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文檔簡介
植物生產(chǎn)類農(nóng)業(yè)科研機(jī)構(gòu)植物生產(chǎn)技術(shù)實(shí)習(xí)報(bào)告一、摘要
2023年7月10日至9月5日,我在某植物生產(chǎn)類農(nóng)業(yè)科研機(jī)構(gòu)擔(dān)任實(shí)習(xí)技術(shù)員,參與水稻品種抗病性評(píng)價(jià)項(xiàng)目。核心工作成果包括完成120份病斑樣本的病原菌分離與鑒定,統(tǒng)計(jì)結(jié)果顯示其中85份樣本感染稻瘟病菌,占總樣本的70.8%;協(xié)助建立抗病性評(píng)價(jià)體系,篩選出3個(gè)高抗病品種,其發(fā)病率低于5%。專業(yè)技能應(yīng)用包括掌握分子標(biāo)記輔助選擇技術(shù),完成30份基因組DNA提取,并運(yùn)用SSR引物檢測標(biāo)記基因;通過田間試驗(yàn)數(shù)據(jù)采集,建立抗病性評(píng)分模型,相關(guān)系數(shù)R2達(dá)0.89。提煉出標(biāo)準(zhǔn)化樣本處理流程與數(shù)據(jù)分析方法,可應(yīng)用于類似病害研究。
二、實(shí)習(xí)內(nèi)容及過程
2023年7月10日到9月5日,我在一家植物生產(chǎn)類科研機(jī)構(gòu)實(shí)習(xí),崗位是技術(shù)員。主要目標(biāo)是熟悉田間試驗(yàn)管理流程,掌握抗病性評(píng)價(jià)技術(shù)。單位規(guī)模不大,大概有二十幾個(gè)研究員和實(shí)驗(yàn)人員,研究方向集中在水稻和玉米的育種與栽培。
實(shí)習(xí)期間,核心工作圍繞水稻抗稻瘟病品種篩選展開。7月15日至8月10日,跟著師兄學(xué)田間管理,每天記錄溫濕度、光照等環(huán)境數(shù)據(jù),并處理病斑樣本。8月12日到8月25日,獨(dú)立完成120份病斑樣本的病原菌分離,用顯微鏡觀察菌絲形態(tài),結(jié)合分子條形碼技術(shù)鑒定病原種類。結(jié)果發(fā)現(xiàn)85份樣本是稻瘟病菌,占比70.8%,其中30份屬于高致病性菌株。
遇到最大困難是8月18日數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)分析卡殼。之前學(xué)過SPSS,但面對(duì)大量田間試驗(yàn)數(shù)據(jù),主成分分析和聚類分析總出不了合理結(jié)果。導(dǎo)師建議先用Excel篩選關(guān)鍵指標(biāo),再導(dǎo)入R語言繪圖。我花了三天重新整理數(shù)據(jù)集,學(xué)會(huì)用ggplot2包做熱圖和樹狀圖,最后相關(guān)性分析顯示抗病性評(píng)分與葉片脯氨酸含量呈顯著正相關(guān)(R2=0.82)。
9月1日到實(shí)習(xí)結(jié)束,參與抗病性評(píng)價(jià)體系優(yōu)化。用隸屬函數(shù)法綜合評(píng)分,把3個(gè)發(fā)病率低于5%的品種標(biāo)記為高抗,它們?cè)贒NA水平也檢測到多個(gè)抗病基因位點(diǎn)。期間還幫忙整理了基因型測序數(shù)據(jù),發(fā)現(xiàn)SSR標(biāo)記X309能區(qū)分80%的病圃材料。
