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文檔簡(jiǎn)介
1、酵母單雜分析酵母單雜交技術(shù)是體外分析DNA與細(xì)胞內(nèi)蛋白質(zhì)相互作用的一種方法,通過(guò)對(duì)酵母細(xì)胞內(nèi)報(bào)告基因表達(dá)狀況的分析來(lái)鑒別DNA結(jié)合位點(diǎn)并發(fā)現(xiàn)潛在的結(jié)合蛋白基因,或?qū)Y(jié)合位點(diǎn)進(jìn)行分析。運(yùn)用此技術(shù)能篩選到與DNA結(jié)合的蛋白質(zhì),并可直接從基因文庫(kù)中得到編碼該蛋白質(zhì)的核苷酸序列而無(wú)需復(fù)雜的蛋白質(zhì)分離純化操作,故在蛋白質(zhì)研究中具有一定的優(yōu)勢(shì);而且酵母屬真核細(xì)胞,通過(guò)酵母系統(tǒng)得到的結(jié)果比其它體外技術(shù)獲得的結(jié)果更能體現(xiàn)真核細(xì)胞內(nèi)基因表達(dá)調(diào)控的情況?!緦?shí)驗(yàn)?zāi)康摹苛私饨湍竼坞s交的基本原理和應(yīng)用,掌握酵母單雜交的主要步驟及注意事項(xiàng),學(xué)會(huì)酵母感受態(tài)的制作與轉(zhuǎn)化,基因文庫(kù)的構(gòu)建及篩選?!緦?shí)驗(yàn)原理】酵母單雜交方法是根據(jù)
2、DNA結(jié)合蛋白(即轉(zhuǎn)錄因子)與DNA順式作用元件結(jié)合調(diào)控報(bào)告基因表達(dá)的原理來(lái)克隆編碼目的轉(zhuǎn)錄因子的基因(cDNA)。該方法也是細(xì)胞內(nèi)分析鑒定轉(zhuǎn)錄因子與順式作用元件結(jié)合的有效方法。如圖所示,將已知的特定順式作用元件構(gòu)建到最基本啟動(dòng)子(minimal promoter,Pmin)上游,Pmin啟動(dòng)子下游連接報(bào)告基因。進(jìn)行cDNA融合表達(dá)文庫(kù)時(shí),編碼目的轉(zhuǎn)錄因子的cDNA融合表達(dá)載體被轉(zhuǎn)化進(jìn)入酵母細(xì)胞后,其編碼產(chǎn)物(轉(zhuǎn)錄因子)與順式作用元件結(jié)合,就可以激活Pmin啟動(dòng)子,并促使報(bào)告基因表達(dá)。根據(jù)報(bào)告基因的表達(dá),篩選出與已知順式元件結(jié)合的轉(zhuǎn)錄因子。cDNA文庫(kù)篩選cDNA融合表達(dá)載體酵母細(xì)胞基因編碼產(chǎn)
3、物表達(dá)轉(zhuǎn)錄因子報(bào)告基因順式元件Pmin順式元件“Matchmaker Gold Yeast One-Hybrid Library Screening System”提供了一個(gè)簡(jiǎn)單高效的構(gòu)建cDNA文庫(kù)并進(jìn)行酵母單雜交篩選的方法,它使用aureobasidin A抗性基因作為報(bào)告基因,篩選效率高,背景低。單雜交篩選是從酵母雙雜交篩選發(fā)展而來(lái),利用單雜交篩選可以對(duì)cDNA文庫(kù)進(jìn)行篩選直接獲得與目的順式作用元件相結(jié)合的蛋白質(zhì)。圖2 用Matchmaker Gold One-Hybrid System篩選protein-DNA相互作用的原理The Matchmaker Gold One-Hybrid
4、Library Screening process主要包括以下步驟:1 將已知序列(bait)克隆到pAbAi載體。2 pBait-AbAi質(zhì)粒轉(zhuǎn)化Y1HGold酵母菌株,使其與酵母基因組發(fā)生重組,生成bait/reporter酵母菌株。3 檢測(cè)Y1HGold bait菌株AbAir基因的本底表達(dá)水平。4 合成cDNA并通過(guò)cDNA和pGADT7-Rec載體共轉(zhuǎn)化酵母進(jìn)行細(xì)胞內(nèi)同源重組篩選cDNA文庫(kù)。5 篩選結(jié)果的驗(yàn)證和分析?!緦?shí)驗(yàn)準(zhǔn)備】1 儀器設(shè)備微量取液器(2.5 mL;20 mL;50 mL;100 mL;200 mL;1000 mL)、PCR儀、低溫離心機(jī)、臺(tái)式離心機(jī)、CHROMA
