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乳腺癌相關(guān)基因研究國(guó)內(nèi)外文獻(xiàn)綜述1乳腺癌相關(guān)基因研究現(xiàn)狀與分析細(xì)胞拷貝數(shù)變化及蛋白編碼基因外顯子的突變情況,發(fā)現(xiàn)100個(gè)腫瘤中至少存在40種癌癥基因和73種不同突變癌癥基因組合中的驅(qū)動(dòng)突變,同時(shí)發(fā)現(xiàn)了乳腺癌9個(gè)新驅(qū)動(dòng)基因,包括CASP8、MAP3患者進(jìn)行全外顯子測(cè)序以檢測(cè)易感基因中的種系突變,發(fā)現(xiàn)9.2%的癌癥患者存對(duì)轉(zhuǎn)移性乳腺癌患者進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,發(fā)現(xiàn)50%以上乳腺癌患者存在ESR1突2乳腺癌相關(guān)單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)研究現(xiàn)狀與分析近年來,由于單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)填補(bǔ)了期望(僅研究某些特定類型細(xì)胞)與現(xiàn)實(shí)(僅可以檢測(cè)多種混合細(xì)胞的均值)之間的巨大裂隙,因此在乳腺癌研究上逐漸涌現(xiàn)出大量與單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)相關(guān)的優(yōu)秀工作。2017年Chung[6等利用單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序分析了來自4種乳腺癌亞型共11名患者的515個(gè)單細(xì)胞,發(fā)現(xiàn)絕大群都顯示出了免疫抑制基因表達(dá)特征。其中T淋巴細(xì)胞除具有免疫抑制性外還腫瘤浸潤(rùn)免疫細(xì)胞的異質(zhì)性。Kim7等利用單細(xì)胞測(cè)序分析了20位三陰性乳 (Triple-negativebreastcancer,TNBC)患者化療前后的6862個(gè)細(xì)胞,發(fā)現(xiàn)化療治療策略具有重大作用。以上研究利用單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)深入地揭示了乳腺癌的細(xì)胞類型特異性基因及基因調(diào)控通路。但由于單細(xì)胞測(cè)序的高昂成本,基于單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)的乳腺癌特異性基因識(shí)別僅在小規(guī)模樣本下進(jìn)行了探究,導(dǎo)致了每個(gè)課題組研究的單細(xì)胞數(shù)量雖大卻都來源于有限的樣本,從而使測(cè)序及分析結(jié)果包含個(gè)體差異性,研究結(jié)論難以普適到大規(guī)模人群中。因此為降低乳腺癌細(xì)胞類型特異性基因的假陽(yáng)性率,豐富對(duì)照組樣本量,實(shí)現(xiàn)跨平臺(tái)、跨批次的乳腺癌單細(xì)胞測(cè)序數(shù)據(jù)整合具有重要意義。[1]WorldHealthOrganization.evolutionrevealedbymultiregionsequencing[J].Nmutationalprocessesinbreastcancer[J].Nature,2012,486(7403):400-404.[4]SunJ,MengH,YaoL,etal.Germlinalargeseriesofunselectedbreastcancerpatients[J].ClinicalCancerResearch,2017,23(20):6113-6119.[5]RobinsonDR,WuYM,VatsP,etal.ActivatingESR1mutationsresistantmetastaticbreastcancer[J].Naturegenetics,2013,45(12):1446.tumourandimmunecellprofilingicommunications,2017,8(1):1-12.[7]KimC,GaoR,SeiE,etal.Chemoresistanceevolutionicancerdelineatedbysingle-cellsequencing[J].Cell,2[8]梁愛斌,梁智宇,汪俊幫.單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)及其在腫瘤研究中的應(yīng)用[J].收藏,2015,1.[9]張蒙,張青云,徐國(guó)賓.新一代測(cè)序技術(shù)在腫瘤臨床中的應(yīng)用[J].臨床檢驗(yàn)雜[10]WheelerDL,Barrett
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