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1、酶促反應(yīng)動(dòng)力學(xué)酶促反應(yīng)動(dòng)力學(xué)研究酶促反應(yīng)的速率以及影響速率的各種因素研究酶促反應(yīng)的速率以及影響速率的各種因素Lecture Outline 講授內(nèi)容底物濃度對(duì)酶反應(yīng)速率的影響底物濃度對(duì)酶反應(yīng)速率的影響 米氏方程米氏方程酶的抑制作用酶的抑制作用環(huán)境因素對(duì)酶反應(yīng)的影響環(huán)境因素對(duì)酶反應(yīng)的影響名詞解釋名詞解釋米氏常數(shù)米氏常數(shù)KmKm,Michaelis-MentonMichaelis-Menton constant constant抑制作用抑制作用inhibitioninhibition可逆抑制作用可逆抑制作用reversible inhibitionreversible inhibition不可逆抑
2、制作用不可逆抑制作用irreversible inhibitionirreversible inhibition競(jìng)爭(zhēng)性抑制作用競(jìng)爭(zhēng)性抑制作用competitive inhibitioncompetitive inhibition非競(jìng)爭(zhēng)性抑制作用非競(jìng)爭(zhēng)性抑制作用noncompetitive inhibitionnoncompetitive inhibition反競(jìng)爭(zhēng)性抑制作用反競(jìng)爭(zhēng)性抑制作用uncompetitive inhibitionuncompetitive inhibition 第一部分第一部分底物濃度對(duì)酶反應(yīng)速率的影響底物濃度對(duì)酶反應(yīng)速率的影響 1.11.1米氏學(xué)說(shuō)米氏學(xué)說(shuō) 酶有被底物
3、所飽和的現(xiàn)象酶有被底物所飽和的現(xiàn)象雙曲線雙曲線 酶酶-底物復(fù)合物學(xué)說(shuō)底物復(fù)合物學(xué)說(shuō)(Enzyme-substrate complex)1903年,年,Herin-Wurtz 快速平衡學(xué)說(shuō)快速平衡學(xué)說(shuō)1913年年Michaelis和和Menten 提出米氏方程提出米氏方程Ks為為ES的解離常數(shù)的解離常數(shù)Maud Menten1879-1960Leonor Michaelis1875-1949 穩(wěn)態(tài)理論(穩(wěn)態(tài)理論(Steady State )Briggs and Haldane in 1925Km=(k2+k3)/k1修正修正Michaelis-Menton EquationKm 米氏常數(shù)米氏常數(shù)
4、 Vmax 最大反應(yīng)最大反應(yīng)速率速率3個(gè)假設(shè)個(gè)假設(shè):(1)底物大過(guò)量,即底物大過(guò)量,即SE(2)P濃度極小,忽略濃度極小,忽略 這步反應(yīng)這步反應(yīng)ESE + Pk4(3)穩(wěn)態(tài)假設(shè):穩(wěn)態(tài)假設(shè):ES的生成速度和的生成速度和ES的分解速度的分解速度相等,相等, ES 為常數(shù),達(dá)到穩(wěn)態(tài)。為常數(shù),達(dá)到穩(wěn)態(tài)。1.2 米氏方程式的推導(dǎo)米氏方程式的推導(dǎo)酶促反應(yīng)分兩步進(jìn)行:酶促反應(yīng)分兩步進(jìn)行:第一步:酶與底物作用,形成酶第一步:酶與底物作用,形成酶-底物復(fù)合物。底物復(fù)合物。第二步:第二步:ES復(fù)合物分解形成產(chǎn)物,釋放出游離酶。復(fù)合物分解形成產(chǎn)物,釋放出游離酶。酶與底物生成酶與底物生成ES的速度為:的速度為:注:E
