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1、第八章:蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)和功能(12學(xué)時(shí))第一節(jié):活性蛋白質(zhì)與前體(pp277-285)例如: 酶原 Þ 蛋白酶;激素原 Þ 激素,或者:前激素原 Þ 激素原 Þ 激素一、 激素與激素原(pp277-279)1 提取和確定前體的方法:前體不表現(xiàn)生物活性,活性測(cè)定的方法無(wú)效。免疫復(fù)合物提取法(主要方法,例如胰島素前體的提?。?,步驟如下: 制備抗激素抗體:以激素作為抗原,注射到實(shí)驗(yàn)動(dòng)物體內(nèi),待動(dòng)物產(chǎn)生相應(yīng)的抗體后,抽取血清,提取具有交叉反應(yīng)性的抗激素抗體。 找出無(wú)活性的蛋白質(zhì):利用激素原能和“抗激素抗體”形成免疫復(fù)合物的特性,將抗激素抗體與產(chǎn)生激素的腺體的組織勻
2、漿混合,分離提取免疫復(fù)合物,找出無(wú)活性的蛋白質(zhì),即為可疑的激素原。 鑒定激素原:對(duì)這種無(wú)活性的蛋白質(zhì)測(cè)序,與相應(yīng)的激素的一級(jí)結(jié)構(gòu)對(duì)比,就能推斷是不是該激素的前體。重組DNA譯碼法:例如“前腦啡肽原”的確定2 前體與激素在一級(jí)結(jié)構(gòu)方面的關(guān)系:見(jiàn)227頁(yè)表8-1。前體部分序列與激素相同,或者說(shuō),激素的序列包含在前體的序列之中。胰島素與前體1 胰島素的分布、功能和來(lái)源:主要作用于肝、肌肉、脂肪組織,參與糖代謝,有平衡血糖的作用。作為糖尿病的特效藥,在臨床醫(yī)學(xué)上廣為應(yīng)用。胰島素原由胰腺中胰島細(xì)胞產(chǎn)生。2 胰島素的活化過(guò)程:(見(jiàn)278頁(yè)圖8-1和8-2)前胰島素原:信號(hào)肽B-鏈C-肽鏈A-鏈(105肽)
3、 ß 信號(hào)肽酶 ß 切下 信號(hào)肽(24肽)胰島素原:B-鏈C-肽鏈A-鏈(81肽) ß 類胰蛋白酶+類羧肽酶 ß 切下 Arg31, Arg32, Lys59, Arg60和C鏈胰島素:胰島素(A-鏈+B-鏈)(21肽+30肽)3. C肽的作用: 便于生物合成; 利于二硫鍵正確配對(duì)。4. 信號(hào)肽的作用:在新生肽鏈的傳送過(guò)程中起識(shí)別和導(dǎo)向的作用。腦啡肽與前體1 腦啡肽的分布和功能:腦啡肽存在于腦區(qū),與腦細(xì)胞的專一性受體結(jié)合,對(duì)機(jī)體具有強(qiáng)烈的鎮(zhèn)痛作用。2 腦啡肽的種類:甲硫腦啡肽:Tyr-Gly-Gly-Phe-MetC端為甲硫氨酸;亮腦啡肽:Tyr-Gly
4、-Gly-Phe-LeuC端為亮氨酸。3 前腦啡肽原的一級(jí)結(jié)構(gòu)特征:(見(jiàn)280頁(yè)圖8-3)全長(zhǎng)267個(gè)氨基酸殘基(人體);信號(hào)肽段1個(gè):位于124;甲硫腦啡肽(MEK) 4個(gè):位于100104、107111、136140、210214;亮腦啡肽(LEK)1個(gè):位于230234;甲七肽(MEK-RK)1個(gè):位于261267; 甲八肽(MEK-RGL)1個(gè):位于189193; 酶切位點(diǎn)(配對(duì)堿性殘基):三種(Lys-Arg;Lys-Lys;Arg-Arg),12個(gè)。4 腦啡肽結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系:Tyr1:以甲氧基取代酚羥基,失去活性;前面加一個(gè)Arg,活性下降;Gly2:改為D-Ala(D型丙氨酸)
5、,則鎮(zhèn)痛作用大大提高;Gly3:為活性必需的,不能被取代;Phe4:可被Trp或者N-CH3-Phe取代;但不能被Tyr和Leu取代;Met5:去除則活性下降;延長(zhǎng)一個(gè)Thr,則活性不變。二、 酶與酶原(pp279-283)1. 體內(nèi)蛋白酶的來(lái)源和功能: 胃和胰臟:產(chǎn)生消化食物蛋白質(zhì)的酶; 血液:產(chǎn)生導(dǎo)致血液凝固的蛋白酶。2. 酶原的概念:酶的前體,含有酶的一級(jí)結(jié)構(gòu)的氨基酸殘基序列,但是由于多余肽段的存在,沒(méi)有形成活化中心的立體結(jié)構(gòu)(功能域),因而不具有催化活性。在生理活動(dòng)需要時(shí),在其他酶和/或因子的作用下,切去多余的肽段,形成酶。3. 10種酶原激活的條件和過(guò)程:見(jiàn)281頁(yè),表8-2。胰凝乳
