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文檔簡介
1、劉夢晗劉夢晗 2015 2015年年1111月月6-106-10日日張家港市三陽泰農(nóng)業(yè)科技有限公司張家港市三陽泰農(nóng)業(yè)科技有限公司美國育種軟件美國育種軟件PRISMPRISM中國獨家代理中國獨家代理PRISMPRISM育種系統(tǒng)軟件培訓會育種系統(tǒng)軟件培訓會培訓會注意事項:培訓會注意事項: 保持桌面地面整潔、干凈、垃圾及時處理 開會第一天需貼好印有自己名字的不干膠 每天到會后就在名單上簽字并告知是否預(yù)訂午飯 開會第一天上午10點前安裝好試用版PRISM 培訓時不要交頭接耳、手機靜音,如有問題,先寫在紙上,稍后一并交流回答 討論時積極發(fā)言、開拓思路、踴躍思考、隨時準備回答問題 操作時,首先保證自己學會
2、且學正確的情況下再幫助他人培訓會時間安排培訓會時間安排日期時間安排培訓內(nèi)容8月17日之前自行安裝PRISM單機版到位,如有問題17日現(xiàn)場解決8月17日8:30-9:45報到,單機版安裝到位10:00-10:30PRISM 概述10:30-12:00PRISM EM13:30-14:45 PRISM Inventory15:00-17:30PRISM Nursery 18月18日8:30-9:45PRISM Nursery 210:00-12:00PRISM Yield Trial 113:30-14:45 PRISM Yield Trial 215:00-17:30PRISM Yield Tr
3、ial 3(Nursery vs. Yield Trial)8月19日8:30-9:45PRISM 高級批處理的應(yīng)用10:00-12:00PRISM Molecular Breeding13:30-14:45 精育精點平板使用及修改討論15:00-17:30PRISM第三方測試平臺工作流程討論流程管理的核心流程管理的核心 PRISM PRISM中部軟件公司成立于1996年,為植物育種和農(nóng)業(yè)科研提供專業(yè)軟件解決方案。在公司多年軟件開發(fā)和農(nóng)業(yè)領(lǐng)域科研經(jīng)驗的基礎(chǔ)上推出了旗艦產(chǎn)品:PRISM(Plant Research Information Sharing Manager,植物科研信息系統(tǒng))Pla
4、nt Research Information Sharing ManagerPRISM PRISM 概述概述- -在種業(yè)信息化平臺中的核心地位及優(yōu)勢在種業(yè)信息化平臺中的核心地位及優(yōu)勢PRISM PRISM 概述概述- -在種業(yè)信息化平臺中的核心地位及優(yōu)勢在種業(yè)信息化平臺中的核心地位及優(yōu)勢外引材料外引材料 、前育種、前育種、 群體材料、雜交種群體材料、雜交種大象有形大象有形T1T2T3C1C2C32個個測試階段測試階段測試點測試點4個個8個個15個個40個個90個個自交系培育(雜交作自交系培育(雜交作物)物)或群體選系(自交作或群體選系(自交作物)物)雜交種組配(雜交作物)雜交種組配(雜交作物
5、)或者選系材料測試(自交作物)或者選系材料測試(自交作物)性狀性狀QTL挖掘挖掘分子輔助分子輔助病蟲害鑒定病蟲害鑒定全基因組預(yù)測全基因組預(yù)測統(tǒng)計分析統(tǒng)計分析精確播種測產(chǎn)系統(tǒng)精確播種測產(chǎn)系統(tǒng)轉(zhuǎn)基因技術(shù)轉(zhuǎn)基因技術(shù)病蟲害鑒定病蟲害鑒定大象無形大象無形雙單倍體雙單倍體P R I S M育種信息系統(tǒng)育種信息系統(tǒng)PRISM育種軟件育種軟件人機合一,知行合一:人機合一,知行合一:PRISMPRISM不分模塊!不分模塊!PRISM PRISM 概述概述- -在種業(yè)信息化平臺中的核心地位及優(yōu)勢在種業(yè)信息化平臺中的核心地位及優(yōu)勢CSSI將最先進的計算機技術(shù),機械化、高效率和人性化的方案植入PRISM中,為谷物和蔬
6、菜類農(nóng)作物提供信息管理支持,包括玉米、大豆、高粱、棉花、油菜、花生、馬鈴薯、水稻、南瓜、干豆、向日葵、小麥、西紅柿、西瓜、南瓜和爆裂玉米等多種作物同步管理多種作物同步管理PRISM Database-XX作物作物PRISM PRISM 概述概述- -在種業(yè)信息化平臺中的核心地位及優(yōu)勢在種業(yè)信息化平臺中的核心地位及優(yōu)勢VPN客戶端客戶端育種家出差育種家出差VPN客戶端客戶端其他育種站登錄其他育種站登錄IntranetXX玉米研究所玉米研究所5個課題組每個小組個課題組每個小組2個授權(quán),可以同時登錄個授權(quán),可以同時登錄10位育位育種科研人員,兼容種科研人員,兼容15-25個登錄端口個登錄端口網(wǎng)絡(luò)服務(wù)
