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文檔簡介
基因治療產品生產用細胞培養(yǎng)污染物檢測標準演講人01引言:基因治療產品細胞培養(yǎng)污染物檢測的戰(zhàn)略意義02細胞培養(yǎng)污染物的分類與潛在風險03現行標準體系與法規(guī)框架04檢測方法與技術應用05質量控制與過程管理策略06行業(yè)挑戰(zhàn)與未來展望07總結:以標準守護基因治療的“生命線”目錄基因治療產品生產用細胞培養(yǎng)污染物檢測標準01引言:基因治療產品細胞培養(yǎng)污染物檢測的戰(zhàn)略意義引言:基因治療產品細胞培養(yǎng)污染物檢測的戰(zhàn)略意義在基因治療領域,細胞培養(yǎng)是生產重組病毒載體(如慢病毒、腺相關病毒)或工程化細胞(如CAR-T、干細胞)的核心環(huán)節(jié),其質量直接決定產品的安全性與有效性。作為“活的藥物”,基因治療產品的生產過程高度依賴細胞的生命活動,而任何污染物的引入都可能引發(fā)災難性后果——輕則導致產品批次報廢、研發(fā)周期延誤,重則引發(fā)患者免疫反應、細胞因子風暴,甚至危及生命。從業(yè)十余年,我親歷了行業(yè)從早期“經驗式生產”到當前“標準化質控”的轉型。記得2018年,某企業(yè)因細胞庫中未檢出支原體污染,導致臨床級產品中殘留微量支原體,最終使Ⅱ期臨床試驗被迫中止,不僅損失數億元研發(fā)投入,更讓患者錯失治療時機。這一案例讓我深刻認識到:細胞培養(yǎng)污染物檢測并非簡單的“質檢工序”,而是貫穿產品全生命周期的“質量生命線”。引言:基因治療產品細胞培養(yǎng)污染物檢測的戰(zhàn)略意義當前,隨著基因治療產品加速上市(全球已獲批超50款,中國占10余款),監(jiān)管部門對生產質控的要求日趨嚴格。美國FDA、歐盟EMA、中國國家藥品監(jiān)督管理局(NMPA)均將細胞培養(yǎng)污染物檢測列為“關鍵質量屬性(CQA)”,要求建立從原材料到終產品的全流程監(jiān)控體系。本文將基于行業(yè)實踐與法規(guī)要求,系統(tǒng)梳理基因治療產品生產用細胞培養(yǎng)污染物的分類、檢測標準、技術方法及質量控制策略,為從業(yè)者提供一套科學、可操作的參考框架。02細胞培養(yǎng)污染物的分類與潛在風險細胞培養(yǎng)污染物的分類與潛在風險細胞培養(yǎng)污染物是指在生產過程中引入的、非預期的外源性或內源性物質,根據其性質可分為生物污染物、化學污染物和物理污染物三大類。每一類污染物的來源、特性及對基因治療產品的影響均存在顯著差異,需針對性制定檢測策略。生物污染物:基因治療產品的“頭號殺手”生物污染物是細胞培養(yǎng)中最常見、風險最高的污染物類型,主要包括細菌、真菌、支原體、病毒及交叉細胞污染,其可通過直接損傷細胞、干擾基因編輯或載體包裝,引入外源遺傳物質,引發(fā)患者免疫應答。生物污染物:基因治療產品的“頭號殺手”細菌與真菌污染來源:主要來自環(huán)境(如實驗室空氣、操作臺面)、原材料(如血清、培養(yǎng)基、胰酶)或操作人員(如皮膚、呼吸道)。細菌以革蘭氏陰性菌(如大腸桿菌、銅綠假單胞菌)為主,真菌則以黑曲霉、白色念珠菌常見。風險:細菌快速繁殖(20-30分鐘一代)會消耗培養(yǎng)基中的營養(yǎng)物質,產生內毒素(革蘭氏陰性菌細胞壁成分)或代謝毒素(如真菌的黃曲霉毒素),直接導致細胞死亡或功能異常。內毒素進入人體后可引發(fā)發(fā)熱、休克,甚至多器官衰竭,是靜脈注射類基因治療產品的“致命威脅”。