6、蛋白酶原的激活1激活過(guò)程:(282頁(yè),圖8-4)胰凝乳蛋白酶原:?jiǎn)捂湥?45肽,5對(duì)二硫鍵 ß 胰蛋白酶 ß Arg15Ile16之間切斷-胰凝乳蛋白酶:雙鏈,15肽+230肽,酶活性最高,但不穩(wěn)定 ß -胰凝乳蛋白酶(自身激活)切開(kāi)三處 ß釋放2個(gè)2肽:Ser14-Arg15;Thr147-Asn148-胰凝乳蛋白酶:三鏈:A鏈、B鏈、C鏈,穩(wěn)定,但活性較低2活化中心的形成:(催化部位變化不大,結(jié)合部位從無(wú)到有) 催化部位(Asp102、His57、Ser195):酶原和酶的分子構(gòu)象非常相似,活化中心的催化部位具有相同的取向(282-283頁(yè),圖8-5
7、 A. 和 B.)。結(jié)合部位(189192位口袋):是酶原中不存在的 (283頁(yè)圖8-6)。胰凝乳蛋白酶結(jié)合部位形成的機(jī)理:l Ile16氨基質(zhì)子化:15-16切開(kāi)后,Ile16與Asp194羧基形成離子鍵。l 形成“口袋”結(jié)構(gòu):上述離子鍵的形成,引起一系列的構(gòu)象變化:- Met192從酶分子內(nèi)部轉(zhuǎn)移到分子表面,暴露疏水側(cè)鏈;- Gly187和Gly193伸展,形成疏水“口袋”,可與底物結(jié)合;- Ser195和Gly193的亞氨基也與底物羰基氧形成氫鍵。胰蛋白酶原的激活1 激活過(guò)程:(284頁(yè),圖8-7)(提前教室畫(huà)圖) 激活的地點(diǎn):來(lái)自胰臟,在12指腸激活。 過(guò)程:在腸激酶或者胰蛋白酶的催化
8、下,切下N端6肽。2 連鎖反應(yīng):(284頁(yè),圖8-8)(提前教室畫(huà)圖)三、 兩類前體的不同功能(pp283-285)表 兩類前體功能和結(jié)構(gòu)的比較前 體前激素原/前酶原激素原/酶原多余肽段的生理作用:信號(hào)肽:起識(shí)別和向?qū)ё饔?,將新生肽輸送到?nèi)質(zhì)網(wǎng),信號(hào)肽切除后,肽段進(jìn)入儲(chǔ)存場(chǎng)所分泌顆粒。多余肽段:起阻礙活化中心或者活性肽形成的作用,是酶的無(wú)活性儲(chǔ)備形式,接受生理功能調(diào)節(jié)。多余肽段的結(jié)構(gòu)特征:信號(hào)肽:數(shù)目:1個(gè);位置:多肽鏈的N端;長(zhǎng)度:1530個(gè)殘基;殘基:很強(qiáng)的疏水性。多余肽段:數(shù)目:1至多個(gè);位置:末端或肽段的中部;長(zhǎng)度:或長(zhǎng)或短;殘基:切口處常有Arg,Lys第二節(jié):血紅蛋白的結(jié)構(gòu)與功能(
9、pp285-299)一、 概述(pp285-285)1.分布及功能存在于人和脊椎動(dòng)物的紅細(xì)胞中,是O2和CO2的運(yùn)載工具。2.學(xué)科發(fā)展史上的貢獻(xiàn)在結(jié)構(gòu)和功能關(guān)系的研究上,它是研究得最清楚的蛋白質(zhì)。3.血紅蛋白的種類和亞基的組成HbA:22在成人體內(nèi)為主要成分,占95% 以上;HbA2:22在成人體內(nèi)為次要成分,占2 % 左右;HbF:22是胎兒的主要血紅蛋白。二、 血紅蛋白的分子結(jié)構(gòu)(pp285-291)血紅蛋白一、二、三、四級(jí)結(jié)構(gòu)1.一級(jí)結(jié)構(gòu)特征:(以HbA為例)見(jiàn)286頁(yè)的圖8-9鏈和鏈有60處氨基酸殘基是相同的,占42 %;鏈和鏈與肌紅蛋白有23處相同,占16 %;2.二、三級(jí)結(jié)構(gòu):鏈和
10、鏈與肌紅蛋白三者的構(gòu)象高度相似,走向相同(見(jiàn)圖8-11);三者的差異見(jiàn)288頁(yè)表8-4(以肌紅蛋白作標(biāo)準(zhǔn))。3.四級(jí)結(jié)構(gòu):(見(jiàn)288頁(yè)的圖8-1)四聚體結(jié)構(gòu):為四面體排布(二面體對(duì)稱),體積:6.4×5.5×5 nm。亞基的接觸:分為兩種l 1/1或者(2/2):兩條鏈之間有34個(gè)殘基的接觸,共形成17-19個(gè)氫鍵,接觸面積較大,形成一個(gè)穩(wěn)定的二聚體,不受O2結(jié)合作用的影響;l 1/2或者(2/1):兩條鏈之間只有19個(gè)殘基的接觸,接觸面積較小,受O2結(jié)合作用的影響。能把兩個(gè)二聚體聯(lián)系成為一個(gè)四聚體。脫氧血紅蛋白的亞基間的離子鍵(見(jiàn)289頁(yè)的圖8-13):總共8個(gè)l 1與2