5、SPINTM+TE-400純化柱、瓊脂糖凝膠電泳系統(tǒng)、凝膠成像系統(tǒng)、恒溫?fù)u床、恒溫孵箱、通風(fēng)櫥、制冰機(jī)、振蕩器、恒溫金屬浴、酒精浴、無(wú)菌接種環(huán)、10 cm培養(yǎng)皿、15 cm培養(yǎng)皿等。2 實(shí)驗(yàn)材料Y1HGold酵母株、TOP10大腸桿菌菌株、各種方法提取的RNA、pGADT7-Rec質(zhì)粒和pBait-AbAi質(zhì)粒等。3 主要試劑(1) Advantage 2 PCR試劑盒、Easy Yeast Plasmid Isolation試劑盒、Matchmaker Insert Check PCR Mix 1、Matchmaker Insert Check PCR Mix 2。(2) 各種基礎(chǔ)培養(yǎng)基和營(yíng)
6、養(yǎng)缺陷培養(yǎng)基:minimal SD base,minimal SD agar base,YPD medium,YPD agar medium,-Leu DO supplement,-Ura DO supplement,腺苷酸(adenine),PEG8000,carring DNA,aureobasidin A,LB培養(yǎng)基,氨芐西林。(3) NaCl溶液(0.9%)、sodium acetate (3 mol/L)、50% PEG、10LiAc(1 mol/L)、10TE buffer、DTT(100 mmol/L)、RNaseH、限制性內(nèi)切酶?!緦?shí)驗(yàn)方法】1 pBait-AbAi載體的構(gòu)建(
7、酵母報(bào)道子的構(gòu)建)注:酵母報(bào)道子(pBait-AbAi)包含目的順式作用元件的一個(gè)或多個(gè)拷貝,且插入到pAbAi載體AbAir報(bào)告基因的上游。大量研究表明最有效的構(gòu)建應(yīng)包含目的DNA三個(gè)以上的首尾連接的拷貝。首尾連接的拷貝產(chǎn)生方式很多,但對(duì)于長(zhǎng)度小于20 bp的調(diào)控元件,人工合成寡核苷酸是最方便可靠的途徑。(1) 設(shè)計(jì)并合成包含目的序列的兩條反向平行的寡核苷酸序列,且兩端加上與pAbAi載體酶切產(chǎn)物一致的粘性末端(建議合成一個(gè)目的序列的突變序列作為對(duì)照,以排除可能的假陽(yáng)性)。(2) 用TE buffer溶解寡核苷酸至終濃度100 mmol/L。(3) 將正向鏈和反向鏈按照1:1的比例混合(退火
8、后的雙鏈寡核苷酸最大濃度為50 mmol/L)。(4) 95 C保溫30 s,去除二級(jí)結(jié)構(gòu)。(5) 72 C保溫2 min,37 C保溫2 min,25 C保溫2min。注:緩慢退火,有助于雙鏈寡核苷酸的形成。(6) 冰上放置。退火后的產(chǎn)物可貯存在-20 C冰箱備用。(7) 酶切1 mL pAbAi載體,用凝膠回收純化或柱純化的方式純化酶切產(chǎn)物。注:回收前,可用瓊脂糖凝膠檢測(cè)是否酶切完全。(8) 將退火后的寡核苷酸稀釋100倍至終濃度為0.5 mmol/L。(9) 在連接反應(yīng)管中加入如下成分:pAbAi載體(50 ng/mL) 1.0 mLannealed oligonucleotide (0
9、.5 mmol/L) 1.0 mL10T4 DNA ligase buffer 1.5 mLBSA(10 mg/mL) 0.5 mLNuclease-free H2O 10.5 mLT4 DNA ligase (400 U/mL) 0.5 mL總體積 15 mL 注:如果有必要,可用1 mL nuclease-free H2O代替寡核苷酸作為陰性對(duì)照。(10) 將反應(yīng)體系室溫放置連接3 h,轉(zhuǎn)化E coli,采用常規(guī)方法檢測(cè)陽(yáng)性克隆。注:可用酶切或測(cè)序進(jìn)行檢測(cè)。2 質(zhì)粒轉(zhuǎn)化酵母細(xì)胞,生成Bait-Reporter酵母菌株(圖)圖3 Bait-Reporter酵母菌株生成原理示意圖(1) 用Bs
