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文檔簡介
1、二、 trp衰減子的作用機制(一)trp mRNA的前導序列的結構(圖823)(二)衰減子的作用機制1,trp mRNA前導序列的二級結構(圖824)2, trp mRNA前導序列轉錄與翻譯的時空關系13,Trp對衰減子作用的影響(圖825)(1)Trp存在時(圖825,a)(2)Trp(或Arg)饑餓時(圖825,b)(3)其他Aa(如Gly)饑餓時(圖825,c)4,Trp衰減子模型的實驗證據2三、衰減子的普遍性及其生物學意義1,普遍性(1)結構共性(2)作用機制共性2,衰減子的作用機制可被看作是一種可阻遏的正調控33,衰減子調控的生物學意義(1)調控更為靈敏(2)對代謝產物的反應更為直接
2、(3)調控更為精細4四、負責核苷酸合成的基因的衰減子(一)天門冬氨酸轉氨甲酰酶操縱元(pyr BI操縱元)前導序列結構(二)pyr BI操縱元衰減子作用的機制(圖826)1, UTP含量較低時2,UTP充足時5第七節(jié) 翻譯水平的調控一、反義RNA的調控作用(一)micRNA (mRNA -interfering complementary RNA)及其作用位點1,micRNA2,micRNA的作用位點63,反義RNA的作用方式(1)與mRNA的核糖體結合位點結合,使翻譯不能起始(2)與mRNA結合形成雙鏈結構,成為核酸內切酶的底物,從而使mRNA不穩(wěn)定(3)與轉錄物結合,使轉錄提前終止7(二)
3、大腸桿菌外膜蛋白基因表達中micRNA的作用1,滲透壓對ompC,ompF基因表達的影響2,micF RNA對ompF基因表達的調控8(三)噬菌體C蛋白對晚期基因表達調控的機制1,PaQ及其轉錄產物2,PaQ對Q基因表達的調控(1)抑制Q基因mRNA的翻譯(2)由于PaQ的轉錄活性很高,可以抑制PR的轉錄,使Q基因的mRNA轉錄減少(3) PaQ的作用的證據9(四)反義RNA的應用1,研究應用2,臨床應用10二、mRNA二級結構對基因表達的影響(一) mRNA二級結構對自身翻譯的影響1,單鏈噬菌體MS2家族噬菌體基因的表達產物(圖8-29)11(1) A基因:編碼附著蛋白(2)CP基因:編碼衣
4、殼蛋白(3) rep基因:編碼復制酶(4)溶菌基因:裂解蛋白122,R17噬菌體mRNA二級結構對翻譯的影響(1) R17正鏈RNA的特點(2)基因的翻譯的過程13(3) R17正鏈RNA復制過程中的二級結構對翻譯的影響A,R17正鏈RNA的復制B, R17正鏈RNA的復制時A基因的翻譯(圖8-30)14(二) mRNA二級結構對自身壽命的影響1,影響mRNA降解速度的因素(1)mRNA降解不是內切酶隨機切割的結果(2)核糖體對mRNA壽命無重要影響(3)mRNA末端二級結構的作用152,mRNA中二級結構對int基因壽命的影響(1)溶菌周期的int基因表達產物N蛋白的作用使RNA聚合酶轉錄出
5、含int基因的產物L2L2轉錄產物的結構(圖8-31)sib位點返回調控16(2)溶原周期的int基因表達(3)從溶原生長向溶菌生長轉變時int基因的表達173,S12-引發(fā)酶-亞基操縱元mRNA二級結構對基因壽命的影響(圖8-18)(1) S12-引發(fā)酶-亞基操縱元結構(P304)轉錄產物的降解:先由RNA內切酶在引發(fā)酶和亞基之間切斷,然后由外切酶從3末端發(fā)生降解18(2)引發(fā)酶部分mRNA的降解降解最快(3) S21基因和亞基編碼區(qū)的mRNA的降解均有發(fā)夾結構,較穩(wěn)定S21基因的mRNA還具衰減子結構,更為穩(wěn)定19三、蛋白質合成的自體調控控制自身mRNA的可翻譯性的蛋白質:多數為核酸結合蛋
