2026年生物信息學(xué)常用數(shù)據(jù)庫使用試題含答案一、單選題（每題2分，共20題）1.在NCBI（NationalCenterforBiotechnologyInformation）中，用于檢索核苷酸序列的主要數(shù)據(jù)庫是？A.PubMedB.GenBankC.ProteinDataBankD.UniProt答案：B解析：GenBank是NCBI的主要核苷酸序列數(shù)據(jù)庫，收錄了全球大部分的DNA和RNA序列數(shù)據(jù)。2.在歐洲分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室聯(lián)合會（EMBL-EBI）中，用于檢索蛋白質(zhì)序列的數(shù)據(jù)庫是？A.EMBLB.UniProtC.PDBD.InterPro答案：B解析：UniProt是EMBL-EBI的核心蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫，整合了多個蛋白質(zhì)信息資源。3.在蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)研究中，哪個數(shù)據(jù)庫提供三維蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)信息？A.GenBankB.PDBC.UniProtD.DDBJ答案：B解析：PDB（ProteinDataBank）是國際蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫，存儲了實(shí)驗(yàn)測定的蛋白質(zhì)和核酸結(jié)構(gòu)。4.在DDBJ（DNADataBankofJapan）中，用于檢索核酸序列的數(shù)據(jù)庫是？A.PDBB.UniProtC.EMBLD.DNABank答案：D解析：DDBJ的DNABank是其主要核苷酸序列數(shù)據(jù)庫，與GenBank和EMBL并列全球三大核酸數(shù)據(jù)庫。5.在UCSC（UniversityofCalifornia,SantaCruz）基因組瀏覽器中，哪個數(shù)據(jù)庫提供人類基因組參考序列？A.hg38B.GRCh38C.b38D.Hg19答案：B解析：GRCh38是UCSC當(dāng)前最新的人類基因組參考版本，廣泛用于基因組研究。6.在Ensembl中，用于檢索基因組注釋信息的數(shù)據(jù)庫是？A.EBIB.GenBankC.VegaD.EnsemblGenes答案：D解析：EnsemblGenes存儲了詳細(xì)的基因組注釋信息，包括基因、轉(zhuǎn)錄本和蛋白質(zhì)等。7.在NCBI中，用于檢索基因表達(dá)譜數(shù)據(jù)的數(shù)據(jù)庫是？A.GeneExpressionOmnibus(GEO)B.SRAC.PubMedD.dbGAP答案：A解析：GEO是NCBI的基因表達(dá)數(shù)據(jù)存儲庫，收錄了各類轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)。8.在SRA（SequenceReadArchive）中，用于檢索高通量測序數(shù)據(jù)的數(shù)據(jù)庫是？A.GEOB.DDBJC.EBID.SRA答案：D解析：SRA是NCBI的高通量測序數(shù)據(jù)存儲庫，全球最大的測序數(shù)據(jù)庫之一。9.在GTEx（Genotype-TissueExpression）數(shù)據(jù)庫中，主要研究的是？A.基因組變異B.蛋白質(zhì)表達(dá)C.基因型-組織表達(dá)關(guān)聯(lián)D.轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)答案：C解析：GTEx研究不同組織中基因組變異與表達(dá)的關(guān)系，為復(fù)雜疾病研究提供數(shù)據(jù)支持。10.在PrimerBank中，主要提供哪種類型的數(shù)據(jù)庫？A.基因組序列B.引物對數(shù)據(jù)庫C.蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)D.轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)答案：B解析：PrimerBank存儲了大量PCR引物對，常用于基因表達(dá)分析。二、多選題（每題3分，共10題）1.在NCBI中，哪些數(shù)據(jù)庫與GenBank相關(guān)？