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1、Guide to Geometric Morphometrics,2013.07.16,幾何形態(tài)學(xué),幾何形態(tài)學(xué)是用笛卡爾坐標(biāo)來表示生物的形狀信息,再通過縮放、旋轉(zhuǎn)與重疊的方式,去除大小、形狀等非形態(tài)因素的影響,線性代數(shù)作矩陣運(yùn)算,用網(wǎng)格圖形和相對(duì)扭曲分析樣本間的形狀差異的一種測(cè)量方法。 幾何是指肯德爾形狀空間的幾何學(xué),它利用普魯克提斯距離(普氏距離)來估計(jì)平均空間,描述形狀變異。 幾何形態(tài)測(cè)量技術(shù)可以將樣本的大小和形狀相互獨(dú)立,以使結(jié)果更加可信。,朱萬龍等2013年3月發(fā)表于生態(tài)學(xué)報(bào)的中緬樹鼩頭骨及下臼齒幾何形態(tài)與環(huán)境的關(guān)系。 運(yùn)用幾何形態(tài)測(cè)量法對(duì)其頭骨側(cè)面、腹面、背面及下頜側(cè)面的形態(tài)特征進(jìn)行

2、主成分分析、薄片樣條分析,同時(shí)運(yùn)用統(tǒng)計(jì)軟件 SPSS15.0 對(duì)頭骨和臼齒進(jìn)行多維尺度分析,以探討頭骨及臼齒形態(tài)與環(huán)境之間的關(guān)系。 云南、貴州和廣西地區(qū)的中緬樹鼩的頭骨具有形態(tài)變異,并且差異僅僅發(fā)生在種群水平,這可能反映了其對(duì)特定生態(tài)環(huán)境的形態(tài)適應(yīng)。,何鍇、白明、萬韜、李權(quán)、蔣學(xué)龍、王應(yīng)祥2013年發(fā)表于獸類學(xué)報(bào)的白尾鼴( 鼴科: 哺乳綱) 下頜骨幾何形態(tài)測(cè)量分析及地理分化研究 背景:由于白尾鼴分布區(qū)范圍內(nèi)地形、氣候和生境十分復(fù)雜,很可能導(dǎo)致物種的地理分化。 通過對(duì)18 個(gè)地區(qū)的 49 號(hào)標(biāo)本的下頜骨進(jìn)行幾何形態(tài)測(cè)量方法的分析比較。結(jié)果顯示所有的標(biāo)本按照地理分布可分為 3 組,推測(cè) 3 個(gè)下頜

3、骨形態(tài)有明顯差異的地理居群可能代表了 3 個(gè)不同的地理亞種或是不同的種。但這仍需要結(jié)合上頜骨的形態(tài)差異和遺傳結(jié)構(gòu)分析加以證實(shí)。,楊紅,張子慧,2011 年發(fā)表于四川動(dòng)物的中華姬鼠與大林姬鼠頭骨的幾何形態(tài)學(xué)研究。 背景:中華姬鼠 和大林姬鼠形態(tài)與習(xí)性相似,北京地區(qū)的這兩種鼠都存在還是只有大林姬鼠存在一直存在爭(zhēng)議。 對(duì)兩者頭骨背面和側(cè)面的形態(tài)進(jìn)行對(duì)比分析。系統(tǒng)聚類分析結(jié)果、主成分分析結(jié)果和判別函數(shù)分析結(jié)果顯示,北京地區(qū)姬鼠除了黑線姬鼠外可以分為大林姬鼠和中華姬鼠兩類; 薄板曲線結(jié)果顯示形變多集中在顴弓、眶下孔和枕骨等處。,目前,幾何形態(tài)學(xué)的原理和方法已經(jīng)廣泛地應(yīng)用于各個(gè)領(lǐng)域 如醫(yī)學(xué)診斷中的畸形預(yù)測(cè)

4、 重要器官的病理診斷 骨骼矯正等 ;考古研究中一些重要?dú)v史人物面貌的重建以及珍貴文物的復(fù)原等; 刑事偵查中的人臉自動(dòng)識(shí)別系統(tǒng)的建立; 農(nóng)產(chǎn)品篩選中牡蠣 貝類 水果等的隨機(jī)抽樣檢驗(yàn)等; 此外,人類生活用品,尤其是衣服 頭盔等的設(shè)計(jì)也在利用幾何形態(tài)學(xué)的原理和方法。 幾何形態(tài)學(xué)研究者們成立了專門的網(wǎng)站。/morph/index.html,幾何形態(tài)學(xué)測(cè)量方法的一般操作步驟:,1.圖像采集 2.標(biāo)點(diǎn)數(shù)字化 3.疊印 4.分析基于地標(biāo)點(diǎn)的形狀 5.形變的可視化 6.基于地標(biāo)點(diǎn)形狀的統(tǒng)計(jì)分析 7.系統(tǒng)發(fā)育樹的建立,圖像采集,添加比例尺 照片周圍留有足夠的空間,防止發(fā)生扭曲 為確保不同樣本之間的可比性,圖像采集過程中還需保證標(biāo)本擺放位置、拍攝方位以及聚焦部位等外部條件的一致性,標(biāo)點(diǎn)數(shù)字化,文件格式為 .Tps 利用TpsDig2選取標(biāo)點(diǎn)并數(shù)字化(在對(duì)稱結(jié)構(gòu)中標(biāo)點(diǎn)選在同一側(cè)) 標(biāo)點(diǎn)數(shù)目、順序需一致 隨時(shí)保存,疊印,TpsRewl or TpsSuper 在疊印的過程中計(jì)算出總體樣本的平均形態(tài),進(jìn)而將平均形態(tài)作為參考計(jì)算每個(gè)樣本到平均形態(tài)的距離,用類似于主成分分析的相對(duì)扭曲分析方法分析樣本與樣本之間的變異程度得到相對(duì)扭曲值。疊印后,車可利用相對(duì)扭

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