生物污染物:基因治療產品的“頭號殺手”支原體污染:隱形的“質量破壞者”來源:廣泛存在于牛血清、動物源酶制劑中,或通過操作人員氣溶膠傳播。支原體缺乏細胞壁,常規(guī)抗生素(如青霉素)無法抑制,且體積?。?.2-0.3μm),可輕易穿過0.22μm濾膜。風險:支原體不導致細胞快速死亡,但可通過競爭營養(yǎng)、產生核酸酶干擾基因表達,或整合到宿主基因組引發(fā)插入突變。據FDA統(tǒng)計,約15%-30%的細胞污染事件由支原體引起,且常規(guī)顯微鏡檢查難以檢出,是“最容易被忽視的污染物”。生物污染物:基因治療產品的“頭號殺手”病毒污染:最棘手的“安全挑戰(zhàn)”來源:包括外源病毒(如生產原材料中的牛病毒BIV、鼠源病毒MMV)和內源逆轉錄病毒(如人胚胎干細胞中的HERV)。病毒污染可能來自細胞基質(如HEK293細胞)、血清或上游工藝交叉污染。風險:病毒具有感染性,可能感染患者并整合到宿主基因組,激活癌基因或抑制抑癌基因。例如,2019年某CAR-T產品因生產過程中鼠源逆轉錄病毒污染,被FDA要求增加病毒清除驗證和長期隨訪研究,導致上市延遲2年。生物污染物:基因治療產品的“頭號殺手”交叉細胞污染來源:不同細胞系在同時培養(yǎng)或操作中混淆,如將未轉染的HEK293細胞混入病毒包裝細胞。風險:導致產品效價下降(如病毒滴度降低)或引入未知的遺傳物質,影響產品批次一致性?;瘜W污染物:常被忽視的“功能干擾者”化學污染物主要來源于培養(yǎng)基成分、試劑、耗材或生產設備,雖不直接引發(fā)細胞死亡,但可能干擾基因編輯效率、載體穩(wěn)定性或細胞功能。化學污染物:常被忽視的“功能干擾者”內毒素來源:革蘭氏陰性菌細胞壁裂解產物,易通過血清、緩沖液或設備表面引入。風險:即使極低濃度(0.1EU/mL)也可激活單核巨噬細胞,釋放大量細胞因子,引發(fā)細胞因子風暴?;蛑委煯a品(如溶瘤病毒)常靜脈給藥,內毒素控制不當可能導致嚴重不良反應。化學污染物:常被忽視的“功能干擾者”重金屬與殘留試劑來源:培養(yǎng)基中的鋅、銅等微量元素超標,或細胞消化后殘留的胰酶、EDTA。風險:重金屬(如汞、鉛)可與蛋白質結合,改變載體構象;殘留胰酶可能消化細胞表面受體,影響載體感染效率。化學污染物:常被忽視的“功能干擾者”降解產物與雜質來源:培養(yǎng)基儲存中產生的乳酸、氨,或色譜純化后的蛋白A、樹脂碎片。風險:乳酸積累導致pH值下降,抑制細胞生長;蛋白A殘留可能引發(fā)患者抗體應答,降低產品療效。物理污染物:直觀但易控的“工藝缺陷”物理污染物主要包括細胞碎片、纖維、顆粒物等,通常來源于細胞傳代、離心或過濾過程。風險:顆粒物可能堵塞下游層析柱,影響純化效率;細胞碎片攜帶的DNA和蛋白質可能形成免疫原性復合物,引發(fā)患者不良反應。03現行標準體系與法規(guī)框架現行標準體系與法規(guī)框架基因治療產品細胞培養(yǎng)污染物檢測標準的制定,需兼顧科學性、法規(guī)性和行業(yè)可操作性。目前,全球已形成以國際藥典(USP、EP、ChP)為核心,以FDA、EMA、NMPA指南為補充的標準體系,覆蓋了從原材料到終產品的全流程要求。國際標準與指南美國藥典(USP)USP<63>《細胞培養(yǎng)用微生物檢查法》、USP<1043>《細胞培養(yǎng)的無菌操作》明確規(guī)定了細胞培養(yǎng)中細菌、真菌、支原體的檢測方法和限度要求。例如,支原體檢測需采用培養(yǎng)法(14天)和指示細胞法(如Vero細胞),兩者任一陽性即判為不合格。國際標準與指南歐洲藥典(EP)EP2.6.1《細胞基治療產品的微生物學控制》要求對生產細胞庫(MCB)、工作細胞庫(WCB)及終產品進行“全譜微生物檢測”,包括需氧菌、厭氧菌、真菌、支原體及特定病毒(如HIV、HBV)。