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1、1,計算機(jī)在農(nóng)業(yè)中的應(yīng)用,第二章 農(nóng)業(yè)試驗的設(shè)計與分析,主講:梁 茹 冰 聯(lián)系方式:liang_ru_,2,引 言,科學(xué)研究是人類認(rèn)識自然、改造自然、服務(wù)社會的原動力。 農(nóng)業(yè)領(lǐng)域中所涉及的學(xué)科大多數(shù)屬于實驗科學(xué),主要是通過周密設(shè)計的實驗進(jìn)行探索。 農(nóng)業(yè)科學(xué)試驗及農(nóng)業(yè)生產(chǎn)調(diào)查都會獲得大量的數(shù)據(jù),在千差萬別的數(shù)字后面往往隱藏著事物的內(nèi)在規(guī)律性。 農(nóng)業(yè)數(shù)據(jù)處理與分析就是挖掘與利用這些規(guī)律。 相應(yīng)的農(nóng)業(yè)試驗和調(diào)查數(shù)據(jù)分析軟件。,3,農(nóng)業(yè)數(shù)據(jù)處理與分析,農(nóng)業(yè)是一巨型復(fù)雜的系統(tǒng)。 農(nóng)業(yè)數(shù)據(jù)具有大量、多維、動態(tài)、不完整、不確定性(數(shù)據(jù)中的系統(tǒng)或隨機(jī)噪聲)、稀疏性(很少甚至沒有有用的記錄)、并且與時間相關(guān)等特

2、點。 農(nóng)業(yè)試驗設(shè)計主要在介紹經(jīng)典的農(nóng)業(yè)設(shè)計方法的基礎(chǔ)上還介紹正交設(shè)計、均勻設(shè)計和回歸設(shè)計等方法。,4,農(nóng)業(yè)數(shù)據(jù)分析的基本方法,農(nóng)業(yè)數(shù)據(jù)分析的基本方法是農(nóng)業(yè)數(shù)學(xué)建模和生物統(tǒng)計。 農(nóng)業(yè)數(shù)學(xué)模型用來揭示農(nóng)業(yè)過程中的機(jī)理關(guān)系,描述農(nóng)業(yè)各因子之間的動態(tài)的定量關(guān)系,如農(nóng)業(yè)產(chǎn)量與其他生態(tài)因子的關(guān)系。 生物統(tǒng)計用來檢驗、歸類和判別農(nóng)業(yè)的最終結(jié)果,如在一定的置信度下判斷農(nóng)業(yè)因子對指標(biāo)如作物產(chǎn)量是否有影響,比較不同的農(nóng)業(yè)措施下農(nóng)業(yè)產(chǎn)量是否有差別。 農(nóng)業(yè)數(shù)學(xué)建模和生物統(tǒng)計是相互聯(lián)系的:首先生物統(tǒng)計模型是一類重要的數(shù)學(xué)模型;其次由于農(nóng)業(yè)數(shù)據(jù)具有的不確定性,數(shù)學(xué)建模中時常要考慮隨機(jī)誤差的影響,因此在農(nóng)業(yè)數(shù)據(jù)分析中,農(nóng)業(yè)

3、數(shù)學(xué)建模和生物統(tǒng)計這兩種方法經(jīng)常一起使用。,5,第一節(jié)農(nóng)業(yè)試驗數(shù)據(jù)分析,6,農(nóng)業(yè)試驗數(shù)據(jù)分析,農(nóng)業(yè)試驗設(shè)計的基本原則 重復(fù)、隨機(jī)化和區(qū)域控制 農(nóng)業(yè)試驗設(shè)計的方法 隨機(jī)完全區(qū)組設(shè)計等 農(nóng)業(yè)試驗設(shè)計的數(shù)據(jù)處理方法 描述性統(tǒng)計、統(tǒng)計推斷、回歸分析、主成分分析等,農(nóng)業(yè)數(shù)學(xué)建模,生物統(tǒng)計,7,第二節(jié)SAS (Statistical Analysis System )簡介,8,附:SAS 9.0安裝步驟,調(diào)時間(2004年9月前)Setup disksetup.exe 選擇設(shè)置語言:英語 3)Install SAS Software 選擇SAS Installation Data: sas9834961.