A.PubMedB.EMBLC.DDBJD.GenBank答案：A、B、C解析：GenBank與PubMed（文獻(xiàn)檢索）、EMBL（歐洲數(shù)據(jù)庫）和DDBJ（日本數(shù)據(jù)庫）共同構(gòu)成全球三大核酸數(shù)據(jù)庫。2.在EMBL-EBI中，哪些數(shù)據(jù)庫與蛋白質(zhì)信息相關(guān)？A.UniProtB.PDBC.InterProD.EMBL答案：A、B、C解析：UniProt、PDB和InterPro是EMBL-EBI的核心蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫，EMBL主要存儲核酸序列。3.在基因組瀏覽器中，哪些數(shù)據(jù)庫常被整合用于注釋？A.EnsemblB.UCSCC.NCBID.Vega答案：A、B、D解析：Ensembl、UCSC和Vega提供基因組注釋信息，NCBI主要是數(shù)據(jù)存儲。4.在高通量測序數(shù)據(jù)管理中，哪些數(shù)據(jù)庫常被用于數(shù)據(jù)存儲和檢索？A.GEOB.SRAC.DDBJD.EBI答案：A、B解析：GEO和SRA是主要的高通量測序數(shù)據(jù)存儲庫，DDBJ和EBI是核酸數(shù)據(jù)庫。5.在基因功能研究中，哪些數(shù)據(jù)庫提供實(shí)驗(yàn)證據(jù)？A.OMIMB.GeneCardsC.KEGGD.GO答案：A、B解析：OMIM和GeneCards提供基因功能注釋，KEGG和GO偏向通路和本體分析。6.在蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測中，哪些數(shù)據(jù)庫提供模板信息？A.PDBB.CDDC.Swiss-ModelD.ModBase答案：A、C、D解析：PDB提供結(jié)構(gòu)模板，Swiss-Model和ModBase是常用的同源建模數(shù)據(jù)庫。7.在轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析中，哪些數(shù)據(jù)庫提供參考基因組？A.GRCh38B.hg38C.mm10D.GRCm38答案：A、B、C、D解析：這些都是常用的參考基因組版本，分別對應(yīng)人類、小鼠等物種。8.在變異檢測中，哪些數(shù)據(jù)庫提供臨床注釋？A.ClinVarB.dbSNPC.LOVDD.VCF答案：A、C解析：ClinVar和LOVD提供變異的臨床意義注釋，dbSNP和VCF是變異格式和數(shù)據(jù)庫。9.在系統(tǒng)發(fā)育研究中，哪些數(shù)據(jù)庫提供物種樹信息？A.NCBITaxonomyB.TreeBASEC.PhylomaticD.NCBIGenBank答案：A、B、C解析：NCBITaxonomy提供物種分類，TreeBASE和Phylomatic提供系統(tǒng)發(fā)育樹。10.在藥物研發(fā)中，哪些數(shù)據(jù)庫提供靶點(diǎn)信息？A.DrugBankB.STITCHC.SwissTargetPredictionD.ChEMBL答案：A、C解析：DrugBank和SwissTargetPrediction提供藥物靶點(diǎn)信息，STITCH和ChEMBL偏向藥物-蛋白質(zhì)相互作用。三、判斷題（每題2分，共10題）1.GenBank是NCBI的主要核苷酸序列數(shù)據(jù)庫，與EMBL和DDBJ并列全球三大核酸數(shù)據(jù)庫。（正確）2.PDB數(shù)據(jù)庫只存儲蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)，不包含核酸結(jié)構(gòu)。（錯誤）3.GEO數(shù)據(jù)庫是EMBL-EBI的一部分，用于存儲基因表達(dá)數(shù)據(jù)。（錯誤，GEO是NCBI的數(shù)據(jù)庫）4.GTEx數(shù)據(jù)庫主要研究人類不同組織中的基因表達(dá)模式。（正確）5.PrimerBank是NCBI的數(shù)據(jù)庫，提供大量PCR引物對。（正確）6.UniProt是EMBL-EBI的核心蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫，整合了蛋白質(zhì)序列、結(jié)構(gòu)和功能信息。（正確）7.SRA數(shù)據(jù)庫是DDBJ的主要測序數(shù)據(jù)存儲庫。（錯誤，SRA是NCBI的數(shù)據(jù)庫）8.KEGG數(shù)據(jù)庫主要提供通路信息，不包含基因組數(shù)據(jù)。（錯誤，KEGG包含基因組注釋）9.Swiss-Model是用于蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測的數(shù)據(jù)庫，提供同源建模模板。