7、器層次構(gòu)架網(wǎng)絡(luò)服務(wù)器層次構(gòu)架 管理平臺容量和網(wǎng)絡(luò)安全性的問題管理平臺容量和網(wǎng)絡(luò)安全性的問題PRISM PRISM 概述概述- -在種業(yè)信息化平臺中的核心地位及優(yōu)勢在種業(yè)信息化平臺中的核心地位及優(yōu)勢高比例中文界面,全中文使用手冊高比例中文界面,全中文使用手冊保持英文保持英文/ /中文這種翻譯格式幫助我們理解中文這種翻譯格式幫助我們理解國外育種邏輯和術(shù)語,同時也是個校驗互補的過程國外育種邏輯和術(shù)語,同時也是個校驗互補的過程PRISM PRISM 概述概述- -在種業(yè)信息化平臺中的核心地位及優(yōu)勢在種業(yè)信息化平臺中的核心地位及優(yōu)勢PRISM 安裝:安裝:PRISM中國銷售版本:基于微軟中國銷售版本:基
8、于微軟SQL數(shù)據(jù)庫開數(shù)據(jù)庫開發(fā)發(fā)單機版:在本機上安裝單機版:在本機上安裝SQL express即可,然后即可,然后安裝安裝PRISM 軟件軟件網(wǎng)絡(luò)版:在服務(wù)器上安裝網(wǎng)絡(luò)版:在服務(wù)器上安裝SQL server,然后在,然后在各個電腦終端安裝各個電腦終端安裝PRISM軟件,鏈接軟件,鏈接IP地址地址PRISM PRISM 概述概述- -在種業(yè)信息化平臺中的核心地位及優(yōu)勢在種業(yè)信息化平臺中的核心地位及優(yōu)勢數(shù)據(jù)的后臺控制:數(shù)據(jù)的后臺控制:PRISM EMPRISM EM數(shù)據(jù)庫設(shè)置、公司屬性設(shè)置、育種項目、性數(shù)據(jù)庫設(shè)置、公司屬性設(shè)置、育種項目、性狀設(shè)置、統(tǒng)計分析、標簽設(shè)置、地圖區(qū)域、狀設(shè)置、統(tǒng)計分析、標
9、簽設(shè)置、地圖區(qū)域、用戶設(shè)定、角色權(quán)限設(shè)定和授權(quán)用戶設(shè)定、角色權(quán)限設(shè)定和授權(quán)PRISM PRISM 概述概述- -數(shù)據(jù)流邏輯性數(shù)據(jù)流邏輯性數(shù)據(jù)的前臺管理:數(shù)據(jù)的前臺管理:PRISMPRISM批處理本、種質(zhì)資源庫、育種圃、隔離區(qū)、批處理本、種質(zhì)資源庫、育種圃、隔離區(qū)、產(chǎn)量測試、系譜管理、本主目錄管理、條產(chǎn)量測試、系譜管理、本主目錄管理、條塊試驗和分子標記塊試驗和分子標記 一句話:用戶在一句話:用戶在PRISM中能看到什么數(shù)據(jù)中能看到什么數(shù)據(jù)都是由企業(yè)的管理員在都是由企業(yè)的管理員在PRISM EM中設(shè)置決定的。中設(shè)置決定的。Inventory(種質(zhì)資源庫清單,自交系、雜交種、育種中間材料)Entry
10、list Books育種材料田間播種清單1.觀測圃:病蟲害鑒定圃2.隔離區(qū)ISO隔離測配圃3.育種圃:群內(nèi)組配、選育自交系產(chǎn)量測試:選育雜交種育種田間本數(shù)據(jù)采集整理數(shù)據(jù)處理和分析系譜升級,材料和品種更新Nursery,育種圃,育種圃Yield Trial,產(chǎn)量測試,產(chǎn)量測試 邏輯性:育種信息化中的數(shù)據(jù)流向邏輯性:育種信息化中的數(shù)據(jù)流向春播秋收春播秋收PRISM PRISM 概述概述- -數(shù)據(jù)流邏輯性數(shù)據(jù)流邏輯性Inventory(種質(zhì)資源庫清單,自交系、雜交種、育種中間材料)Entrylist Books育種材料田間播種清單2.隔離區(qū)ISO隔離測配圃育種田間本數(shù)據(jù)采集整理系譜升級,材料和品種更
11、新Nursery,育種圃,育種圃3.育種圃:群內(nèi)組配、選育自交系 邏輯性:育種信息化中的數(shù)據(jù)流向邏輯性:育種信息化中的數(shù)據(jù)流向冬繁冬繁PRISM PRISM 概述概述- -數(shù)據(jù)流邏輯性數(shù)據(jù)流邏輯性InventoryMasterMarker ListBreeding Line List Marker Data Marker BookMarker Data Pedigree BookMarker Data Books選擇選擇Marker Data Grid Book分子輔助分子輔助育種結(jié)果育種結(jié)果Inventory春播春播冬繁冬繁秋收秋收 邏輯性:育種信息化中的數(shù)據(jù)流向邏輯性:育種信息化中的數(shù)據(jù)流
