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1、生物化學(xué)知識(shí)點(diǎn)總結(jié)第一章 蛋白質(zhì)化學(xué)1、氨基酸的分類: 記?。?0種蛋白質(zhì)氨基酸的結(jié)構(gòu)式,三字母符號(hào)。例題:1、請(qǐng)寫(xiě)出下列物質(zhì)的結(jié)構(gòu)式: 賴氨酸,組氨酸,谷氨酰胺。 2、寫(xiě)出下列縮寫(xiě)符號(hào)的中文名稱: Ala Glu Asp Cys 3、是非題: 1)天然氨基酸都有一個(gè)不對(duì)稱碳原子。 2)自然界的蛋白質(zhì)和多肽類物質(zhì)均由L氨基酸組成。2、氨基酸的酸堿性質(zhì)3、氨基酸的等電點(diǎn)(pI):使氨基酸處于凈電荷為零時(shí)的pH。4、紫外光譜性質(zhì):三種氨基酸具有紫外吸收性質(zhì)。最大吸收波長(zhǎng):酪氨酸275nm;苯丙氨酸257nm;色氨酸280nm。一般考選擇題或填空題。5、化學(xué)反應(yīng): 與氨基的反應(yīng):6、蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)層次
2、一級(jí)(10)結(jié)構(gòu)(primary structure):指多肽鏈中以肽鍵相連的氨基酸序列。 二級(jí)(20)結(jié)構(gòu)(secondary structure):指多肽鏈借助氫鍵排列成一些規(guī)則片斷,螺旋,-折疊, -轉(zhuǎn)角及無(wú)規(guī)則卷曲。n 超二級(jí)結(jié)構(gòu):在球狀蛋白質(zhì)中,若干相鄰的二級(jí)結(jié)構(gòu)單元如-螺旋,-折疊,-轉(zhuǎn)角組合在一起,彼此相互作用,形成有規(guī)則的在空間上能辨認(rèn)的二級(jí)結(jié)構(gòu)組合體,并充當(dāng)三級(jí)結(jié)構(gòu)的構(gòu)件,基本組合有:,。結(jié)構(gòu)域: 結(jié)構(gòu)域是多肽鏈在二級(jí)結(jié)構(gòu)或超二級(jí)結(jié)構(gòu)的基礎(chǔ)上形成三級(jí)結(jié)構(gòu)的局部折疊區(qū),它是一個(gè)相對(duì)獨(dú)立的緊密球狀實(shí)體7、維持蛋白質(zhì)各級(jí)結(jié)構(gòu)的作用力:一級(jí)結(jié)構(gòu):肽鍵二,三,四級(jí)結(jié)構(gòu):氫鍵,范德華力,
3、疏水作用力,離子鍵和二硫鍵。胰蛋白酶: Lys和Arg羧基所參加的反應(yīng)糜蛋白酶:Phe,Tyr,Trp羧基端肽鍵。梭菌蛋白酶: Arg的羧基端溴化氰:只斷裂Met的羧基形成的肽鍵。 波耳效應(yīng):當(dāng)H+離子濃度增加時(shí),pH值下降,氧飽和度右移,這種pH對(duì)血紅蛋白對(duì)氧的親和力影響被稱為波耳效應(yīng)(Bohr效應(yīng))。第二章 核酸化學(xué)1、核苷酸: 四種堿基的結(jié)構(gòu)式,四種核苷酸的結(jié)構(gòu)式,四種脫氧核苷酸的結(jié)構(gòu)式,假尿嘧啶核苷酸的結(jié)構(gòu)式,環(huán)腺苷酸的結(jié)構(gòu)式。2、核酸的一級(jí)結(jié)構(gòu):核苷酸是核酸的基本結(jié)構(gòu)單位。核苷酸以磷酸二酯鍵連接。例題:核酸的基本結(jié)構(gòu)單位是 。3、DNA的二級(jí)結(jié)構(gòu):雙螺旋 Watson雙螺旋的結(jié)構(gòu)特點(diǎn)
