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文檔簡介
SDS-聚丙烯酰胺凝膠電泳SDS-聚丙烯酰胺凝膠共78頁,您現(xiàn)在瀏覽的是第1頁!一.什么是SDS-聚丙烯酰胺凝膠電泳?1.聚丙烯酰胺凝膠:由丙烯酰胺單體(Acr)和交聯(lián)劑甲叉雙丙烯酰胺(Bis)在催化劑過硫酸銨(AP)或核黃素,以及加速劑四甲基乙二胺(TEMED)作用下聚合交聯(lián)而成的三維網(wǎng)狀結(jié)構(gòu)凝膠.
形成的凝膠具有穩(wěn)定的親水性,無電離基團,不帶電荷,幾乎無吸附和電滲作用.凝膠孔徑可控制.SDS-聚丙烯酰胺凝膠共78頁,您現(xiàn)在瀏覽的是第2頁!*凝膠機械性能和孔徑大小:由總濃度T%控制.即100ml凝膠溶液中含有Acr、Bis的總克數(shù).
T%越大,平均孔徑越小,機械強度大.交聯(lián)度C%:
Acr和Bis的比例.即交聯(lián)劑Bis占單體Acr與Bis總量的百分數(shù).SDS-聚丙烯酰胺凝膠共78頁,您現(xiàn)在瀏覽的是第3頁!2.SDS:十二烷基磺硫酸鈉(sodiumdodecylsulfate,SDS)陰離子去污劑在水溶液中以單體(monomer)和分子團(micellae)的混合形式存在.破壞蛋白質(zhì)分子之間以及其他物質(zhì)分子之間的非共價鍵,使蛋白質(zhì)變性(denature)而改變原有的構(gòu)象,保證蛋白質(zhì)分子與SDS充分結(jié)合而形成帶負電荷的蛋白質(zhì)-SDS復(fù)合物。SDS-聚丙烯酰胺凝膠共78頁,您現(xiàn)在瀏覽的是第4頁!二.SDS-聚丙烯酰胺凝膠電泳基本原理:
SDS與樣品中各蛋白質(zhì)形成的SDS-蛋白質(zhì)復(fù)合物帶有大量的負電荷,從而使天然蛋白質(zhì)分子間的電荷差別降低或減至最小,與此同時蛋白質(zhì)在SDS作用下結(jié)構(gòu)變得松散,形狀趨向一致使被測物的泳動速率的大小完全取決與該物質(zhì)的分子量.
SDS-聚丙烯酰胺凝膠共78頁,您現(xiàn)在瀏覽的是第5頁!1.SDS陰離子去污劑,變性劑,助溶劑.斷裂分子內(nèi)和分子間的氫鍵,分子去折疊,破壞蛋白質(zhì)分子的二級和三級結(jié)構(gòu).
SDS-聚丙烯酰胺凝膠共78頁,您現(xiàn)在瀏覽的是第6頁!SDS-聚丙烯酰胺凝膠共78頁,您現(xiàn)在瀏覽的是第7頁!蛋白質(zhì)-SDS膠束的特點
(1)形狀像一個長橢圓棒
(2)短軸對不同的蛋白質(zhì)亞基-SDS膠束基本上是相同的.