12、向分子輔助育種分子輔助育種PRISM PRISM 概述概述- -數(shù)據(jù)流邏輯性數(shù)據(jù)流邏輯性 邏輯性:育種信息化中的數(shù)據(jù)流向邏輯性:育種信息化中的數(shù)據(jù)流向轉(zhuǎn)基因轉(zhuǎn)基因Inventory導入片段T0 Lab 篩選InventotyT1命名 GS1NurseryNurseryInventotyT2命名 GS2InventotyT3命名 GS3NurseryT1T2T3C1C2C32個個測試階段測試階段測試點測試點4個個8個個15個個40個個90個個傳統(tǒng)大田育種流程傳統(tǒng)大田育種流程與流行品種的副/母本回交后,田釋放測試YT評定后確定正式片段NurseryTC3階段秋收后開始階段秋收后開始轉(zhuǎn)基因片段回交介
13、入轉(zhuǎn)基因片段回交介入走春播,秋收,冬繁的程走春播,秋收,冬繁的程序序PRISM PRISM 概述概述- -數(shù)據(jù)流邏輯性數(shù)據(jù)流邏輯性PRISM EM-PRISMPRISM EM-PRISM用戶管理用戶管理PRISM EM-PRISMPRISM EM-PRISM用戶管理用戶管理 規(guī)則規(guī)則1: 統(tǒng)一的命名系統(tǒng)統(tǒng)一的命名系統(tǒng) 規(guī)則規(guī)則2:規(guī)范的系譜管理:規(guī)范的系譜管理 規(guī)則規(guī)則3:性狀命名系統(tǒng):性狀命名系統(tǒng) 規(guī)則規(guī)則4:權(quán)限設(shè)置:權(quán)限設(shè)置 規(guī)則規(guī)則1: 統(tǒng)一的命名系統(tǒng)統(tǒng)一的命名系統(tǒng)基礎(chǔ)三要素的命名:基礎(chǔ)三要素的命名:時間(時間(Season):):14春;春; 14冬冬項目組(項目組(Project)
14、:):NO;SO地點(地點(Location):):HNXX001,HNZZ001,BJTZ001提高分辨性的要素:提高分辨性的要素:材料(材料(Material):):HYB,IBD,SegPop世代(世代(Generation):):F1-F6, S0-S5,DH1,T0性狀管理的命名:性狀管理的命名:各種被測性狀的縮寫編碼:雄穗最高位側(cè)枝以上的主軸長度(太太太長)各種被測性狀的縮寫編碼:雄穗最高位側(cè)枝以上的主軸長度(太太太長)分子標記數(shù)據(jù)的編碼:分子標記數(shù)據(jù)的編碼:SNP001, Bar008試驗名稱:試驗名稱:13冬冬BJSYIBD001:13年冬季北京實驗站三亞冬繁自交系選系年冬季北
15、京實驗站三亞冬繁自交系選系001試驗試驗PRISM EM-PRISMPRISM EM-PRISM用戶管理用戶管理 規(guī)則規(guī)則2:規(guī)范的系譜管理:規(guī)范的系譜管理大田育種系譜升級規(guī)則:大田育種系譜升級規(guī)則:何時混選,何時拉穗行,多少穗,父本來源何時混選,何時拉穗行,多少穗,父本來源雙單倍體系譜升級規(guī)則:雙單倍體系譜升級規(guī)則:單倍體系譜;雙單倍體系譜單倍體系譜;雙單倍體系譜轉(zhuǎn)基因材料系譜升級規(guī)則:轉(zhuǎn)基因材料系譜升級規(guī)則:轉(zhuǎn)基因轉(zhuǎn)基因T0開始的系譜;轉(zhuǎn)基因材料隔離區(qū);開始的系譜;轉(zhuǎn)基因材料隔離區(qū);其他:不育系等其他:不育系等 在確定系譜升級方案之前,需要聯(lián)系我們詳細溝通授粉手段和育種目的,最后確立定制化
16、的系譜升級引擎。PRISM為美國知名水稻公司提供量身定做的授粉方案和系譜升級引擎系統(tǒng)。例如:三系/兩系配套的授粉方式、Full-sib selection、Half-sib selection、Poly-pollination、Open PollinationPRISM EM-PRISMPRISM EM-PRISM用戶管理用戶管理 規(guī)則規(guī)則2:規(guī)范的系譜管理:規(guī)范的系譜管理以玉米回交選育為例:以玉米回交選育為例:1.標準標準F1開始組建群體(開始組建群體(A和和B兩個親本),兩個親本),F(xiàn)1代混種,然后每代自交選系代混種,然后每代自交選系2.標準標準F1開始組建群體(開始組建群體(A和和B 兩