4、,雙螺旋類型,雙螺旋的維持力4、tRNA的二級(jí)結(jié)構(gòu)和三級(jí)結(jié)構(gòu) 二級(jí)結(jié)構(gòu):三葉草形結(jié)構(gòu) 三級(jí)結(jié)構(gòu):倒L形。5、原核生物和真核生物mRNA的區(qū)別 原核生物mRNA為多順?lè)醋觤RNA。真核生物mRNA具5端帽子和3端多聚腺苷酸結(jié)構(gòu),是單順?lè)醋印?、限制性內(nèi)切酶:在細(xì)菌中發(fā)現(xiàn)的,具有嚴(yán)格的堿基序列專一性,主要是降解外源的DNA一類酶。第三章 酶1、酶的概念 經(jīng)典概念:是一類由活細(xì)胞產(chǎn)生的,具有特殊催化能力,高度專一性的蛋白質(zhì)。 目前的定義:是生物體內(nèi)一類具有催化能力和特定空間構(gòu)象的生物大分子。4、全酶酶蛋白輔助因子5、酶的系統(tǒng)命名法例題:寫(xiě)出下列反應(yīng)酶的國(guó)際系統(tǒng)命名6、酶的分類 1)氧化還原酶 2)轉(zhuǎn)
5、移酶 3)水解酶 4)裂合酶 5)異構(gòu)酶 6)合成酶7、酶活力的概念,酶活力單位,比活力,總活力 酶活力是指酶催化某一化學(xué)反應(yīng)的能力。用一定條件下所催化的某一反應(yīng)的速率來(lái)表示。 酶活力單位:在一定條件下,一定時(shí)間內(nèi)將一定量的底物轉(zhuǎn)化為產(chǎn)物所需的酶量(unit, U)。8、酶的專一性假說(shuō):鎖鑰學(xué)說(shuō),誘導(dǎo)契合假說(shuō)9、酶的專一性分為結(jié)構(gòu)專一性和立體異構(gòu)專一性。10、酶的活性部位:酶分子中能和底物結(jié)合并起催化作用的空間部位,分為結(jié)合部位和催化部位。11、米氏方程 米氏常數(shù)的意義:米氏常數(shù)Km是當(dāng)酶的反應(yīng)速率達(dá)到最大反應(yīng)速率一半時(shí)的底物濃度,單位是濃度單位(mol/L)。Km是酶的一個(gè)特性常數(shù),只與酶的
6、性質(zhì)有關(guān)。12、溫度系數(shù)(Q10):反應(yīng)提高10,其酶促反應(yīng)速率與原來(lái)反應(yīng)速率之比。13、酶的抑制作用:酶的必需基團(tuán)受到某種物質(zhì)影響發(fā)生改變,導(dǎo)致酶活性降低或喪失。 可逆抑制作用:抑制劑與酶以非共價(jià)鍵結(jié)合,引起酶活性喪失或者降低,可以用物理化學(xué)方法除去抑制劑,使酶復(fù)活。分為三類: 競(jìng)爭(zhēng)性抑制作用 非競(jìng)爭(zhēng)性抑制作用 反競(jìng)爭(zhēng)性抑制作用競(jìng)爭(zhēng)性抑制作用:抑制劑(I)與底物(S)有相似的結(jié)構(gòu),它們競(jìng)爭(zhēng)酶的活性部位,從而影響底物與酶的正常結(jié)合,使酶的活性降低,這種抑制作用可以通過(guò)增加底物濃度解除。非競(jìng)爭(zhēng)性抑制作用:抑制劑與酶活性中心以外的部位結(jié)合,不妨礙酶與底物的結(jié)合,可以形成ESI復(fù)合物,這種復(fù)合物不能
7、進(jìn)一步轉(zhuǎn)變?yōu)楫a(chǎn)物。這種抑制作用不能用增加底物的方式解除。反競(jìng)爭(zhēng)性抑制作用:酶與底物結(jié)合后才能與抑制劑結(jié)合形成ESI復(fù)合物,這種復(fù)合物不能分解為產(chǎn)物,從而抑制了酶的活性。16、決定酶高效率的機(jī)制: 鄰近效應(yīng)和定向效應(yīng);誘導(dǎo)契合;酸堿催化;共價(jià)催化;局部微環(huán)境的影響。17、酶的別構(gòu)調(diào)節(jié):酶分子的非催化部位與某些化合物可逆的非共價(jià)結(jié)合,使酶發(fā)生構(gòu)象的改變,進(jìn)而改變酶活性狀態(tài),稱為酶的別構(gòu)調(diào)節(jié)。效應(yīng)物:能使酶分子發(fā)生別構(gòu)作用的物質(zhì),又分為正效應(yīng)物和負(fù)效應(yīng)物。第四章 維生素1、維生素:是維持機(jī)體正常生命活動(dòng)不可缺少的小分子有機(jī)物。分為脂溶性維生素和水溶性維生素2、維生素A缺乏癥:夜盲癥3、維生素D缺乏癥
