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文檔簡介
合成生物基因編輯工具研發(fā)工程師崗位招聘考試試卷及答案一、填空題(共10題,每題1分)1.CRISPR的全稱是______。2.Cas9蛋白切割雙鏈DNA的PAM序列通常為______。3.TALEN工具的核心識(shí)別單元是______。4.基因編輯中,雙鏈DNA斷裂后的主要修復(fù)途徑包括NHEJ和______。5.常用的熒光報(bào)告基因包括GFP和______。6.PCR技術(shù)中常用的耐高溫DNA聚合酶是______。7.RNA干擾(RNAi)過程中起關(guān)鍵作用的小RNA分子是______和siRNA。8.合成啟動(dòng)子的核心元件包括TATA框和______。9.基因編輯脫靶效應(yīng)的常用檢測方法是______(舉1種)。10.合成生物學(xué)的核心研究要素包括“設(shè)計(jì)、構(gòu)建、測試、______”。二、單項(xiàng)選擇題(共10題,每題2分)1.以下屬于RNA引導(dǎo)型基因編輯工具的是()A.ZFNB.TALENC.CRISPR-Cas9D.限制酶2.Cas9蛋白識(shí)別的PAM序列多為()A.5’-NGG-3’B.5’-TTTN-3’C.5’-NNN-3’D.5’-GTT-3’3.TALEN的重復(fù)單元(RVD)中,識(shí)別腺嘌呤(A)的是()A.NIB.NGC.HDD.NN4.合成生物學(xué)中常用的原核表達(dá)載體是()A.pUC系列B.pET系列C.pCMV系列D.pEGFP系列5.基因編輯后篩選陽性細(xì)胞常用的標(biāo)記基因是()A.AmpRB.LacZC.NeoRD.GFP6.CRISPR-Cas13的作用靶點(diǎn)是()A.雙鏈DNAB.單鏈DNAC.雙鏈RNAD.單鏈RNA7.ZFN的結(jié)構(gòu)不包括()A.鋅指結(jié)構(gòu)域B.FokI切割域C.sgRNAD.連接區(qū)8.以下不屬于基因編輯修復(fù)途徑的是()A.NHEJB.HDRC.RNAiD.MMEJ9.合成啟動(dòng)子的核心元件不包括()A.TATA框B.CAAT框C.增強(qiáng)子D.起始密碼子10.基因編輯效率的常用檢測方法是()A.測序B.電泳C.熒光定量PCRD.以上都是三、多項(xiàng)選擇題(共10題,每題2分,多選、少選均不得分)1.CRISPR-Cas系統(tǒng)的組成包括()A.Cas蛋白B.sgRNAC.PAM序列D.靶DNA2.基因編輯的主要應(yīng)用領(lǐng)域包括()A.基因治療B.作物改良C.合成生物學(xué)D.基礎(chǔ)科研3.TALEN設(shè)計(jì)需考慮的因素有()A.靶序列長度B.PAM序列C.重復(fù)單元(RVD)匹配D.切割域二聚化4.合成生物學(xué)的研究內(nèi)容包括()A.基因線路設(shè)計(jì)B.人工代謝途徑構(gòu)建C.基因編輯工具研發(fā)D.生物安全評估5.基因編輯脫靶效應(yīng)的影響因素有()A.sgRNA長度B.Cas蛋白濃度C.靶序列同源性D.細(xì)胞周期6.常用的基因編輯載體類型有()A.質(zhì)粒載體B.病毒載體(如AAV)C.轉(zhuǎn)座子載體D.人工染色體7.RNA引導(dǎo)的基因編輯工具包括()A.CRISPR-Cas9B.CRISPR-Cas13C.TALEND.ZFN8.合成啟動(dòng)子的設(shè)計(jì)原則包括()A.元件功能匹配B.強(qiáng)度可調(diào)C.物種特異性D.無同源序列9.基因編輯后細(xì)胞篩選方法有()A.抗生素篩選B.熒光分選C.測序篩選D.報(bào)告基因檢測10.合成生物學(xué)中常用的DNA合成技術(shù)有()A.化學(xué)合成法B.PCR擴(kuò)增C.基因合成D.鳥槍法測序四、判斷題(共10題,每題2分,正確打√,錯(cuò)誤打×)1.CRISPR-Cas9僅能切割雙鏈DNA()2.TALEN的識(shí)別特異性比ZFN高()3.