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文檔簡介
生存分析前言一些醫(yī)學(xué)事件所經(jīng)歷的時間:從開始觀察到事件發(fā)生的時間,不是短期內(nèi)可以明確判斷的乳腺癌病人術(shù)后生存時間幼兒乳牙萌出的時間白血病病人化療后緩解持續(xù)的時間兩種方法治療某慢性病產(chǎn)生療效的時間針對這類生存資料的分析方法:生存分析生存分析(survivalanalysis)是將事件的結(jié)果(終點事件)和出現(xiàn)這一結(jié)果所經(jīng)歷的時間結(jié)合起來分析的一種統(tǒng)計分析方法。生存分析不同于其它多因素分析的主要區(qū)別點就是生存分析考慮了每個觀測出現(xiàn)某一結(jié)局的時間長短。生存時間的定義
病例隨訪研究是一種前瞻性調(diào)查。從一明確規(guī)定的起點開始,例如自診斷治療日起,隨訪到另一明確規(guī)定的終點事件,如死亡或復(fù)發(fā)等發(fā)生為止,其間經(jīng)歷的這段時間稱生存時間。生存時間的長短是衡量慢性病療效的重要依據(jù)。生存時間起點時間——動物試驗可將所有受試者在同一時間開始試驗觀察。而對臨床試驗,對象是所研究的某病患者,病人是陸續(xù)來醫(yī)院就診,診斷、治療不可能同一時間開始觀察。因此對病例隨訪觀察時間的起點,在試驗設(shè)計時要有明確的、統(tǒng)一的規(guī)定,使先后進入研究觀察的時間起點,都保持一致。生存時間終點事件——在臨床試驗中的終點事件也必須有明確統(tǒng)一的定義,一般指死亡或復(fù)發(fā)。但死亡必須是所研究疾病的死亡,由于其它疾病或原因的死亡,不能作為本研究的終點事件。生存數(shù)據(jù)的特征生存時間一般都是正偏態(tài)分布含有終檢數(shù)據(jù)(censoreddata)或稱截尾數(shù)據(jù)能夠提供確切生存時間的數(shù)據(jù)稱為完全觀察。未觀察到規(guī)定的終點事件,因而不能提供確切的生存時間,稱為終檢觀察,所觀察的時間數(shù)據(jù)并非生存時間,稱為終檢值。截尾原因:失訪、死于其它疾病、觀察結(jié)束時病人尚存活等。估計:Kaplan-Meier法,壽命表法比較:log-rank檢驗影響因素分析:Cox比例風險回歸模型(Cox回歸模型),是生存分析中最重要的模型之一。預(yù)測:Cox回歸模型預(yù)測生存率。生存資料分析方法隨訪觀察所得到的這些時間數(shù)據(jù)是隨機變異的。也是隨機變量,形成一個生存時間的分布。一般用T表示生存時間的隨機變量。生存時間T的分布,通常用生存函數(shù)(survivalfunction)S(t)來描述其特征。生存函數(shù)的定義生存函數(shù)S(t)是指一個個體生存時間等于或長于t的概率,即(7-1)當數(shù)據(jù)中沒有終檢值時,生存函數(shù)是由生存時間等于或長于t的病人數(shù)占病人總數(shù)的比例來估計。
S(t)是時間t的非增函數(shù),有下列特性:當t=0時S(t)=1
即S(0)=1當t=時
S(t)=0即S()=0(7-2)生存率計算方法:
1、S(t)=t時刻仍存活的例數(shù)/觀察總例數(shù)
2、S(t)=P1·P2·P3···例如:手術(shù)治療50例肺癌病人,術(shù)后1,2,3年的死亡數(shù)分別為10,10,10例,求各年的生存概率和3
年生存率。
P1=(50-10)/50=0.800P2=(40-10)/40=0.750P3=(30-10)/30=0.6673年生存率S(3)=(50-10-10-10)/50=0.400=0.800×0.750×0.667=0.40015i(!)ti(2)di(3)ni(4)(5)123456745681011121113211109874210.90.80.70.40.20.10.0臨床試驗10例肺癌病人隨訪至死,生存時間及S(t)的估計見下表(1)當數(shù)據(jù)中沒有終檢值時,可用式(7.2)得到生存函數(shù)的估計量。生存函數(shù)的乘積極限估計量(product-limit)簡稱PL估計量,也稱Kaplan-Meier估計量,由統(tǒng)計學(xué)家Kaplan和Meier于1958年首先提出的
原理:概率乘法原理適用:主要是小樣本。
(2)當數(shù)據(jù)中有終檢值時,應(yīng)采用PL法對S(t)進行估計。例7-2表7-2為急性白血病患者兩種療法各21例的生存時間的隨訪記錄(單位:周)表7-2急性白血病患者兩種療法各的生存時間(周)A療法(6-MP)6666+79+1010+11+1316
17+19+20+222325+32+32+34+35+B療法(安慰劑)11223445588881111121215172223例7-2A療法的生存函數(shù)估計i(!)ti(2)di(3)wi(4)ni(5)Pi(6)S(t)(7)123456767101316222335+31111111120304121171512117610.8570.9410.9330.9170.9090.8570.8330.8570.8070.7530.6900.6270.5380.448生存曲線(survivalcurve)以觀察(隨訪)時間為橫軸,以生存率為縱軸,將各個時間點所對應(yīng)的生存率連接在一起的曲線圖。生存曲線是一條下降的曲線,分析時應(yīng)注意曲線的高度和下降的坡度。平緩的生存曲線表示高生存率或較長生存期,陡峭的生存曲線表示低生存率或較短生存期。生存函數(shù)的積極限估計量
例7-2
兩種療法的生存曲線見圖7-3。當最后一個數(shù)據(jù)為非終檢值時,如B療法t=23,生存函數(shù)估計量S(23十0)=0,與t軸重合,可定義到t=。當最后一個數(shù)為終檢值時,如A療法,t=35+,則,只能定義到t=35,生存曲線只能畫到t=35。
中位生存期中位生存期(mediansurvivaltime)又稱半數(shù)生存期,表示恰好有50%的個體尚存活的時間。中位生存期越長,表示疾病的預(yù)后越好;中位生存期越短,預(yù)后越差。估計中位生存期常用圖解法或線性內(nèi)插法。兩生存分布比較在醫(yī)學(xué)研究中,常需對兩個生存分布進行比較,如例7-2,比較A及B療法的生存時間的長短,以便得出何種療法較好的結(jié)論。從生存曲線上可看出A療法比B療法好。也可從中數(shù)生存時間上比較,A療法Md=23周;B療法Md=8周,也是A療法好。但這是由兩樣本得到的結(jié)果,可能受抽樣誤差的影響,所以必須進行兩生存分布比較的假設(shè)檢驗。兩生存分布比較的非參數(shù)法Gehan比分法logrank簡化法Mantel-Haenszel’s檢驗
檢驗假設(shè)為
H0:兩組生存期相等
H1:兩種生存期不相等
α=0.05
Gehan比分法
此檢驗是wilcoxon秩和檢驗在有終檢值時的推廣?;舅枷耄簩⑸鏁r間的數(shù)據(jù)作變量置換,成為比分,生存時間ti愈長,比分Ui愈大,這是由于生存時間ti愈長,則能確定比ti時點早死亡的總例數(shù)R1i愈大而比ti晚死亡的總例數(shù)R2i愈小,則Ui=R1i—R2i愈大。反之ti愈小則Ui愈小。置換后,用比分代替原始數(shù)據(jù),進行兩樣本均數(shù)的比較。作置換后,比分近似正態(tài)分布,而任一樣本比分和的絕對值
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