同時,EP5.2.3《細胞治療產品的交叉污染控制》強調對細胞系進行STR分型鑒定,防止交叉污染。國際標準與指南FDA指南FDA《HumanGeneTherapyProductsGuidanceforIndustry》(2021)要求企業(yè)建立“污染風險評估模型”,針對不同生產階段(如細胞庫擴增、病毒載體生產)制定個性化的檢測方案。例如,慢病毒載體生產需額外檢測replication-competentlentivirus(RCL),采用PCR法檢測gag-pol基因序列。國際標準與指南EMA指南EMA《GuidelineonGoodClinicalPracticeGeneTherapyMedicinalProducts》(2020)規(guī)定,細胞治療產品需進行“外源病毒因子檢測”,包括體內試驗(如接種于敏感動物)和體外試驗(如雞胚接種),確保無傳染性病毒殘留。中國標準與法規(guī)《中華人民共和國藥典》(2020年版)ChP三部《生物制品生產檢定用菌種、毒種管理規(guī)程》和《生物制品無菌檢驗法》對細胞培養(yǎng)污染物的檢測方法與限度進行了本土化規(guī)定,要求支原體檢測同時采用培養(yǎng)法和DNA熒光染色法,縮短檢測周期至7天。中國標準與法規(guī)NMPA指導原則《人源性干細胞產品生產質量管理規(guī)范》(2023)明確要求,干細胞生產需對細胞庫進行“細胞外源因子檢測”,包括細菌、真菌、支原體及病毒,并采用NGS技術篩查未知病毒?!度芰霾《井a品藥學研究技術指導原則》(2022)則要求對病毒載體進行replication-competentvirus(RCV)檢測,靈敏度需達到1PFU/10?載體顆粒。中國標準與法規(guī)行業(yè)標準《細胞治療產品生產用細胞庫建立和檢定技術規(guī)范》(T/CGAAC001-2022)細化了細胞庫的檢定項目,包括STR分型、同工酶檢測、微生物污染檢測等,要求細胞庫支原體檢測陰性率為100%,細菌、真菌檢測需采用直接接種法和薄膜過濾法。標準協調與國際化趨勢隨著基因治療產品全球化注冊趨勢加強,各國標準逐步趨同。例如,FDA、EMA和NMPA均接受USP/EP的檢測方法,但針對特定風險(如內源病毒)會提出補充要求。企業(yè)需在遵循ICHQ5D(細胞基產品質控)和Q7(GMP)基礎上,結合目標市場法規(guī)制定“高于藥典”的內控標準,例如將支原體檢測限度從“不得檢出”提高至“檢測靈敏度<10CFU/mL”。04檢測方法與技術應用檢測方法與技術應用細胞培養(yǎng)污染物檢測需兼顧“靈敏度、特異性、時效性”三大核心要素,傳統(tǒng)方法與新興技術各有優(yōu)勢,需根據污染物類型、生產階段及產品特性選擇合適的檢測策略。生物污染物檢測方法細菌與真菌檢測:從“培養(yǎng)法”到“快速檢測”傳統(tǒng)方法:-直接接種法:將樣品分別接種需氧菌、厭氧菌培養(yǎng)基(如硫乙醇酸鹽流體培養(yǎng)基)和真菌培養(yǎng)基(如沙氏葡萄糖培養(yǎng)基),培養(yǎng)5-14天,觀察渾濁、沉淀或菌落形成。該方法成本低、可靠性高,但耗時長,無法滿足快速放行需求。-薄膜過濾法:通過0.45μm濾膜富集樣品中的微生物,再轉移至培養(yǎng)基培養(yǎng)。適用于大體積樣品(如細胞培養(yǎng)上清),檢測靈敏度可達1CFU/mL,是《中國藥典》推薦的細菌檢測方法??焖贆z測技術:-ATP生物熒光法:利用熒光素酶催化ATP產生熒光,檢測微生物代謝活性。檢測時間僅需5-15分鐘,靈敏度10?1?molATP,適用于生產環(huán)境的實時監(jiān)測。