11、之間的離子鍵:兩個(gè)末端離子鍵,兩個(gè)鏈間的離子鍵;l 1或者2的各自鏈內(nèi)離子鍵一個(gè),共兩個(gè);l 1與2之間離子鍵一個(gè);l 2與1之間離子鍵一個(gè)。這種四聚體對(duì)氧分子的親和力低于亞基,也低于氧合血紅蛋白。脫氧血紅蛋白亞基與DPG間的離子鍵(見(jiàn)290頁(yè)的圖8-14):共6個(gè)l DPG:是2,3-二磷酸甘油醛的簡(jiǎn)稱,位于四聚體的中央空穴中。l 離子鍵:DPG帶負(fù)電荷,與1和2上六個(gè)(每鏈三個(gè))帶正電荷的基團(tuán)形成離子鍵。l 作用:使脫氧血紅蛋白四級(jí)結(jié)構(gòu)更加穩(wěn)定,降低對(duì)氧分子的親和力。血紅素、原卟啉、鐵原子(見(jiàn)212頁(yè) 圖6-24提前畫(huà)圖;291頁(yè) 圖8-15)1.血紅素:位于各亞基的疏水性空穴中,由一個(gè)原
12、卟啉和一個(gè)鐵原子組成。2.原卟啉:由4個(gè)吡咯基構(gòu)成,呈扁平狀,鐵原子位于中央。3.鐵原子:通過(guò)2個(gè)共價(jià)鍵和2個(gè)配位鍵與原卟啉的4個(gè)氮原子相連,另外還能形成2個(gè)具有非常重要生物功能的配位鍵,稱為第5配位鍵和第6配位鍵。血紅素與珠蛋白的結(jié)合、氧分子的結(jié)合位(291頁(yè) 圖8-15)血紅素與珠蛋白的結(jié)合依靠來(lái)自E和F螺旋上的E7和F8位上的兩個(gè)組氨酸:1. 第5配位鍵與F8組氨酸的相連:F8位上的組氨酸距離血紅素較近,直接以配位鍵與鐵原子相連;2. 第6配位鍵與E7組氨酸的相連:E7位上的組氨酸距離血紅素較遠(yuǎn),不能直接與鐵原子相連,因此在兩者之間形成了一個(gè)空間;3. 氧分子的結(jié)合位:上述的空間就是氧分
13、子的結(jié)合位。氧分子在這個(gè)位置上的結(jié)合是一種可逆的結(jié)合過(guò)程。4. 疏水性空穴:水分子可以障礙氧分子的結(jié)合。為了防水,珠蛋白為血紅素構(gòu)筑了一個(gè)防水的空穴。三、 血紅蛋白對(duì)氧分子的結(jié)合(pp291-292)1 結(jié)合狀態(tài)的決定因素:血紅蛋白與氧分子的可逆結(jié)合主要取決與血液中的氧分壓(PO2):在肺部,氧分壓高:Hb + 4 O2 Þ Hb(O2)4;在組織,氧分壓低:Hb(O2)4Þ Hb + 4 O2式中Hb成為脫氧血紅蛋白;Hb(O2)4 稱為氧合血紅蛋白(有時(shí)簡(jiǎn)寫(xiě)為HbO2)。每個(gè)血紅蛋白有四條肽鏈,故可以與四個(gè)氧分子結(jié)合。2 鐵原子的變價(jià):在血紅蛋白分子中,鐵原子可以有二價(jià)
14、與三價(jià)的變化:在Hb中,鐵原子為亞鐵:Fe2+;在Hb(O2)4中,鐵原子為三價(jià)鐵:Fe3+。3 血紅蛋白氧飽和度(Y):4 血紅蛋白的氧結(jié)合曲線(氧解離曲線):坐標(biāo)系:PO2為橫坐標(biāo);Y為縱坐標(biāo):最低值為0%,即全部為脫氧血紅蛋白,最高值為100%,即全部為氧合血紅蛋白。特征:肌紅蛋白為雙曲線型,血紅蛋白為S型(見(jiàn)292頁(yè) 圖8-16)。四、 血紅蛋白的變構(gòu)效應(yīng)(pp292-293)1 變構(gòu)效應(yīng)的概念:變構(gòu)效應(yīng)(allosteric effect)指的是:在蛋白質(zhì)分子中一個(gè)亞基由于與配子體(例如氧分子)的結(jié)合,導(dǎo)致亞基的構(gòu)象發(fā)生變化,隨之引起相鄰亞基的構(gòu)象和功能發(fā)生改變的現(xiàn)象。許多蛋白質(zhì)和酶
15、都具有變構(gòu)效應(yīng)。2 血紅蛋白的變構(gòu)效應(yīng):書(shū)上的Adair模型的推導(dǎo)過(guò)程請(qǐng)同學(xué)自己看,不作要求。模型要點(diǎn)是: 血紅蛋白的4個(gè)亞基(或者4個(gè)氧結(jié)合位)之間有協(xié)同作用; 這種協(xié)同作用使結(jié)合常數(shù)K1 < K2 < K3 < K 4,換句話說(shuō),對(duì)氧分子的結(jié)合,一個(gè)比一個(gè)更容易,具體就表現(xiàn)為這種S型曲線; 在血紅蛋白分子中,-亞基首先與氧分子結(jié)合,氧分子引起-亞基構(gòu)象變化。這種構(gòu)象變化使相鄰的-亞基的構(gòu)象隨之發(fā)生變化,排除了-亞基氧分子結(jié)合部位的空間障礙,提高了-亞基對(duì)氧的親和力。五、 血紅蛋白的變構(gòu)過(guò)程(pp293-295)是實(shí)際測(cè)量結(jié)果加上推斷得出理論假說(shuō)。1鐵原子和血紅素的變化:
