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文檔簡介
法獲取目的基因演示文稿現(xiàn)在是1頁\一共有21頁\編輯于星期五(優(yōu)選)法獲取目的基因現(xiàn)在是2頁\一共有21頁\編輯于星期五PCR技術(shù)的定義及其發(fā)展歷史PCR技術(shù)的原理PCR的反應(yīng)體系和條件PCR法獲取目的基因PCR技術(shù)的未來展望現(xiàn)在是3頁\一共有21頁\編輯于星期五PCR技術(shù)多聚酶鏈式反應(yīng)
(PolymeraseChainReaction)
PCR技術(shù)即多聚酶鏈式反應(yīng),又稱聚合酶鏈式反應(yīng)。是一種選擇性體外擴增DNA或RNA的方法。
在生物學(xué)實驗中做為基礎(chǔ)存在,可以說是現(xiàn)代分子生物學(xué)研究中最重要的技術(shù)。
現(xiàn)在是4頁\一共有21頁\編輯于星期五一、PCR技術(shù)的創(chuàng)建1.Khorana等1971年提出在體外經(jīng)DNA變性、與適當引物雜交、再用DNA聚合酶延伸,克隆DNA的設(shè)想。2.1983年,Mullis發(fā)明了PCR技術(shù),使Khorana的設(shè)想得到實現(xiàn)。3.1988年Saiki等將耐熱DNA聚合酶(Taq)引入了PCR技術(shù)。
4.1988年,第一臺PCR儀問世。5.1989年美國《Science》雜志比喻1989年為PCR爆炸年,Mullis榮獲1993年度諾貝爾化學(xué)獎?,F(xiàn)在是5頁\一共有21頁\編輯于星期五二、PCR技術(shù)的原理
1.PCR技術(shù)在微量離心管中,加入適量的緩沖液,微量的模板DNA,四種脫氧核苷酸,耐熱性DNA聚合酶,一對合成DNA的引物,通過高溫變性、低溫退火和中溫延伸三個階段的循環(huán)合成DNA,每一次循環(huán)使特異區(qū)段的基因拷貝數(shù)放大一倍。一般樣品經(jīng)過30次循環(huán),可使基因的拷貝數(shù)達到數(shù)百萬。現(xiàn)在是6頁\一共有21頁\編輯于星期五
PCR原理
(1)類似于DNA的天然復(fù)制過程,其特異性依賴于寡核苷酸引物的存在
(3)重復(fù)“變性--退火--延伸”的循環(huán),可獲得大量的新DNA鏈,而且這種新鏈又可成為下次循環(huán)的模板,從而指數(shù)級地獲得大量DNA產(chǎn)物,數(shù)小時內(nèi)可使目的基因的數(shù)量擴增數(shù)百萬倍。(2)PCR過程:由變性—復(fù)性(退火)--延伸三個基本反應(yīng)步驟構(gòu)成①變性:94℃左右,使雙鏈DNA模板解離成為單鏈;②復(fù)性:55℃左右,引物與模板DNA單鏈互補配對結(jié)合;③延伸:72℃左右,“模板-引物結(jié)合物”在DNA聚合酶作用下,以dNTP為原料,以靶序列為模板,按堿基配對與半保留復(fù)制原理,合成新的DNA鏈現(xiàn)在是7頁\一共有21頁\編輯于星期五2.PCR技術(shù)的特點1)速度快,靈敏度高:經(jīng)過30輪循環(huán),理論上目的產(chǎn)物的擴增量達230個拷貝(109拷貝)。2)特異性:引物的序列及其與模板結(jié)合的特異性是決定PCR反應(yīng)結(jié)果的關(guān)鍵;引物設(shè)計的最大原則是最大限度地提高擴增效率和特異性,同時盡可能減少非特異性擴增。3)操作簡便易行:只需要數(shù)小時就可以用電泳法檢出1μg基因組DNA中僅含數(shù)個拷貝的模板序列?,F(xiàn)在是8頁\一共有21頁\編輯于星期五三、PCR的反應(yīng)體系和基本步驟H2O
35μL10×PCR反應(yīng)緩沖液
5μL25mmol/LMgCl2
4μL4種dNTP
4μL上游引物(引物1)
0.5μL下游引物(引物2)
0.5μL模板DNA
(約1ng)
0.5μLTaq酶0.5μL
1.反應(yīng)體系組成成分(總體積:50L)現(xiàn)在是9頁\一共有21頁\編輯于星期五模板DNAdNTP引物BufferMg2+預(yù)變性模板DNAdNTP引物BufferMg2+TaqDNA聚合酶94℃5min2.基本程序PCR排管現(xiàn)在是10頁\一共有21頁\編輯于星期五Taq酶模板DNAdNTP引物BufferMg2+
