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文檔簡介
1、2003年4月14日宣布人類基因組序列圖完成 這標(biāo)志著進(jìn)入了后基因組時代。,人類基因組:指DNA分子所攜帶的全部 遺傳信息。,蛋白質(zhì)組:生物個體表達(dá)的蛋白質(zhì)分子的總和。主要是對蛋白質(zhì)功能的研究,專題5 DNA和蛋白質(zhì)技術(shù),蛋白質(zhì)分離的原理:,根據(jù)蛋白質(zhì)各種特性的差異,如分子的形狀和大小、所帶電荷的性質(zhì)和多少、溶解度、吸附性質(zhì)和對其他分子的親和力等等,可以用來分離不同種類的蛋白質(zhì)。,一、基礎(chǔ)知識,(一) 凝膠色譜法,2.凝膠:,大多數(shù)凝膠是由多糖類化合物(如葡聚糖或瓊脂糖)構(gòu)成的多孔小球體,內(nèi)部有許多貫穿的通道。,根據(jù)被分離物質(zhì)的蛋白質(zhì)相對分子質(zhì)量的大小,利用具有網(wǎng)狀結(jié)構(gòu)的凝膠,來進(jìn)行分離。,1
2、.概念:,(分配色譜法),3.凝膠色譜法分離蛋白質(zhì)的具體過程,4.凝膠色譜法的原理,相對分子量較小的蛋白質(zhì)容易進(jìn)入凝膠內(nèi)部的通道,路程較長,移動速度較慢; 相對分子量較大的蛋白質(zhì)無法進(jìn)入凝膠內(nèi)部的通道,只能在凝膠外部移動,路程較短,移動速度較快。 相對分子質(zhì)量不同的蛋白質(zhì)分子因此得以分離。,進(jìn)行體外實(shí)驗(yàn)時,如何保證蛋白質(zhì)不會發(fā)生變性呢?,(二)緩沖溶液,能夠抵制外界的酸和堿對溶液PH值的影響, 維持PH基本不變。,1.作用:,2.緩沖溶液的配制:,通常由12 種緩沖劑溶解于水 中配制而成。調(diào)節(jié)緩沖劑的使用比例就可以制得在不同PH范圍內(nèi)使用的緩沖液。,3. 在本課題中使用的緩沖液是:磷酸緩沖液,
3、成分:磷酸二氫鈉與磷酸氫二鈉,如何證明凝膠色譜法獲得的蛋白質(zhì)是目的蛋白?,(三) 電泳:,1.概念:,帶電粒子在電場作用下發(fā)生遷移的過程。,2.原理:,許多重要的生物大分子,如多肽、 核酸等都具有可解離的基團(tuán),在一定的PH下,這些基團(tuán)會帶上正電或負(fù)電。 在電場的作用下,這些帶電分子會向著與其所帶電荷相反的電極移動。 電泳利用了待分離樣品中各種分子帶電性質(zhì)的差異以及分子本身的大小,形狀的不同,使帶電分子產(chǎn)生不同的遷移速度,從而實(shí)現(xiàn)樣品中各種分子的分離。,3.類型:,瓊脂糖凝膠電泳、聚丙烯酰胺凝膠電泳。,聚丙烯酰胺凝膠電泳,在測定蛋白質(zhì)分子量時常用十二烷基硫酸鈉(SDS)聚丙烯酰胺凝膠電泳。聚丙烯