生物污染物檢測方法細菌與真菌檢測:從“培養(yǎng)法”到“快速檢測”-流式細胞術:使用SYTO9等核酸染料標記微生物,通過流式細胞儀檢測熒光信號??赏瑫r區(qū)分活菌/死菌,檢測通量高達10?樣品/小時,適用于大規(guī)模生產過程的中間控制。生物污染物檢測方法支原體檢測:雙法聯保,兼顧靈敏度與時效性培養(yǎng)法:-支原體缺乏細胞壁,需使用支原體肉湯培養(yǎng)基(如SP4培養(yǎng)基)和固體培養(yǎng)基(如Hayflick培養(yǎng)基),培養(yǎng)14-21天。該方法是藥典“金標準”,可檢測所有已知支原體種屬,但耗時長、靈敏度較低(102-103CCU/mL)。分子生物學方法:-PCR法:針對支原體16SrRNA或16S-23SITS區(qū)域設計引物,通過實時熒光定量PCR(qPCR)檢測DNA。檢測時間僅需4-6小時,靈敏度可達1-10CFU/mL,是目前應用最廣的支原體快速檢測方法。-等溫擴增法(LAMP):在恒定溫度(60-65℃)下實現DNA擴增,無需精密儀器,適合現場快速檢測。但易發(fā)生假陽性,需嚴格設置對照。生物污染物檢測方法支原體檢測:雙法聯保,兼顧靈敏度與時效性指示細胞法:將樣品接種于敏感細胞(如Vero細胞、HEp-2細胞),培養(yǎng)7-14天后,通過顯微鏡觀察細胞病變效應(CPE)或免疫熒光法檢測支原體抗原。該方法可檢測“培養(yǎng)法漏檢”的活支原體,但耗時較長,僅用于確證試驗。生物污染物檢測方法病毒污染檢測:從“特異性靶標”到“全景篩查”傳統(tǒng)方法:-體外培養(yǎng)法:將樣品接種于敏感細胞(如MRC-5細胞),觀察CPE或用血吸附試驗檢測病毒。適用于病毒滴度測定,但耗時長達14-28天,且對某些“非致細胞病變病毒”(如細小病毒)無效。-電鏡法:通過透射電鏡直接觀察病毒顆粒,可識別病毒形態(tài),但靈敏度低(10?-10?particles/mL),且需專業(yè)操作人員。分子與免疫學方法:-qPCR/dPCR:針對病毒特異性基因(如HIVgag、HBVS基因)設計探針,可精確定量病毒載量。dPCR(數字PCR)無需標準曲線,絕對定量精度更高,適用于低病毒載量樣品(如RCV檢測)。生物污染物檢測方法病毒污染檢測:從“特異性靶標”到“全景篩查”-NGS(二代測序):通過宏基因組測序篩查樣品中的所有核酸序列,可檢測未知病毒或新發(fā)病毒。例如,2022年某企業(yè)利用NGS發(fā)現了生產細胞中的鼠源逆轉錄病毒MMV,避免了潛在風險。體內試驗:-動物接種法:將樣品接種于敏感動物(如新生小鼠、倉鼠),觀察發(fā)病情況或檢測病毒抗體。是藥典要求的“外源病毒因子確證方法”,但因倫理問題使用受限,目前多被體外方法替代。生物污染物檢測方法交叉細胞污染檢測:基于遺傳標記的精準鑒定STR分型:通過短串聯重復序列(STR)分析細胞系的DNA指紋,與細胞庫STR圖譜比對。STR具有高度個體特異性,是細胞交叉污染檢測的“金標準”,靈敏度可達0.1%的細胞混合比例。SNP芯片:通過單核苷酸多態(tài)性(SNP)芯片檢測數百萬個SNP位點,可區(qū)分高度同源的細胞系(如不同來源的HEK293細胞)。檢測通量高,成本適中,適用于大規(guī)模細胞庫鑒定?;瘜W污染物檢測方法內毒素檢測:鱟試劑法的絕對優(yōu)勢鱟試驗法(LAL法):利用鱟變形細胞裂解物中的C因子激活內毒素,顯色或沉淀反應定量。包括凝膠法(限度檢測)、濁度法(定量)和顯色法(高靈敏度,可達0.005EU/mL)。LAL法是《中國藥典》內毒素檢測的唯一法定方法,但易受β-葡聚糖(假陽性)和EDTA(假陰性)干擾,需進行樣品前處理。