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文檔簡介
原核生物及真核生物DNA復(fù)制內(nèi)容提要:●DNA的半保留復(fù)制●與DNA復(fù)制有關(guān)的物質(zhì)●DNA的復(fù)制過程(大腸桿菌為例)●DNA復(fù)制的其它方式●真核生物中DNA的復(fù)制特點1、定義:由親代DNA生成子代DNA時,每個新形成的子代DNA中,一條鏈來自親代DNA,而另一條鏈則是新合成的,這種復(fù)制方式稱半保留復(fù)制。(一)DNA的半保留復(fù)制(semi-conservativereplication)(二)與DNA復(fù)制有關(guān)的物質(zhì)1、原料:四種脫氧核苷三磷酸(dATP、dGTP、dCTP、dTTP)2、模板:以DNA的兩條鏈為模板鏈,合成子代DNA3、引物:DNA的合成需要一段RNA鏈作為引物4、引物合成酶(引發(fā)酶):此酶以DNA為模板合成一段RNA,這段RNA作為合成DNA的引物(Primer)。實質(zhì)是以DNA為模板的RNA聚合酶。5、DNA聚合酶:以DNA為模板的DNA合成酶●以四種脫氧核苷酸三磷酸為底物●反應(yīng)需要有模板的指導(dǎo)●反應(yīng)需要有3-OH存在●DNA鏈的合成方向為53原核生物中的DNA聚合酶(大腸桿菌)性質(zhì)聚合酶Ⅰ聚合酶Ⅱ聚合酶Ⅲ3'5'外切活性+++5'3'外切活性+--5'3'聚合活性+中+很低+很高新生鏈合成--+主要是對DNA損傷的修復(fù);以及在DNA復(fù)制時切除RNA引物并填補其留下的空隙。修復(fù)紫外光引起的DNA損傷DNA復(fù)制的主要聚合酶,還具有3’-5‘外切酶的校對功能,提高DNA復(fù)制的保真性真核生物中的DNA聚合酶
α
β
γ
δ
ε定位細(xì)胞核細(xì)胞核線粒體細(xì)胞核細(xì)胞核3‘-5’外切--+++酶活性功能引物合成修復(fù)作用線粒體DNA的復(fù)制核DNA的復(fù)制?
6、DNA連接酶(1967年發(fā)現(xiàn)):若雙鏈DNA中一條鏈有切口,一端是3’-OH,另一端是5‘-磷酸基,連接酶可催化這兩端形成磷酸二酯鍵,而使切口連接。但是它不能將兩條游離的DNA單鏈連接起來
DNA連接酶在DNA復(fù)制、損傷修復(fù)、重組等過程中起重要作用3‘5‘3‘5‘OHP7、DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶(DNATopisomerase):拓?fù)洚悩?gòu)酶?:使DNA一條鏈發(fā)生斷裂和再連接,作用是松解負(fù)超螺旋。主要集中在活性轉(zhuǎn)錄區(qū),同轉(zhuǎn)錄有關(guān)。
例:大腸桿菌中的ε蛋白拓?fù)洚悩?gòu)酶Π:該酶能暫時性地切斷和重新連接雙鏈DNA,作用是將負(fù)超螺旋引入DNA分子。同復(fù)制有關(guān)。例:大腸桿菌中的DNA旋轉(zhuǎn)酶7、DNA解螺旋酶/解鏈酶(DNAhelicase)通過水解ATP獲得能量來解開雙鏈DNA。中的rep蛋白就是解螺旋酶,還有解螺旋酶I、II、III。rep蛋白沿3’5’移動,而解螺旋酶I、II、III沿5’
3’移動。9、單鏈結(jié)合蛋白(SSBP-single-strandbindingprotein):穩(wěn)定已被解開的DNA單鏈,阻止復(fù)性和保護(hù)單鏈不被核酸酶降解。(三)DNA的復(fù)制過程(大腸桿菌為例)雙鏈的解開
RNA引物的合成
DNA鏈的延伸切除RNA引物,填補缺口,連接相鄰的DNA片段1、雙鏈的解開
DNA的復(fù)制有特定的起始位點,叫做復(fù)制原點。ori(或o)、富含A、T的區(qū)段。基本概念:從復(fù)制原點到終點,組成一個復(fù)制單位,叫復(fù)制子復(fù)制時,解鏈酶等先將DNA的一段雙鏈解開,形成復(fù)制點,這個復(fù)制點的形狀象一個叉子,故稱為復(fù)制叉復(fù)制叉復(fù)制叉復(fù)制方向和速度:
單起點、雙向等速多起點、雙向等速雙鏈解開、復(fù)制起始大約20個DnaA蛋白在ATP的作用下與oriC處的4個9bp保守序列相結(jié)合2、RNA引物的合成DnaB蛋白活化引物合成酶,引發(fā)RNA引物的合成。引物長度約為幾個至10個核苷酸,DNA的半不連續(xù)復(fù)制(semi-discontinuousreplication)DNA復(fù)制時其中一條子鏈的合成是連續(xù)的,而另一條子鏈的合成是不連續(xù)的,故稱半不連續(xù)復(fù)制。在DNA復(fù)制時,合成方向與復(fù)制叉移動的方向一致并連續(xù)合成的鏈為前導(dǎo)鏈;合成方向與復(fù)制叉移動的方向相反,形成許多不連續(xù)的片段,最后再連成一條完整的DNA鏈為滯后鏈。3、DNA鏈的延伸在DNA復(fù)制過程中,前導(dǎo)鏈能連續(xù)合成,而滯后鏈只能是斷續(xù)的合成53的多個短片段,這些不連續(xù)的小片段稱為岡崎片段。4、切除RNA引物,填補缺口,連接相鄰的DNA片段(復(fù)制終止)在DNA聚合酶Ⅰ催化下切除RNA引物;留下的空隙由DNA聚合酶Ⅰ催化合成一段DNA填補上;在DNA連接酶作用下,連接相鄰的DNA鏈雙鏈環(huán)狀、θ型復(fù)制、雙向等速(五)真核生物中DNA的復(fù)制特點1、真核生物每條染色體上有多個復(fù)制起點,多復(fù)制子2、真核生物染色體在全部復(fù)制完之前,各個起始點不再重新開始DNA復(fù)制;而在快速生長的原核生物中,復(fù)制起點可以連續(xù)開始新的復(fù)制(多復(fù)制叉)。真核生物快速生長時,往往采用更多的復(fù)制起點。3、真核生物有多種DNA聚合酶。1復(fù)制概況a、多個復(fù)制子,雙向復(fù)制b、復(fù)制子相對較小(13-900kb),復(fù)制速度較慢,大約500~5000bp/min(3000bp/min)岡崎片段100~200bpc、復(fù)制終止通過復(fù)制叉的相遇而終止(五)真核生物中DNA的復(fù)制d.不同的發(fā)育時期,真核的復(fù)制起始點和復(fù)制子的大小會變化。有些復(fù)制起點在不同的發(fā)育階段就不再發(fā)揮作用。如果蠅受精后復(fù)制原點從五千個上升到五萬個。發(fā)育早期,每個復(fù)制子長7.9Kb,成體時,每個復(fù)制子長40Kb,很多Ori區(qū)不再起作用。真核生物DNA聚合酶及有關(guān)蛋白
表真核生物五種DNA聚合酶DNA聚合酶αδεβγ位置核核核核線粒體功能引發(fā)合成修復(fù)修復(fù)復(fù)制相對活性80%
10-15%2-15%分子量300K170-230K250K40K180-300K亞基催化核心(180K)兩個引物酶(60,50K)一個未知催化核心(125K)一個未知(25K)催化核心一個未知催化催化3’→5’外切-++-+雙脫氧T不影響不影響弱抑制抑制蚜黃素抑制抑制抑制不影響不影響
表真核復(fù)制需要的酶和蛋白蛋白亞基功能DNA聚合酶α/引發(fā)酶4引物合成DNA聚合酶δ2DNA合成PCNA1延伸(滑動鉗作用)復(fù)制因子RF-C
3延伸(載體作用)復(fù)制因子RF-A3單鏈結(jié)合拓?fù)洚悩?gòu)酶Ⅰ和Ⅱ
維持DNA的拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)2
SV40復(fù)制
雙鏈環(huán)狀DNA,具有核小體,全長5243bp2.1復(fù)制起始區(qū):具有2個位點位點2包括以下:10bp的前期區(qū),27bp的T抗原結(jié)合位點,含GAGGC17bp的A-T豐富區(qū)。真核生物DNA復(fù)制叉結(jié)構(gòu)示意圖3酵母的自主復(fù)制區(qū)ARS(autonomouslyreplicatingsequence)序列,在酵母染色體復(fù)制和質(zhì)粒復(fù)制中均發(fā)揮復(fù)制起點的功能。A、B起主要作用,C區(qū)作用微弱。ARS1分為A,B,C三個功能區(qū):A區(qū):15bp,其中11個保守,稱ACS
:5′ATTTAT(T/C)TTTA3′有復(fù)制起始子的功能。B區(qū):約80bp,含B1,B2,B3三個區(qū)。B3:ABF1(ARS-bindingfactor1)結(jié)合區(qū)ABF14真核生物DNA末端的復(fù)制
(1)端粒DNATTGGGG(T2G4)序列高度重復(fù)的末端
5’TTGGGGTTGGGGTTGGGGTTGGGG3’(富含G鏈)
3’AACCCCAACCCCAACCCC5’(富含C鏈)
(2)端粒酶:首先在四膜蟲中發(fā)現(xiàn)端粒酶:特殊的反轉(zhuǎn)錄酶,由蛋白質(zhì)和RNA組成。端粒酶以自身攜帶的150bp的RNA為模板,在隨從鏈模板DNA的3′OH末端延長DNA,再以這種延長的DNA為模板,繼續(xù)合成隨從鏈。Greider和Blackburn(1989),1)端粒酶與端粒DNA結(jié)合,端粒酶中的RNA與凸出的3’引物配對;2)以RNA為模板,在3’端上從頭合成六個Nt;3)合成一個重
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