17、個親本),兩個親本),F(xiàn)1代選系,然后每代自交選系代選系,然后每代自交選系3.回交輪回選育,回交過程中沒有自交:回交輪回選育,回交過程中沒有自交:BC1-BC34.回交輪回選育,回交過程中有一定的自交:回交輪回選育,回交過程中有一定的自交:BC1F1,5.回交輪回選育,回交過程中有交替的自交選系過程回交輪回選育,回交過程中有交替的自交選系過程6.回交輪回選育(回交輪回選育(A和和B兩個親本),后加入兩個親本),后加入C第三個親本進行選育第三個親本進行選育PRISM EM-PRISMPRISM EM-PRISM用戶管理用戶管理PRISM EM-PRISMPRISM EM-PRISM用戶管理用戶管
18、理 規(guī)則規(guī)則3:性狀命名系統(tǒng):性狀命名系統(tǒng)資深科研總監(jiān)科研總監(jiān) 資深育種家育種家資深科研助理科研助理技術(shù)員操作工,授粉工人二維保密系統(tǒng):區(qū)域結(jié)構(gòu)和上下級結(jié)構(gòu)二維保密系統(tǒng):區(qū)域結(jié)構(gòu)和上下級結(jié)構(gòu)PRISM EM-PRISMPRISM EM-PRISM用戶管理用戶管理 規(guī)則規(guī)則4:權(quán)限設(shè)置:權(quán)限設(shè)置上下級結(jié)構(gòu)上下級結(jié)構(gòu)PRISM EM-PRISMPRISM EM-PRISM用戶管理用戶管理數(shù)據(jù)共享和分級保密的博弈和平衡數(shù)據(jù)共享和分級保密的博弈和平衡總部服務(wù)器總部服務(wù)器 管理平臺容量和網(wǎng)絡(luò)安全性的問題管理平臺容量和網(wǎng)絡(luò)安全性的問題數(shù)據(jù)共享和分級保密的博弈和平衡數(shù)據(jù)共享和分級保密的博弈和平衡科研構(gòu)架的權(quán)
19、限設(shè)置:從上而下權(quán)限逐漸縮?。芊窬庉嬒底V,查看系譜,更改田間本,記錄田間數(shù)據(jù)等) 數(shù)據(jù)共享和分級保密的博弈和平衡數(shù)據(jù)共享和分級保密的博弈和平衡共享和非共享數(shù)據(jù)的界定共享和非共享數(shù)據(jù)的界定1.共享:株高,穗位,排號,行號,授粉要求等共享:株高,穗位,排號,行號,授粉要求等2.非共享:產(chǎn)量,抗病性鑒定結(jié)果,系譜,非共享:產(chǎn)量,抗病性鑒定結(jié)果,系譜,QTL 位點等位點等PRISM-Inventory(PRISM-Inventory(種質(zhì)資源庫)種質(zhì)資源庫) 種質(zhì)資源庫的實現(xiàn)種質(zhì)資源庫的實現(xiàn) 硬件:高效運轉(zhuǎn)的貨柜系統(tǒng),冷庫調(diào)節(jié)系統(tǒng) 軟件:庫管ERP軟件+物流軟件+育種管理軟件1.種子名稱2.來源系譜
20、(自交系,雜交種,中間材料,雙單倍體等)3.分群4.試驗地點5.庫存地點,數(shù)量6.分子標記數(shù)據(jù)PRISM-Inventory(PRISM-Inventory(種質(zhì)資源庫)種質(zhì)資源庫)季節(jié)季節(jié)世代世代Inventory(種質(zhì)資源庫)(種質(zhì)資源庫)Nursery(育種圃)(育種圃)Yield Trial(產(chǎn)量測試)(產(chǎn)量測試)2014春春S8Chang72,PH0RA半雙列雜交,系譜升級2014冬冬F(xiàn)1Chang72/PH0RA自交混收,系譜升級2015春春F2Chang72/PH0RA-B自交收穗行2015冬冬S2Chang72/PH0RA-B-08IPT 2個測配種PH6WC/Zhen58,同
21、時自交選系收穗行ISO隔離區(qū)1個測配種PH6WC,同時育種圃自交收穗行2016春春S3,HYBChang72/PH0RA-B-08-3PH6WC/Chang72/PH0RA-B-08Zhen58/Chang72/PH0RA-B-08Chang72/PH0RA-B-08-1/PH6WC育種圃自交,對照產(chǎn)量測試結(jié)果,在育種圃中挑出系譜后代產(chǎn)量測試TC1,決選2016冬冬S4Chang72/PH0RA-B-08-3-1/2/3ISO隔離區(qū)1個測配種PH6WC,同時育種圃自交收穗行2017春春S5, HYBChang72/PH0RA-B-08-3-1-2Chang72/PH0RA-B-08-3-1/P
22、H6WCChang72/PH0RA-B-08-3-2/PH6WCChang72/PH0RA-B-08-3-3/PH6WC育種圃自交,對照產(chǎn)量測試結(jié)果,在育種圃中挑出系譜后代產(chǎn)量測試TC2,決選2017冬冬S6CH0RA(New Inbred)新自交系擴繁,ISO隔離區(qū)或復(fù)配2018春春S7,HYBCH0RA/Zhen68新自交系擴繁產(chǎn)量測試R12018冬冬S8CH0RA(New Inbred)新自交系擴繁,ISO隔離區(qū)或復(fù)配2019春春S9,HYBCH0RA/Zhen68新自交系擴繁產(chǎn)量測試R2PRISM-Inventory(PRISM-Inventory(種質(zhì)資源庫)種質(zhì)資源庫)Invent
