生物統(tǒng)計(jì)學(xué)擬合優(yōu)檢驗(yàn)_第1頁
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文檔簡介

在我們以前所介紹的有關(guān)統(tǒng)計(jì)推斷的所有檢驗(yàn)方法中,涉及到的生物性狀都是基于正態(tài)分布的連續(xù)型數(shù)據(jù)。在現(xiàn)實(shí)生活中,我們遇到的研究對象決非全部如此!例1:以紫花大豆和白花大豆品種雜交,在F2代共得到289株,其中紫花208株,白花81株,如果花色受一對等位基因控制,則根據(jù)遺傳學(xué)理論,F(xiàn)2代紫花與白花植株的分離比應(yīng)為3:1,即紫花應(yīng)該為216.75株,白花為72.25株,問現(xiàn)在的實(shí)驗(yàn)結(jié)果是否符合一對等位基因的遺傳規(guī)律?例2:有人做給藥方式與藥效之間關(guān)系的試驗(yàn),得出以下數(shù)據(jù),問不同的給藥方式對藥物的效果有無影響?給藥方式有效無效總數(shù)口服584098注射643195這一類數(shù)據(jù)的特點(diǎn)是都屬于離散型數(shù)據(jù),是通過數(shù)數(shù)的辦法獲得的原始數(shù)據(jù),它們不再符合基于正態(tài)分布的u分布、t分布和F分布等,因此也就不能再用基于正態(tài)分布的u檢驗(yàn)、t檢驗(yàn)、F檢驗(yàn)等對數(shù)據(jù)進(jìn)行統(tǒng)計(jì)推斷,而必須引入新的檢驗(yàn)方法,這就是我們即將給大家介紹的新內(nèi)容:擬和優(yōu)度檢驗(yàn)第六章擬合優(yōu)度檢驗(yàn)第一節(jié)擬合優(yōu)度檢驗(yàn)的一般原理一、什么是擬合優(yōu)度檢驗(yàn)1、概念擬合優(yōu)度檢驗(yàn)(goodnessoffittest)是用來檢驗(yàn)實(shí)際觀測數(shù)與依照某種假設(shè)或模型計(jì)算出來的理論數(shù)之間的一致性,以便判斷該假設(shè)或模型是否與觀測數(shù)相配合。擬合優(yōu)度檢驗(yàn)也有兩種類型的錯(cuò)誤。2、檢驗(yàn)的類型第一種類型是檢驗(yàn)觀測數(shù)與理論數(shù)之間的一致性。第二種類型是通過檢驗(yàn)觀測值與理論數(shù)之間的一致性來判斷事件之間的獨(dú)立性。這兩種類型的問題都使用了近似的2

檢驗(yàn)。二、擬合優(yōu)度檢驗(yàn)的統(tǒng)計(jì)量

----離散型數(shù)據(jù)的2

擬和優(yōu)度檢驗(yàn)實(shí)際上是離散型數(shù)據(jù)的顯著性測驗(yàn)。由于離散型數(shù)據(jù)不符合正態(tài)分布,因此不能用基于正態(tài)分布的u檢驗(yàn)、t檢驗(yàn)、F檢驗(yàn)等,擬和優(yōu)度檢驗(yàn)需要有獨(dú)特的檢驗(yàn)統(tǒng)計(jì)量,我們通過實(shí)例來介紹有關(guān)的規(guī)定。例1:以紫花大豆和白花大豆品種雜交,在F2代共得到289株,其中紫花208株,白花81株,如果花色受一對等位基因控制,則根據(jù)遺傳學(xué)理論,F(xiàn)2代紫花與白花植株的分離比應(yīng)為3:1,即紫花應(yīng)該為216.75株,白花為72.25株,問現(xiàn)在的試驗(yàn)結(jié)果是否符合一對等位基因的遺傳規(guī)律?如果我們用n

來表示觀察值總數(shù),用“O”來表示實(shí)際觀測值,用“T”來表示理論值,并且按照屬性性狀或質(zhì)量性狀對我們得到的后代進(jìn)行分組,以“Oi”表示第i

組的實(shí)測值,以“Ti”表示第i

組的理論值,則有n=289,O1=208,O2=81,且,如果按照某種理論或模型第i組的概率為pi,則有,且第i

組的理論數(shù)Ti

應(yīng)按:Ti=n·pi

計(jì)算,上例中的T1=np1=289×0.75=216.75,

T2=np2=289×0.25=72.25,且p1+p2=0.75+0.25=1,T1+T2=216.75+72.25=289現(xiàn)在的問題是Oi與Ti的差異是由于抽樣誤差造成的還是由于實(shí)測值Oi不符合某種理論或模型造成的?為了表示這種差異,我們以進(jìn)行計(jì)算,可是有:若取表示實(shí)測值和理論值的不相符,顯然:但是存在:①Oi=9,Ti=6,Oi-Ti=3,(Oi-Ti)2=9,

