1、文獻(xiàn)檢索新思維,張發(fā)寶 生物谷網(wǎng)站 上海北岸信息技術(shù)有限公司,什么是真正的文獻(xiàn)檢索?,檢索(retrieve)查找(search, find) 有四層含義: 1 如何有效查找到所需文獻(xiàn) 2 如何查全,查精所需文獻(xiàn) 3 如何整理、歸納文獻(xiàn) 4 從文獻(xiàn)中得出有意義的結(jié)論,5S檢索新理念,Select-選擇合適的數(shù)據(jù)庫 Search-如何精確查找文獻(xiàn) Sort-文獻(xiàn)的篩選與歸類 Systematize-文獻(xiàn)管理軟件的使用 Strategy-如何從文獻(xiàn)中發(fā)現(xiàn)idea?,一、Select,1 期刊類、專利類、新聞?lì)悺?huì)議類、書籍類等數(shù)據(jù)庫；其它是專門的數(shù)據(jù)庫，如藥物數(shù)據(jù)庫，中草藥數(shù)據(jù)庫，疾病數(shù)據(jù)庫等。

2、最常用的期刊類。 中文：維普，萬方，CNKI三大期刊知識(shí)庫。超星、書生之家書籍庫。 英文：Pubmed、SD、EBSCO、Springer、NPG、Ei Village、CAS、Kluwer,1 關(guān)鍵詞檢索 2 組合檢索、二次檢索、回溯檢索,二、Search,如何將檢索到的文獻(xiàn)進(jìn)行篩選和歸類。檢索一直有一個(gè)問題：不熟練檢索的同學(xué)往往拼命查資料；而熟悉檢索的同學(xué)往往內(nèi)容太多，大量時(shí)間在重復(fù)檢索和查找已檢索過的內(nèi)容。 正常：Search : Sort = 3 : 7 往往：Search : Sort = 5 : 5,三、Sort,原 則,1 只保留重要的資料-不要什么文獻(xiàn)都要！許多新手往往只要查到

3、的資料，就一定要保存下來，哪怕僅僅是相關(guān)。時(shí)間長了，這些不重要的資料，往往占住你主要地方。 2 一定要精細(xì)分類，并錄入數(shù)據(jù)庫。傳統(tǒng)的電腦中按文件夾分類已不能適應(yīng)時(shí)代的發(fā)展了。務(wù)必要用合適的軟件進(jìn)行歸類。 3 要分精讀與速讀兩類,四、Systematize,Reference Manage和Endnote 優(yōu)點(diǎn)：處理英文較方便，前者屬于老牌軟件商了。但后者信息更新快，尤其是文獻(xiàn)檢索更新更快，近來應(yīng)用更廣。同時(shí)Endnote還能支持中文期刊的格式，這也是比較優(yōu)秀的一面。 不利：價(jià)格比較貴，界面為英文的。,Note express,這是國內(nèi)近年來發(fā)展最快的一款軟件，同類軟件還有文獻(xiàn)王，但前者運(yùn)行效率

4、更高，適用面更廣，對中英文支持都非常完善，升級更快，值得期待。,Strategy-如何從文獻(xiàn)中發(fā)現(xiàn)Idea?,文獻(xiàn)怎么看？多看還是少看？ -看少了什么都不懂；看多了什么都不做了。 -走進(jìn)文獻(xiàn)，走出文獻(xiàn),出入法,1 文章背后的故事 2 文章與文章間的idea溝通。 許多文獻(xiàn)你閱讀完以后，覺得很完善，這一塊似乎已經(jīng)perfect了，實(shí)際上你需要更多思考這篇文章的缺陷，即使是CNS上的，同樣有漏洞，這些漏洞有時(shí)是作者回避的，或尚未研究的東西，這里面就是新的idea來源。 如何讀出文章背后的故事，這非常重要。讀文獻(xiàn)有兩個(gè)境界，一是入，二是出。先要按作者意思去讀文獻(xiàn)，讀懂它；其次按作者的方法去自己假設(shè)，