化學污染物檢測方法重金屬與殘留試劑檢測ICP-MS(電感耦合等離子體質譜):通過等離子體原子化樣品,檢測金屬元素的質荷比??赏瑫r檢測數十種重金屬(如鉛、汞、鎘),靈敏度達ppb(10??)級,是重金屬檢測的首選方法。HPLC(高效液相色譜):用于檢測殘留有機試劑(如乙腈、甲醇)或小分子雜質(如血清中的未消耗胰島素)。通過紫外或熒光檢測器定量,靈敏度高,重現性好。化學污染物檢測方法生物活性雜質檢測ELISA(酶聯免疫吸附試驗):針對特定蛋白雜質(如蛋白A、宿主細胞蛋白)設計抗體,通過酶催化顯色反應定量。靈敏度高(ng/mL級),適用于終產品的放行檢測。SDS(聚丙烯酰胺凝膠電泳):通過蛋白質分子量差異分離雜質,可直觀檢測宿主細胞蛋白或降解產物。常與Westernblot聯用,提高特異性。物理污染物檢測方法顯微鏡計數法:通過光學顯微鏡直接計數細胞碎片或顆粒物,操作簡單,但主觀性強,僅適用于粗略檢測。庫爾特計數器:通過電阻變化顆粒物的體積和數量,檢測精度高(≥2μm顆粒),適用于細胞培養(yǎng)上清的中間控制。顯微成像系統(tǒng):結合人工智能算法,自動識別并計數顆粒物,可區(qū)分細胞碎片、纖維和氣泡,檢測通量高,適用于大規(guī)模生產過程監(jiān)控。05質量控制與過程管理策略質量控制與過程管理策略污染物檢測并非“終點控制”,而是需貫穿“設計-生產-放行”全生命周期的“過程管理”。基因治療企業(yè)需基于QbD(質量源于設計)理念,建立“風險評估-方法驗證-持續(xù)改進”的閉環(huán)體系。污染風險評估:從“被動檢測”到“主動預防”風險評估工具:采用FMEA(失效模式與影響分析)或HACCP(危害分析與關鍵控制點)系統(tǒng),識別細胞培養(yǎng)過程中的污染風險點。例如,血清添加、細胞傳代、病毒收獲等環(huán)節(jié)為“高風險操作”,需制定針對性控制措施。風險等級劃分:-高風險(RPN≥100):細胞庫復蘇、病毒載體轉染等,需100%在級潔凈環(huán)境(A級/B級)下操作,人員需經無菌培訓,設備需在線滅菌(SIP)。-中風險(50≤RPN<100):培養(yǎng)基配制、細胞計數等,需定期環(huán)境監(jiān)測(沉降菌、浮游菌),操作人員需穿戴無菌服。-低風險(RPN<50):試劑儲存、樣品運輸等,需確保包裝完整性,防止污染引入。檢測方法驗證:確保數據的可靠性驗證參數:根據ICHQ2(R1)《分析方法驗證指導原則》,需對檢測方法的“特異性、準確性、精密度、線性、范圍、耐用性”進行驗證。例如,支原體PCR法需驗證無交叉反應(特異性)、回收率(準確性)、批內/批間變異系數(精密度)。驗證方案設計:-特異性:使用至少10株不同支原體種屬(如M.hyorhinis、M.orale)和常見微生物(如大腸桿菌、金黃色葡萄球菌)驗證引物/探針的特異性。-靈敏度:通過梯度稀釋支原體標準品,確定檢測限(LOD)和定量限(LOQ)。例如,qPCR法的LOD需≤10CFU/mL,LOQ需≤30CFU/mL。-耐用性:考察反應條件(如退火溫度、延伸時間)微小變化對結果的影響,確保方法的重現性。全過程監(jiān)控:建立“三級檢測網”級:原材料與細胞庫-原材料:血清、胰酶等動物源材料需提供支原體、病毒、細菌的檢測報告,并進廠后復檢內毒素和重金屬。-細胞庫:主細胞庫(MCB)需進行全面檢定,包括STR分型、同工酶檢測、微生物污染、外源病毒因子及細胞表型鑒定(如干細胞多能性標記)。工作細胞庫(WCB)需檢測支原體、細菌、真菌,并確認無交叉污染。第二級:生產過程-上游工藝:細胞復蘇、擴增階段,每3天檢測1次支原體和細菌;病毒轉染后,檢測RCV/replication-competentlentivirus。