16、原子半徑的變化:在血紅素中,鐵原子由于其電子所占外層軌道的不同,而有高自旋和低自旋兩種狀態(tài)。在脫氧血紅蛋白中,鐵原子處于高自旋狀態(tài),半徑大;在氧合血紅蛋白中,鐵原子處于低自旋狀態(tài),半徑小。 血紅素構(gòu)象的變化:(參見(jiàn)294頁(yè)圖8-17)在脫氧狀態(tài),由于鐵原子半徑大,不能嵌合在卟啉環(huán)的中央小孔,而偏離原卟啉平面0.06 nm;當(dāng)O2與Fe2+結(jié)合時(shí),鐵原子由高旋狀態(tài)變成低旋狀態(tài),半徑縮小13 %,于是鐵原子移動(dòng)0.06 nm,進(jìn)入原卟啉的中央小孔,并且牽動(dòng)了F8 His向原卟啉平面的位移,從而引起蛋白質(zhì)分子的構(gòu)象發(fā)生變化。2亞基三級(jí)結(jié)構(gòu)的變化:F8 His向原卟啉平面的位移,引起亞基三級(jí)結(jié)構(gòu)的變化
17、包括: F螺旋、EF拐角、FG拐角發(fā)生位移(見(jiàn)294頁(yè) 圖8-18); F螺旋與H螺旋之間的空隙變?。ㄒ?jiàn)296頁(yè) 圖8-21),使位于該空隙的HC2 Tyr的酚基排出空隙之外; 導(dǎo)致與相鄰亞基相連的離子鍵斷裂(見(jiàn)296頁(yè) 圖8-21)。3四級(jí)結(jié)構(gòu)的變化: 11二聚體與22二聚體之間相對(duì)位置旋轉(zhuǎn)15 o,平移0.08 nm; 2相對(duì)于1旋轉(zhuǎn)了13.5 o:2的AspG1(99)與1的TyrC7(42)之間的氫鍵消失,而新建2的AsnG4(102)與1的AspG1(94)之間的氫鍵(295頁(yè) 圖8-21); 兩個(gè)亞基之間的空隙變小,擠出了DPG分子,兩個(gè)亞基之間的離子鍵全部斷裂; 上述變化進(jìn)一步使
18、維持四級(jí)結(jié)構(gòu)所有的離子鍵都斷裂; 血紅蛋白分子由緊密的T構(gòu)象轉(zhuǎn)變成松弛的R構(gòu)象,對(duì)O2親和力提高; 亞基的構(gòu)象變化,使對(duì)氧分子結(jié)合的空間障礙(E11Val)消失,亞基也與氧結(jié)合。六、 S型氧合曲線的生理意義(pp295-296)1 血液流經(jīng)肺部時(shí):肺部氧分壓相對(duì)較高,但是受環(huán)境氣壓的影響較大。即使O2分壓從100毫米汞柱降至80毫米汞柱(例如從平原進(jìn)入高原地區(qū)),由于S型曲線上部較為平坦,血液的氧飽和度并不受很大的影響,氧飽和度僅下降2 %(從0.95降至0.93),血紅蛋白仍然能夠保證充分的攝氧能力。2 血液流經(jīng)組織時(shí):進(jìn)入了解離曲線的中段,氧分壓從40毫米汞柱降至20毫米汞柱,血液的氧飽和
19、度隨之下降30 %(從0.60降至0.30),保證了血液在流經(jīng)氧分壓低的在組織時(shí),即使氧分壓僅有較小的變化,氧合血紅蛋白的解離也有明顯的增加,從而釋放出更多的O2,保證組織需要。七、 影響血紅蛋白氧親和力的因素(pp296-299)氧親和力:指的是血紅蛋白對(duì)氧結(jié)合的牢固程度,表示為PO250,含義是血紅蛋白中的氧達(dá)到半飽和程度所需要的氧分壓。氧親和力越高,血紅蛋白與氧分子的結(jié)合越牢固,則釋放給給組織的氧就越少;反之越低,組織就能得到更多的氧供應(yīng)。影響血紅蛋白氧親和力的因素有:H+、CO2、DPG等濃度,Hb的變異。1 質(zhì)子(H+)和二氧化碳(CO2)的影響1 波爾效應(yīng)(Bohr effect)
20、:質(zhì)子濃度 Ý 和二氧化碳分壓 Ý,能夠降低血紅蛋白對(duì)氧分子的親和力,促使氧解離曲線右移(297頁(yè) 圖8-22)。2 波爾效應(yīng)(Bohr effect)的生理意義: 當(dāng)血液流經(jīng)組織時(shí):與血液相比,組織的pH值較低,CO2分壓較高,曲線右移,因而有利于氧合血紅蛋白釋放O2,同時(shí)O2的釋放又促進(jìn)了脫氧血紅蛋白分子與H+ 和CO2 的結(jié)合; 當(dāng)血液流經(jīng)肺部時(shí):由于肺氣泡的O2分壓較高,促使脫氧血紅蛋白分子釋放H+ 和CO2。CO2的呼出,曲線左移,有利于氧合血紅蛋白的生成。3 波爾效應(yīng)(Bohr effect)的發(fā)生機(jī)理: H+ 有助于離子鍵形成:l H+ 與鏈N末端Val的NH