5、S分解的速度為:分解的速度為:當(dāng)整個(gè)反應(yīng)體系處于當(dāng)整個(gè)反應(yīng)體系處于穩(wěn)態(tài)穩(wěn)態(tài)時(shí),時(shí),ESES生成生成速度(速度(V V1 1)等于)等于ESES分解速度(分解速度(V V2 2):): 令: 將(將(2)代入()代入(1) 用用Et代表酶的總濃度,則代表酶的總濃度,則得:得:將(將(4 4)代入()代入(3 3)酶促反應(yīng)速度酶促反應(yīng)速度v取決于取決于ES轉(zhuǎn)換為轉(zhuǎn)換為E+P的速度的速度得:得:當(dāng)反應(yīng)體系中的底物濃度極大,而使所有的酶分子都當(dāng)反應(yīng)體系中的底物濃度極大,而使所有的酶分子都以以ES形式存在時(shí),反應(yīng)速度達(dá)到最大值(即最大反應(yīng)形式存在時(shí),反應(yīng)速度達(dá)到最大值(即最大反應(yīng)速度,速度,V)。)。得
6、:得: 將(將(6)代入()代入(5)米氏方程式米氏方程式Km-米氏常數(shù)米氏常數(shù)(Michaelis-Menton constant)表明當(dāng)已知表明當(dāng)已知Km和和Vmax時(shí),酶反應(yīng)速率與底物濃時(shí),酶反應(yīng)速率與底物濃度的定量關(guān)系。度的定量關(guān)系。Km的物理意義的物理意義Km值是當(dāng)酶反應(yīng)速度為最大反應(yīng)速度一半時(shí)的底物濃度。值是當(dāng)酶反應(yīng)速度為最大反應(yīng)速度一半時(shí)的底物濃度。單位是底物濃度的單位,一般用單位是底物濃度的單位,一般用mol/L或或mmolL表示。表示。計(jì)算:底物濃度計(jì)算:底物濃度反應(yīng)速度反應(yīng)速度底物濃度較低時(shí),底物濃度較低時(shí), S Km,米氏方程式的分母中,米氏方程式的分母中S一項(xiàng)一項(xiàng)可以忽
7、略不計(jì),得:可以忽略不計(jì),得: 反應(yīng)速度與底物濃度成正比,反應(yīng)速度與底物濃度成正比, 符合一級(jí)反應(yīng)。符合一級(jí)反應(yīng)。在底物濃度很高時(shí),在底物濃度很高時(shí),SKm,米氏方程中,米氏方程中,Km可以忽略不可以忽略不計(jì),得計(jì),得 反應(yīng)速度與底物濃度無(wú)關(guān),反應(yīng)速度與底物濃度無(wú)關(guān), 符合零級(jí)反應(yīng)符合零級(jí)反應(yīng)測(cè)定酶活力測(cè)定酶活力1.3 1.3 米氏常數(shù)的意義米氏常數(shù)的意義 Km是酶的一個(gè)特征常數(shù)。是酶的一個(gè)特征常數(shù)。Km的大小的大小只與酶的性質(zhì)有關(guān),而與酶濃度無(wú)關(guān)。只與酶的性質(zhì)有關(guān),而與酶濃度無(wú)關(guān)。鑒別酶:鑒別酶:25,最適,最適pH的的Km值值 Km可以判斷酶的專一性和天然底物。可以判斷酶的專一性和天然底物