23、ory的種類:自交系、雙單倍體、中間選系材料、雜交種的種類:自交系、雙單倍體、中間選系材料、雜交種Inventory細分的標準:細分的標準: 自交系:雜種優(yōu)勢群、熟期、抗性自交系:雜種優(yōu)勢群、熟期、抗性 雜交種:測配種、熟期、種子數(shù)量(測試點數(shù))雜交種:測配種、熟期、種子數(shù)量(測試點數(shù))熟期的計算熟期的計算: PRISM提供提供RM(相對熟期計算模塊),快速對種質(zhì)資(相對熟期計算模塊),快速對種質(zhì)資源進行歸類,品種定位源進行歸類,品種定位 PRISM-Inventory(PRISM-Inventory(種質(zhì)資源庫)種質(zhì)資源庫)Inventory入庫流程、標簽打印、信息采集入庫流程、標簽打印、信
24、息采集PRISM 育種圃系譜升級自動產(chǎn)生系譜育種圃系譜升級自動產(chǎn)生系譜PRISM 育種圃收獲穗數(shù)記錄、性狀記錄(自交系)育種圃收獲穗數(shù)記錄、性狀記錄(自交系)外部外部Excel系譜直接導入系譜直接導入PRISMPRISM Inventory中數(shù)據(jù)產(chǎn)生中數(shù)據(jù)產(chǎn)生PedId,RecId種子袋打印標簽、收獲種子裝袋種子袋打印標簽、收獲種子裝袋種子袋掃碼、種子入庫軟件記錄存放位置、數(shù)粒機記錄收獲數(shù)量種子袋掃碼、種子入庫軟件記錄存放位置、數(shù)粒機記錄收獲數(shù)量PRISM-Inventory(PRISM-Inventory(種質(zhì)資源庫)種質(zhì)資源庫)Inventory入庫流程、標簽打印、信息采集入庫流程、標簽打
25、印、信息采集掃碼槍掃碼槍稱重儀稱重儀Record updated數(shù)粒儀數(shù)粒儀PRISM-Inventory(PRISM-Inventory(種質(zhì)資源庫)種質(zhì)資源庫)Inventory入庫流程、標簽打印、信息采集入庫流程、標簽打印、信息采集PRISM-Inventory(PRISM-Inventory(種質(zhì)資源庫)種質(zhì)資源庫)Inventory入庫流程、標簽打印、信息采集入庫流程、標簽打印、信息采集PRISM-Inventory(PRISM-Inventory(種質(zhì)資源庫)種質(zhì)資源庫)Inventory入庫流程、標簽打印、信息采集入庫流程、標簽打印、信息采集材料目的不同,Inventory保存信
26、息不同:自交系信息:熟期、雜種優(yōu)勢群、開花信息、穗信息、照片等雜交種信息:熟期、種子數(shù)量等10000個雜交個雜交種材料測試種材料測試NSS 6000個個SS 4000個個測配種測配種A-3000個個測配種測配種B-3000個個測配種測配種C-2000個個測配種測配種D-2000個個熟期熟期1 1000個個熟期熟期2 1000個個熟期熟期3 1000個個熟期熟期1 1000個個熟期熟期2 1000個個熟期熟期3 1000個個熟期熟期1 1000個個熟期熟期2 1000個個熟期熟期1 1000個個熟期熟期2 1000個個血緣系譜血緣系譜1 250個個血緣系譜血緣系譜2 250個個血緣系譜血緣系譜3
27、 250個個血緣系譜血緣系譜4 250個個最終產(chǎn)生大概最終產(chǎn)生大概40個個初級試驗,每個實初級試驗,每個實驗容量為驗容量為250個左右個左右PRISM-Inventory(PRISM-Inventory(種質(zhì)資源庫)種質(zhì)資源庫)PRISM-Inventory(PRISM-Inventory(種質(zhì)資源庫)種質(zhì)資源庫)PRISM-NurseryPRISM-Nursery(育種圃)(育種圃) 育種圃的數(shù)據(jù)流向育種圃的數(shù)據(jù)流向工作計劃分層逐級完成:項目/實驗站分地塊、溫室,面積大小 育種目標決定試驗個數(shù)和種類 目標決定種子數(shù)量(每行棵數(shù)) 根據(jù)授粉習慣合理安排種植位置PRISM的授粉規(guī)則:提供FMMF