合成啟動(dòng)子只能由天然序列拼接而成()4.NHEJ修復(fù)是精確的DNA修復(fù)途徑()5.CRISPR-Cas12a的PAM序列為5’-TTTN-3’()6.ZFN的鋅指結(jié)構(gòu)域每3個(gè)氨基酸識(shí)別1個(gè)bp()7.RNAi屬于基因編輯技術(shù)()8.合成生物學(xué)核心是“設(shè)計(jì)-構(gòu)建-測試-學(xué)習(xí)”循環(huán)()9.HDR修復(fù)需要同源模板DNA()10.CRISPR-Cas系統(tǒng)僅存在于細(xì)菌中()五、簡答題(共4題,每題5分)1.簡述CRISPR-Cas9基因編輯的基本原理。2.比較CRISPR-Cas9、TALEN和ZFN三種工具的主要區(qū)別。3.基因編輯工具研發(fā)需關(guān)注哪些關(guān)鍵問題?4.簡述合成啟動(dòng)子在基因編輯中的應(yīng)用及設(shè)計(jì)思路。六、討論題(共2題,每題5分)1.如何降低CRISPR-Cas9基因編輯的脫靶效應(yīng)?2.合成生物學(xué)與基因編輯結(jié)合在生物醫(yī)藥領(lǐng)域的應(yīng)用前景及挑戰(zhàn)。---答案部分一、填空題答案1.規(guī)律間隔成簇短回文重復(fù)序列2.5’-NGG-3’3.轉(zhuǎn)錄激活因子樣效應(yīng)物(TALE)4.同源定向修復(fù)(HDR)5.RFP(或其他合理熒光報(bào)告基因)6.Taq酶(或熱穩(wěn)定DNA聚合酶)7.miRNA8.CAAT框(或其他核心啟動(dòng)子元件)9.GUIDE-seq(或Digenome-seq等合理方法)10.學(xué)習(xí)二、單項(xiàng)選擇題答案1.C2.A3.B4.B5.C6.D7.C8.C9.D10.D三、多項(xiàng)選擇題答案1.ABCD2.ABCD3.ACD4.ABCD5.ABCD6.ABC7.AB8.ABC9.ABD10.AC四、判斷題答案1.√2.√3.×4.×5.√6.√7.×8.√9.√10.×五、簡答題答案1.CRISPR-Cas9原理:sgRNA與靶DNA互補(bǔ)配對,引導(dǎo)Cas9結(jié)合靶位點(diǎn);Cas9識(shí)別旁側(cè)PAM后切割雙鏈DNA產(chǎn)生斷裂;細(xì)胞通過NHEJ(易錯(cuò)修復(fù),引入突變)或HDR(同源修復(fù),精確編輯)修復(fù)斷裂,實(shí)現(xiàn)基因編輯。2.三者區(qū)別:①引導(dǎo)方式:Cas9(RNA引導(dǎo))、TALEN/ZFN(蛋白引導(dǎo));②設(shè)計(jì)難度:Cas9(僅sgRNA)<TALEN<ZFN;③特異性:Cas9略低、TALEN/ZFN較高;④效率:Cas9最高、TALEN次之、ZFN最低;⑤靶序列限制:Cas9更廣、TALEN/ZFN有一定限制。3.關(guān)鍵問題:①特異性(降低脫靶);②效率(提高編輯成功率);③安全性(減少細(xì)胞毒性);④通用性(適配不同物種/細(xì)胞);⑤可調(diào)控性(時(shí)空特異性編輯);⑥可擴(kuò)展性(多基因同時(shí)編輯)。4.合成啟動(dòng)子應(yīng)用與設(shè)計(jì):應(yīng)用:調(diào)控Cas9等工具表達(dá),避免持續(xù)表達(dá)脫靶;設(shè)計(jì)思路:①選核心元件(TATA框、CAAT框);②匹配物種特異性序列;③元件組合/修飾調(diào)控強(qiáng)度;④引入可誘導(dǎo)元件(如四環(huán)素響應(yīng)元件)實(shí)現(xiàn)可控表達(dá)。六、討論題答案1.降低脫靶的方法:①優(yōu)化sgRNA:選高特異性序列、縮短長度(17-18bp);②改造Cas9:用eSpCas9、HypaCas9等變體;③控制表達(dá)量:弱啟動(dòng)子或瞬時(shí)表達(dá)(RNP復(fù)合物);④檢測脫靶:GUIDE-seq等提前評估;⑤雙切口編輯:Cas9n結(jié)合雙sgRNA
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