單位培訓(xùn)挺隨意的,沒系統(tǒng)講實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)或者統(tǒng)計(jì)分析,更多靠師兄師姐帶。有時(shí)候覺得崗位要求跟學(xué)校課程銜接不緊密,比如分子實(shí)驗(yàn)操作規(guī)范在課堂上講得少。管理上也有點(diǎn)亂,同一批樣本不同組處理方式不一,最后得返工。建議他們可以建立標(biāo)準(zhǔn)化操作手冊(cè),或者定期組織行業(yè)案例分享會(huì)。這次經(jīng)歷讓我意識(shí)到,做科研不能光會(huì)跑試驗(yàn),還得懂?dāng)?shù)據(jù)挖掘,下回得加強(qiáng)R語言和Python學(xué)習(xí)。感覺職業(yè)規(guī)劃要更側(cè)重?cái)?shù)據(jù)分析方向了。
三、總結(jié)與體會(huì)
2023年9月5日結(jié)束實(shí)習(xí)時(shí),我盤點(diǎn)這八周收獲,感覺像是從書本走向田野的過渡。當(dāng)初去時(shí)想學(xué)田間數(shù)據(jù)怎么收集,回來后明白更關(guān)鍵的是怎么讓數(shù)據(jù)說話。比如8月那場雨后病圃調(diào)查,單純記錄發(fā)病率不夠,得結(jié)合葉片相對(duì)含水量變化,這才關(guān)聯(lián)出抗病性跟滲透調(diào)節(jié)能力的相關(guān)性。這種從現(xiàn)象到機(jī)理的思考方式,實(shí)驗(yàn)室永遠(yuǎn)給不了。
最直觀的改變是抗壓能力。7月21日同時(shí)處理50份樣品時(shí),第一次出現(xiàn)菌絲污染,急得手足無措。導(dǎo)師讓我先隔離可疑樣本再分析原因,后來發(fā)現(xiàn)是高壓滅菌鍋密封圈老化。這件事讓我記著,科研失誤不是查錯(cuò),而是建立錯(cuò)誤處理流程。現(xiàn)在看文獻(xiàn)會(huì)刻意關(guān)注作者怎么處理異常數(shù)據(jù),比如9月讀的《作物學(xué)報(bào)》那篇稻瘟病模型,作者提過樣本混勻不均會(huì)導(dǎo)致預(yù)測偏差,這種細(xì)節(jié)以前完全忽略。
職業(yè)規(guī)劃上更清晰了。實(shí)習(xí)中接觸到的分子標(biāo)記輔助選擇技術(shù),學(xué)校課程只講原理,單位用的卻是最新版Amplicon數(shù)據(jù)解析流程。我發(fā)現(xiàn)自己缺的不僅是實(shí)驗(yàn)技能,還有生物信息學(xué)短板。下學(xué)期打算報(bào)個(gè)Coursera的二代測序課程,順便把之前擱置的英語六級(jí)證書拿下。行業(yè)里好像現(xiàn)在都講究高通量,不會(huì)數(shù)據(jù)處理,以后連文獻(xiàn)都看不懂。
看著9月1日篩選出的那批抗病株標(biāo)記,突然覺得科研真有意思。以前覺得實(shí)驗(yàn)是重復(fù)勞動(dòng),現(xiàn)在明白每個(gè)數(shù)據(jù)都是別人踩坑的結(jié)果。比如他們用病圃做抗性鑒定,會(huì)人為控制孢子密度,這種標(biāo)準(zhǔn)化操作比自然發(fā)病更能定位基因。行業(yè)趨勢我看,未來育種肯定繞不開大數(shù)據(jù),像那篇文獻(xiàn)提的機(jī)器學(xué)習(xí)預(yù)測抗病性,再結(jié)合我實(shí)習(xí)時(shí)用的KASP標(biāo)記,感覺離產(chǎn)業(yè)很近了。從學(xué)生到職場人,心態(tài)轉(zhuǎn)變挺明顯的以前犯錯(cuò)想躲,現(xiàn)在覺得是積累經(jīng)驗(yàn)的機(jī)會(huì)。下階段得少琢磨怎么“表現(xiàn)”,多想怎么把事情做扎實(shí)。
四、致謝
感謝實(shí)習(xí)單位給我機(jī)會(huì),讓我在有限時(shí)間里接觸實(shí)際科研流程。
特別感謝導(dǎo)師,8月15日指導(dǎo)我分離病原菌時(shí),耐心糾正我培養(yǎng)基配比錯(cuò)誤,后來看數(shù)據(jù)分析報(bào)告也是逐條點(diǎn)醒我思路。
同事們幫忙解決過很多小麻煩,
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