28、,F(xiàn)MF等多種授粉方案(測配,雜交作物)提供ISO(隔離區(qū))授粉方案(雜交作物)提供小區(qū)內(nèi)雜交,隨機雜交方案(小組合材料,自交作物)PRISM-NurseryPRISM-Nursery(育種圃)(育種圃) 育種圃的實現(xiàn)育種圃的實現(xiàn)育種圃工作流程育種圃工作流程PRISM-NurseryPRISM-Nursery(育種圃)(育種圃)Inventory導入數(shù)據(jù)到導入數(shù)據(jù)到Entry List育種圃目標計劃:選系、擴繁、隔離區(qū)、復(fù)配、育種圃目標計劃:選系、擴繁、隔離區(qū)、復(fù)配、IPTEntry List中確定父母本,拷貝數(shù)中確定父母本,拷貝數(shù)Entry List中設(shè)定授粉計劃、行為單位還是株為單位中設(shè)定
29、授粉計劃、行為單位還是株為單位創(chuàng)建育種圃創(chuàng)建育種圃Field Book,將授粉計劃導入,將授粉計劃導入授粉計劃給工人做授粉記錄,完成后將記錄導入授粉計劃給工人做授粉記錄,完成后將記錄導入Field Book根據(jù)實際收獲穗數(shù),收獲方法,完成系譜升級,重新導入根據(jù)實際收獲穗數(shù),收獲方法,完成系譜升級,重新導入Inventory中中各類授粉方案各類授粉方案以行為單位的授粉方案以行為單位的授粉方案: 測配種進行測配測配種進行測配PRISM-NurseryPRISM-Nursery(育種圃)(育種圃)各類授粉方案各類授粉方案以行為單位的授粉方案以行為單位的授粉方案: 隔離區(qū)(雜交作物)隔離區(qū)(雜交作物)
30、PRISM-NurseryPRISM-Nursery(育種圃)(育種圃)各類授粉方案(雜交各類授粉方案(雜交/自交作物)自交作物)以株為單位的授粉方案以株為單位的授粉方案: 小材料雙列雜交小材料雙列雜交PRISM-NurseryPRISM-Nursery(育種圃)(育種圃)各類授粉方案各類授粉方案以株為單位的授粉方案以株為單位的授粉方案: 小材料隨機雜交組合小材料隨機雜交組合PRISM-NurseryPRISM-Nursery(育種圃)(育種圃)系譜升級方案系譜升級方案花粉來源,授粉方案,選穗個數(shù),穗行or Bulk。做好選擇后,直接轉(zhuǎn)入下一季的種子庫清單中。PRISM-NurseryPRIS
31、M-Nursery(育種圃)(育種圃)多年系譜追溯,多年多點試驗跟蹤多年系譜追溯,多年多點試驗跟蹤PRISM-NurseryPRISM-Nursery(育種圃)(育種圃)多年系譜追溯,多年多點試驗跟蹤多年系譜追溯,多年多點試驗跟蹤PRISM-NurseryPRISM-Nursery(育種圃)(育種圃)PRISM-NurseryPRISM-Nursery(育種圃)(育種圃)PRISM-NurseryPRISM-Nursery(育種圃)(育種圃)PRISM-NurseryPRISM-Nursery(育種圃)(育種圃)PRISM-NurseryPRISM-Nursery(育種圃)(育種圃)產(chǎn)量測試工
32、作流程和任務(wù) 數(shù)據(jù)交流順暢 在不同測試階段使用有效的試驗設(shè)計 精確控制小區(qū)和地塊 與播種、測產(chǎn)、數(shù)據(jù)采集設(shè)備結(jié)合提高工作效率 數(shù)據(jù)分析結(jié)果專業(yè)權(quán)威 產(chǎn)量測試的實現(xiàn)產(chǎn)量測試的實現(xiàn)PRISM-Yield TrialPRISM-Yield Trial(產(chǎn)量測試)(產(chǎn)量測試)時間時間(東北為例)(東北為例)工作流程工作流程任務(wù)任務(wù)信息化管理的好處信息化管理的好處2014年11-12月確定地塊看地、選地、測量地塊周年循環(huán)式利用周年循環(huán)式利用/ /淘汰測試點淘汰測試點2014年1-3月調(diào)整地塊根據(jù)公司要求和實際地形劃分地塊精確劃分小區(qū),封閉小區(qū)精確劃分小區(qū),封閉小區(qū)2014年4-5月接收種子,微調(diào)地塊整理
33、種子,龍擺尾種植,調(diào)整種植位置二維方向排種,人工機播精確二維方向排種,人工機播精確度高,同時可以做空間分析度高,同時可以做空間分析(龍擺尾不能)(龍擺尾不能)2014年6月苗期管理采集整理苗期數(shù)據(jù)信息化管理數(shù)據(jù)采集整理,實信息化管理數(shù)據(jù)采集整理,實時控制進度時控制進度2014年7月-8月花期管理采集整理花期數(shù)據(jù)2014年9月成熟期管理采集整理熟期數(shù)據(jù)201410月收獲管理采集整理收獲數(shù)據(jù)分析數(shù)據(jù),品種比較,跨年比分析數(shù)據(jù),品種比較,跨年比較,品種定位,測試點篩選較,品種定位,測試點篩選產(chǎn)量測試工作流程和任務(wù)PRISM-Yield TrialPRISM-Yield Trial(產(chǎn)量測試)(產(chǎn)量測