②Oi=49,Ti=46,Oi-Ti=3,(Oi-Ti)2=9,顯然,前者的偏離大于后者。單純以來表示實(shí)測值與理論值的偏差有缺陷,若能以來度量實(shí)測值與理論值的偏差,則不但避免了,而且還解決了前述問題。由于在n一定時(shí),理論值更穩(wěn)定,所以采用Ti的值求平均的偏離程度更可靠。我們將命名為2

,并且有近似地符合分布。當(dāng)自由度df=1時(shí),總是大于,需要矯正,可以按照計(jì)算,據(jù)此,我們可以對離散型數(shù)據(jù)進(jìn)行近似的2檢驗(yàn)!?。〉@種近似的檢驗(yàn)是有條件的,即觀察值總數(shù)不得少于30,每種屬性(或分組)的理論值不得少于5,否則,離散型數(shù)據(jù)的卡平方2與連續(xù)型數(shù)據(jù)的2的偏差就很大,這種檢驗(yàn)的精度就不準(zhǔn)了。三、擬和優(yōu)度檢驗(yàn)的程序1、根據(jù)屬性性狀對調(diào)查數(shù)據(jù)進(jìn)行分組;2、根據(jù)某種理論、模型或假定,以n為基礎(chǔ)計(jì)算理論數(shù)Ti;3、假設(shè):H0:O=T,實(shí)測值與理論值相符,即試驗(yàn)結(jié)果符合某種理論、模型、假定;

HA:O≠T,實(shí)測值與理論值不相符,即試驗(yàn)結(jié)果不符合某種理論、模型或假定。4、顯著水平:=0.05,=0.015、統(tǒng)計(jì)量的計(jì)算:或6、確定H0的拒絕域:7、結(jié)論,生物學(xué)的解釋。(永遠(yuǎn)是單尾檢驗(yàn))第二節(jié)擬和優(yōu)度檢驗(yàn)(適合性測驗(yàn),吻合度檢驗(yàn))一、適宜的對象:按屬性分組,每一分組的理論數(shù)Ti可以按照總體分布或某種理論、模型或假說等事先計(jì)算出來。二、測驗(yàn)的目的:通過實(shí)測值判斷試驗(yàn)結(jié)果是否與某總體分布、某理論、模型或假說等相吻合。三、自由度的確定:

df=k-1,其中k為屬性性狀的分組數(shù),在例1中,按花色將大豆分成兩組,則k=2,df=1。四、應(yīng)用實(shí)例:例3:以紫花大豆和白花大豆品種雜交,在F2代共得到289株,其中紫花208株,白花81株,如果花色受一對等位基因控制,則根據(jù)遺傳學(xué)理論,F(xiàn)2代紫花與白花植株的分離比應(yīng)為3:1,問現(xiàn)在的試驗(yàn)結(jié)果是否符合一對等位基因的遺傳規(guī)律?分析:①屬性性狀:紫花、白花,②符合的理論:分離規(guī)律,③紫花的概率p1:0.75,白花的概率p2:0.25,④紫花的理論數(shù)T1=np1=216.75株,白花的理論數(shù)T2=np2=72.25株推斷過程:H0:O=T,HA:O≠T,=0.05,查表,df=k-1=2-1=1時(shí),∴接受

H0:O=T,∵即大豆F2代的花色遺傳符合一對等位基因的遺傳規(guī)律。當(dāng)df=1時(shí)需要對2

進(jìn)行矯正由于矯正后的c2

比2

還小,所以,在這個(gè)特例中,對2

不進(jìn)行矯正,對結(jié)論沒有影響。例4:黃圓豌豆與綠皺豌豆雜交,第二代分離數(shù)目如下:Y-R-黃圓Y-rr黃皺yyR-綠圓yyrr綠皺總數(shù)31510110832556問試驗(yàn)結(jié)果是否符合自由組合律?解:若性狀間相互獨(dú)立,根據(jù)孟德爾的自由組合律,則可以有:計(jì)算出相應(yīng)性狀的理論數(shù)Ti,列于下表:Y-R-Y-rryyR-yyrr實(shí)際觀測數(shù)O31510110832理論頻率p9/163/163/161/16理論數(shù)T312.75104.25104.2534.75O-T2.25-3.253.75-2.75(O-T)25.062510.562514.06257.5625(O-T)2/T0.0160.1010.1350.2182=0.016+0.101+0.135+0.218=0.470H0:O=T,HA:O≠T,=0.05,2=0.470當(dāng)df=k-1=4-1=3

時(shí),查表即試驗(yàn)結(jié)果是否符合自由組合律。例2:有人做給藥方式與藥效之間關(guān)系的試驗(yàn),得出以下數(shù)據(jù),問不同的給藥方式對藥物的效果有無影響?