(3)長軸的長度則與亞基分子量的大小成正比.SDS-聚丙烯酰胺凝膠共78頁,您現(xiàn)在瀏覽的是第8頁!*不同的蛋白質(zhì)分子有不同的電泳遷移率mR,自由遷移率m0和阻滯系數(shù)KR值不同蛋白質(zhì)的SDS復(fù)合物的m0值都很接近,分子量相差5倍的蛋白質(zhì)之間,m0值只相差10%,如果忽略這個差別,就可以認為,各種蛋白質(zhì)-SDS復(fù)合物的m0基本上是一個定值。這表明,不同蛋白質(zhì)的SDS復(fù)合物都帶有相同密度的負電荷,并具有同樣的構(gòu)象它們的凈電荷量與摩擦系數(shù)(f由溶液的粘滯性、蛋白質(zhì)分子的大小和形狀決定)之比(q/f)都接近于一個定值而不受各種蛋白質(zhì)原來電荷、分子大小和形狀的影響,因而,在溶液中,自由遷移率就表現(xiàn)出一致性;但在一定濃度的凝膠中,由于引入凝膠的分子篩效應(yīng),電泳遷移率mR就成為蛋白質(zhì)分子量函數(shù).SDS-聚丙烯酰胺凝膠共78頁,您現(xiàn)在瀏覽的是第9頁!3.影響SDS電泳的關(guān)鍵因素
(1)溶液中SDS單體濃度(>1mmol/L)
大多數(shù)蛋白質(zhì)與SDS結(jié)合的重量比為1:1.4
(2)樣品緩沖液的離子強度(不>0.26)
低離子強度的溶液中,SDS單體才具有較高的平衡濃度。SDS-聚丙烯酰胺凝膠共78頁,您現(xiàn)在瀏覽的是第10頁!(二)緩沖系統(tǒng)的選擇
一般情況下,在被分析的蛋白質(zhì)穩(wěn)定的pH范圍,凡不與SDS發(fā)生相互作用的緩沖液都可以使用,但緩沖液的選擇對蛋白質(zhì)的分離和電泳的速度是非常關(guān)鍵的。SDS-聚丙烯酰胺凝膠共78頁,您現(xiàn)在瀏覽的是第11頁!(三)凝膠濃度的選擇
由于SDS電泳分離并不取決于蛋白質(zhì)的電荷密度,只取決于分子解聚后SDS-蛋白質(zhì)膠束的大小,因此凝膠濃度的選擇會直接影響分辨率。
*不同分子量范圍的蛋白質(zhì)應(yīng)選用不同的凝膠濃度.
SDS-聚丙烯酰胺凝膠共78頁,您現(xiàn)在瀏覽的是第12頁!SDS-聚丙烯酰胺凝膠共78頁,您現(xiàn)在瀏覽的是第13頁!SDS-聚丙烯酰胺凝膠共78頁,您現(xiàn)在瀏覽的是第14頁!2.作圖
以已知蛋白質(zhì)分子量的常用對數(shù)值為縱坐標,
Rf為橫坐標繪圖SDS-聚丙烯酰胺凝膠共78頁,您現(xiàn)在瀏覽的是第15頁!
3.通過測定未知蛋白質(zhì)的Rf值,便可在標準曲線上讀出他的分子量*a.標準蛋白質(zhì)的相對遷移率最好在0.2—0.8之間均勻分布.
b.SDS-凝膠電泳法測定分子量,每次測定樣品必須同時做標準曲線,而不得利用另一次電泳的標準曲線。
SDS-聚丙烯酰胺凝膠共78頁,您現(xiàn)在瀏覽的是第16頁!
三.去污劑的選擇
無離子去污劑:LubroW;Brij35,Tween
Triton
陽離子去污劑:cetyltrimethylammonium
bromide(CTAB)
cetylpyyridinium(CPC)
陰離子去污劑:SDSdeoxycholateSDS-聚丙烯酰胺凝膠共78頁,您現(xiàn)在瀏覽的是第17頁!(2)根據(jù)緩沖系統(tǒng)和凝膠孔徑的不同
連續(xù)電泳
不連續(xù)電泳
(3)根據(jù)電泳的形式
圓盤電泳
垂直電泳
平板電泳
水平電泳SDS-聚丙烯酰胺凝膠共78頁,您現(xiàn)在瀏覽的是第18頁!SDS-聚丙烯酰胺凝膠共78頁,您現(xiàn)在瀏覽的是第19頁!不連續(xù)系統(tǒng)中的三種物理效應(yīng):
①電荷效應(yīng):
②分子篩效應(yīng):