34、試)PRISM育種軟件育種軟件資深科研總監(jiān)科研總監(jiān) 資深育種家育種家資深科研助理科研助理技術(shù)員操作工,授粉工人數(shù)據(jù)交流順暢實時多地多點的數(shù)據(jù)匯總PRISM-Yield TrialPRISM-Yield Trial(產(chǎn)量測試)(產(chǎn)量測試)PRISM-Yield TrialPRISM-Yield Trial(產(chǎn)量測試)(產(chǎn)量測試) 產(chǎn)量測試的數(shù)據(jù)流向產(chǎn)量測試的數(shù)據(jù)流向產(chǎn)量測試工作流程產(chǎn)量測試工作流程PRISM-Yield TrialPRISM-Yield Trial(產(chǎn)量測試)(產(chǎn)量測試)初級試驗:根據(jù)初級試驗:根據(jù)HYB熟期、測配熟期、測配種、種子數(shù)量分為若干個小試驗種、種子數(shù)量分為若干個小試驗
35、確定試驗階段:初級還是高級確定試驗階段:初級還是高級高級試驗:根據(jù)綠色通道、審定高級試驗:根據(jù)綠色通道、審定要求分為幾個試驗組別要求分為幾個試驗組別根據(jù)試驗內(nèi)品種數(shù)量選擇合適的設(shè)計方法,和重復(fù)數(shù)量根據(jù)試驗內(nèi)品種數(shù)量選擇合適的設(shè)計方法,和重復(fù)數(shù)量創(chuàng)建測試創(chuàng)建測試Field Book,使用,使用worksheet將試驗放入測試點中將試驗放入測試點中在在Field Book中放置田間定植圖:中放置田間定植圖:Field Map在不同生長階段采集數(shù)據(jù),并上傳到系統(tǒng)中在不同生長階段采集數(shù)據(jù),并上傳到系統(tǒng)中初級試驗,統(tǒng)計分析后,雜交種品種定位,比對初級試驗,統(tǒng)計分析后,雜交種品種定位,比對Nursery結(jié)
36、果,使結(jié)果,使用用Decision Maker導入下一季導入下一季Nursery中,復(fù)配,進入下一年中,復(fù)配,進入下一年YT測試測試試驗階段試驗階段設(shè)計類型設(shè)計類型 容量容量 優(yōu)點優(yōu)點 缺點缺點 間比法間比法 大 簡單,排地不容易出錯 誤差有偏性,理論上不能應(yīng)用統(tǒng)計分析進行顯著性測驗,差異大小決定是否選擇品種 初級試驗初級試驗Generalized Lattice/Alpha Lattice100-300 用地節(jié)省,測試量大,精度高需要專業(yè)軟件設(shè)計處理數(shù)據(jù) 初級試驗初級試驗Modified Augmented Design (MAD) 100-300 用地節(jié)省,測試量大,精度高,對照排布靈活需
37、要專業(yè)軟件設(shè)計處理數(shù)據(jù)對照用量大高級試驗高級試驗Randomize Complete Block 30設(shè)計簡單,單因素多因素及綜合性試驗均可,對地形要求不嚴格,有效降低誤差 不允許處理太多 高級試驗高級試驗Lattice/Squared Lattice4-8精確度高 缺乏伸縮性,處理少 高級試驗高級試驗split-plot F (Entry)PrF (Rep)CommentsTrack Back10.57940.5493Entry 沒區(qū)別?放對區(qū)域了嗎?20.03540.1099OK30.16820.2332Entry 沒區(qū)別?放對區(qū)域了嗎?40.00080.2047OK50.08190.42
38、44OK60.00000.7020OK70.00740.2140OK80.00000.1217OK90.26710.0038?地力,地形問題,數(shù)據(jù)采集?是否繼續(xù)使用此地塊100.00120.5802OK110.24640.9822Entry 沒區(qū)別?放對區(qū)域了嗎?120.18330.0276?地力,地形問題,數(shù)據(jù)采集?是否繼續(xù)使用此地塊130.00370.0172OK140.01280.4883OK數(shù)據(jù)分析結(jié)果專業(yè)權(quán)威PRISM-Yield TrialPRISM-Yield Trial(產(chǎn)量測試)(產(chǎn)量測試)多點分析(across location之間的分析):了解每個Entry在各個點上的具