5、從更高角度 看這篇文章，還有哪些不完善的地方？,找到成功背后的失敗,如ES細(xì)胞培養(yǎng)的例子，一開始文獻(xiàn)是記錄XXX培養(yǎng)成功，保持不分化狀態(tài)。你認(rèn)為很高興，但你是否注意到他曾經(jīng)失敗過多少次，或者說正常培養(yǎng)就失敗。那么這背后到底是什么因素導(dǎo)致成功？什么因子？ 有時(shí)有些文獻(xiàn)中一句話，里面可能是一個(gè)大課題。如ES細(xì)胞在無血清培養(yǎng)下會(huì)向神經(jīng)細(xì)胞方向分化，因此必需有血清培養(yǎng)。這是常識(shí)，但為什么呢？這就一個(gè)大課題。 細(xì)胞凋亡需要ATP參與，是主動(dòng)過程，這句話背后包含了這一層含義：ATP是凋亡必需的。但同樣有另一個(gè)常識(shí)，細(xì)胞在死亡過程中ATP往往下降，這其中存在一個(gè)矛盾，就也是idea.,逆向思維,案例1：低氧

6、導(dǎo)致細(xì)胞死亡。 這是常識(shí)，但是是否存在一種細(xì)胞，給它各種各樣的刺激仍不會(huì)死亡？其機(jī)理是什么？ 案例2：為什么成年以后，心臟細(xì)胞，腦細(xì)胞不分裂了，而有些細(xì)胞卻可以分裂？ -是不是因?yàn)榧?xì)胞周期缺失了某些因子？如果人為補(bǔ)充這些因子又如何？ 案例3：細(xì)胞周期分裂大家都認(rèn)為是G0-G1-S-M，那么我們能逆向進(jìn)行嗎？ 案例4：大象細(xì)胞大還是細(xì)胞多？ 為什么 案例5：蛇等有毒動(dòng)物為什么不毒自己？蛇毒與Na通道關(guān)系,挑戰(zhàn)經(jīng)典,案例1：細(xì)胞周期中Cyclin D是必需的 -如果我knockout這個(gè)基因呢？ 案例2：大腸桿菌不能產(chǎn)生糖蛋白，這是基因工程上最頭疼的難題。 -能否人為轉(zhuǎn)入產(chǎn)生糖蛋白相關(guān)基因，讓大腸

7、桿菌也能產(chǎn)生人類的糖蛋白？ 案例3：癌癥是干細(xì)胞？ 案例4：SiRNA，CaM的發(fā)現(xiàn) 案例5: TNF基因無法被SiRNA,比較延伸,將相似的文獻(xiàn)做比較，總結(jié)異同 案例1：做骨髓間質(zhì)干細(xì)胞（MSC）分化時(shí)： A+B-誘導(dǎo)向神經(jīng)細(xì)胞分化 C+E誘導(dǎo)向內(nèi)皮細(xì)胞分化 B+F誘導(dǎo)向脂肪細(xì)胞分化,B在MSC分化中作用,案例2：離子通道屬性在高等生物神經(jīng)細(xì)胞上研究已相對透徹。可以引出以下幾個(gè)問題： （1）特殊物種：線蟲，果蠅，蛇，或一些突變體上呢？（2）特殊類型細(xì)胞：腫瘤細(xì)胞，胚胎干細(xì)胞，腎上皮？ （4）同一通道放在不同細(xì)胞上呢？如NMDA受體轉(zhuǎn)到腎上皮呢？,交叉嫁接,如已知 ABC 和 FGC ，那么C

8、可能是連接BG的關(guān)鍵，這里面可能會(huì)出現(xiàn)新的idea. 案例1：如長期關(guān)節(jié)炎患者，往往冠心病發(fā)生少。如服阿斯匹林可以減少心臟病 案例2：長期服用抗生素患者，患冠心病機(jī)率也下降-冠心病與支原體相關(guān)學(xué)說 案例3：神經(jīng)細(xì)胞中觀察到同一種信號分子在細(xì)胞中不同位置作用不同。那么在其它細(xì)胞呢？ 案例4：睡眠足，白天記憶好，why？-hypothesis: GABA對學(xué)習(xí)和記憶作用的多面性 案例5：RA，As2O3促白血病分化；低氧可以促進(jìn)干細(xì)胞分化；,Gap junction,不要看不起gap junction的工作，這是絕大部分工作的源頭。也是必要的。 要從gap junction工作中發(fā)現(xiàn)更多線索,生物谷：檢索能力加速器,充分利用網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行學(xué)習(xí)和交流-生物谷是首選平臺(tái) 生物谷網(wǎng)站是生物行業(yè)最專業(yè)的網(wǎng)站，擁有網(wǎng)站，論壇，博客，面向不同人群的需求。 中國生命科學(xué)論壇 （交流中心） 生物谷博客： （個(gè)人信息中心） 生物谷網(wǎng)站： （信息獲取源） 論壇可以用來交流和學(xué)習(xí)；博客是整理資料的重要的地方，可以將自己有用的資料，心得，想法，放在博客中，不斷回饋，交流，以獲得更多的