8、:佝僂病4、維生素B1:是TPP的前體;TPP是丙酮酸脫羧酶,乙酰乳酸合成酶,戊糖磷酸途徑中轉(zhuǎn)酮酶的輔酶。缺乏癥是腳氣病。5、維生素PP:是NAD,NADP的組成成分。6、維生素B2是FAD,F(xiàn)MN的組成成分7、泛酸是輔酶A的組成成分8、維生素B6是磷酸吡哆胺和磷酸吡哆醛的前體,這兩種物質(zhì)主要作為轉(zhuǎn)氨酶和脫羧酶的輔酶n 9、維生素B12的缺乏癥:惡性貧血n 10、葉酸:是四氫葉酸的前體,四氫葉酸是體內(nèi)一碳單位的載體。n 11、硫辛酸作為丙酮酸脫氫酶系中的一個(gè)輔酶。第五章 糖代謝1、糖酵解:發(fā)生場(chǎng)所,反應(yīng)過(guò)程,酶,調(diào)控酶,限速反應(yīng),能量變化及生理意義場(chǎng)所:細(xì)胞質(zhì)調(diào)控酶:己糖激酶,磷酸果糖激酶,丙
9、酮酸激酶凈產(chǎn)生2個(gè)ATP2、三羧酸循環(huán):場(chǎng)所,反應(yīng)過(guò)程,酶,調(diào)控酶,能量產(chǎn)生,生理意義產(chǎn)所:線粒體調(diào)控酶:檸檬酸合成酶、異檸檬酸脫氫酶和-酮戊二酸脫氫酶能量產(chǎn)生:10個(gè)ATPn 3、糖原合成和分解:場(chǎng)所和過(guò)程n 4、糖異生:三個(gè)迂回措施n 5、磷酸戊糖途徑的生理意義是細(xì)胞產(chǎn)生還原力(NADPH)的主要途徑。是細(xì)胞內(nèi)不同結(jié)構(gòu)糖分子的重要來(lái)源,并為各種單糖的相互轉(zhuǎn)變提供條件6、乙醛酸途徑中兩個(gè)特有的酶:異檸檬酸裂合酶和蘋(píng)果酸合酶7、胰島素,胰高血糖素,腎上腺素,糖皮質(zhì)激素對(duì)血糖的作用。第六章 生物氧化1、生物氧化的概念: 是有機(jī)物在活細(xì)胞中進(jìn)行氧化分解生成二氧化碳和水,并釋放出能量的過(guò)程。2、呼吸
10、鏈:在生物氧化過(guò)程中,基質(zhì)脫下的氫經(jīng)過(guò)一系列傳遞體傳遞,最后與氧結(jié)合生成水的電子傳遞系統(tǒng),在具有線粒體的生物中,呼吸鏈分為NADH鏈和FADH2鏈兩種。4、呼吸鏈的組成:NADH鏈:NADH輔酶Q還原酶,輔酶Q,輔酶Q細(xì)胞色素c還原酶,細(xì)胞色素c,細(xì)胞色素氧化酶。FADH2鏈:FADH2輔酶Q還原酶,輔酶Q,輔酶Q細(xì)胞色素c還原酶,細(xì)胞色素c,細(xì)胞色素氧化酶。5、底物水平磷酸化:在代謝過(guò)程中,由于底物分子內(nèi)部能量重新分布產(chǎn)生的高能磷酸鍵轉(zhuǎn)移給ADP,產(chǎn)生ATP或GTP的反應(yīng)。6、氧化磷酸化:電子在呼吸鏈傳遞過(guò)程中釋放的能量,在ATP合成酶催化下,促使ADP生成ATP,這是氧化與磷酸化相偶聯(lián)的反
11、應(yīng),稱為氧化磷酸化,是生物合成ATP的主要方式。7、氧化作用和磷酸化作用相偶聯(lián)的部位8、呼吸抑制劑阻斷呼吸鏈的部位:n 計(jì)算當(dāng)一對(duì)電子從NADH轉(zhuǎn)移到細(xì)胞色素C的反應(yīng)中,標(biāo)準(zhǔn)自由能的變化。 (pH=7.0,250C,NAD/NADH+H+ E0,=-0.32V, Cyt C Fe3+/Fe2+ E0,=+0.235V ) 答案:G0nFE 223.062【0.235(0.32)】25.6 Kcal/mol第七章 脂類代謝n -氧化:脂肪酸氧化從羧基端的位碳原子開(kāi)始,每次分解出一個(gè)2碳片斷,生成一個(gè)乙酰CoA的過(guò)程,是脂肪酸氧化的主要方式。1、脂肪酸的氧化分解氧化1)脂肪酸的活化 部位:細(xì)胞質(zhì);