循環(huán)儀94℃55℃72℃72℃5~7min循環(huán)25~35次擴增出的目標基因現(xiàn)在是11頁\一共有21頁\編輯于星期五瓊脂糖凝膠電泳轉(zhuǎn)移點樣進行電泳擴增出的目的基因現(xiàn)在是12頁\一共有21頁\編輯于星期五3.PCR反應(yīng)條件循環(huán)參數(shù)(1)預(yù)變性:94℃5min(2)變性:94℃20s-45s使雙鏈DNA解鏈為單鏈(3)退火:溫度由引物的解鏈溫度Tm決定,時間45s左右。增加溫度能減少引物與模板的非特異性結(jié)合;降低溫度可增加反應(yīng)的靈敏性。(4)延伸:一般為72℃,時間由擴增片段長度決定。(5)循環(huán)次數(shù):主要取決于模板DNA的濃度,一般為25-35次次數(shù)過多,導(dǎo)致擴增效率降低,錯誤摻入率增加。到達平臺期所需循環(huán)次數(shù)取決于樣品中模板的拷貝數(shù)。(6)延伸補齊:72℃5min—10min現(xiàn)在是13頁\一共有21頁\編輯于星期五PCR技術(shù)的注意事項1.合理分隔實驗室將樣品的處理、配制PCR反應(yīng)液、PCR循環(huán)擴增及PCR產(chǎn)物的鑒定等步驟分區(qū)或分室進行,特別注意樣本處理及PCR產(chǎn)物的鑒定應(yīng)與其他步驟嚴格分開。2.吸樣槍由于操作時不慎將樣品或模板核酸吸入槍內(nèi)或粘上槍頭是一個嚴重的污染源,因而加樣或吸取模板核酸時要十分小心,吸樣要慢,吸樣時盡量一次性完成,忌多次抽吸,以免交叉污染或產(chǎn)生氣溶膠污染。3.試劑分裝所有的PCR試劑都應(yīng)小量分裝,-20℃保存,以減少重復(fù)加樣次數(shù),避免污染機會。另外,PCR試劑和PCR反應(yīng)液應(yīng)與樣品及PCR產(chǎn)物分開保存。4.防止操作人員污染一次性手套、吸頭、小離心管應(yīng)一次性使用。現(xiàn)在是14頁\一共有21頁\編輯于星期五四、PCR法獲取目的基因現(xiàn)在是15頁\一共有21頁\編輯于星期五由TaqDNA聚合酶擴增的PCR產(chǎn)物中,其3’末端總是會帶有一個非模板依賴型的突出堿基,而且這個堿基幾乎總是A,因為TaqDNA聚合酶對dATP具有優(yōu)先聚合活性。由于該突出堿基的存在,克隆時可以使用T載體克隆目的基因。1.T載體克隆PCR獲取的目的基因現(xiàn)在是16頁\一共有21頁\編輯于星期五具有3‘-5’外切酶活性的DNA聚合酶(如pfu聚合酶),其擴增的PCR產(chǎn)物是平末端,要對這種平末端的PCR產(chǎn)物進行克隆,應(yīng)首先對PCR產(chǎn)物的3‘末端進行加A的工作。工作程序如下方案一膠回收平末端PCR產(chǎn)物,進入5μl10×TagDNAPolymeraseBuffer、4種dNTP或dATP(終濃度為200nM)、2.5UTagDNAPolymerase,加水至終反應(yīng)體積為50μl,72℃保溫10min,純化PCR片段后進行TA克隆方案二PCR反應(yīng)(50μl反應(yīng)體積)結(jié)束以后,加入1μl20mMdATP和2.5U的Tag酶,72℃保溫10min,然后進行直接進行TA克隆現(xiàn)在是17頁\一共有21頁\編輯于星期五2.設(shè)計酶切位點克隆PCR獲取的目的基因3’5’限制性內(nèi)切酶的識別序列目的基因的PCR片段3’5’限制性內(nèi)切酶的識別序列經(jīng)限制酶切割得到的具有粘性末端的線性載體經(jīng)限制酶切割得到粘性末端體外連接獲得目的基因的克隆現(xiàn)在是18頁\一共有21頁\編輯于星期五1、不對稱PCR2、反向PCR(reversePCR)3、多重PCR(復(fù)合PCR)4、LP-PCR(Labelledprimers)5、錨定PCR(anchoredPCR,A-PCR)6、PCR固相分析法7、原位PCR8、反轉(zhuǎn)錄PCR(RT-PCR)9、
熒光定量PCR(real-timePCR)
五、PCR的類型現(xiàn)在是19頁\一共有21頁\編輯于星期五熒光定位PCR技術(shù)(FQ-PCR)FQ-PCR的工作原理是利用Taq酶的5′→3′外切酶活性,在PCR反應(yīng)系統(tǒng)中加入一個熒光標記的探針。該探針可與引物包含序列內(nèi)的DNA模板發(fā)生特異性雜交,探針的5′端標以熒光報告基團,靠近3′端標以熒光淬滅基團,兩者之間構(gòu)成能量傳遞結(jié)構(gòu)。當PCR反應(yīng)每復(fù)制一個特異核酸片段,就有一個探針被切斷,伴隨一個熒光信號的釋放。由于被釋放的熒光基團數(shù)目和PCR產(chǎn)物是一對一的關(guān)系,因此用熒光檢測技術(shù)檢測出的熒光信號有無或強弱,即代表擴增產(chǎn)物有無或多少。由于熒光信號是代表擴增產(chǎn)物的有效特異信號,實現(xiàn)了儀器實時檢測,為新的PCR定量原理創(chuàng)造了條件。現(xiàn)在是20頁\一共有21頁\編輯于星期五PCR技術(shù)的應(yīng)用舉例:研究:基因克?。籇NA測序;分析突變;基因重組與融合;鑒定與調(diào)控蛋白質(zhì)結(jié)合DNA序列;轉(zhuǎn)座子插入位點的繪圖;檢測基因的修飾;人類基因組工程:用散布重復(fù)序列產(chǎn)生DNA標志
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