21、2結(jié)合:生成正電基團(tuán)NH3+,后者再與另一個(gè)鏈的C末端的COO 結(jié)合形成離子鍵;l H+ 與鏈His146的咪唑基結(jié)合:生成帶正電荷的基團(tuán),后者再與同一條鏈上的Asp94的側(cè)鏈COO 結(jié)合形成離子鍵; CO2也有助于離子鍵形成:l 與N末端的NH2發(fā)生可逆反應(yīng),生成H+ 和RNHCOO;l 后者可與82 Lys和141 Arg的正電基團(tuán)生成離子鍵 這些離子鍵增加了脫氧血紅蛋白的穩(wěn)定性,從而降低了對(duì)氧的親和力。2,3-二磷酸甘油酸(DPG)的影響1 DPG的來(lái)源和特征:DPG是一種有機(jī)磷酸酯,是紅細(xì)胞中糖酵解支路的產(chǎn)物。DPG分子量雖然不大,但是帶有高密度的負(fù)電。2 DPG的右移作用:DPG能夠
22、穩(wěn)定脫氧血紅蛋白的四級(jí)結(jié)構(gòu),降低后者對(duì)氧分子的親和力,使血紅蛋白的氧合曲線右移(見(jiàn)298頁(yè) 圖8-23)。3 DPG的右移作用的發(fā)生機(jī)理:脫氧血紅蛋白分子的中央空穴較大,可以容納1個(gè)DPG分子。在氧分壓低的組織中,DPG與血紅蛋白的結(jié)合能力大于O2,同時(shí)在血紅蛋白中DPG又與O2是互不相容,這樣在血紅蛋白與DPG結(jié)合的同時(shí),就必須釋放O2;而另一方面,與DPG的結(jié)合使得血紅蛋白四級(jí)結(jié)構(gòu)更加穩(wěn)定,使血紅蛋白對(duì)O2的親和力進(jìn)一步降低。4 DPG的生理作用: 當(dāng)血液流經(jīng)O2分壓低組織時(shí):紅細(xì)胞中的DPG能促進(jìn)氧合血紅蛋白釋放更多的O2,以滿足組織對(duì)O2的需要。DPG的濃度越大,則釋放的O2越多。故D
23、PG濃度變化是調(diào)節(jié)血紅蛋白分子對(duì)O2親和力的重要因素; 在有呼吸困難時(shí):例如在空氣稀薄的高山上的人,或者有換氣困難的肺氣腫病人,其紅細(xì)胞中的DPG濃度都會(huì)代償性增加,使為數(shù)不多的氧合血紅蛋白分子盡量地釋放O2,以滿足組織對(duì)O2的需要。 胎兒紅細(xì)胞中的DPG:胎兒紅細(xì)胞中血紅蛋白主要是HbF(22),HbF對(duì)O2的親和力比HbA高,這使胎兒血液流經(jīng)胎盤(pán)時(shí),HbF能從胎盤(pán)的另側(cè)母體的HbA奪取到O2。其原因是鏈的143位是絲氨酸而不是組氨酸,故而HbF結(jié)合DPG的能力弱,因而對(duì)O2親和力高。第三節(jié):分子?。╬p299-305)一、 概述(pp299-300)1 分子?。╩olecular dise
24、ase):是由于DNA分子上的基因突變,機(jī)體合成了失去正?;钚缘漠惓5鞍踪|(zhì),或者是缺失了某種蛋白質(zhì),影響了機(jī)體的正常生理功能,而產(chǎn)生的疾病。由于病因是基因的突變,故分子病可以遺傳。2 基因突變的類型: 單個(gè)堿基取代; 一個(gè)或多個(gè)密碼子的嵌入或缺失; 基因的連接; 終止密碼子的變異等3 異常血紅蛋白:?jiǎn)蝹€(gè)堿基取代:目前發(fā)現(xiàn)的異常血紅蛋白絕大多數(shù)是第一種類型,即單個(gè)堿基的取代。單個(gè)堿基引起蛋白質(zhì)異常的機(jī)理如下:按照蛋白質(zhì)生物合成的翻譯機(jī)理,mRNA 所含的A、U、G、C(腺、尿嘌呤、鳥(niǎo)、胞嘧啶)四種核苷酸,三個(gè)一組相連,可以排列組成64種三聯(lián)密碼子。64個(gè)密碼子中61種對(duì)應(yīng)于20種不同的氨基酸(每
25、種氨基酸,少則對(duì)應(yīng)1種密碼子,如蛋氨酸AUG、色氨酸UGC;多則對(duì)應(yīng)6種密碼子,如精氨酸、亮氨酸),如果三聯(lián)密碼子中某個(gè)堿基被取代,就有可能翻譯出不同的氨基酸,造成蛋白質(zhì)一級(jí)結(jié)構(gòu)的錯(cuò)誤。舉例:參見(jiàn)299頁(yè) 圖8-24:異常種類正常鏈異常鏈位置密碼子氨基酸密碼子氨基酸HbS6GAAGluGUAValHbC6GAAGluAAALysHb Siriraj7GAAGluAAALysHbE26GAAGluAAALysHb Ms63CAUHisUAUTyrHb N95AAALysGAAGlu其它突變類型:還可以見(jiàn)到一個(gè)或多個(gè)密碼子的嵌入或缺失等。4 異常血紅蛋白的分類: 改換分子表面:取代發(fā)生在分子的表面