③濃縮效應(yīng)SDS-聚丙烯酰胺凝膠共78頁,您現(xiàn)在瀏覽的是第20頁!SDS-聚丙烯酰胺凝膠共78頁,您現(xiàn)在瀏覽的是第21頁!SDS-聚丙烯酰胺凝膠共78頁,您現(xiàn)在瀏覽的是第22頁!SDS-聚丙烯酰胺凝膠共78頁,您現(xiàn)在瀏覽的是第23頁!SDS-聚丙烯酰胺凝膠共78頁,您現(xiàn)在瀏覽的是第24頁!(3)加樣
樣品的處理
在蛋白溶液中加入過量的SDS后,可引起以下的反應(yīng):
蛋白質(zhì)本身的電荷被屏蔽
氫鍵斷裂
疏水相互作用被取消
多肽被去折疊(二級結(jié)構(gòu)破壞),并形成橢球形SDS-聚丙烯酰胺凝膠共78頁,您現(xiàn)在瀏覽的是第25頁!②帶有烷基化作用的還原SDS處理
烷基化作用可以很好地并經(jīng)久牢固地保護SH基團,而得到窄的電泳帶。SDS-聚丙烯酰胺凝膠共78頁,您現(xiàn)在瀏覽的是第26頁!SDS-聚丙烯酰胺凝膠共78頁,您現(xiàn)在瀏覽的是第27頁!(5)固定(6)染色
考馬斯亮藍(coomassiebrilliantblue)
①R-250
三苯基甲烷,紅藍色,每個分子含有兩個SO3H基團,偏酸性,和氨基黑一樣也是結(jié)合在蛋白質(zhì)的堿性基團上。
SDS-聚丙烯酰胺凝膠共78頁,您現(xiàn)在瀏覽的是第28頁!②G-250
二甲花青亮藍,藍綠色SDS-聚丙烯酰胺凝膠共78頁,您現(xiàn)在瀏覽的是第29頁!銀染色
銀染的機制是將蛋白帶上的硝酸銀(銀離子)還原成金屬銀,以使銀顆粒沉積在蛋白帶上。SDS-聚丙烯酰胺凝膠共78頁,您現(xiàn)在瀏覽的是第30頁!(7)照相,凝膠干燥(8)定量測定SDS-聚丙烯酰胺凝膠共78頁,您現(xiàn)在瀏覽的是第31頁!(2)“皺眉”現(xiàn)象
由于垂直電泳槽的裝置不合適引起的,特別是當凝膠和玻璃板組成的“三明治”底部有氣泡或靠近隔片的凝膠聚合不完全。
SDS-聚丙烯酰胺凝膠共78頁,您現(xiàn)在瀏覽的是第32頁!(3)“拖尾”現(xiàn)象
樣品溶解不佳引起SDS-聚丙烯酰胺凝膠共78頁,您現(xiàn)在瀏覽的是第33頁!(5)偏斜現(xiàn)象
電極放置不平行引起或加樣位置偏斜而引起SDS-聚丙烯酰胺凝膠共78頁,您現(xiàn)在瀏覽的是第34頁!蛋白質(zhì)轉(zhuǎn)移
蛋白質(zhì)經(jīng)凝膠電泳分離后所得的區(qū)帶通過另一次電泳轉(zhuǎn)移到特定的固相支持物(常用硝酸纖維膜)上,稱為轉(zhuǎn)移電泳.蛋白質(zhì)轉(zhuǎn)移并固定特定的固相支持物上,然后一特定的親和反應(yīng)、免疫反應(yīng)或結(jié)合反應(yīng)以及顯色系統(tǒng)分析此印跡,稱為Western印跡法(WesternBlot).SDS-聚丙烯酰胺凝膠共78頁,您現(xiàn)在瀏覽的是第35頁!SDS-聚丙烯酰胺凝膠共78頁,您現(xiàn)在瀏覽的是第36頁!Western印跡:鑒定蛋白質(zhì)。Western使用的探針是抗體,它與附著于固相支持體的靶蛋白所呈現(xiàn)的抗原表位發(fā)生特異性反應(yīng)。這種技術(shù)的作用是對非放射性標記蛋白組成的復(fù)雜混合物中的某些特異蛋白進行鑒別和鑒定。
步驟:1.固定:蛋白質(zhì)行SDS電泳并從聚丙烯酰胺凝膠上轉(zhuǎn)移至固相載體上.2.封閉:保持膜上沒有特殊抗體結(jié)合的場所,使場所處于飽和狀態(tài),用以保護特異性抗體結(jié)合到膜上并與蛋白質(zhì)反應(yīng).3.初級抗體(抗體):特異性4.第二抗體或配體試劑:與一抗特異性結(jié)合并作為指示劑5.顯色SDS-聚丙烯酰胺凝膠共78頁,您現(xiàn)在瀏覽的是第37頁!*階段為SDS-聚丙烯酰胺凝膠電泳(SDS)??乖鹊鞍讟悠方?jīng)SDS處理后帶陰電荷,在聚丙烯酰胺凝膠中從陰極向陽極泳動,分子量越小,泳動速度越快。此階段分離效果肉眼不可見(只有在染色后才顯出電泳區(qū)帶)。