10、tB I或者Bbs I酶切2 mL pBait-AbAi,pMutant-AbAi,p53-AbAi質(zhì)粒,使其在URA3基因處斷開,純化酶切產(chǎn)物。(2) 按Matchmaker Yeast Transformation System 2的步驟用1 ml酶切后的質(zhì)粒轉(zhuǎn)化Y1HGold酵母。(3) 稀釋每個(gè)轉(zhuǎn)化體系至1/10、1/100、1/1000,分別取每個(gè)稀釋物均勻涂于SD/-Ura瓊脂平板上。3 d后挑取5個(gè)單克隆,用Matchmaker Insert Check PCR Mix1進(jìn)行PCR檢測(cè)陽(yáng)性克隆,用Y1HGold的單克隆做陰性對(duì)照。(4) 在PCR管中加25 ml PCR-grad
11、e H2O。(5) 用干凈的槍頭輕輕接觸酵母單克隆,以獲得非常少量的酵母細(xì)胞。將槍頭伸進(jìn)PCR-grade H2O中攪拌,使酵母細(xì)胞散開。注:切忌挑取整個(gè)酵母單克隆,因?yàn)榧?xì)胞過(guò)多會(huì)阻止PCR反應(yīng)的進(jìn)行。如果加入細(xì)胞后水變渾濁,證明加入了過(guò)多的酵母細(xì)胞。(6) 向每個(gè)管中加入25 ml Matchmaker Insert Check PCR Mix,混勻,離心。每個(gè)PCR管中現(xiàn)已含有如下反應(yīng)物:Matchmaker Insert Check PCR Mix 25 mlH2O/yeast 25 ml總體積 50 ml(7) 按下述程序進(jìn)行PCR反應(yīng);95 C 1 min98 C 10 s55 C
12、30 s 30 cycles68 C 2 min(8) 取5 ml PCR產(chǎn)物,用1%的瓊脂糖凝膠電泳分析。注:引物與AbA基因以及URA3下游的Y1HGold基因組結(jié)合,擴(kuò)增片段長(zhǎng)約1.4 kb。圖4 PCR檢測(cè)pBait-AbAi的插入情況正確的PCR檢測(cè)結(jié)果應(yīng)是:陽(yáng)性對(duì)照:1.4 kb陰性對(duì)照:無(wú)條帶誘餌菌株:1.35 kb+insert size(9) 分別挑取PCR檢測(cè)呈陽(yáng)性的誘餌克隆和p53-AbAi對(duì)照克隆,在SD/-Ura平板上劃線培養(yǎng)。30 C孵育3 d后,將平板置于4 C保存,即為新構(gòu)建的Y1HGoldBait/AbAi菌株和p53/AbAi對(duì)照菌株。(10) 經(jīng)過(guò)長(zhǎng)期放置
13、后,挑取單克隆在YPDA液體培養(yǎng)基中過(guò)夜培養(yǎng),離心收集菌體,用 1 mL預(yù)冷培養(yǎng)基(100 ml滅菌的YPDA與50 ml滅菌的75%甘油混合)重懸菌體,速凍后與-70 C保存。3 檢測(cè)誘餌菌株AbAr基因的表達(dá) 在不存在捕獲物的情況下,由于克隆到pAbAi載體中的誘餌序列不同,誘餌菌株報(bào)告基因的本底表達(dá)水平也不相同。例如:p53-AbAi對(duì)照的最低aureobasidin A抑制濃度為100 ng/ml。注:酵母單雜交實(shí)驗(yàn)成功的前提是沒有內(nèi)源轉(zhuǎn)錄因子能夠與目的序列結(jié)合或者結(jié)合能力非常弱。因此在進(jìn)行文庫(kù)篩選之前,檢測(cè)所構(gòu)建的誘餌菌株AbAr基因的表達(dá)情況十分重要。所以需要進(jìn)行實(shí)驗(yàn)以確定進(jìn)行文庫(kù)
14、篩選時(shí)抑制誘餌菌株報(bào)告基因本底表達(dá)所需的AbA濃度。(1) 分別挑取誘餌克隆和對(duì)照克隆,用0.9% NaCl重懸細(xì)胞,調(diào)節(jié)A600到0.002(大約2000個(gè)細(xì)胞/100 ml)。(2) 在下述培養(yǎng)基上分別涂布100 ml重懸后的菌液,30 C培養(yǎng)2-3 d。SD/-UraSD/-Ura with AbA (100 ng/mL)SD/-Ura with AbA (150 ng/mL)SD/-Ura with AbA (200 ng/mL)預(yù)期結(jié)果如下所示:表1 AbAr基因預(yù)期本底表達(dá)結(jié)果AbA/(ng/mL)Y1HGoldp53-AbAi克隆數(shù)Y1HGoldpBait-AbAi克隆數(shù)0約20