8、。酶的最適底物或天然底物:酶的最適底物或天然底物: Km值最小的底物值最小的底物酶對(duì)底物親和力的大?。好笇?duì)底物親和力的大?。?/ Km 最適底物的親和力(最適底物的親和力(1/ Km)最大,)最大, Km最小最小,達(dá)最大反達(dá)最大反應(yīng)速率一半時(shí)所需要的底物濃度愈小。應(yīng)速率一半時(shí)所需要的底物濃度愈小。1.4 1.4 米氏常數(shù)的求法米氏常數(shù)的求法雙倒數(shù)作圖法雙倒數(shù)作圖法(Lineweaver-Burk作圖法作圖法)以以1 1SS為橫坐標(biāo),為橫坐標(biāo), 以以1 1v v為縱坐標(biāo)作圖為縱坐標(biāo)作圖 缺點(diǎn):缺點(diǎn):實(shí)驗(yàn)點(diǎn)過(guò)于集中于直線的左端,實(shí)驗(yàn)點(diǎn)過(guò)于集中于直線的左端,作圖不易十分準(zhǔn)確。作圖不易十分準(zhǔn)確。第第二
9、二部分部分酶的抑制作用酶的抑制作用名詞解釋名詞解釋米氏常數(shù)米氏常數(shù)KmKm,Michaelis-MentonMichaelis-Menton constant constant抑制作用抑制作用inhibitioninhibition可逆抑制作用可逆抑制作用reversible inhibitionreversible inhibition不可逆抑制作用不可逆抑制作用irreversible inhibitionirreversible inhibition競(jìng)爭(zhēng)性抑制作用競(jìng)爭(zhēng)性抑制作用competitive inhibitioncompetitive inhibition非競(jìng)爭(zhēng)性抑制作用非競(jìng)爭(zhēng)性
10、抑制作用noncompetitive inhibitionnoncompetitive inhibition反競(jìng)爭(zhēng)性抑制作用反競(jìng)爭(zhēng)性抑制作用uncompetitive inhibitionuncompetitive inhibition 2.1 2.1 酶的抑制作用酶的抑制作用失活作用失活作用(inactivationinactivation)酶蛋白酶蛋白變性變性而引起活力喪失。而引起活力喪失。變性劑對(duì)酶變性劑對(duì)酶無(wú)選擇性無(wú)選擇性。抑制作用抑制作用(inhibitioninhibition)酶的酶的必須基團(tuán)必須基團(tuán)化學(xué)性質(zhì)的改變,引起酶活力降低化學(xué)性質(zhì)的改變,引起酶活力降低或喪失。但酶或喪失。
11、但酶未變性。未變性。一種抑制劑一種抑制劑只能只能使一種酶或一類酶產(chǎn)生抑制作用。使一種酶或一類酶產(chǎn)生抑制作用。不可逆的抑制作用(不可逆的抑制作用(irreversible inhibition):):抑制劑與酶的必須基團(tuán)以抑制劑與酶的必須基團(tuán)以共價(jià)鍵共價(jià)鍵結(jié)合而引起酶活力結(jié)合而引起酶活力喪失,喪失,不能不能用透析、超濾等物理方法除去抑制劑用透析、超濾等物理方法除去抑制劑而使酶復(fù)活。而使酶復(fù)活??赡娴囊种谱饔茫赡娴囊种谱饔茫╮eversible inhibition) :抑制劑與酶的必須基團(tuán)以抑制劑與酶的必須基團(tuán)以非共價(jià)鍵非共價(jià)鍵結(jié)合而引起酶活結(jié)合而引起酶活力喪失,力喪失,能能用透析、超濾等物理
