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文檔簡(jiǎn)介
ICS65.020.01
CCSB01
15
內(nèi)蒙古自治區(qū)地方標(biāo)準(zhǔn)
DB15/T3185—2023
山藥根尖染色體制片和核型分析技術(shù)規(guī)程
Technicalrulesforchromosomepreparationandkaryotypeanalysisin
roottipofyam
2023-10-30發(fā)布2023-11-30實(shí)施
內(nèi)蒙古自治區(qū)市場(chǎng)監(jiān)督管理局發(fā)布
DB15/T3185—2023
前言
本文件按照GB/T1.1—2020《標(biāo)準(zhǔn)化工作導(dǎo)則第1部分:標(biāo)準(zhǔn)化文件的結(jié)構(gòu)和起草規(guī)則》的規(guī)定
起草。
本文件由內(nèi)蒙古自治區(qū)農(nóng)牧廳提出。
本文件由內(nèi)蒙古自治區(qū)農(nóng)業(yè)標(biāo)準(zhǔn)化技術(shù)委員會(huì)(SAM/TC20)歸口。
本文件起草單位:內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué)、內(nèi)蒙古自治區(qū)農(nóng)牧業(yè)科學(xué)院、鄂爾多斯市農(nóng)牧業(yè)科學(xué)研究院、
巴彥淖爾市農(nóng)牧業(yè)科學(xué)研究院所。
本文件主要起草人:霍秀文、張艷芳、郭樹(shù)春、菅志亮、劉小燕、張曉蒙、張勇、邵盈、趙令敏、
喬慧蕾、邢麗南、葛明然、黃小龍。
I
DB15/T3185—2023
山藥根尖染色體制片和核型分析技術(shù)規(guī)程
1范圍
本文規(guī)定了山藥根尖染色體制片的試劑溶液配制、制片方法以及核型分析方法。
本文件適用于山藥根尖染色體玻片制備和核型分析。
2規(guī)范性引用文件
下列文件中的內(nèi)容通過(guò)文中的規(guī)范性引用而構(gòu)成本文件必不可少的條款。其中,注日期的引用文件,
僅該日期對(duì)應(yīng)的版本適用于本文件;不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改單)適用于本
文件。
DB15/T2788向日葵根尖染色體制片和核型分析技術(shù)規(guī)程
3術(shù)語(yǔ)和定義
下列術(shù)語(yǔ)和定義適用于本文件。
著絲粒centromere
染色體主縊痕部位的染色質(zhì),是染色體中將兩條姐妹染色單體結(jié)合起來(lái)的區(qū)域。
核型karyotype
染色體組在有絲分裂中期的表型,是染色體數(shù)目、大小、形態(tài)特征的總和。
隨體satellite
位于染色體末端的、圓形或圓柱形的染色體片段,通過(guò)次縊痕與染色體主要部分相連,主要由異染
色質(zhì)組成,含高度重復(fù)的DNA序列,不具有常染色質(zhì)的功能活性。
染色體核型分析chromosomekaryotyping
以分裂中期染色體為研究對(duì)象,根據(jù)染色體的長(zhǎng)度、著絲粒位置、長(zhǎng)短臂比例、隨體的有無(wú)等特征,
對(duì)染色體進(jìn)行分組、比較、排隊(duì)、配對(duì),并進(jìn)行形態(tài)分析的過(guò)程。
4試劑配制
本文件用到的試劑參見(jiàn)附錄A中表A.3。
1
DB15/T3185—2023
5染色體標(biāo)本的制備
樣本的獲取
選擇打破休眠的山藥塊莖或者零余子,播種于裝有育苗基質(zhì)的營(yíng)養(yǎng)缽中,在溫度24℃±2℃,濕
度60%,光照強(qiáng)度3000lx的培養(yǎng)室中培養(yǎng)生根。
預(yù)處理
剪取0.5cm~1cm的根尖材料自來(lái)水沖洗后,置于8-羥基喹啉預(yù)處理液中14℃處理1h。
