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文檔簡介

ICS65.020.20B16

DB37山 東 省 地 方 標(biāo) 準(zhǔn)DB37/T4101—2020蘋果輪紋病菌快速檢測方法Rapiddetectionofbotryosphaeriadothidea20202020083120201001山東省市場監(jiān)督管理局發(fā)布前言本標(biāo)準(zhǔn)按照GB/T1.1—2009給出的規(guī)則起草。本標(biāo)準(zhǔn)由山東省農(nóng)業(yè)農(nóng)村廳提出并組織實(shí)施。本標(biāo)準(zhǔn)由山東省農(nóng)業(yè)標(biāo)準(zhǔn)化技術(shù)委員會歸口。本標(biāo)準(zhǔn)起草單位:山東省煙臺市農(nóng)業(yè)科學(xué)研究院。本標(biāo)準(zhǔn)主要起草人:王英姿、劉保友、汪少麗、王培松、石潔。蘋果輪紋病菌快速檢測方法范圍本標(biāo)準(zhǔn)規(guī)定了用環(huán)介導(dǎo)等溫擴(kuò)增(LAMP)快速檢測蘋果輪紋病菌的測定方法。本標(biāo)準(zhǔn)適用于蘋果葉片、枝條和果實(shí)中蘋果輪紋病菌的快速檢測。方法檢出限:10-7ng/μL蘋果輪紋病菌DNA。GB/T6682分析實(shí)驗(yàn)室用水規(guī)格和試驗(yàn)方法GB/T27403實(shí)驗(yàn)室質(zhì)量控制規(guī)范食品分子生物學(xué)檢測原理ITSBstITS基DNASYBRGreenIDNADNA000倍。在不發(fā)生擴(kuò)增反應(yīng)時,SYBR染料分子的熒光信號不DNASYBRDNA縮略語下列縮略語適用于本文件。LAMP:環(huán)介導(dǎo)等溫擴(kuò)增(loop-mediatedisothermalamplification)DNA:脫氧核糖核酸(deoxyribonucleicacid)ITS:內(nèi)轉(zhuǎn)錄間隔區(qū)(Internaltranscribedspacer)2×LampMasterMix:等溫擴(kuò)增PCR混合液Bst酶:BstDNA聚合酶(BstDNApolymerase)除有特殊說明外,所有實(shí)驗(yàn)用試劑均為分析純;實(shí)驗(yàn)用水為GB/T6682中規(guī)定的一級水。42 CR(2amPRMaterMi1)40molLTi-C20mmol/(NH)SO、20mmol/LKC1(pH8.8)16mmol/LMgSO42.0mmol/LdNTPs、0.2Trion42 BstDNA8U/μLSYBRGreenI1000ITSbp,引物序列見附錄ADNADNA-EZReagentsAll-DNA-Fast-Out2)5mol/L0.1mL、1.5mL70mm6.2mm9.5mm6.165±380℃±16.20.5μL~10μL10μL~100μL,100μL~1000μL(Valsamali)DNA(Botryosphaeriadothidea)DNADNA0.5cm×0.5cm(),1.5mLDNA100μLDNA1.5mL5min80±1510min~30minLAMPLAMP(上海認(rèn)可。如果其他等效產(chǎn)品具有相同的效果,則可使用這些等效產(chǎn)品。(上海認(rèn)可。如果其他等效產(chǎn)品具有相同的效果,則可使用這些等效產(chǎn)品。LAMP2DNA1μL表1LAMP組分工作液濃度加樣量反應(yīng)體系最終濃度外引物1(F3)10μmol/L0.5μL0.2μmol/L外引物2(B3)10μmol/L0.5μL0.2μmol/L內(nèi)引物1(FIP)10μmol/L2μL0.8μmol/L內(nèi)引物2(BIP)10μmol/L2μL0.8μmol/L環(huán)引物1(LF)10μmol/L1μL0.4μmol/L環(huán)引物2(LB)10μmol/L1μL0.4μmol/LLampPCRMasterMix2×12.5μL1×BstDNA聚合酶8U/μL0.5μL0.16U/μL甜菜堿5mol/L4μL0.8mmol/LDNA模板-1μL-水-補(bǔ)足至25.0μL-65±360min,80110min(7.5防污染措施環(huán)介導(dǎo)等溫擴(kuò)增檢測過程的防污染措施應(yīng)符合GB/T27403中附錄D規(guī)定。8結(jié)果判定22附錄A(資料性附錄)蘋果輪紋病菌ITS基因特異性序列ITS(accessionno.MN559436.1)1ATTGCGCCCTTTGGTATTCCGAAGGGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTACAACCCTCAAGC61TCTGCTTGGTATTGGGCACCGTCCTTTGCGGGCGCGCCTCAAAGACCTCGGCGGTGGCGT121CTTGCCTCAAGCGTAGTAGAACATACATCTCGCTTCGGAGCGCAGGGCGTCGCCCGCCGG181ACGAACCTTCTGAACTTTTCTCAAGGTTGACCTCGGATCAGGTAGGGATACCCGCTGAAC注:下劃線所示部分為引物擴(kuò)增匹配區(qū)段。1(F3,5’-3’):TGCCTGTTCGAGCGTCAT2(B3,5’-3’):TCCGAGGTCAACCTTGAGAAF1cF2B1cB2內(nèi)引物2(BIP,5’-3’):GCGTCTTGCCTCAAGCGTAGTGTTCAGAAGGTTCGTCCGG環(huán)引物1(LF,5’-3’):G

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