12、方法除去抑制劑用透析、超濾等物理方法除去抑制劑而使酶復(fù)活。而使酶復(fù)活??赡娴囊种谱饔茫嚎赡娴囊种谱饔茫?競(jìng)爭(zhēng)性抑制、非競(jìng)爭(zhēng)性抑制、反競(jìng)爭(zhēng)性抑制。競(jìng)爭(zhēng)性抑制、非競(jìng)爭(zhēng)性抑制、反競(jìng)爭(zhēng)性抑制。2.2 分類分類根據(jù)抑制劑與酶作用方式及是否可逆根據(jù)抑制劑與酶作用方式及是否可逆2.3 2.3 競(jìng)爭(zhēng)性抑制作用競(jìng)爭(zhēng)性抑制作用(competitive inhibition) 概念概念:抑制劑與底物:抑制劑與底物競(jìng)爭(zhēng)競(jìng)爭(zhēng)酶的結(jié)合部位,從而影響酶的結(jié)合部位,從而影響了底物與酶的正常結(jié)合。了底物與酶的正常結(jié)合。最常見(jiàn)的一種可逆抑制作用。最常見(jiàn)的一種可逆抑制作用。 原因原因:抑制劑與底物的抑制劑與底物的結(jié)構(gòu)類似結(jié)構(gòu)類似,
13、與酶可形成可逆的復(fù)合物,但,與酶可形成可逆的復(fù)合物,但此復(fù)合物不可能分解成產(chǎn)物,酶反應(yīng)速率下降。此復(fù)合物不可能分解成產(chǎn)物,酶反應(yīng)速率下降。 增加底物濃度可解除這種抑制。增加底物濃度可解除這種抑制。動(dòng)畫 競(jìng)爭(zhēng)性抑制的特征競(jìng)爭(zhēng)性抑制的特征 a 反應(yīng)式:反應(yīng)式:EI + SESIb 動(dòng)力學(xué)方面動(dòng)力學(xué)方面 : VmaxVmax不不變,但變,但KmKm增大增大 。 競(jìng)爭(zhēng)性抑制的臨床應(yīng)用意義競(jìng)爭(zhēng)性抑制的臨床應(yīng)用意義 磺胺類藥物磺胺類藥物:對(duì)氨基苯磺酰胺:對(duì)氨基苯磺酰胺磺胺類藥物有抑制細(xì)菌生長(zhǎng)繁殖的作用,而不傷害人和畜禽?;前奉愃幬镉幸种萍?xì)菌生長(zhǎng)繁殖的作用,而不傷害人和畜禽。葉酸和二氫葉酸是四氫葉酸的前體。
14、(二氫葉酸合成酶)葉酸和二氫葉酸是四氫葉酸的前體。(二氫葉酸合成酶)PABA人:人: 葉酸葉酸 (食物)(食物)FH2FH4葉酸還原酶葉酸還原酶FH2還原還原酶酶細(xì)菌:細(xì)菌:PABAFH2合成酶合成酶FH2FH4FH2還原還原酶酶對(duì)氨基苯磺胺對(duì)氨基苯磺胺與與PABA兩者競(jìng)爭(zhēng)兩者競(jìng)爭(zhēng)FH2合成酶合成酶細(xì)菌:細(xì)菌:PABAFH2合成酶合成酶FH2FH4抗菌增效劑抗菌增效劑TMP與與FH2相似,抑制細(xì)菌相似,抑制細(xì)菌FH2還原酶還原酶細(xì)菌:細(xì)菌:PABAFH2合成酶合成酶FH2FH4FH2還原還原酶酶2.4 非競(jìng)爭(zhēng)性抑制作用非競(jìng)爭(zhēng)性抑制作用 (noncompetitive inhibition)概念
15、概念:底物和抑制劑同時(shí)與酶結(jié)合,兩者沒(méi)有競(jìng)爭(zhēng)作用。底物和抑制劑同時(shí)與酶結(jié)合,兩者沒(méi)有競(jìng)爭(zhēng)作用。抑制劑(抑制劑(I I)和底物()和底物(S S)可以同時(shí)結(jié)合在酶分子()可以同時(shí)結(jié)合在酶分子(E E)的不同)的不同部位上,形成部位上,形成ESIESI三元復(fù)合物。但是,中間產(chǎn)物三元復(fù)合物。但是,中間產(chǎn)物ESIESI三元復(fù)三元復(fù)合物不能進(jìn)一步分解為產(chǎn)物合物不能進(jìn)一步分解為產(chǎn)物, ,酶酶活力降低?;盍档?。動(dòng)畫原因原因抑制劑的抑制劑的結(jié)構(gòu)結(jié)構(gòu)可與底物毫無(wú)相關(guān)之處可與底物毫無(wú)相關(guān)之處 如亮氨酸是精氨酸的一種非競(jìng)爭(zhēng)性抑制劑如亮氨酸是精氨酸的一種非競(jìng)爭(zhēng)性抑制劑 加入加入大量底物不能解除大量底物不能解除非競(jìng)爭(zhēng)