6、白質,或是與核酸相互作用的蛋白質201, RF2對自身mRNA翻譯的控制(1)RF2 mRNA結構編碼340個Aa有兩個ORF:ORF0(編碼25個Aa,終止密碼UGA)和ORF1(編碼315個Aa,終止密碼UAA)21(2)RF2mRNA的翻譯RF2充足時:核糖體翻譯完ORF1在UGA處肽鏈合成終止RF2缺乏時:核糖體到達UGA時不能釋放,發(fā)生一個堿基的移框,繼續(xù)合成下游的315個Aa。RF1促進核糖體在UAA的釋放22(3)移框窗口必需保留15個核苷酸,才能保證30%以上的移框效率窗口內部SD序列對移框有重要作用232,核糖體蛋白質合成的自體調控(1) E coli基因表達機構的蛋白質及其
7、基因的操縱元A,蛋白質種類有70余種:核糖體蛋白質(50多種),輔助蛋白質,RNA聚合酶的亞基和輔因子B,操縱元數目:六個24C,操縱元中不同基因表達的差異性核糖體蛋白質:絕大多數一個核糖體一個(L7L12有4個)EFTu:每個細胞中是核糖體數的10倍RNA聚合酶的亞基:比核糖體少25(2)核糖體蛋白質合成的自體調控A,有自體調控作用的核糖體蛋白的特點在核糖體中直接與rRNA結合能與rRNA的結合(親和力較高),也可與mRNA結合(親和力較低),兩種結合序列有很大的同源性,并有相似的二級結構26B,核糖體蛋白質合成的自體調控作用(圖833)當細胞中有游離rRNA時,與rRNA結合,參與核糖體裝
8、配當細胞中無游離rRNA時,與mRNA結合(位點包含或靠近S-D序列),影響蛋白質的翻譯,實現自體負調控27C,同一個操縱元中不同基因的表達調控無獨立的S-D序列的基因:連在一起,受共同的調控蛋白控制有獨立的S-D序列的基因:不受調控蛋白控制28例子:L11操縱元中,L1基因的mRNA無S-D序列, 與L11基因連在一起,兩者的翻譯均受L1蛋白質的負調控29四、嚴謹反應(一)嚴謹反應1,定義細菌對不良的營養(yǎng)條件所產生的一系列反應2,生理變化RNA、核苷酸、碳水化合物、脂類合成速度下降;蛋白質降解速度加快;30(二)嚴謹反應的觸發(fā)器及報警信號1,觸發(fā)器位于核糖體A位無活性的氨?;?tRNA(可由
9、氨基酸缺乏或氨?;?tRNA合成酶的失活引起)312,報警信號空轉反應:無負載的氨?;?tRNA造成GTP消耗的同時不合成新的肽鍵空轉反應的后果:發(fā)出報警信號 PPGPP (魔斑I ), PPPGPP魔斑32其他報警信號:APPPPA,在原核細胞tRNA缺乏或真核細胞復制停頓時產生333,嚴謹反應相關的基因relA基因:編碼嚴謹因子L11:核糖體50S亞基組分tRNA 的TC環(huán)4,報警信號的作用機制不詳34第八節(jié) DNA序列重排對基因轉錄的調控一、沙門氏菌的相(phase)1,細菌的相與鞭毛蛋白的關系I相:H1基因編碼H1型鞭毛蛋白,細菌處于I相II相:H2基因編碼H2型鞭毛蛋白,細菌處于II
10、相352,相變細菌分裂時,以1/1000的頻率產生另一相的后代二、決定沙門氏菌相的因素1,H1,H2基因的位置位于染色體的不同區(qū)域362,H2rh1轉錄單元的作用(圖836)(1)H2rh1轉錄單元H2基因與rh1基因緊密連鎖(2)rh1基因產物H1基因的阻遏蛋白(3)H2rh1轉錄單元的表達對相的影響細菌處于II相,H1基因表達被阻遏373, H2rh1轉錄單元的表達調控(圖837)(1) 995bp的可倒位序列位于H2rh1轉錄單元的上游兩端有14個堿基的倒轉重復序列末端有啟動子38(2) hin基因產物的功能催化995bpDNA的倒位,當啟動子朝向H2基因時, H2rh1轉錄單元表達39三、相變的生物學意義逃脫寄主的免疫攻擊40第九章 真核生物基因表達的調控41第一節(jié)概述一、真核生物基因調控的特點1,基因及染色體DNA的特點基因數目多,多數基因有內元DNA非編碼序列占基因組的90%以上DNA和多種成分組成染色體結構422,真核生物基因表達有多層次的調控(1)DNA水平的調控基因拷貝數改變和基因重排(2)轉錄水平的調控43(2)轉錄后水平的調控大多數mRNA要經過拼接加工存在細胞核膜,基因轉錄和翻譯不耦聯(3)翻譯水平的調控443,基因表達隨細胞類型、發(fā)育階段和環(huán)境的變
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