再生醫(yī)學空間轉(zhuǎn)錄組分析師崗位考試試卷及答案單項選擇題（每題2分，共10題）1.空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)主要用于分析（）A.細胞形態(tài)B.基因表達空間分布C.蛋白結(jié)構(gòu)D.細胞代謝答案：B2.以下哪種技術(shù)不屬于空間轉(zhuǎn)錄組常用技術(shù)（）A.Slide-seqB.STC.FISHD.Visium答案：C3.空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)預處理不包括（）A.質(zhì)量控制B.數(shù)據(jù)標準化C.細胞聚類D.讀段比對答案：C4.空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析中，用于識別差異表達基因的方法是（）A.PCAB.DEseq2C.t-SNED.UMAP答案：B5.空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)可視化常用工具是（）A.PhotoshopB.R語言C.PrismD.SPSS答案：B6.空間分辨率最高的技術(shù)是（）A.Stereo-seqB.VisiumC.Slide-seqD.HDST答案：A7.空間轉(zhuǎn)錄組實驗中，捕獲芯片的作用是（）A.固定組織B.捕獲mRNAC.標記細胞D.切割組織答案：B8.用于空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)降維的方法是（）A.相關(guān)性分析B.層次聚類C.PCAD.回歸分析答案：C9.空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析可揭示（）A.細胞間相互作用B.基因突變C.蛋白修飾D.染色體結(jié)構(gòu)答案：A10.空間轉(zhuǎn)錄組研究的樣本一般不包括（）A.腫瘤組織B.血液C.腦組織D.肝臟組織答案：B多項選擇題（每題2分，共10題）1.空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)優(yōu)勢包括（）A.保留空間信息B.可進行單細胞水平分析C.檢測全轉(zhuǎn)錄組D.無需樣本處理答案：ABC2.空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析步驟有（）A.數(shù)據(jù)獲取B.數(shù)據(jù)預處理C.特征提取D.結(jié)果可視化答案：ABCD3.常用空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫有（）A.SpatialDBB.STomicsC.GEOD.ArrayExpress答案：AB4.空間轉(zhuǎn)錄組實驗中可能用到的試劑有（）A.固定液B.裂解液C.逆轉(zhuǎn)錄酶D.蛋白酶K答案：ABC5.空間轉(zhuǎn)錄組與單細胞轉(zhuǎn)錄組的區(qū)別在于（）A.空間轉(zhuǎn)錄組有空間信息B.單細胞轉(zhuǎn)錄組細胞分辨率更高C.空間轉(zhuǎn)錄組檢測范圍廣D.單細胞轉(zhuǎn)錄組無法分析細胞間相互作用答案：AB6.空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)標準化方法有（）A.總計數(shù)標準化B.分位數(shù)標準化C.基于模型的標準化D.無需標準化答案：ABC7.空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)可應用于（）A.發(fā)育生物學研究B.腫瘤研究C.神經(jīng)科學研究D.微生物研究答案：ABC8.空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)聚類方法有（）A.K-means聚類B.層次聚類C.譜聚類D.密度聚類答案：ABCD9.空間轉(zhuǎn)錄組實驗對樣本要求包括（）A.新鮮樣本B.合適的固定時間C.樣本大小合適D.無嚴格要求答案：ABC10.分析空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)時，常用的編程語言有（）A.PythonB.RC.JavaD.C++答案：AB判斷題（每題2分，共10題）1.空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)可以精確到單個細胞的基因表達。（×）2.空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析不需要生物學背景知識。（×）3.空間轉(zhuǎn)錄組實驗中，組織切片厚度對結(jié)果無影響。（×）4.所有空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)都能實現(xiàn)超高分辨率。（×）5.空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)可視化只能用專門軟件。（×）6.空間轉(zhuǎn)錄組可用于研究細胞分化軌跡。（√）7.空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)預處理是為了提高數(shù)據(jù)質(zhì)量。（√）8.空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析中，差異表達基因篩選無意義。（×）9.空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)只能用于動物樣本。（×）10.掌握空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)不需要學習統(tǒng)計方法。（×）簡答題（每題5分，共4題）1.簡述空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)原理答案：空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)基于組織切片，通過帶有空間位置信息的捕獲探針捕獲組織中的mRNA，經(jīng)過逆轉(zhuǎn)錄等步驟形成cDNA文庫，測序后結(jié)合位置信息分析基因表達的空間分布，揭示細胞間基因表達差異及空間關(guān)系。2.列舉空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析的關(guān)鍵環(huán)節(jié)答案：關(guān)鍵環(huán)節(jié)有數(shù)據(jù)預處理，去除低質(zhì)量數(shù)據(jù)；特征提取，如基因表達量計算；降維分析，減少數(shù)據(jù)復雜性；聚類分析，劃分細胞亞群；差異表達分析，找出不同區(qū)域差異基因；最后是結(jié)果可視化，直觀呈現(xiàn)數(shù)據(jù)。3.空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)在腫瘤研究中的應用答案：可繪制腫瘤組織基因表達空間圖譜，了解腫瘤細胞異質(zhì)性，識別腫瘤微環(huán)境中不同細胞類型及相互作用，發(fā)現(xiàn)新的腫瘤標志物，為腫瘤的診斷、治療及預后評估提供依據(jù)。4.簡述空間轉(zhuǎn)錄組實驗流程答案：首先準備合適樣本，進行固定、包埋、切片；將切片置于帶有捕獲探針的芯片上，使mRNA與探針結(jié)合；經(jīng)過逆轉(zhuǎn)錄合成cDNA；構(gòu)建文庫后進行高通量測序；最后對測序數(shù)據(jù)進行分析處理。討論題（每題5分，共4題）1.討論空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)在再生醫(yī)學中的潛在應用答案：在再生醫(yī)學中，可用于研究組織再生過程中基因表達時空變化，了解細胞分化軌跡和細胞間信號通路，指導干細胞定向分化；還能分析再生組織與正常組織差異，為組織工程構(gòu)建更接近天然組織的支架材料提供方向，助力器官再生研究。2.分析空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)目前面臨的挑戰(zhàn)及解決思路答案：挑戰(zhàn)有空間分辨率有限、數(shù)據(jù)處理復雜、成本較高等。解決思路包括研發(fā)更高分辨率技術(shù)；開發(fā)更高效數(shù)據(jù)處理算法和軟件；優(yōu)化實驗流程，降低成本，如改進捕獲芯片設(shè)計、簡化文庫構(gòu)建步驟等。3.談?wù)効臻g轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)與其他組學數(shù)據(jù)整合的意義答案：空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)與基因組、蛋白質(zhì)組等數(shù)據(jù)整合，能從多層面解析生物學過程?；蚪M數(shù)據(jù)提供遺傳基礎(chǔ)，蛋白質(zhì)組反映最終功能產(chǎn)物，整合后可深入理解基因表達調(diào)控機制、細胞功能及細胞間相互作用網(wǎng)絡(luò)，全面揭示生物學奧秘