39、體表現(xiàn)差異,對品種區(qū)域定位分析,了解每個Entry在多年間表現(xiàn)的穩(wěn)定性大品種大品種 vs.小品種小品種穩(wěn)定穩(wěn)定vs.不穩(wěn)定不穩(wěn)定數(shù)據(jù)分析結(jié)果專業(yè)權(quán)威PRISM-Yield TrialPRISM-Yield Trial(產(chǎn)量測試)(產(chǎn)量測試)1.NNA EW2.NNA EW + Border3.Lattice4.MAD Type I5.MAD Type II注意:部分調(diào)整方法和初始試驗設(shè)計模型注意:部分調(diào)整方法和初始試驗設(shè)計模型有關(guān),調(diào)整前后差別可能存在有關(guān),調(diào)整前后差別可能存在具體參見:具體參見:Chapter 11統(tǒng)計分析中的介紹統(tǒng)計分析中的介紹Entry #Source ID YIELD
40、Rk1YIELD Adj Rk DiffYIELD Rk(after adjustment)1SYT069 1012SYT070 6173SYT088 2244SYT105 12-395SYT1064156SYT230 11-387SYT231 14-1138SYT234 16-1159SYT297 1511610SYT363 30311SYT364 1001012SYT365 5-3213SYT403 13114Check, 14XY335 7512Check, 15ZD909 8-26Check, 16ZD958 9211數(shù)據(jù)分析結(jié)果專業(yè)權(quán)威PRISM-Yield TrialPRISM-Y
41、ield Trial(產(chǎn)量測試)(產(chǎn)量測試)數(shù)據(jù)分析結(jié)果專業(yè)權(quán)威PRISM-Yield TrialPRISM-Yield Trial(產(chǎn)量測試)(產(chǎn)量測試)PRISM-Yield TrialPRISM-Yield Trial(產(chǎn)量測試)(產(chǎn)量測試)PRISM-Yield TrialPRISM-Yield Trial(產(chǎn)量測試)(產(chǎn)量測試)育種的決選過程需要將育種的決選過程需要將YT測試結(jié)果和育種圃一一對應(yīng)起來測試結(jié)果和育種圃一一對應(yīng)起來決選結(jié)果顯示如下:決選結(jié)果顯示如下:PRISM-Yield Trial(Nursery VS. Yield Trial)PRISM-Yield Trial(Nu
42、rsery VS. Yield Trial)育種的決選過程需要將育種的決選過程需要將YT測試結(jié)果和育種圃一一對應(yīng)起來測試結(jié)果和育種圃一一對應(yīng)起來決選結(jié)果確定后,在決選結(jié)果確定后,在Yield Trial Entry List中顯示如下:中顯示如下:PRISM-Yield Trial(Nursery VS. Yield Trial)PRISM-Yield Trial(Nursery VS. Yield Trial)育種的決選過程需要將育種的決選過程需要將YT測試結(jié)果和育種圃一一對應(yīng)起來測試結(jié)果和育種圃一一對應(yīng)起來在同步的育種圃中找到選中的系譜并升級加代在同步的育種圃中找到選中的系譜并升級加代PR
43、ISM-Yield Trial(Nursery VS. Yield Trial)PRISM-Yield Trial(Nursery VS. Yield Trial)育種的決選過程需要將育種的決選過程需要將YT測試結(jié)果和育種圃一一對應(yīng)起來測試結(jié)果和育種圃一一對應(yīng)起來在同步的育種圃中找到選中的系譜并升級加代在同步的育種圃中找到選中的系譜并升級加代PRISM-Yield Trial(Nursery VS. Yield Trial)PRISM-Yield Trial(Nursery VS. Yield Trial)PRISM-PRISM-高級批處理的應(yīng)用高級批處理的應(yīng)用首先要有育種的全局觀,然后才能進行高級的批處理應(yīng)用首先要有育種的全局觀,然后才能進行高級的批處理應(yīng)用全局觀是育種所有相關(guān)事務(wù)的整體把握和控制:1.育種材料:數(shù)量、世代和特性2.育種圃的規(guī)劃:世代遞進、授粉計劃(隔離/IPT/自交/回交)、數(shù)量、地塊分布等3.產(chǎn)量測試的規(guī)劃:時間進度、工作協(xié)調(diào)、測試材料世代、測試材料數(shù)量、實驗設(shè)計和地塊準確大小全局數(shù)據(jù)到位后可以產(chǎn)生:Book Creation Books,一次同步產(chǎn)生多個:Inventory、Nursery EL、Nursery FB、Yield Trial EL、Yield Tr
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