4、酰胺凝膠是由單體丙烯酰胺和交聯(lián)劑N,N-亞甲基雙丙烯酰胺在引發(fā)劑和催化劑的作用下聚合交聯(lián)成的具有三維網(wǎng)狀結(jié)構(gòu)的凝膠。,N,N-亞甲基雙丙烯酰胺(形成交聯(lián)),丙烯酰胺和交聯(lián)劑 N,N-亞甲基雙丙烯酰胺的交聯(lián)共聚反應(yīng),蛋白質(zhì)在聚丙烯酰胺凝膠中的遷移率取決 于它所帶凈電荷的多少以及分子的大小等因素。,1.原理:,SDS能使蛋白質(zhì)發(fā)生完全變性。由幾條肽鏈組成的蛋白質(zhì)復(fù)合體在SDS的作用下會解聚成單條肽鏈,因此測定的結(jié)果只是單條肽鏈的分子量。SDS能與各種蛋白質(zhì)形成蛋白質(zhì)SDS復(fù)合物,SDS所帶負(fù)電荷的量大大超過了蛋白質(zhì)分子原有的電荷量。因而掩蓋了不同種蛋白質(zhì)間的電荷差別,使電泳遷移率完全取決于分子的大
5、小。,2. SDS作用機(jī)理:,用SDS 聚丙烯酰胺凝膠電泳測定蛋白質(zhì)分子量的方法,使用SDS聚丙烯酰胺凝膠電泳測定蛋白質(zhì)的分子量時,可選用一組已知分子量的標(biāo)準(zhǔn)蛋白同時進(jìn)行電泳,根據(jù)已知分子量的標(biāo)準(zhǔn)蛋白的電泳區(qū)帶位置,可以測定未知蛋白質(zhì)的分子量。市場上有高分子量、次高分子量及低分子量的標(biāo)準(zhǔn)蛋白試劑出售。,二、實(shí)驗(yàn)操作,樣品處理粗分離純化純度鑒定,蛋白質(zhì)提取和分離步驟,血液有哪些成分?,(一)血紅蛋白,每個肽鏈環(huán)繞一個亞鐵血紅素基團(tuán),此基團(tuán)可攜帶一分子氧或一分子二氧化碳,血紅蛋白因含有血紅素而呈紅色。,(一)血紅蛋白,二、實(shí)驗(yàn)操作,用雞的紅細(xì)胞提取DNA,用豬、牛、羊的紅細(xì)胞提取血紅蛋白的原因是什
6、么?,雞的紅細(xì)胞具有細(xì)胞核,含有DNA,便于進(jìn)行DNA的提?。蝗说募t細(xì)胞無細(xì)胞核,結(jié)構(gòu)簡單,血紅蛋白含量豐富,便于提取血紅蛋白。,樣品處理粗分離純化純度鑒定,蛋白質(zhì)提取和分離步驟,(二)操作過程,(1)紅細(xì)胞的洗滌:,洗滌目的:,去除雜蛋白,以利于后續(xù)血紅蛋白的 分離純化。,洗滌操作:,1、采集血樣。 2、低速短時間離心。 3、吸取血漿:上層透明的黃色血漿。 4、鹽水洗滌:用五倍體積的質(zhì)量分?jǐn)?shù)為0.9的氯化鈉溶液洗滌。 5、低速短時間離心。 6、重復(fù)4、5步驟三次,直至上清液中已沒有黃色,表明洗滌干凈。,1.樣品處理,(二)操作過程,洗滌次數(shù)過少,無法除去血漿蛋白; 離心速度過高、時間過長會使
7、白細(xì)胞和淋巴細(xì)胞等一同沉淀,達(dá)不到分離的效果。,注意:,(2)血紅蛋白的釋放:加蒸餾水到原血液體積,再加40體積的甲苯 ,置于磁力攪拌器上充分?jǐn)嚢?0分鐘(加速細(xì)胞破裂),細(xì)胞破裂釋放出血紅蛋白。,(3)分離血紅蛋白溶液:,離心:將攪拌好混合液轉(zhuǎn)移到離心管內(nèi),以2000r/min的速度離心10 min。 試管中溶液層次: 第1層(最上層):甲苯層(無色透明); 第2層(中上層):脂溶性物質(zhì)沉淀層(白色); 第3層(中下層):血紅蛋白的水溶液層(紅色); 第4層(最下層):雜質(zhì)沉淀層(暗紅色)。 分離:用濾紙過濾,除去脂溶性沉淀層,于分液漏斗中靜置片刻后,分出下層的紅色透明液體。,(4)透 析:
8、,過程:取1ml的血紅蛋白溶液裝入透析袋中,將透析袋放入盛有300ml的物質(zhì)的量濃度為20mmol/l的磷酸緩沖液中(pH為7.0),透析12小時。 透析目的:除去樣品中分子量較小的雜質(zhì)。,2. 粗分離,2.凝膠色譜操作:,(1)凝膠色譜柱的制作:,取長40厘米,內(nèi)徑1.6厘米的玻璃管,兩端需用砂紙磨平。底塞的制作:打孔挖出凹穴安裝移液管頭部覆蓋尼龍網(wǎng),再用100目尼龍紗包好,插到玻璃管的一端。注意事項(xiàng):底塞中插入的玻璃管的上部不得超出橡皮塞的凹穴底面,否則難以鋪實(shí)尼龍網(wǎng),還會導(dǎo)致液體殘留,蛋白質(zhì)分離不徹底。頂塞的制作:打孔安裝玻璃管。組裝:將上述三者按相應(yīng)位置組裝成一個整體。安裝其他附屬結(jié)構(gòu)
9、。,凝膠的選擇: A、材料:交聯(lián)葡聚糖凝膠(G-75)。 B、代表意義:“G”表示凝膠的交聯(lián)程度,膨脹程度及分離范圍。75表示凝膠的得水值,即每克凝膠膨脹時吸水7.5克。 凝膠的前處理:配置凝膠懸浮液:計(jì)算并稱取一定量的凝膠浸泡于蒸餾水或洗脫液中充分溶脹后,配成凝膠懸浮液。,(2)凝膠色譜柱的裝填,凝膠色譜柱的裝填: A、固定:將色譜柱裝置固定在支架上。 B、裝填:將凝膠懸浮液一次性緩慢倒入色譜柱內(nèi),裝填時輕輕敲動色譜柱,使凝膠填裝均勻。 注意: 1、凝膠裝填時盡量緊密,以降低凝膠顆粒之間的空隙。 2、裝填凝膠柱時不得有氣泡存在:因?yàn)闅馀輹噥y洗脫液中蛋白質(zhì)的洗脫次序,降低分離效果。,(2)凝
10、膠色譜柱的裝填,洗滌平衡:裝填完畢后,立即用緩沖液洗脫瓶,在50cm高的操作壓下,用300ml的20mmol/l的磷酸緩沖液(pH為7.0)充分洗滌平衡12小時。 注意:,50cm高,(2)凝膠色譜柱的裝填,1、液面不要低于凝膠表面,否則可能有氣泡混入,影響液體在柱內(nèi)的流動與最終生物大分子物質(zhì)的分離效果。 2、不能發(fā)生洗脫液流干,露出凝膠顆粒的現(xiàn)象。,(3)樣品加入與洗脫,調(diào)節(jié)緩沖液面:打開下端出口,使柱內(nèi)緩沖液緩慢下降到與凝膠面平齊,關(guān)閉出口。 滴加透析樣品:吸管吸1ml樣品加到色譜柱的頂端,滴加樣品時,吸管管口貼著管壁環(huán)繞移動加樣,同時注意不要破壞凝膠面。,樣品滲入凝膠床:加樣后打開下端出口,使樣品滲入凝膠床內(nèi),等樣品完全進(jìn)入凝膠層后,關(guān)閉下端出口 洗脫:小心加入pH=7.0 的20mmol/l的磷酸緩沖液到適當(dāng)高度,連接緩沖液洗脫瓶,打開下端出口進(jìn)行洗脫。 收集:待紅色的蛋白質(zhì)接近色譜柱底端時,用試管收集流出液,每5ml收集一試管,連續(xù)收集。,注意:正確的加樣操作是:1、不要觸及并破壞凝膠面。2、貼壁加樣。3、使吸管管口沿管壁環(huán)繞移動。,在分離過程中,如果紅色區(qū)帶均勻一致的移動,說明色譜柱制作成功,注意:,(三)SDS聚丙烯酰胺凝膠
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