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文檔簡介
1、會(huì)計(jì)學(xué)1生物化學(xué)蛋白質(zhì)上幻燈片生物化學(xué)蛋白質(zhì)上幻燈片第一節(jié) 蛋白質(zhì)在生命活動(dòng)中的作用一、蛋白質(zhì)的概念蛋白質(zhì)(protein):是由氨基酸(amino acids)通過肽鍵(peptide bond)相連形成的高分子含氮化合物。三、蛋白質(zhì)的元素組成碳50%氫7%氧23%氮16%硫0-3%微量的磷、鐵、銅、碘、鋅、鉬1/16%蛋白質(zhì)系數(shù)蛋白質(zhì)的一些功能酸水解:色氨酸破壞,天冬酰胺、谷胺酰胺脫酰胺基堿水解:消旋,色氨酸穩(wěn)定酶水解:水解位點(diǎn)特異,用于一級(jí)結(jié)構(gòu)分析。第二節(jié) 氨基酸組成蛋白質(zhì)的基本單位v自然界中的氨基酸有300余種,組成生物體蛋白質(zhì)的氨基酸有20種。v-氨基酸起偏鏡 檢偏鏡 Thr(蘇)和
2、Ile(異)有四種立體異構(gòu)體。其余 17種氨基酸有兩種光學(xué)異構(gòu)體:L型、D型。 構(gòu)成蛋白質(zhì)的氨基酸均屬L-型。Gly:一種構(gòu)型,無旋光性;按R基的極性性質(zhì)分類: 非極性氨基酸 極性不帶電荷的氨基酸 酸性氨基酸 堿性氨基酸二、氨基酸的種類和結(jié)構(gòu)氨基酸的分類結(jié)構(gòu)名稱縮寫pI1、非極性(疏水性)H-CHCOO-+NH3甘氨酸glycineGly,G5.97CH3-CHCOO-+NH3丙氨酸alanineAla,A6.00CH3-CH-CHCOO-CH3+NH3纈氨酸valineVal,V5.96CH3-CH-CH2-CHCOO-CH3+NH3亮氨酸leucineLeu,L5.98CH3-CH2-CH
3、-CHCOO-CH3+NH3異亮氨酸isoleucineIle,I5.98-CH2-CHCOO-+NH3苯丙氨酸phenylalaninePhe,F5.48CH22HCCH-COO-2HCNH脯氨酸prolinePro,P6.30結(jié)構(gòu)名稱縮寫pI2、極性不帶電荷的氨基酸NCH2CHCOO-+NH3色氨酸t(yī)ryptophanTrp,W5.89CH3-S-CH2CH2-CHCOO-+NH3-CH2-CHCOO-+NH3HO-酪氨酸t(yī)yrosineTyr,Y5.66半胱氨酸cysteineCys,C5.07HS-CH2-CHCOO-+NH3甲硫(蛋)氨酸methionineMetM5.74結(jié)構(gòu)名稱縮
4、寫pIHH2N-C-CH2-CHCOO-O+NH3天冬酰胺asparagineAsn,N5.41H2N-C-CH2CH2-CHCOO-O+NH3谷氨酰胺glutamineGln,Q5.65HO-CH-CHCOO-+NH3CH3蘇氨酸t(yī)hreonineThr,T5.60絲氨酸serineSer,S5.68HO-CH2-CHCOO-+NH3結(jié)構(gòu)名稱縮寫pI3、堿性氨基酸(帶正電荷)H2NCH2CH2CH2CH2-CHCOO-+NH3賴氨酸lysineLys,K9.74H2NCNHCH2CH2CH2-CHCOO-+NH3NH精氨酸arginineArg,R10.76HC=C-CH2-CHCOO-NN
5、H+NH3CH組氨酸histidineHis,H7.59結(jié)構(gòu)名稱縮寫pI4、酸性氨基酸(帶負(fù)電荷)HOOC-CH2-CHCOO-+NH3天冬氨酸Asp,D2.97AsparticacidHOOC-CH2-CH2-CHCOO-+NH3谷氨酸Glu,E3.22Glutamicacid結(jié)構(gòu)名稱縮寫pI幾種特殊氨基酸 脯氨酸(亞氨基酸)CH2CHCOO-NH2+CH2CH2CH2CHCOO-NH2+CH2CH2-OOC-CH-CH2-S+NH3S-CH2-CH-COO-+NH3-OOC-CH-CH2-S+NH3S-CH2-CH-COO-+NH3 半胱氨酸 +胱氨酸二硫鍵-HH-OOC-CH-CH2-S
6、H+NH3-OOC-CH-CH2-SH+NH3HS-CH2-CH-COO-+NH3HS-CH2-CH-COO-+NH3芳香族氨基酸紫外吸收在280nm左右,Trp吸收最強(qiáng),Tyr次之,Phe最弱。分析溶液中蛋白質(zhì)含量的快速簡便方法。摩爾吸光系數(shù)從營養(yǎng)學(xué)角度可分為:必需氨基酸和非必需氨基酸,必需氨基酸:人體必不可少,而機(jī)體內(nèi)又不能合成,必須從食物中補(bǔ)充的氨基酸。異亮氨酸、蛋氨酸、纈氨酸、亮氨酸、色氨酸、苯丙 氨酸、蘇氨酸、賴氨酸三、氨基酸的理化性質(zhì)兩性離子(偶極):在某一pH值時(shí),羧基以COO, 氨基以 NH3 +形式存在,這樣的氨基酸分 子含有一個(gè)正電荷和一個(gè)負(fù)電荷,稱為-。1.兩性解離和等電