4、txt next Select Licensed Software next 選擇Disk1 68%時,選擇Disk2 76%時,選擇Secure windows 81%時,選擇SAS Shared Components 進(jìn)度條消失,選擇Setup Disk Finish 將sashost.dll復(fù)制到安裝目錄下,即“C:Program FilesSASSAS System9.0”下,覆蓋原文件 調(diào)回時間 完成!,9,關(guān)于SAS軟件,SAS是美國SAS軟件研究所于本上世紀(jì)70年代研制的一套大型集成應(yīng)用軟件系統(tǒng),因其最初功能(Statistical Analysis System ) 而得名。經(jīng)

5、過二十多年的發(fā)展, 已成為綜合軟件系統(tǒng), 其功能涉及數(shù)據(jù)訪問、管理、分析和顯示。作為管理信息系統(tǒng)(MIS)或決策支持系統(tǒng)(DSS)的開發(fā)平臺, 1996 年評為建立數(shù)據(jù)倉庫系統(tǒng)的首選產(chǎn)品。,10,關(guān)于SAS軟件,SAS軟件為模塊式結(jié)構(gòu), 用戶可根據(jù)需要選擇 譬如, 我們可以只選Base SAS (基本模塊) , 用于數(shù)據(jù)管理、制表和描述性統(tǒng)計。 或再加上SAS/STAT (統(tǒng)計模塊)和SAS/GRAPH (圖形模塊), 組成一套具有數(shù)據(jù)管理、統(tǒng)計分析和圖形表達(dá)功能的軟件系統(tǒng)。 若在公司或工商企業(yè)工作, 再選兩種模塊,SAS/QC (質(zhì)控) 和SAS/OR (運(yùn)籌) , 就可使軟件系統(tǒng)在質(zhì)量管理

6、、計劃運(yùn)籌、規(guī)劃、決策等方面的功能大為增強(qiáng)。 而SAS/ETS 則是計量經(jīng)濟(jì)學(xué)、時序分析和預(yù)測的有力工具等等。,11,SAS軟件的界面P16,12,SAS軟件的界面P16,編輯窗口(PROGRAM EDITOR):編輯程序和數(shù)據(jù)文件。 日志窗口(LOG):記錄運(yùn)行情況,顯示error信息。 輸出窗口(OUTPUT):輸出運(yùn)行的結(jié)果。 圖形窗口(GRAPH):輸出圖形。,13,SAS軟件的界面P16,編輯窗口(PROGRAM EDITOR):編輯程式和數(shù)據(jù)文件。 日志窗口(LOG):記錄運(yùn)行情況,顯示error信息。 輸出窗口(OUTPUT):輸出運(yùn)行的結(jié)果。 圖形窗口(GRAPH):輸出圖形。

7、,點擊 Globals 菜單中的 Program editor、Log、Output、Graph 命令可以進(jìn)入編輯、日志、輸出及圖形窗口。 按功能鍵F5、F6、F7也可以進(jìn)入編輯、日志及輸出窗口。,14,SAS程序初步,在SAS中,對數(shù)據(jù)的處理可分為兩大步: 將數(shù)據(jù)讀入SAS建立的SAS數(shù)據(jù)集,稱為數(shù)據(jù)步(DATA)。 調(diào)用SAS的模塊處理和分析數(shù)據(jù)集中的數(shù)據(jù),稱為過程步(PROC)。 每一數(shù)據(jù)步都是以DATA語句開始,以RUN語句結(jié)束; 而每一過程步則都是以PROC語句開始,以RUN語句結(jié)束。 每個語句的后面都要用符號“;”作為這個語句結(jié)束的標(biāo)志。 下面看一個簡單的例程。,15,SAS程序初

8、步例程,在“* ”號與分號“; ”之間的內(nèi)容(第一行的漢字)為注釋,SAS是不理會的。 指令作用的SAS 關(guān)鍵詞決不允許拼錯, 一般用大寫。其它詞, 如數(shù)據(jù)集名(DATA后面的juli“距離”的漢語拼音)、變量名(miles英里, km 公里) 最好用小寫, 以資區(qū)別。名稱的長度不可超過8個英文字符(所以公里用縮寫km )。 每一SAS 語句必須以分號結(jié)尾。,數(shù)據(jù)步以DATA開頭, 接著是即將建立的數(shù)據(jù)集的名稱。 過程步以PROC開始, 后面是要運(yùn)行的過程的名稱, 如PRINT (顯示/打印出)、SORT(分類)、PLOT(制圖) 等。 程序的結(jié)尾是“RUN ; ”。,16,SAS程序初步例程