12、酶:脂酰輔酶A合成酶 需要消耗1個(gè)ATP,2個(gè)高能磷酸鍵。不可逆反應(yīng)。2)長(zhǎng)鏈脂肪酸的轉(zhuǎn)運(yùn):脂酰肉堿轉(zhuǎn)運(yùn)機(jī)制3)氧化 部位:線粒體 反應(yīng)過(guò)程:脫氫,水化,脫氫,硫解 酶:脂酰輔酶A脫氫酶(FAD輔酶),烯酰輔酶A水合酶,3羥脂酰輔酶A脫氫酶(NAD+輔酶),硫解酶 能量產(chǎn)生:乙酰輔酶A進(jìn)入TCA循環(huán),NADH和FADH2進(jìn)入呼吸鏈。 -氧化過(guò)程 4步反應(yīng):脫氫,加水,脫氫,硫解2、磷脂酶A1,磷脂酶A2,磷脂酶C,磷脂酶D的作用位點(diǎn)。3、酮體產(chǎn)生 酮體:是一類小分子有機(jī)物,脂肪酸分解代謝產(chǎn)生的特有中間產(chǎn)物,包括乙酰乙酸, 羥丁酸,丙酮。 產(chǎn)所:肝臟線粒體 原料:乙酰輔酶A 關(guān)鍵酶:羥甲基戊二酸
13、單酰輔酶A合成酶4、酮體的利用:解酮作用(ketolysis) 由于肝內(nèi)缺乏分解酮體所需要的硫激酶,酮體的分解須在肝外組織中進(jìn)行(轉(zhuǎn)硫酶的作用相當(dāng)于硫激酶),最終轉(zhuǎn)變成乙酰CoA進(jìn)入三羧酸循環(huán)途徑氧化供能。5、脂肪酸的合成 分為從頭合成途徑和延長(zhǎng)途徑從頭合成途徑的產(chǎn)所:細(xì)胞質(zhì)原料:乙酰輔酶A乙酰輔酶A的轉(zhuǎn)運(yùn):檸檬酸丙酮酸循環(huán)?;d體蛋白(ACP)的作用:脂肪酸合成酶系中的酰基載體。合成氫源:NADPH+H+第八章 氨基酸的代謝1、氮的平衡:氮的總平衡;氮的正平衡;氮的負(fù)平衡2、必需氨基酸:8種,纈氨酸,亮氨酸,異亮氨酸,蘇氨酸,甲硫氨酸,苯丙氨酸,色氨酸,賴氨酸3、氨基酸共同代謝途徑脫氨基作用
14、:轉(zhuǎn)氨,脫氨,聯(lián)合脫氨轉(zhuǎn)氨作用的酶:轉(zhuǎn)氨酶(輔酶是磷酸吡哆醛,維生素B6的衍生物)轉(zhuǎn)氨作用的機(jī)制:乒乓機(jī)制脫氨基作用的酶:L氨基酸氧化酶,谷氨酸脫氫酶(輔酶NAD+ NADP+)聯(lián)合脫氨基作用:以谷氨酸為中心的聯(lián)合脫氨基作用,天冬氨酸的聯(lián)合脫氨基作用聯(lián)合脫氨基作用:氨基酸與-酮戊二酸經(jīng)轉(zhuǎn)氨作用生成-酮酸和谷氨酸,后者經(jīng)L-谷氨酸脫氫酶作用生成游離氨和-酮戊二酸的過(guò)程。是轉(zhuǎn)氨基作用和L-谷氨酸氧化脫氨基作用聯(lián)合反應(yīng)。骨骼肌中氨基轉(zhuǎn)運(yùn):葡萄糖丙氨酸循環(huán)氨基的去路尿素循環(huán) 產(chǎn)所:線粒體和細(xì)胞質(zhì) 限速酶:精氨酸代琥珀酸合成酶n 尿素循環(huán):是路生動(dòng)物排氨的主要途徑,氨基酸氧化時(shí)產(chǎn)生的氨,在肝臟細(xì)胞線粒體