-下游工藝:收獲液、純化樣品需檢測內毒素、宿主細胞蛋白及顆粒物,確保符合放行標準(如內毒素≤5EU/kg,宿主細胞蛋白≤100ppm)。全過程監(jiān)控:建立“三級檢測網”級:原材料與細胞庫第三級:終產品-無菌檢查:按《中國藥典》方法接種需氧菌、厭氧菌、真菌培養(yǎng)基,培養(yǎng)14天,需無菌生長。-支原體檢查:同時采用培養(yǎng)法和PCR法,兩者均陰性方可放行。-病毒安全性:終產品需進行RCV/replication-competentvirus檢測,靈敏度需≤1PFU/10?載體顆粒。污染事件應急處理:最小化損失與風險CAPA體系:建立“糾正與預防措施”(CAPA)系統(tǒng),對污染事件進行根本原因分析(RCA)。例如,若某批次支原體檢測陽性,需追溯血清批次、操作人員、環(huán)境監(jiān)測數據,確認是原材料問題還是操作失誤,并采取糾正措施(如更換供應商、加強培訓)。數據追溯與審計:采用LIMS(實驗室信息管理系統(tǒng))記錄檢測數據,實現“從細胞庫到患者”的全流程追溯。定期進行內部審計和外部檢查(如FDA、NMPAGMP符合性檢查),確保質控體系有效運行。06行業(yè)挑戰(zhàn)與未來展望行業(yè)挑戰(zhàn)與未來展望盡管當前基因治療產品細胞培養(yǎng)污染物檢測標準已日趨完善,但隨著技術進步和產品復雜化,行業(yè)仍面臨諸多挑戰(zhàn),同時也催生了檢測技術的創(chuàng)新方向。當前面臨的主要挑戰(zhàn)新型污染物的檢測難題-內源逆轉錄病毒(ERVs):人源干細胞(如iPSC)中存在大量HERV,其激活可能導致感染性病毒顆粒釋放,但目前尚無標準化的ERV檢測方法。-朊病毒:盡管風險極低,但動物源原材料(如牛血清)中可能存在朊病毒,常規(guī)方法無法滅活,需開發(fā)超靈敏檢測技術。當前面臨的主要挑戰(zhàn)檢測成本與時效性的矛盾-基因治療產品(如CAR-T)多為“個性化定制”,生產批次小、批數多,傳統(tǒng)檢測方法(如培養(yǎng)法)耗時長達2-3周,無法滿足“快速放行”需求。而快速檢測技術(如NGS、dPCR)設備成本高,中小型企業(yè)難以承擔。當前面臨的主要挑戰(zhàn)標準滯后于技術發(fā)展-新興技術(如類器官、基因編輯細胞)的細胞培養(yǎng)體系與傳統(tǒng)方法差異較大,例如類器官培養(yǎng)需要3D支架和復雜培養(yǎng)基,現有微生物檢測標準可能無法完全適用。當前面臨的主要挑戰(zhàn)國際法規(guī)協調不足-不同國家對“未知病毒”的檢測要求存在差異,例如FDA要求檢測鼠源病毒,而EMA要求檢測牛源病毒,導致企業(yè)需針對不同市場開發(fā)多套檢測方案,增加研發(fā)成本。未來技術發(fā)展趨勢自動化與智能化檢測平臺-微流控芯片技術:將樣品處理、PCR擴增、信號檢測集成于芯片,實現“樣本進-結果出”的全自動化檢測。例如,某公司開發(fā)的支原體檢測芯片,僅需2小時即可完成從樣品到結果輸出,靈敏度達1CFU/mL。-人工智能(AI)輔助數據解讀:通過機器學習算法分析微生物培養(yǎng)圖像、測序數據,提高檢測準確性和效率。例如,AI可自動識別支原體培養(yǎng)的“荷包蛋樣”菌落,減少人為誤差。未來技術發(fā)展趨勢多污染物同步檢測技術-多重PCR/NGS:通過多重引物或探針設計,在同一反應中檢測數十種污染物(如細菌、真菌、支原體、病毒)。例如,某研究
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