9、,SAS程序編好后, 不會自動出結(jié)果。必須經(jīng)過發(fā)送(常用的方式是在命令行鍵入SUBMIT再按回車鍵) 所編程序才會被執(zhí)行。或者通過菜單操作“run”-“submit”,也可執(zhí)行SAS程序。 該程序運(yùn)行結(jié)果如圖:,17,SAS程序的輸入及運(yùn)行步驟:,進(jìn)入SAS的顯示管理系統(tǒng)。 進(jìn)入并擴(kuò)大編輯窗口。 調(diào)出、編輯或修改SAS程式或數(shù)據(jù)文件。 將編輯窗口的SAS程式或數(shù)據(jù)文件存盤。 按功能鍵F8或點擊“RUN”鍵運(yùn)行SAS程式并注意觀察日志窗口中的信息,如有error出現(xiàn),應(yīng)將光標(biāo)移到日志窗口,用PgUp或PgDn翻頁,找到錯誤的所在。 將光標(biāo)移到編輯窗口,按功能鍵F4或點擊 Locals菜單中的 R

10、ecall text命令調(diào)出已經(jīng)運(yùn)行的SAS程式,改正錯誤后轉(zhuǎn)入步驟(4),直到日志窗口中的信息沒有error出現(xiàn)為止。 將光標(biāo)移到輸出窗口,用PgUp或PgDn翻頁閱讀輸出的結(jié)果。,18,SAS的菜單操作系統(tǒng),SAS不僅提供了靈活的程序模塊來進(jìn)行數(shù)據(jù)處理和分析,還提供了功能強(qiáng)大的菜單操作系統(tǒng),借助SAS的菜單系統(tǒng)可以方便的進(jìn)行數(shù)據(jù)的導(dǎo)入、導(dǎo)出、修改和統(tǒng)計分析、作圖,并可以進(jìn)行試驗設(shè)計、時間序列預(yù)測。 下面的試驗設(shè)計與數(shù)據(jù)分析學(xué)習(xí)全部是基于菜單操作展開的。,19,第三節(jié)SAS在農(nóng)業(yè)試驗設(shè)計與數(shù)據(jù)分析中的應(yīng)用,20,應(yīng)用SAS對試驗數(shù)據(jù)作方差分析,SAS在農(nóng)業(yè)單因素試驗中的應(yīng)用舉例: 有一水稻施

11、肥試驗,設(shè)有5個處理(TRT),分別為A(施氨水1),B(施氨水2),C(施碳氨),D(施尿素)和E(不施肥)。每個處理均種植4盆,隨機(jī)排列,得稻谷產(chǎn)量如表2.3。試分析各處理平均數(shù)差異的顯著性。,21,應(yīng)用SAS對試驗數(shù)據(jù)作方差分析,SAS在農(nóng)業(yè)單因素試驗中的應(yīng)用舉例: (1)建立數(shù)據(jù)庫文件 按圖示錄入數(shù)據(jù)表。,22,應(yīng)用SAS對試驗數(shù)據(jù)作方差分析,SAS在農(nóng)業(yè)單因素試驗中的應(yīng)用舉例: (2)進(jìn)入方差分析,選取方差分析類型與檢驗內(nèi)容,StatisticsANOVAOne-Way ANOVA(單因素方差分析),彈出單因素方差分析對話框,在該對話框中選擇可控(自)變量independent與響應(yīng)

12、(因)變量dependent。 操作如圖所示:,23,應(yīng)用SAS對試驗數(shù)據(jù)作方差分析,SAS在農(nóng)業(yè)單因素試驗中的應(yīng)用舉例: (2)進(jìn)入方差分析,選取方差分析類型與檢驗內(nèi)容,StatisticsANOVAOne-Way ANOVA(單因素方差分析),彈出單因素方差分析對話框,在該對話框中選擇可控(自)變量independent與響應(yīng)(因)變量dependent。 操作如圖所示:,24,應(yīng)用SAS對試驗數(shù)據(jù)作方差分析,(3)進(jìn)行多重比較。點擊單因素方差分析對話框中的Means項,并選擇要進(jìn)行多重比較的主效應(yīng)及相應(yīng)的多重比較方法,點擊Add添加。 操作如圖所示:,25,應(yīng)用SAS對試驗數(shù)據(jù)作方差分析