15、和胞質(zhì)中,經(jīng)過(guò)谷氨酸,瓜氨酸,精胺琥珀酸,精氨酸,鳥(niǎo)氨酸循環(huán),生成尿素的過(guò)程。氨基的脫羧反應(yīng):產(chǎn)物是一級(jí)胺,大部分一級(jí)胺有毒,少數(shù)作為生物活性物質(zhì)。-氨基丁酸:抑制性神經(jīng)遞質(zhì)組胺:強(qiáng)烈的血管舒張劑,能增加毛細(xì)血管的通透性。5-羥色胺:腦內(nèi)5-羥色胺可作為抑制性神經(jīng)遞質(zhì)。在外周組織,5-羥色胺有收縮血管的作用第九章 核酸代謝1、核酸的降解:蛇毒磷酸二酯酶和牛脾磷酸二酯酶的作用位點(diǎn)2、核苷酸的合成:從頭合成途徑和補(bǔ)救途徑從頭途徑中元素來(lái)源3、DNA的生物合成半保留復(fù)制:即新的雙鏈DNA中,一股鏈來(lái)自模板,一股鏈為新合成的。復(fù)制子:基因組能獨(dú)立進(jìn)行復(fù)制的單位 半不連續(xù)復(fù)制:DNA雙鏈在進(jìn)行復(fù)制時(shí),一
16、條模板鏈35方向,復(fù)制鏈以5 3方向連續(xù)合成,另一條模板鏈3 5方向,復(fù)制鏈以5 3方向合成許多DNA片斷,最后連成完整的鏈。岡崎片斷:岡崎用電子顯微鏡看到了DNA復(fù)制過(guò)程中出現(xiàn)一些不連續(xù)片段,這些不連續(xù)片段只存在與DNA復(fù)制叉上其中的一股。后來(lái)就把這些不連續(xù)的片段稱為岡崎片段。DNA連接酶(ligase)原核生物以NAD+為能量供體,為DNA連接酶提供能量。真核生物以ATP為能量供體,為DNA連接酶提供能量拓?fù)洚悩?gòu)酶:是一類可改變DNA拓?fù)湫再|(zhì) 的酶。解旋酶 通過(guò)ATP水解提供能量,使堿基對(duì)分開(kāi) 大部分的解旋酶方向是沿著5 3方向單鏈結(jié)合蛋白 和 引發(fā)酶 復(fù)制過(guò)程分為:起始,延伸,終止三個(gè)階
17、段3、復(fù)制的終止原核生物和真核生物DNA復(fù)制的區(qū)別DNA的損傷修復(fù)5、DNA指導(dǎo)的RNA聚合 RNA聚合酶活性特點(diǎn): 1)底物:4種NTP 2)模板:DNA雙鏈中的一條鏈 3)合成方向:5 3 4)合成RNA鏈第一個(gè)核苷酸5有3個(gè)磷酸基 5)引物:無(wú) 6)外切酶作用:無(wú) 表1:E.coli RNA聚合酶各亞基的大小與功能:模板鏈:用于轉(zhuǎn)錄的DNA鏈。編碼鏈:與模板鏈相對(duì)應(yīng)的DNA鏈。例題:是非題:DNA復(fù)制時(shí),前導(dǎo)鏈只需1個(gè)引物,后隨鏈則需多個(gè)引物。是非題:原核生物的基因往往為斷裂基因,因大多數(shù)基因都被內(nèi)含子所分隔。 第十章 蛋白質(zhì)的生物合成1、中心法則2、遺傳密碼:起始密碼:AUG終止密碼:
18、UAA,UGA,UAG特點(diǎn):連續(xù)性,簡(jiǎn)并性,變偶性,通用性和變異性,糾錯(cuò)性核糖體的功能位點(diǎn)1、P位:即肽酰結(jié)合位(peptidyl site),在延長(zhǎng)成肽之后,肽酰tRNA占據(jù)的位置,肽鏈轉(zhuǎn)位至此,延長(zhǎng)繼續(xù)。2、A位:即氨酰接受位(aminoacyl site),氨基酰tRNA就加入到A位上,延長(zhǎng)成肽中,此位因接受肽酰基鏈,故名受位。3、E位:排出位(exit site)起始密碼子和起始tRNA 真核生物的tRNAi攜帶的是甲硫氨酸;原核生物的tRNAi攜帶的是甲酰甲硫氨酸。延伸過(guò)程3個(gè)步驟: 1)進(jìn)位:與第二個(gè)密碼子相對(duì)應(yīng)的氨酰tRNA結(jié)合到A位。消耗一個(gè)GTP 2)轉(zhuǎn)肽:P位上的fMet羧基與A位氨基酸的氨基形成肽鍵。 3)移位:核糖體移動(dòng),使氨酰tRNA和肽酰tRNA位置發(fā)生變化。消耗一個(gè)GTP.肽鏈合成的終止和釋放 肽鏈合成結(jié)束后,肽鏈從核糖體上釋放的過(guò)程。3個(gè)步驟: 1)釋放因子識(shí)別終
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