26、,絕大多數(shù)無(wú)害(HbS等例外); 改換活性部位:變異發(fā)生在血紅素附近,影響對(duì)氧的結(jié)合; 改換三級(jí)結(jié)構(gòu):多肽鏈?zhǔn)フ?gòu)象,結(jié)構(gòu)不穩(wěn)定; 改換四級(jí)結(jié)構(gòu):在亞基之間界面上的突變,常具有異常的氧親和力。二、 分子表面突變的血紅蛋白鐮刀狀紅細(xì)胞貧血癥(pp300-302)1 概況:暴露于血紅蛋白(HbA)分子表面是極性的氨基酸殘基。在人類以及各種動(dòng)物的血紅蛋白之間,分子表面的氨基酸殘基有顯著的差異。說(shuō)明這部分的氨基酸容易變異,它們對(duì)于血紅蛋白的功能是不重要的。已經(jīng)發(fā)現(xiàn)的100多種在分子表面發(fā)生氨基酸取代的異常血紅蛋白,絕大多數(shù)是無(wú)害的。只有一小部分,例如:HbS、HbC、HbE、HbI、HbK等可以引
27、起臨床癥狀。2 鐮刀狀紅細(xì)胞貧血癥: 分布及危害:鐮刀狀紅細(xì)胞貧血癥在非洲黑人中流行。因?yàn)榧t細(xì)胞中含有HbS血紅蛋白,使病人的紅細(xì)胞呈鐮刀狀,而不是正常的扁圓形(見(jiàn)300頁(yè) 圖8-25)。鐮刀狀紅細(xì)胞極易破碎,壽命短,造成嚴(yán)重的貧血,危及生命。遺傳學(xué)分析表明,患者若為純合子(HbS/HbS),其紅細(xì)胞中HbS含量高達(dá)95%以上,患者很難活到成年;患者若為雜合子(HbS/HbA),紅細(xì)胞中HbS含量約為35%,臨床癥狀不嚴(yán)重,不危及生命,但能將疾病的基因傳給下一代。 HbS與HbA一級(jí)結(jié)構(gòu)的差異:如上表所述,決定6位氨基酸的mRNA的三聯(lián)密碼子由GAA變成了GUA,(DNA中:CTT變成了CAT
28、;),使得氨基酸由Glu變成為Val。 HbS與HbA三級(jí)結(jié)構(gòu)的差異:相同點(diǎn):6位氨基酸都位于分子表面;不同點(diǎn):在HbS中6位氨基酸疏水側(cè)鏈不帶電荷,HBA中6位氨基酸側(cè)鏈帶負(fù)電荷。使脫氧HbS在紅細(xì)胞中的溶解度大大降低。 亞基6位粘斑和血紅蛋白纖維的形成:在HbS中6位氨基酸疏水側(cè)鏈起到了粘斑的作用(301頁(yè) 圖8-26),使得HbS分子可以形成細(xì)長(zhǎng)的聚合體,即一股螺旋纖維。幾股螺旋纖維進(jìn)一步纏繞在一起,就形成了直徑為17nm和21.5 nm的兩種纖維(302頁(yè) 圖8-27)。它們使紅細(xì)胞變成了鐮刀形,而這種細(xì)胞就容易破碎,導(dǎo)致貧血,最后危及生命。三、 活性部位突變的血紅蛋白HbM病和CHB
29、HA?。╬p302-303)1 HbM病的分布和危害:HbM病發(fā)現(xiàn)于世界各地區(qū)和各種種族。在HbM的四聚體中只有半數(shù)的血紅素可以與O2結(jié)合,結(jié)果產(chǎn)生組織供氧不足,導(dǎo)致臨床上的先天性青紫癥狀,以及繼發(fā)性的紅細(xì)胞增多癥。2 HbM的分類:分為以下五種類型表8-6 血紅蛋白M的類型 血紅蛋白名稱氨基酸的取代氧親和力波爾效應(yīng)M BostonTyr®58(E7)His降低降低M IwateTyr®87(F8)His降低降低M SaskatoonTyr®63(E7)His正常存在M Hyde ParkTyr®92(F8)His正常存在M Milwauskee-1Gl
30、u®67(E11)Val降低存在3 HbM病的發(fā)病機(jī)理(見(jiàn)303頁(yè) 圖8-28): 酪氨酸Tyr對(duì)E7和F8 His的取代:見(jiàn)于前四種HbM病。由于Tyr殘基的負(fù)離子(一O)與血紅素的Fe 3+ 構(gòu)成了離子鍵,從而使血紅素固定在高鐵(Fe 3+)狀態(tài),受影響的血紅素喪失了與氧結(jié)合的能力。 谷氨酸Glu對(duì)67 (E11) Val的取代:見(jiàn)于最后一種HbM病。67 (E11) Val與63 (E7) His非常接近,相距4個(gè)殘基,這在螺旋上大致相當(dāng)于轉(zhuǎn)了一圈,因此兩者指的方向相同。由于Glu帶負(fù)電荷,它也能與血紅素的Fe 3+ 構(gòu)成了離子鍵,從而使血紅素固定在高鐵(Fe 3+)狀態(tài),受影
31、響的血紅素喪失了與氧結(jié)合的能力。4 CHBHA病的發(fā)病機(jī)理(見(jiàn)290頁(yè)表8-5和304頁(yè) 圖8-29):CHBHA病又稱為先天性亨氏小體溶血性貧血癥。與血紅素接觸的氨基酸殘基都位于血紅素空穴的周?chē)?,這些殘基絕大多數(shù)都是非極性的殘基,非極性殘基與血紅素互相作用,可以將血紅素固定在該空穴之中,這對(duì)于血紅蛋白的功能是必需的。如果上述殘基被極性殘基取代,可以使血紅素脫離血紅蛋白,不能攜帶氧分子,失去血紅蛋白的功能。而沒(méi)有血紅素的珠蛋白也會(huì)發(fā)生變性、沉淀形成所謂的“亨氏小體”,故這一類的分子病又稱為“先天性亨氏小體溶血性貧血癥”。四、 三級(jí)結(jié)構(gòu)突變的血紅蛋白(pp303-304)1 殘基被脯氨酸Pro取