第二階段為電轉(zhuǎn)移。將在凝膠中已經(jīng)分離的條帶轉(zhuǎn)移至硝酸纖維素膜上,選用低電壓(100V)和大電流(1—2A),通電45min轉(zhuǎn)移即可完成。此階段分離的蛋白質(zhì)條帶肉眼仍不可見。
第三階段為酶免疫定位。將印有蛋白條帶的硝酸纖維素膜(相當于包被了抗原的固相載體)依次與特異性抗體和酶標第二抗體作用后,加入能形成不溶性顯色物的酶反應(yīng)底物,使區(qū)帶染色。常用的HRP底物為3,3,—二氨基聯(lián)苯胺(呈硝酸纖維素膜棕色)和4—氯—1—萘酚(呈藍紫色)。陽性反應(yīng)的條帶清晰可辨,并可根據(jù)SDS時加入的分子量標準,確定各組分的分子量。SDS-聚丙烯酰胺凝膠共78頁,您現(xiàn)在瀏覽的是第38頁!SDS-聚丙烯酰胺凝膠共78頁,您現(xiàn)在瀏覽的是第39頁!應(yīng)用:1.檢測樣品中特異蛋白的存在與否2.細胞中特異蛋白的半定量分析同一蛋白質(zhì)在不同細胞或統(tǒng)一細胞不同條件下的相對含量分析.3.蛋白質(zhì)分子相互作用的研究SDS-聚丙烯酰胺凝膠共78頁,您現(xiàn)在瀏覽的是第40頁!*分子量范圍 適用的凝膠濃度(%) 蛋白質(zhì)
104 20-30 1-4×104 15-201-5×104-1×105 10-15 1×105 5-10
5×105 2-5 核酸 104 15–20 104–105 5-10 105-2×106
2-2.6
SDS-聚丙烯酰胺凝膠共78頁,您現(xiàn)在瀏覽的是第41頁!聚丙烯酰胺凝膠為電泳支持物,電泳系統(tǒng)中加入一定濃度的SDS稱為SDS-聚丙烯酰胺凝膠電泳(SDS).
SDS-聚丙烯酰胺凝膠電泳主要用于蛋白質(zhì)的分離、蛋白質(zhì)或肽類分子量的測定.SDS-聚丙烯酰胺凝膠共78頁,您現(xiàn)在瀏覽的是第42頁!(一)蛋白質(zhì)分子的解聚
樣品介質(zhì)和聚丙烯酰胺中加入離子去污劑和強還原劑后,蛋白質(zhì)亞基的電泳遷移率主要取決于亞基分子量的大小,而電荷因素可以被忽略。SDS-聚丙烯酰胺凝膠共78頁,您現(xiàn)在瀏覽的是第43頁!2.強還原劑a.β-巰基乙醇b.二硫蘇糖醇(DTT)使半胱氨酸殘基之間的二硫鍵斷裂.SDS-聚丙烯酰胺凝膠共78頁,您現(xiàn)在瀏覽的是第44頁!SDS和還原劑的作用:(1)分子被解聚
(2)氨基酸側(cè)鏈與SDS充分結(jié)合形成帶負電荷的蛋白質(zhì)-SDS膠束。
(3)蛋白質(zhì)-SDS膠束所帶的負電荷大大超
過了蛋白質(zhì)分子原有的電荷量,消除了不同分子之間原有的電荷差異SDS-聚丙烯酰胺凝膠共78頁,您現(xiàn)在瀏覽的是第45頁!
膠束在SDS系統(tǒng)中的電泳遷移率不再受蛋白質(zhì)原有電荷的影響,而主要取決于橢圓棒的長軸長度,即蛋白質(zhì)或亞基分子量的大小。
當?shù)鞍踪|(zhì)的分子量在15KD—200KD之間時,電泳遷移率與分子量的對數(shù)呈線性關(guān)系.SDS-聚丙烯酰胺凝膠共78頁,您現(xiàn)在瀏覽的是第46頁!SDS-聚丙烯酰胺凝膠共78頁,您現(xiàn)在瀏覽的是第47頁!(3)二硫鍵是否完全被還原:
只有在蛋白質(zhì)分子內(nèi)的二硫鍵被徹底還原的情況下,蛋白質(zhì)分子才能被解聚,SDS才能定量地結(jié)合到蛋白質(zhì)分子上去,并使之具有相同的構(gòu)象而給出相對遷移率和分子量對數(shù)的線性關(guān)系。SDS-聚丙烯酰胺凝膠共78頁,您現(xiàn)在瀏覽的是第48頁!電泳緩沖液的種類:
1.磷酸緩沖液
2.Tris-醋酸鈉緩沖系統(tǒng)
3.咪唑緩沖液系統(tǒng):比磷酸緩沖系統(tǒng)的導(dǎo)電性低,電泳速度比后者快一倍.