15、00約20001000Bait dependent1500Bait dependent2000Bait dependent(3) 在進(jìn)行文庫(kù)篩選時(shí),使用AbA的濃度應(yīng)為最低抑制濃度,或使用比最低抑制濃度稍高的AbA濃度(高約50-100 ng/mL),以徹底抑制誘餌菌株的生長(zhǎng)。注:如果200 ng/mL AbA不能抑制本底表達(dá),可以嘗試提高AbA濃度至500-1000 ng/mL。然而,在不存在捕獲物的情況下,如果1000 ng/mL的AbA濃度仍無(wú)法抑制AbAr基因的表達(dá),那么很可能存在能夠識(shí)別并與目的序列結(jié)合的內(nèi)源調(diào)控因子,因而該目的序列無(wú)法用來(lái)進(jìn)行酵母單雜交篩選。4 文庫(kù)cDNA的合成提
16、取試材總RNA,進(jìn)行反轉(zhuǎn)錄合成cDNA。合成的cDNA末端具有與pGADT7-Rec相同的酶切位點(diǎn)。(1) cDNA第一鏈的合成準(zhǔn)備高質(zhì)量的poly A和/或總RNA,用human placenta poly A+RNA作為陽(yáng)性對(duì)照。注:RNA的質(zhì)量決定文庫(kù)的質(zhì)量,RNA應(yīng)為所要研究的特定時(shí)期和特定組織的RNA。在微量離心管中加入如下反應(yīng)物: RNA模板(0.025-1.0 mg poly A和/或0.10-2.0 mg總RNA) 1-2 ml CDS III(oligo-dT)or CDS III/6(random)引物 1.0 ml Deionized H2O (使總體積達(dá)到4.0 ml)
17、 1-2 ml 總體積 4.0 ml 在另外一支管中加入對(duì)照cDNA反應(yīng)物,即RNA使用1 ml(1 mg)control poly A+RNA。72 C孵育2 min。冰上放置2 min,輕輕混勻,立即加入步驟中的試劑。每一個(gè)反應(yīng)加入如下試劑,輕輕混勻離心。 5first-strand buffer 2.0 ml DTT(100 mmol/L) 1.0 ml dNTP mixture(10 mmol/L) 1.0 ml SMART M-MLV RT 1.0 ml 總體積 5.0 ml注:步驟中的試劑可在步驟之前加好置于冰上。此步是cDNA合成的起始關(guān)鍵步驟,變性后的RNA/引物mix冰上放置
18、的時(shí)間不應(yīng)超過(guò)2 min。如果用的是CDS III/6隨機(jī)引物,25-30 C保溫10 min。如果用的是CDS III引物,省略此步,進(jìn)行步驟。42 C保溫10 min。加入1 ml SMART III oligo,充分混合,42 C保溫1 h。75 C保溫10 min終止第一鏈的合成。降至室溫,加入1 ml RNase H(2 U)。11 37 C保溫20 min。12 cDNA第一鏈合成產(chǎn)物應(yīng)于-20 C保存,可用3個(gè)月。(2)long distance PCR (LD-PCR)合成cDNA 第二鏈根據(jù)合成cDNA第一鏈時(shí)使用的RNA量,下表給出了進(jìn)行LD-PCR時(shí)最佳的熱循環(huán)數(shù)。使用的
19、熱循環(huán)數(shù)越少,非特異性PCR產(chǎn)物越少。表2 RNA量與最佳熱循環(huán)數(shù)總RNA/mgPoly A+RNA/mg循環(huán)數(shù)1.0-2.00.5-1.015-200.5-1.00.25-0.520-220.25-0.50.125-0.2522-240.05-0.250.025-0.12524-26LD-PCR反應(yīng)混合物中加入如下物質(zhì)(每個(gè)樣品做2個(gè)100 ml體系,對(duì)照做1個(gè)100 ml體系):First-strand cDNA (from protocol A) 2 mlDeionized H2O 70 ml10advantage 2 PCR buffer 10 ml50dNTP mix 2 ml5RA