13、,(3)進(jìn)行多重比較。點擊單因素方差分析對話框中的Means項,并選擇要進(jìn)行多重比較的主效應(yīng)及相應(yīng)的多重比較方法,點擊Add添加。 操作如圖所示:,26,應(yīng)用SAS對試驗數(shù)據(jù)作方差分析,方差分析結(jié)果: P0.00020.05,即處理結(jié)果差異具有統(tǒng)計學(xué)意義。,說明: Source變異來源;DF自由度; Type I SSSum of Squares (平方和); Mean Square均方; F ValueF值(F值接近1,說明各組均數(shù)間的差異沒有統(tǒng)計學(xué)意義,即沒有差異;F值遠(yuǎn)大于1,說明各組均數(shù)間的差異具有統(tǒng)計學(xué)意義,即有差異。) PrF即P值,如果該值小于0.05(顯著性水平),則具有統(tǒng)計學(xué)

14、意義,反之沒有統(tǒng)計學(xué)意義。,27,應(yīng)用SAS對試驗數(shù)據(jù)作方差分析,多重比較結(jié)果說明: 為了便于理解,SAS將兩兩比較的結(jié)果直接用英文字母的形式標(biāo)示出來。 兩兩比較結(jié)果的最右側(cè)是處理因素變量的取值,最左側(cè)標(biāo)以字母A、B、C等等,用以表示該處理組和其它組有無差異。 如果兩組有相同的字母(如d、c、a三組),則兩者之間無差異; 而如果兩組間只有不同的字母,則表示兩組間的差異有統(tǒng)計學(xué)意義。,28,應(yīng)用SAS對試驗數(shù)據(jù)作方差分析,多重比較結(jié)果: 結(jié)果顯示施尿素(d組)稻田產(chǎn)量最高,但施尿素(d組)的稻田產(chǎn)量與施氨水1(a組)、施碳氨(c組)的稻田產(chǎn)量之間的差別并不具備統(tǒng)計學(xué)意義,施尿素(d組)的稻田產(chǎn)量

15、與施氨水2(b組) 、不施肥(e組)的稻田產(chǎn)量之間的差別具有統(tǒng)計學(xué)意義。,29,SAS對農(nóng)業(yè)正交試驗設(shè)計數(shù)據(jù)的變異分析,正交試驗設(shè)計的直觀分析 幾因素幾水平的正交試驗 正交表采用L8(27) 通過觀察SAS輸出的結(jié)果,得出最優(yōu)的策略 正交試驗設(shè)計的方差分析 方差分析 多重比較,30,正交試驗設(shè)計的直觀分析,例題:為了解決花菜留種問題,以進(jìn)一步提高花菜種子的產(chǎn)量和質(zhì)量,科技人員考察了澆水、施肥、病害防治和移入溫室時間對花菜留種的影響,進(jìn)行了四個因素各兩個水平的正交試驗。 各因素及其水平見表2.6,31,正交試驗設(shè)計的直觀分析,首先,選用L8(27)正交表: 8表示總共要做8次試驗,2表示每個因子

16、都有兩個水平,7表示這個表最多可安排7個因子。試驗結(jié)果如表2.7,32,正交試驗設(shè)計直觀分析: SAS操作步驟,第一步:SolutionsAnalysisAnalysts,出現(xiàn)分析員界面后,輸入表2.7的數(shù)據(jù),其中交互作用列不必輸入 數(shù)據(jù)錄入如圖所示:,33,正交試驗設(shè)計直觀分析: SAS操作步驟,第二步:StatisticsDescriptiveSummary Statistics,出現(xiàn)分析員描述性統(tǒng)計對話框,在該對話框中,Analysis按鈕是選中要進(jìn)行描述性統(tǒng)計的變量,我們選擇產(chǎn)量y。Class按鈕是選中分組變量,我們首先選擇澆水次數(shù)A,34,正交試驗設(shè)計直觀分析: SAS操作步驟,第三

17、步:點擊Statistics按鈕,彈出對話框,在此對話框中你可以選擇要輸出的描述性統(tǒng)計量,打“”表示選中,我們選擇均值(Mean),最小值(Minimum)和最大值(Maximum),極差(Range),和(Sum),35,正交試驗設(shè)計直觀分析: SAS操作步驟,第四步:分別選擇其他因素作為分組變量進(jìn)行描述性統(tǒng)計。分析結(jié)果如下表所示,36,結(jié)果直觀分析: 根據(jù)各試驗因子的總計數(shù)或平均數(shù)可以看出:A取A1,B取B2,C取C2,D取D2為好,即花椰菜留種最好的栽培管理方式為:A1 B2 C2 D2,37,正交試驗設(shè)計的方差分析:SAS操作,第一步: 在SAS分析員中,從StatisticsANOV