16、性抑制劑對(duì)酶活性的抑非競(jìng)爭(zhēng)性抑制劑對(duì)酶活性的抑制。這是不同于競(jìng)爭(zhēng)性抑制的一個(gè)特征制。這是不同于競(jìng)爭(zhēng)性抑制的一個(gè)特征。 特征特征a反應(yīng)式反應(yīng)式 b b 動(dòng)力學(xué)方面動(dòng)力學(xué)方面:VmaxVmax降低,但降低,但KmKm值不改變。值不改變。2.5 反競(jìng)爭(zhēng)性抑制反競(jìng)爭(zhēng)性抑制(uncompetitive inhibition)概念概念酶只有與底物結(jié)合后,才能與抑制劑結(jié)合。與酶只有與底物結(jié)合后,才能與抑制劑結(jié)合。與抑制劑結(jié)合后的三元復(fù)合物不能形成產(chǎn)物。抑制劑結(jié)合后的三元復(fù)合物不能形成產(chǎn)物。特征特征a反應(yīng)式反應(yīng)式:b動(dòng)力學(xué)方面動(dòng)力學(xué)方面: VmaxVmax和和KmKm值值均均降低。降低。P373E+IEI 有
17、機(jī)磷化合物有機(jī)磷化合物 POOXOR1R2POOXR2R1或或 化學(xué)結(jié)構(gòu)通式化學(xué)結(jié)構(gòu)通式: R1、R2 : 烷基烷基 ; X: -F等等2.6 不可逆抑制不可逆抑制(irreversible inhibition)有機(jī)磷化合物有機(jī)磷化合物:與酶活直接相關(guān)的絲氨酸上的羥基牢固結(jié)合,與酶活直接相關(guān)的絲氨酸上的羥基牢固結(jié)合, 從而抑制某些蛋白酶及酯酶。從而抑制某些蛋白酶及酯酶。神經(jīng)毒氣神經(jīng)毒氣DFP 、有機(jī)磷殺蟲(chóng)劑、有機(jī)磷殺蟲(chóng)劑E-S H +COOHHgCl有機(jī)汞、有機(jī)砷化合物有機(jī)汞、有機(jī)砷化合物 與酶中的半胱氨酸殘基的巰基作用,抑制含巰基的酶與酶中的半胱氨酸殘基的巰基作用,抑制含巰基的酶COOHH
18、gSE+ HCl重金屬鹽重金屬鹽如含如含Ag+、Cu2+、Hg2+、Pb2+等金屬鹽能使大多數(shù)酶失活等金屬鹽能使大多數(shù)酶失活烷化試劑烷化試劑例例 ICH2COOH,ICH2CONH2等等 E-S H + I CH2COOHE-S-CH2COOH + HI 青霉素青霉素糖肽轉(zhuǎn)肽酶糖肽轉(zhuǎn)肽酶:在細(xì)菌細(xì):在細(xì)菌細(xì)胞壁合成中使肽聚糖胞壁合成中使肽聚糖鏈交聯(lián)。鏈交聯(lián)。與活性部位絲氨酸羥基與活性部位絲氨酸羥基共價(jià)結(jié)合,使酶失活,共價(jià)結(jié)合,使酶失活,影響肽聚糖鏈交聯(lián),影響肽聚糖鏈交聯(lián),導(dǎo)致細(xì)菌細(xì)胞壁合成導(dǎo)致細(xì)菌細(xì)胞壁合成受阻,細(xì)菌生長(zhǎng)被損受阻,細(xì)菌生長(zhǎng)被損害。害。第三部分第三部分環(huán)境因素對(duì)酶反應(yīng)的影響環(huán)境因素對(duì)酶反應(yīng)的影
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