4.尿素系統(tǒng):
適用分子量低于15KD的蛋白樣品.
5.Tris-甘氨酸系統(tǒng):
使用最多的緩沖液
6.Tris-硼酸鹽緩沖液:
測定糖蛋白的分子量
SDS-聚丙烯酰胺凝膠共78頁,您現(xiàn)在瀏覽的是第49頁!SDS-聚丙烯酰胺凝膠共78頁,您現(xiàn)在瀏覽的是第50頁!SDS-聚丙烯酰胺凝膠共78頁,您現(xiàn)在瀏覽的是第51頁!(四)分子量測定
1.相對遷移率(relativemobility,Rf)
Rf即用每個帶的遷移距離除以溴酚藍前沿的遷移距離得到的。
測量位置應(yīng)在蛋白帶的中央。
蛋白帶遷移距離
Rf=————————
溴酚藍遷移距離
SDS-聚丙烯酰胺凝膠共78頁,您現(xiàn)在瀏覽的是第52頁!SDS-聚丙烯酰胺凝膠共78頁,您現(xiàn)在瀏覽的是第53頁!SDS-聚丙烯酰胺凝膠共78頁,您現(xiàn)在瀏覽的是第54頁!四.方法
1.分類(1)根據(jù)對樣品的處理方式的不同
還原SDS電泳
非還原SDS電泳
帶有烷基化作用的還原SDS電泳
SDS-聚丙烯酰胺凝膠共78頁,您現(xiàn)在瀏覽的是第55頁!SDS-聚丙烯酰胺凝膠共78頁,您現(xiàn)在瀏覽的是第56頁!連續(xù)系統(tǒng):電泳體系中緩沖液pH值及凝膠濃度相同,帶電顆粒在電場作用下,主要靠電荷和分子篩效應(yīng).
不連續(xù)系統(tǒng):緩沖液離子成分,pH,凝膠濃度及電位梯度均不連續(xù)性,帶電顆粒在電場中泳動不僅有電荷效應(yīng),分子篩效應(yīng),還具有濃縮效應(yīng),因而其分離條帶清晰度及分辨率均較前者佳.
SDS-聚丙烯酰胺凝膠共78頁,您現(xiàn)在瀏覽的是第57頁!
2.操作
(1)制備分離膠(separatinggel)
(2)制備積層膠(stackinggel)SDS-聚丙烯酰胺凝膠共78頁,您現(xiàn)在瀏覽的是第58頁!SDS-聚丙烯酰胺凝膠共78頁,您現(xiàn)在瀏覽的是第59頁!SDS-聚丙烯酰胺凝膠共78頁,您現(xiàn)在瀏覽的是第60頁!SDS-聚丙烯酰胺凝膠共78頁,您現(xiàn)在瀏覽的是第61頁!SDS-聚丙烯酰胺凝膠共78頁,您現(xiàn)在瀏覽的是第62頁!①還原SDS處理
當加入還原試劑DTT或β-二巰基乙醇后,蛋白質(zhì)被完全去折疊,只根據(jù)分子量分離。SDS-聚丙烯酰胺凝膠共78頁,您現(xiàn)在瀏覽的是第63頁!③非還原的SDS處理
許多樣品,如生理體液、血清或尿素,一般只需用1%SDS在100℃煮沸3分鐘,并不需要加還原劑,此時二硫鍵不能被斷裂,蛋白并沒有完全被去折疊。SDS-聚丙烯酰胺凝膠共78頁,您現(xiàn)在瀏覽的是第64頁!SDS-聚丙烯酰胺凝膠共78頁,您現(xiàn)在瀏覽的是第65頁!SDS-聚丙烯酰胺凝膠共78頁,您現(xiàn)在瀏覽的是第66頁!SDS-聚丙烯酰胺
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