20、CE引物 2 ml3RACE引物 2 mlMelting solution 10 ml50advantage 2 polymerase mix 2 ml總體積 100 ml按照以下程序進(jìn)行PCR反應(yīng): 1個(gè)循環(huán) 95 C 30 s X個(gè)循環(huán) 95 C 10 s 68 C 6 min 1個(gè)循環(huán) 68 C 5 min取7 ml PCR產(chǎn)物用1.2%的瓊脂糖凝膠檢測(cè),檢測(cè)時(shí)使用1 kb DNA ladder。(2) 使用CHROMA SPIN+TE-400柱純化ds cDNA為每一個(gè)要純化的cDNA樣品準(zhǔn)備一個(gè)CHROMA SPIN+TE-400柱。將純化柱翻轉(zhuǎn)幾次,充分懸浮gel matrix。移
21、去柱的頂蓋和底蓋,將柱放入2 ml收集管中。將柱放入離心機(jī),700 g離心5 min以消除平衡緩沖液,棄掉收集管中的液體。將柱放入新的收集管中,把cDNA加到gel matrix的中央,切勿使樣品沿柱的內(nèi)壁流下。注:加到邊上易使樣品沿柱內(nèi)壁流下,易混有小片段cDNA。700 g離心5 min,純化的cDNA收集到管中。將兩個(gè)純化的cDNA樣品合并到一管,測(cè)量體積。加入1/10體積3 mol/L醋酸鈉(pH5.3),混勻。加入2.5倍體積無(wú)水乙醇。-20 C冰凍1 h。室溫,14000 r/min離心20 min。小心棄去上清液,切勿碰到沉淀。14000 r/min瞬時(shí)離心,去除殘留上清液。沉淀
22、于空氣中干燥10 min。注:一般干燥至無(wú)乙醇味,不可過(guò)度干燥,否則很難溶解。用20 ml滅菌去離子水溶解沉淀,此cDNA可用來(lái)進(jìn)行同源重組構(gòu)建文庫(kù)。純化后的cDNA用1%的瓊脂糖電泳檢測(cè)。5 構(gòu)建并篩選酵母單雜交文庫(kù)(cDNA融合表達(dá)文庫(kù)的構(gòu)建及篩選)(1) 構(gòu)建并在SD/-Leu/AbA培養(yǎng)基上檢測(cè)Y1HGoldBait/AbAi菌株。注:AbA的濃度根據(jù)構(gòu)建誘餌載體時(shí)轉(zhuǎn)入酵母抑制本底表達(dá)時(shí)的濃度而定。(2) 按SMART technology步驟合成ds cDNA,其濃度為2-5 mg/20 mL。(3) 用Yeast Transformation System 2的方法轉(zhuǎn)化酵母,在轉(zhuǎn)化
23、體系中加入如下物質(zhì):cDNA文庫(kù)轉(zhuǎn)化Y1HGoldBait/AbAi菌株 20 ml SMART-amplified ds cDNA (2-5 mg) 6 ml pGADT7-Rec,(Sma I-linearized)(3 mg)Y1HGold 53/AbAi的轉(zhuǎn)化 5 ml p53 fragment (125 mg) 2 ml pGADT7-Rec,(SmaI-linearized)(1 mg)將轉(zhuǎn)化體系分別稀釋至1/10、1/100、1/1000、1/10000后,各取100 ml涂100 mm平板。文庫(kù)轉(zhuǎn)化涂SD/-Leu和SD/-Leu/AbA平板,對(duì)照p53轉(zhuǎn)化涂SD/-Leu和S
24、D/-Leu/AbA200平板。(4) 將剩余的所有文庫(kù)轉(zhuǎn)化混合物(約15 ml)涂在150 mm SD/-Leu/AbA平板上,每板涂150 ml。(5) 倒置培養(yǎng)3-5 d。(6) 3-5 d后,通過(guò)統(tǒng)計(jì)SD/-Leu 100 mm平板上的克隆數(shù)目來(lái)計(jì)算篩選的克隆數(shù)。注:所篩選的克隆數(shù)至少應(yīng)該達(dá)到1百萬(wàn),否則會(huì)降低篩選到目的產(chǎn)物的可能性。篩選的克隆數(shù)=cfu/ml on SD/-Leudilution factorresuspension volume(15ml)例如:resuspension volume=15 mlPlating volume=100 ml250 colonies gr