藥效給藥方式有效無效總數(shù)口服584098注射643195第三節(jié)獨(dú)立性檢驗(yàn)一、適宜的對象當(dāng)實(shí)際觀測值對應(yīng)的理論數(shù)不能用某種理論、模型等進(jìn)行計(jì)算,而需要從樣本資料去推算時(shí),所進(jìn)行的2

檢驗(yàn)。二、檢驗(yàn)的目的這種類型的檢驗(yàn)是要通過檢驗(yàn)觀測值與理論數(shù)之間的一致性來判斷事件之間的獨(dú)立性,也就是要研究兩個(gè)或兩個(gè)以上的因子彼此之間是相互獨(dú)立的還是相互影響的,研究不同試驗(yàn)處理的差異顯著性。

藥效給藥方式

有效

無效總數(shù)

口服584098

注射643195總數(shù)12271193三、理論數(shù)的確定例2:有人做給藥方式與藥效之間關(guān)系的試驗(yàn),得出以下數(shù)據(jù),問不同的給藥方式對藥物的效果有無影響?1、首先假設(shè)兩個(gè)因子(即給藥方式和藥效)之間無關(guān)聯(lián),彼此獨(dú)立。按照獨(dú)立事件概率的乘法,可以計(jì)算出各個(gè)實(shí)際觀測值的對應(yīng)理論數(shù)。不論有效與否:

(A)(B)口服的概率P(B)=98/193,注射的概率P=95/193不論給藥方式:有效的概率P(A)=122/193,無效的概率P=71/193口服并有效的概率:P(BA)=P(B)·P(A)=98/193×122/193口服并有效的人數(shù):T11=n·P(BA)=193×98/193×122/193同理:

藥效給藥方式

有效

無效總數(shù)口服5861.954036.0598

注射6460.053134.9595

總數(shù)12271193這種類型的檢驗(yàn)是要通過檢驗(yàn)觀測值與理論數(shù)之間的一致性來判斷事件之間的獨(dú)立性。。自由度的確定:df=1四、應(yīng)用實(shí)例(一)、2×2列聯(lián)表的檢驗(yàn)例5:有人做給藥方式與藥效之間關(guān)系的試驗(yàn),得出以下數(shù)據(jù),問不同的給藥方式對藥物的效果有無影響?

藥效給藥方式

有效

無效總數(shù)

口服5861.954036.0598

注射6460.053134.9595總數(shù)12271193解:H0:O=T,給藥方式與藥效無關(guān)聯(lián),即不同的給藥方式對藥效沒影響。

HA:O≠T,給藥方式與藥效有關(guān)聯(lián),即不同的給藥方式對藥效有影響。=0.05,當(dāng)df=1時(shí),查表∵∴接受H0:O=T,即:不同的給藥方式對藥效沒影響。自由度為1,卡方要矯正?。ǘ﹔×c列聯(lián)表的檢驗(yàn)有時(shí),我們在研究工作中,遇到的問題將不僅僅只是2×2列聯(lián)表的檢驗(yàn)問題,而是r×c列聯(lián)表的檢驗(yàn)。1、理論數(shù)與自由度的確定:

結(jié)果處理12???c總數(shù)1T11T12T1cT1.2???TijTi.rTr1Tr2Trc總數(shù)T.1T.2T.jn2、應(yīng)用實(shí)例:例6:用三種射線照射“天津一號(hào)”大麥。將處理后的種子做根尖壓片,觀測染色體畸變情況,得到以下結(jié)果,問不同的處理方式所引起的染色體畸變的差異是否顯著?