7、點(diǎn)(isoelectric point, pI) : 在某一pH值時(shí),氨基酸或蛋白質(zhì)的凈電荷為0,在電場(chǎng)中其既不向正極也不向負(fù)極移動(dòng),這時(shí)的pH值稱為AA或蛋白質(zhì)的等電點(diǎn)。解離成陽離子和陰離子的趨勢(shì)及數(shù)目相等時(shí)溶液的pH值。等電點(diǎn)時(shí)氨基酸為兩性離子。氨基酸的兩性離子 陽離子陰離子pHpIpH=pIpHpI+OH-+H+CHNH2COO-R CHNH2COO-RCHNH3+COO-R CHNH3+COO-R+OH-+H+CH COOHRNH3+CH COOHRNH3+pI=1/2(pK1+pK2)側(cè)鏈不解離的AA:pI=(pK1+pK2)/2帶正電荷的AA:pI=(pK2+pKR)/2帶負(fù)電荷的
8、AA:pI=(pK1+pKR)/2谷氨酸的滴定曲線1pKRpK2pK賴氨酸的滴定曲線1pK2pK3pK2、氨基酸的化學(xué)性質(zhì)Pro:亮黃色max440nmSanger反應(yīng)(2,4-二硝基氟苯)(DNP氨基酸)弱堿(DNFB,Sanger試劑)黃色DNP-AAEdman反應(yīng)(苯異硫氰酸酯PITC)第三節(jié)蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)一、蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)層次蛋白質(zhì)是由一條或多條多肽(polypeptide)鏈以特殊方式結(jié)合而成的生物大分子。一級(jí)結(jié)構(gòu)(AA序列)二級(jí)結(jié)構(gòu)三級(jí)結(jié)構(gòu)四級(jí)結(jié)構(gòu)(聚合體)空間結(jié)構(gòu)*二、蛋白質(zhì)的一級(jí)結(jié)構(gòu)(共價(jià)結(jié)構(gòu))v肽(peptide):是由一個(gè)AA的-羧基與另一個(gè)AA的-氨基縮合脫水而形成的化合物。
9、v肽鍵(peptide bond):是由一個(gè)氨基酸的-羧基與另一個(gè)氨基酸的-氨基脫水縮合而形成的酰胺鍵。書寫:把含自由-氨基的AA一端放左邊(稱為N-末端或氨基末端);把含自由-羧基AA放在右邊(稱為C-末端或羧基末端)。命名:從肽鏈的N-末端開始,按照AA在肽鏈中順序逐一稱為某氨基酰某氨基酰某氨基酸。如上面的肽稱為:丙氨酰甘氨酰酪氨酰谷氨酸CH2H2N-CH-C-NH-CH-C-NH-CH-C-NH-CH-COOHCH3=OH=OCH2OH=OCH2COOH1. 谷胱甘肽(glutathione, GSH)CNH-CH-C-NH-CH2COOHCH2=O=OSHCOOHCHNH2CH2CH2
10、Glu-Cys-GlySSGlu-Cys-Gly還原型谷胱甘肽(GSH)氧化型谷胱甘肽(GSSG)2GSHGS-SG-2H+2H二硫鍵2.胰島素蛋白質(zhì)的一級(jí)結(jié)構(gòu):多肽鏈中的氨基酸序列,也包括多肽鏈中連接氨基酸殘基的共價(jià)鍵,主要是肽鍵和二硫鍵。CNH-CH-C-NH-CH2COOHCH2=O=OSHCOOHCHNH2CH2CH2Glu-Cys-GlySSGlu-Cys-Gly還原型谷胱甘肽(GSH)氧化型谷胱甘肽(GSSG)2GSHGS-SG-2H+2H二硫鍵 Thr(蘇)和Ile(異)有四種立體異構(gòu)體。其余 17種氨基酸有兩種光學(xué)異構(gòu)體:L型、D型。 構(gòu)成蛋白質(zhì)的氨基酸均屬L-型。Gly:一種構(gòu)型,無旋光性;2、極性不帶電荷的氨基酸NCH2CHCOO-+NH3色氨酸t(yī)ryptophanTrp,W5.89CH3-S-CH2CH2-CHCOO-+NH3-CH2-CHCOO-+NH3HO-酪氨酸t(yī)yrosineTyr,Y5.66半胱氨酸cysteineCys,C5.07HS-CH2-CHCOO-+NH3甲硫(蛋)氨酸methionineMetM5.74結(jié)構(gòu)名稱縮寫pIH三、氨
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