32、代,造成三級(jí)結(jié)構(gòu)的破壞:Pro是螺旋的破壞者(參見(jiàn)200頁(yè)上)。如果脯氨酸取代了螺旋段中的氨基酸殘基,則血紅蛋白的三級(jí)結(jié)構(gòu)就會(huì)遭到破壞,從而產(chǎn)生不穩(wěn)定的血紅蛋白和CHBHA。例如:Hb Duarte是62 (E6) 的Val被Pro取代所致;Hb Genoa是28 (B10) 的Leu被Pro取代所致。2 殘基的缺失,造成三級(jí)結(jié)構(gòu)的破壞:許多種不穩(wěn)定的血紅蛋白,由于多肽鏈關(guān)鍵部位缺失一個(gè)或多個(gè)氨基酸殘基,從而使螺旋和肽鏈的構(gòu)象受到破壞,導(dǎo)致血紅蛋白的穩(wěn)定性下降,喪失了結(jié)合O2的能力。例如(見(jiàn)304頁(yè) 圖8-30):Hb Freiburg是由于23 (B5) 缺失所致;Hb Gun Hill是由
33、于9195 (即F7FG2)缺失所致。五、 四級(jí)結(jié)構(gòu)突變的血紅蛋白(pp304-305)1 亞基之間界面上的相對(duì)位移:在正常情況下,在氧合血紅蛋白與脫氧血紅蛋白互相轉(zhuǎn)變時(shí),血紅蛋白的四級(jí)結(jié)構(gòu)會(huì)發(fā)生改變,包括12(或者21)的接觸處兩條肽鏈發(fā)生明顯的前后位移(見(jiàn)295頁(yè) 圖8-20):l 在脫氧狀況下:99 (G1) Asp與42(G7)Tyr之間形成一個(gè)氫鍵;l 在氧合狀況下:102 (G4) Asn與94(G1)Asp之間形成一個(gè)氫鍵。當(dāng)這一個(gè)氫鍵形成時(shí),另一個(gè)就破壞;另一個(gè)形成時(shí),這一個(gè)就破壞。維持了血紅蛋白四級(jí)結(jié)構(gòu)構(gòu)象的穩(wěn)定。如果相關(guān)的殘基被取代,會(huì)引起血紅蛋白變構(gòu)效應(yīng)的喪失,出現(xiàn)異常的
34、氧親和力(升高或降低)。2 99 (G1) Asp被取代:如果99 (G1) Asp被取代,將會(huì)破壞脫氧狀態(tài)構(gòu)象的穩(wěn)定性,氧親和力升高。屬于這類的突變血紅蛋白有:l Hb Yakima:His 99 (G1) Asp;l Hb Kempsey:Asn 99 (G1) Asp;l Hb Radcliffe:Ala 99 (G1) Asp;3 102 (G4) Asn被取代:如果102 (G4) Asn被取代,將會(huì)破壞氧合狀態(tài)構(gòu)象的穩(wěn)定性,氧親和力降低。屬于這類的突變血紅蛋白有:l Hb Kansas:Thr102 (G4) Asn。第四節(jié):蛋白質(zhì)的進(jìn)化(pp305-313)一、 蛋白質(zhì)分子進(jìn)化的
35、一般規(guī)律:(pp305-306)1 突變理論:蛋白質(zhì)是DNA基因表達(dá)的產(chǎn)物。結(jié)構(gòu)基因的突變會(huì)導(dǎo)致蛋白質(zhì)分子的變異。 自然選擇的淘汰:如果變異有損于蛋白質(zhì)的生物功能,則有關(guān)的生物個(gè)體就受到自然選擇的淘汰,得不到延續(xù); 物種的進(jìn)化:如果變異有助于蛋白質(zhì)的生物功能的改進(jìn),或者新的功能的產(chǎn)生,就有可能促成物種的進(jìn)化; 中性突變:在更多的情況下,蛋白質(zhì)的生物功能不受影響,則這種突變可以得以遺傳,稱為中性突變。2 同源蛋白:指的是:由共同的祖先蛋白質(zhì)分子經(jīng)過(guò)變異和自然選擇而產(chǎn)生的功能上相同、相關(guān)、甚至不同,但是結(jié)構(gòu)上有某種程度相似性的不同蛋白質(zhì)。例如血紅蛋白與肌紅蛋白就是同源蛋白(結(jié)構(gòu)相似,功能相關(guān))。3