固定
將預(yù)處理的根尖蒸餾水沖洗后放入卡諾固定液中4℃固定24h。
前低滲
將固定后的根尖蒸餾水沖洗后置于0.075mol/L氯化鉀溶液中,室溫處理30min。
解離
將低滲處理后的根尖蒸餾水沖洗后置于0.25mol/L的鹽酸溶液37℃水浴12min。再蒸餾水沖洗10
min后用乙酸-乙酸鈉緩沖液浸泡4min,用3%纖維素酶和0.1%果膠酶酶解液37℃水浴18min。
后低滲
室溫條件下蒸餾水后低滲處理30min以上。
染色壓片
將處理后的根尖置于干凈的載玻片,滴改良卡寶品紅染液染色2min。蓋上蓋玻片輕壓。
鏡檢及圖像采集
在100倍的顯微鏡下觀察中期分裂相,對(duì)染色體充分分散的分裂相進(jìn)行拍照。
6染色體核型分析
分析方法
取30個(gè)以上中期分裂相進(jìn)行染色體計(jì)數(shù)。選擇背景清晰、染色體形態(tài)清晰的5個(gè)細(xì)胞進(jìn)行染色體長(zhǎng)
度的測(cè)量,用于核型分析。核型分析方法等見(jiàn)附錄B,核型分類依據(jù)Stebbins的標(biāo)準(zhǔn)劃分見(jiàn)附錄B中表B.3。
測(cè)量
圖像相關(guān)指標(biāo)測(cè)量使用光學(xué)顯微圖像處理,測(cè)量方法參見(jiàn)附錄A。
Excel計(jì)算
對(duì)每個(gè)細(xì)胞分別計(jì)算每條染色體的臂比和絕對(duì)長(zhǎng)度總長(zhǎng),并列出著絲粒位置類別。
同源染色體配對(duì)及排列
按染色體形態(tài)大小和著絲粒位置進(jìn)行染色體配對(duì),方法見(jiàn)附錄B。
2
DB15/T3185—2023
核型模式圖繪制
分析方法按照DB15/T2788的規(guī)定。使用VideoTesT-Karyo染色體分析軟件進(jìn)行染色體核型圖的制
作,運(yùn)用MicrosoftofficeExcel制作核型模式圖;結(jié)果見(jiàn)附錄B。
3
DB15/T3185—2023
A
A
附錄A
(資料性)
染色體長(zhǎng)度測(cè)量步驟及本技術(shù)規(guī)程用到的試劑和配置方法
A.1染色體長(zhǎng)度測(cè)量步驟
A.1.1掃描修整圖像
用OLYMPUSBX51顯微鏡觀察染色體制片,在100×物鏡下對(duì)染色體充分分散的中期分裂相進(jìn)行拍
照。對(duì)河南鐵棍山藥材料取40個(gè)中期分裂相進(jìn)行染色體計(jì)數(shù)。選擇背景清晰、染色體形態(tài)清晰的5個(gè)
細(xì)胞進(jìn)行拍照,圖像采集使用奧特光學(xué)顯微圖像處理系統(tǒng)OPTPro2008v2.0完成。
A.1.2整理同源染色體并測(cè)量
選擇染色體形態(tài)清晰的5個(gè)細(xì)胞進(jìn)行染色體長(zhǎng)度的測(cè)量。按染色體形態(tài)大小和著絲粒位置進(jìn)行染
色體配對(duì)。使用軟件中“圖像測(cè)量”菜單里“直線”或“曲線”測(cè)量工具測(cè)量染色體長(zhǎng)臂、短臂及隨
體的絕對(duì)長(zhǎng)度。對(duì)每個(gè)細(xì)胞分別計(jì)算每條染色體的臂比和絕對(duì)長(zhǎng)度總長(zhǎng),并列出著絲粒位置類別,由
此進(jìn)行同源染色體的配對(duì)。對(duì)每個(gè)細(xì)胞配對(duì)后計(jì)算每對(duì)同源染色體的長(zhǎng)臂、短臂平均值,得到這個(gè)細(xì)
胞的長(zhǎng)臂值、短臂值。對(duì)細(xì)胞的長(zhǎng)臂值、短臂值再對(duì)應(yīng)地求平均值。得到該材料的長(zhǎng)臂值、短臂值。
由該材料的長(zhǎng)短臂值,計(jì)算染色體總長(zhǎng)并做記錄,由此進(jìn)行染色體排序。
各指標(biāo)的測(cè)量使用奧特光學(xué)顯微圖像處理系統(tǒng)OPTPro2008v2.0完成。核型不對(duì)稱系數(shù)的計(jì)算按