18、AFactorial ANOVA(多因素方差分析),進(jìn)入多因素方差分析的對話框。 Dependent按鈕是選擇因變量,我們選擇產(chǎn)量y, Independent 按鈕是選擇進(jìn)行方差分析的因素,我們將全部因素都選入。,38,正交試驗設(shè)計的方差分析:SAS操作,第二步: 在SAS分析員方差分析對話框中,點擊按鈕Model,會彈出效應(yīng)選擇對話框,這里我們只選擇主效應(yīng)(main effects only)。,39,第三步: 多重比較:在方差分析對話框中,點擊按鈕Means,在彈出對話框中,點擊Add按鈕可添加要進(jìn)行多重比較的主效應(yīng)(將ABCD均Add進(jìn)來),多重比較的方法由Comparison meth

19、od中的下拉列表框中的選項決定(選擇Duncans multiple-range test),40,正交試驗設(shè)計的方差分析:SAS操作,最后一步:查看方差分析結(jié)果,41,正交試驗設(shè)計的方差分析:SAS操作,結(jié)果分析:,42,正交試驗設(shè)計的方差分析:SAS操作,結(jié)果分析: 從方差分析表可以看出,澆水次數(shù)(A)和噴藥次數(shù)(B)對產(chǎn)量的影響具有統(tǒng)計學(xué)意義; 對澆水次數(shù)(A)效應(yīng)進(jìn)行多重比較發(fā)現(xiàn):在不干死為原則,整個生長期只澆水1-2次的澆水措施(水平1)下其花菜的產(chǎn)量明顯高于根據(jù)生長需水量和自然條件澆水,但不過濕的澆水措施(水平2)花椰菜的產(chǎn)量。,43,應(yīng)用SAS作回歸設(shè)計分析,例1為了研究雜交水稻

20、的施氮量和密度與產(chǎn)量之間的關(guān)系,現(xiàn)做有關(guān)施氮量、水稻密度的試驗,試求其回歸關(guān)系。因素編碼水平表見2.13試驗結(jié)果見表2.14,更改為:2.51.5,44,操 作 步 驟,步驟(1):進(jìn)入兩水平正交實驗窗口,45,操 作 步 驟,步驟(1):進(jìn)入兩水平正交實驗(Two-level)窗口,46,操 作 步 驟,步驟(2):定義變量(Define Variables),47,操 作 步 驟,步驟(2):定義變量,48,操 作 步 驟,步驟(2):定義變量,49,操 作 步 驟,步驟(3):選擇實驗設(shè)計,50,操 作 步 驟,步驟(3):選擇實驗設(shè)計,51,操 作 步 驟,步驟(4):設(shè)置中心點數(shù)為2

21、,52,操 作 步 驟,步驟(4):設(shè)置中心點數(shù)為2,53,操 作 步 驟,步驟(5):輸入試驗結(jié)果,54,操 作 步 驟,步驟(5):輸入試驗結(jié)果,55,操 作 步 驟,步驟(6):輸出分析結(jié)果,56,操 作 步 驟,步驟(6):輸出分析結(jié)果,57,操 作 步 驟,步驟(6):輸出分析結(jié)果,58,操 作 步 驟,步驟(7):數(shù)值優(yōu)化,59,操 作 步 驟,步驟(7):數(shù)值優(yōu)化,60,操 作 步 驟,步驟(7):數(shù)值優(yōu)化,61,操 作 步 驟,步驟(7):數(shù)值優(yōu)化,62,操 作 步 驟,步驟(7):數(shù)值優(yōu)化,63,步驟(7): 數(shù)值優(yōu)化,64,應(yīng)用SAS作回歸設(shè)計分析,例4我們以玉米 N 、P和 K 三因素三水平二次正交旋轉(zhuǎn)組合設(shè)計試驗為例,應(yīng)用SAS探索玉米高產(chǎn)高效的施肥方案,試驗因素及編碼水平見表2.18,試驗結(jié)果見表 2.19 。求出產(chǎn)量對N、P和 K三種肥料的回歸模型三元二次方程進(jìn)行方差分析,回歸系數(shù)檢驗在 1.682與-1.682 的約束范圍內(nèi)模擬優(yōu)化找出產(chǎn)量最高的方案。,65,操 作 步 驟,步驟(1):選擇試驗設(shè)計(Response Surface響應(yīng)面設(shè)計),定義

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