36、 同源蛋白的進(jìn)化趨勢(shì): 功能完善:使蛋白質(zhì)所具備的功能得以保全,并得以完善; 功能異化:使蛋白質(zhì)產(chǎn)生新的功能。功能異化是蛋白質(zhì)進(jìn)化的普遍現(xiàn)象。4 守恒氨基酸殘基(嚴(yán)格守恒):指的是:在生物進(jìn)化過(guò)程中,始終保持不變氨基酸殘基。守恒氨基酸殘基一般與蛋白質(zhì)分子的生物功能保持密切的關(guān)聯(lián)。尤其是與活性部位(包括與金屬輔基或輔酶相結(jié)合的位置)構(gòu)象有關(guān)的氨基酸殘基均不會(huì)發(fā)生改變,這是維持蛋白質(zhì)生物功能的基本條件。5 疏水核疏水性的守恒(相對(duì)守恒):蛋白質(zhì)分子的疏水核,其疏水作用對(duì)維持蛋白質(zhì)分子的構(gòu)象有重要的作用,因此在進(jìn)化過(guò)程中,疏水核中的個(gè)別殘基可以置換,但疏水性是守恒的。6 蛋白質(zhì)分子表面的變異(相對(duì)易
37、變):由于分子內(nèi)部的氨基酸殘基通常對(duì)維系三維結(jié)構(gòu)比較重要,因此變異較多發(fā)生在蛋白質(zhì)分子表面上。在同源蛋白的進(jìn)化過(guò)程中,氨基酸殘基之間的置換有下列規(guī)律:殘基側(cè)鏈的大小、形狀、柔性、電荷、氫鍵形成能力等越近似,則置換越容易發(fā)生。例如:Lys被置換為Arg;Ile被置換為L(zhǎng)eu等等。二、 細(xì)胞色素C分子的進(jìn)化(pp306-313)細(xì)胞色素C一級(jí)結(jié)構(gòu)的種族差異1 用細(xì)胞色素C分子研究進(jìn)化的優(yōu)勢(shì): 分布廣泛:細(xì)胞色素C是生物界中廣泛存在的一種古老蛋白質(zhì),從細(xì)菌到人,一切需要氧的生物體中都有細(xì)胞色素C存在。 結(jié)構(gòu)簡(jiǎn)單:細(xì)胞色素C分子結(jié)構(gòu)比較簡(jiǎn)單,大小合適,容易純化、結(jié)晶,結(jié)構(gòu)測(cè)定比較方便?,F(xiàn)在,已經(jīng)測(cè)出近
38、100種生物的細(xì)胞色素C一級(jí)結(jié)構(gòu)。2 細(xì)胞色素C一級(jí)結(jié)構(gòu)的種族差異: 多肽鏈殘基數(shù)目的差異:脊椎動(dòng)物:104個(gè)(個(gè)別103個(gè))昆蟲(chóng):108個(gè)在N端增長(zhǎng)了4個(gè)植物:111114個(gè)(一般為112個(gè))在N端增長(zhǎng)了58個(gè) 一級(jí)結(jié)構(gòu)殘基改變數(shù)與親緣關(guān)系(見(jiàn)306頁(yè) 表8-7):以人為例人與黑猩猩:完全相同;人與恒河猴:相差一個(gè)殘基;人與馬:相差12個(gè)殘基;人與烏龜:相差15個(gè)殘基;人與金槍魚(yú):相差21個(gè)殘基;人與蠶蛾:相差31個(gè)殘基;人與小麥:相差43個(gè)殘基;人與面包酵母:相差45個(gè)殘基; 生物進(jìn)化樹(shù):Dickerson等人根據(jù)各種生物的細(xì)胞色素c一級(jí)結(jié)構(gòu)的差異和相同性,繪制出生物界的進(jìn)化樹(shù)(evolu
39、tionary tree),與生物分類學(xué)所繪制的進(jìn)化樹(shù)是一致的。細(xì)胞色素C三級(jí)結(jié)構(gòu)的保守性從表8-7中發(fā)現(xiàn),在不同物種的細(xì)胞色素c一級(jí)結(jié)構(gòu)中,有26個(gè)位置的氨基酸殘基是完全不變的(守恒殘基)。這些守恒殘基分散在多肽鏈的各個(gè)部位。在分子進(jìn)化過(guò)程中,細(xì)胞色素c的一級(jí)結(jié)構(gòu)雖然有較大的變化,但是三級(jí)結(jié)構(gòu)基本上保持不變(見(jiàn)312頁(yè) 圖8-32)。1 血紅素結(jié)合位(功能域)的嚴(yán)格保守性(312頁(yè) 圖8-32):血紅素是細(xì)胞色素c分子的電子傳遞中心,在生物進(jìn)化中保持不變。 Cys14和Cys17的S原子與血紅素的乙烯基共價(jià)相連; Met18的N原子和Met80的S原子與血紅素的Fe原子配位鍵相連; Tyr48和Trp59與血紅素的丙酸基以氫鍵相連。2 血紅素疏水環(huán)境的嚴(yán)格保守性(表8-7):70-80位11個(gè)殘基參與形成血紅素的疏水環(huán)境,都是守恒殘基。3 多肽鏈轉(zhuǎn)彎處的嚴(yán)格保守性: Pro (30, 71, 76); Gly (29, 34, 45, 77, 84)。4 環(huán)狹縫疏水基團(tuán)的保守性取代:環(huán)繞狹縫的16個(gè)疏水殘基:Leu (32, 35, 64, 68, 94, 98) 6個(gè);Ile (81, 85,
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