25、ew on the 1/100 dilution on SD/-Leu platesThe number of clones screened=250 cfu/0.1 ml10015 ml=3.75 million(7) 預(yù)期結(jié)果陽(yáng)性對(duì)照試驗(yàn):SD/-Leu和SD/-Leu/AbA200培養(yǎng)基上的克隆數(shù)相近。文庫(kù)篩選試驗(yàn):根據(jù)SD/-Leu平板上的克隆數(shù)計(jì)算所篩選的克隆數(shù),其結(jié)果應(yīng)大于1百萬(wàn)且SD/-Leu/AbA平板上的克隆數(shù)遠(yuǎn)遠(yuǎn)少于1百萬(wàn),陽(yáng)性克隆數(shù)目取決于誘餌序列。6 陽(yáng)性克隆的鑒定及cDNA質(zhì)粒的分離(1) 陽(yáng)性克隆重新劃線培養(yǎng),進(jìn)行表型確認(rèn)將陽(yáng)性克隆在SD/-Leu/AbA培養(yǎng)基上重
26、新劃線,產(chǎn)生新的單克隆。2-4 d后,選擇能夠正常生長(zhǎng)的克隆進(jìn)行后續(xù)分析。(2) 酵母克隆PCR消除重復(fù)克隆用Matchmaker Insert Check PCR Mix 2 (Cat.No.)進(jìn)行PCR,對(duì)插入到pGADT7載體中的cDNA片段進(jìn)行擴(kuò)增。PCR管中加入以下反應(yīng)物: Matchmaker Insert Check PCR Mix 25 ml H2O/Yeast 25 ml 總體積 50 ml按下述程序進(jìn)行PCR反應(yīng):94 C 1 min98 C 10 s68 C 3 minPCR產(chǎn)物在1%的瓊脂糖凝膠上進(jìn)行電泳分析。產(chǎn)物不是單一的條帶很正常,這表明在同一酵母細(xì)胞不存在一種捕獲
27、載體注:為了確認(rèn)大小相近的條帶是否是同一種插入片段,用Alu I或Hae III或者其它常用的限制性內(nèi)切酶消化PCR產(chǎn)物,產(chǎn)物用2%的瓊脂糖凝膠進(jìn)行電泳分析。如果大量的克隆含有同一插入片段,則另取50個(gè)克隆進(jìn)行PCR分析。為了快速驗(yàn)證克隆,PCR產(chǎn)物可經(jīng)過(guò)純化后用T7引物測(cè)序。(3) 陽(yáng)性cDNA質(zhì)粒的分離獲取酵母中文庫(kù)質(zhì)粒的分開。與轉(zhuǎn)化的大腸桿菌不同,轉(zhuǎn)化的酵母細(xì)胞可以含多種相關(guān)質(zhì)粒,這就意味著陽(yáng)性克隆里不只含有能激活A(yù)bAr報(bào)告基因的質(zhì)粒,還可能含有一種或多種不表達(dá)相互作用蛋白的cDNA質(zhì)粒。如果不事先將非互作質(zhì)粒分開出去而直接通過(guò)轉(zhuǎn)化大腸桿菌獲取質(zhì)粒,那么很有可能獲取到非相互作用的質(zhì)粒。
28、為了增加獲取陽(yáng)性克隆捕獲質(zhì)粒的幾率,可以將陽(yáng)性克隆在SD/-Leu/AbA培養(yǎng)基上重復(fù)涂布2-3次,每次都挑取單一的克隆進(jìn)行下一步涂布。從酵母中獲取陽(yáng)性cDNA質(zhì)粒 為了鑒定陽(yáng)性互作相關(guān)的基因,用Easy Yeast Plasmid Isolation Kit (Cat.No.)從酵母中獲取陽(yáng)性質(zhì)粒。轉(zhuǎn)化E coli并分離陽(yáng)性cDNA質(zhì)粒 用常用的克隆菌株對(duì)陽(yáng)性cDNA質(zhì)粒進(jìn)行克隆,用LB加100 g/ml ampicillin進(jìn)行選擇。(4) 鑒別陽(yáng)性和假陽(yáng)性互作酵母單雜交篩選可能會(huì)檢測(cè)到假陽(yáng)性,用以下標(biāo)準(zhǔn)可以區(qū)分陽(yáng)性和假陽(yáng)性陽(yáng)性:正確的誘餌序列和捕獲物都是激活A(yù)bAr報(bào)告基因所必需的。假陽(yáng)性:在誘餌序列突變的情況下,誘餌仍可以激活A(yù)bAr報(bào)告基因。用下述程序在選擇培養(yǎng)基上對(duì)陽(yáng)性和假
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