照ARANO的方法,即核型不對(duì)稱系數(shù)=長(zhǎng)臂總長(zhǎng)/全組染色體總長(zhǎng)。相對(duì)長(zhǎng)度指數(shù)(indexofrelative
length)按照KUO的方法計(jì)算并對(duì)染色體進(jìn)行分類,即IRL=染色體長(zhǎng)度/全組染色體平均長(zhǎng)度。
A.2染色體參數(shù)計(jì)算
按染色體形態(tài)大小和著絲粒位置進(jìn)行染色體配對(duì),并根據(jù)染色體臂長(zhǎng)計(jì)算出染色體絕對(duì)長(zhǎng)度、相
對(duì)長(zhǎng)度和臂比等核型參數(shù)。使用VideoTesT-Karyo染色體分析軟件進(jìn)行染色體核型圖的制作,運(yùn)用
MicrosoftofficeExcel制作核型模式圖。
A.3試劑及配置方法
試劑及配置方法見(jiàn)表A.1。
表A.1試劑及配置方法
試劑名稱配制方法
0.002mol/L8-羥基喹啉稱取0.29g8-羥基喹啉,先加入少許乙醇溶解,然后用蒸餾水定容至1000mL。
對(duì)二氯苯飽和水溶液稱取15g對(duì)二氯苯,60℃蒸餾水中攪拌溶解,定容至1000mL,靜置1h取上清,室
溫儲(chǔ)存?zhèn)溆谩?/p>
0.01%秋水仙素溶液稱取0.1g秋水仙素,先用少許乙醇溶解,用蒸餾水定容至1000mL。
0.075mol/L氯化鉀溶液稱氯化鉀5.59g,蒸餾水溶解,定容至1000mL。
1mol/L鹽酸量取83mL36%~38%的濃鹽酸,加蒸餾水定容至1000mL。
乙酸-乙酸鈉緩沖溶液溶液A:量取冰醋酸1.5mL,定容至250mL,制成0.1mol/L醋酸溶液;
(pH=4.75)溶液B:稱取醋酸鈉2.05g,溶解后定容至250mL,制成0.1mol/L醋酸鈉溶液;
使用時(shí)等體積混合,4℃冷藏備用。
酶解液含3%纖維素酶和0.1%果膠酶。取3g纖維素酶(CelluloseOnozukaR-10)和
酶解液0.1g果膠酶(PectolyaseY-23),分別加入少量的乙酸-乙酸鈉緩沖液,待溶解后定
容至100mL。
4
DB15/T3185—2023
表A.1試劑及配置方法(續(xù))
試劑名稱配制方法
原液A:3g堿性品紅,溶于100mL70%酒精中(可長(zhǎng)期保存)。
原液B:取10mL原液A加入5%苯酚水溶液90mL(棕色瓶中保存,限兩周內(nèi)使用)。
改良卡寶品紅染液染色液母液:55mL原液B加冰醋酸和6mL37%甲醛。
改良卡寶品紅染液:10mL染色液母液加45%乙酸90mL,最后加山梨醇1.8g,室溫下
放置兩周后待用。
5
DB15/T3185—2023
B
B
附錄B
(規(guī)范性)
著絲粒位置
B.1著絲粒位置見(jiàn)表B.1。
表B.1著絲粒位置
臂比著絲粒位置符號(hào)
1.00正中部著絲粒M
1.01-1.70中部著絲粒m
1.71-3.00近中部著絲粒sm
3.01-7.00近端部著絲粒st
7.01以上端部著絲粒t
B.2染色體長(zhǎng)度類型見(jiàn)表B.2。
表B.2染色體長(zhǎng)度類型
絕對(duì)長(zhǎng)度(μm)長(zhǎng)度類型符號(hào)
≤1微小型染色體S
1-4小型染色體M1
4-10中等染色體M2
10-30大染色體L
B.3染色體核型分類標(biāo)準(zhǔn)見(jiàn)表B.3。
表B.3染色體核型分類標(biāo)準(zhǔn)
染色體長(zhǎng)度比臂比>2:1的染色體的百分比
(L/S)0.00.01-0.50.51-0.991.00
<2:11A2A3A4A
2:1-4:11B2B3B4B
>4:11C2C3C4C
B.4染色體核型分析參數(shù)見(jiàn)表B.4。
表B.4染色體核型分析參數(shù)
染色體長(zhǎng)度(μm)相對(duì)相對(duì)染色著絲
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