（正確）10.ClinVar數(shù)據(jù)庫提供變異的臨床意義注釋，不包含實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)。（錯誤，ClinVar包含實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證數(shù)據(jù)）四、簡答題（每題5分，共4題）1.簡述NCBI和EMBL-EBI在生物信息學(xué)中的主要區(qū)別。答案：-NCBI（美國）主要數(shù)據(jù)庫包括GenBank（核酸）、GEO（基因表達(dá)）、SRA（測序數(shù)據(jù)）等，提供全面的生物數(shù)據(jù)檢索和分析工具。-EMBL-EBI（歐洲）主要數(shù)據(jù)庫包括EMBL（核酸）、UniProt（蛋白質(zhì)）、PDB（蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)）等，更側(cè)重于蛋白質(zhì)和結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)整合。解析：兩者都是全球三大核酸數(shù)據(jù)庫之一，但NCBI數(shù)據(jù)更全面，EMBL-EBI在蛋白質(zhì)領(lǐng)域更突出。2.簡述GEO數(shù)據(jù)庫在轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析中的作用。答案：-GEO存儲大量轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)（如RNA-Seq），支持用戶上傳和檢索實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)。-提供數(shù)據(jù)關(guān)聯(lián)分析工具（如GEO2R），幫助比較不同樣本的表達(dá)差異。解析：GEO是轉(zhuǎn)錄組研究的核心數(shù)據(jù)平臺，支持標(biāo)準(zhǔn)化數(shù)據(jù)管理和分析。3.簡述PDB數(shù)據(jù)庫在蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)研究中的應(yīng)用。答案：-存儲實(shí)驗(yàn)測定的蛋白質(zhì)和核酸三維結(jié)構(gòu)，為結(jié)構(gòu)生物學(xué)提供基礎(chǔ)數(shù)據(jù)。-支持結(jié)構(gòu)比對、功能預(yù)測和藥物設(shè)計(jì)等研究。解析：PDB是結(jié)構(gòu)生物學(xué)的核心數(shù)據(jù)庫，廣泛應(yīng)用于結(jié)構(gòu)功能關(guān)系研究。4.簡述ClinVar數(shù)據(jù)庫在遺傳病研究中的作用。答案：-收集和注釋基因變異的臨床意義，整合實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證數(shù)據(jù)。-幫助醫(yī)生和研究人員評估變異致病性，支持遺傳咨詢。解析：ClinVar是遺傳變異臨床解讀的重要工具，為遺傳病診斷提供依據(jù)。五、操作題（每題10分，共2題）1.假設(shè)你需要檢索人類基因HLA-B的序列，請說明在NCBIGenBank中如何操作。答案：-訪問NCBI網(wǎng)站（）。-在搜索框輸入“HLA-B”或“NM_000524.4”（基因ID）。-選擇“Nucleotide”數(shù)據(jù)庫進(jìn)行檢索。-查看結(jié)果，下載序列或查看注釋信息。解析：GenBank檢索需明確基因名稱或ID，選擇核酸數(shù)據(jù)庫。2.假設(shè)你需要下載人類基因組GRCh38的參考序列，請說明在UCSCGenomeBrowser中如何操作。答案：-訪問UCSCGenomeBrowser（）。-選擇“Human”作為物種，選擇“GRCh38”作為版本。-點(diǎn)擊“Download”或“TableBrowser”選擇下載區(qū)域（如chr1）。-選擇FASTA格式下載序列。解析：UCSC提供多種基因組版本，下載需明確物種和版本。六、論述題（每題15分，共2題）1.論述GEO數(shù)據(jù)庫在系統(tǒng)發(fā)育研究中的應(yīng)用價值。答案：-GEO存儲大量轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)，支持物種間基因表達(dá)模式比較。-可通過GEO2R等工具分析表達(dá)差異，推斷進(jìn)化關(guān)系。-結(jié)合系統(tǒng)發(fā)育樹軟件（如R