結(jié)果處理有橋細(xì)胞數(shù)無橋細(xì)胞數(shù)總數(shù)40Kr+N21923378357040Kr3193297361625Kr19436203814總數(shù)7051029511000

結(jié)果處理有橋細(xì)胞數(shù)無橋細(xì)胞數(shù)總數(shù)40Kr+N2192228.833783341.2357040Kr319231.832973384.2361625Kr194244.436203569.63814總數(shù)7051029511000解:①理論數(shù)與自由度的確定:df=(3-1)×(2-1)=2②H0:O=T,HA:O≠T,=0.05,∴接受HA:O≠T,即三種不同的處理射線對染色體畸變的影響差異顯著。習(xí)題7.2:用兩種不同的藥物治療末種疾病,服用A藥物的30人中有18人痊愈,服用B藥物的30人中有25人痊愈,問兩種藥物的療效有無差異?問題的分析:1、離散型數(shù)據(jù)2、屬于2×2列聯(lián)表的獨(dú)立性檢驗(yàn)問題統(tǒng)計(jì)推斷:H0:O=T(兩種藥物的種類與療效無關(guān),即兩種藥物的療效無差異)HA:O≠T(兩種藥物的種類與療效有關(guān),即兩種藥物的療效有差異)α=0.05(df=1,需要校正卡方)

療效藥物痊愈未痊愈行總數(shù)RiA1821.5128.530B2521.558.530列總數(shù)Cj431760查表,當(dāng)df=(2-1)(2-1)=1時(shí),∵∴接受

H0:O=T,推斷結(jié)論:兩種藥物的種類與療效無關(guān),即兩種藥物的療效無差異由于H0:O=T,而不是關(guān)于總體參數(shù)(μ或σ)的假設(shè),因此卡方檢驗(yàn)又被稱為非參數(shù)統(tǒng)計(jì)推斷。

療效藥物痊愈未痊愈行總數(shù)RiA1821.5128.530B2521.558.530列總數(shù)Cj431760實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)符合Tij>5、n>30的要求,所以進(jìn)行了卡方檢驗(yàn)。如果上述實(shí)驗(yàn)的數(shù)據(jù)不符合Tij>5、n>30的要求,即:

療效藥物痊愈未痊愈行總數(shù)RiA54126B34326列總數(shù)Cj8412問兩種藥物的療效有無差異?

療效藥物痊愈未痊愈行總數(shù)RiA516B3

36列總數(shù)Cj8412將12個(gè)人分成兩組,每組6個(gè)人,一共有幾種組合?將12個(gè)人分成兩組,一組8個(gè)人,一組4個(gè)人,一共有幾種組合?將12在行間分解6和6、在列間分解為8和4的全部組合數(shù)為:

療效藥物痊愈未痊愈行總數(shù)RiA516B3

36列總數(shù)Cj8412而將12分解為5、1、3、3的組合方式共有:由古典概率可知:若隨機(jī)現(xiàn)象的基本事件總數(shù)為n,事件數(shù)為m,則隨機(jī)事件A的概率為:

療效藥物痊愈未痊愈行總數(shù)RiA516B3

36列總數(shù)Cj8412試驗(yàn)數(shù)據(jù)出現(xiàn)下列2×2聯(lián)表的概率為:若P>α,則接受H0:O=T若P<α,則需要計(jì)算若干Pi的值,當(dāng)時(shí),接受零假設(shè),否則,拒絕H0。第四節(jié)22列聯(lián)表的精確檢驗(yàn)其中a、b、c、d中有小于5、且N小于30時(shí),要進(jìn)行22列聯(lián)表的精確檢驗(yàn)!1、若a、b、c、d中若有0出現(xiàn)時(shí),計(jì)算出的P>0.05時(shí),差異不顯著,算出的P<0.05時(shí),差異顯著。2、若a、b、c、d無0出現(xiàn)時(shí),則依次將a、b、c、d中最小的降為0,把各種情況下的概率P累加起來,此時(shí)若P>0.05時(shí),則差異不顯著;若算出的P<0.05,則差異顯著,拒絕零假設(shè)。P(1)P(0)P=P0+P1+P2若P>接受零假設(shè),否則則否。P(2)P(0)P(1)測驗(yàn):1、一個(gè)小麥雜交組合的F2代單株,經(jīng)抗銹病鑒定,得到抗病型植株124株,中度抗病型植株388株,感染型植株453株,問這一遺傳分離是否符合1:2:1的分離比例。2、在日常生活中,有人慣用左手,也有人慣用右手;有人左眼的視力好,也有人右眼的視力好。現(xiàn)調(diào)查400個(gè)學(xué)生,其調(diào)查結(jié)果如下表,試問使用左手和使用右手,與左眼視力和右眼視力的好壞是否有聯(lián)系性?調(diào)查項(xiàng)目慣用左手慣用右手總計(jì)左

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