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文檔簡介

●基本概念●轉(zhuǎn)錄機(jī)器的主要成分——RNA聚合酶、啟動子、增強(qiáng)子、轉(zhuǎn)錄因子●轉(zhuǎn)錄的基本過程●轉(zhuǎn)錄后加工●原核生物與真核生物mRNA的特征比較Contents現(xiàn)在是1頁\一共有106頁\編輯于星期四是指生物基因組中結(jié)構(gòu)基因所攜帶的遺傳信息經(jīng)過轉(zhuǎn)錄、翻譯等一系列過程,合成特定的蛋白質(zhì),進(jìn)而發(fā)揮其特定的生物學(xué)功能和生物學(xué)效應(yīng)的全過程。但對于rRNA、tRNA編碼基因來說,基因表達(dá)就是轉(zhuǎn)錄生成RNA的過程。一、基本概念基因表達(dá)(geneexpression)現(xiàn)在是2頁\一共有106頁\編輯于星期四生物體以DNA為模板合成RNA的過程。轉(zhuǎn)錄RNADNA

轉(zhuǎn)錄(transcription):現(xiàn)在是3頁\一共有106頁\編輯于星期四參與轉(zhuǎn)錄的物質(zhì)原料:NTP(ATP,UTP,GTP,CTP)模板:DNA酶:RNA聚合酶其他蛋白質(zhì)因子RNA合成方向:5'3'現(xiàn)在是4頁\一共有106頁\編輯于星期四轉(zhuǎn)錄的不對稱性:

(1)在RNA的合成中,DNA的二條鏈中僅有一條鏈可作為轉(zhuǎn)錄的模板,另一股鏈不轉(zhuǎn)錄。

⑵模板鏈或編碼鏈并非永遠(yuǎn)在同一條單鏈上。編碼鏈與模板鏈:與mRNA序列相同的那條DNA鏈稱為編碼鏈;將另一條根據(jù)堿基互補(bǔ)原則指導(dǎo)mRNA合成的DNA鏈稱為模板鏈?,F(xiàn)在是5頁\一共有106頁\編輯于星期四模板鏈或編碼鏈并非永遠(yuǎn)在同一條單鏈上。轉(zhuǎn)錄方向5335模板鏈編碼鏈編碼鏈模板鏈轉(zhuǎn)錄方向DNA分子上轉(zhuǎn)錄出RNA的區(qū)段,稱為結(jié)構(gòu)基因。結(jié)構(gòu)基因:現(xiàn)在是6頁\一共有106頁\編輯于星期四5′……GCAGTACATGTC……3′3′……cgtcatgtacag……5′5′……GCAGUACAUGUC……3′N……Ala·Val·His·Val……CDNA轉(zhuǎn)錄mRNA翻譯肽DNA模板、轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物mRNA

和氨基酸序列之間的關(guān)系編碼鏈模板鏈}現(xiàn)在是7頁\一共有106頁\編輯于星期四●基本概念●轉(zhuǎn)錄機(jī)器的主要成分———

RNA聚合酶、啟動子、增強(qiáng)子、轉(zhuǎn)錄因子●轉(zhuǎn)錄的基本過程●轉(zhuǎn)錄后加工●原核生物與真核生物mRNA的特征比較Contents現(xiàn)在是8頁\一共有106頁\編輯于星期四

轉(zhuǎn)錄酶(transcriptase)即為RNA聚合酶,是依

賴DNA的RNA聚合酶(DNAdependentRNApolymerase,RNA-pol)。

大腸桿菌(E.coli)的RNA聚合酶是由5種亞基α、β、β′、ω和σ(sigma)組成的六聚體蛋白質(zhì),分子量為4.65KD。α2ββ′

ω合稱為核心酶(coreenzyme),在試管內(nèi)能催化NTP聚合生成RNA。σ亞基加上核心酶(α2ββ′ωσ)稱為全酶(holoenzyme)。1、原核生物的RNA聚合酶(一)

RNA聚合酶二、轉(zhuǎn)錄機(jī)器的主要成分——

RNA聚合酶、啟動子、增強(qiáng)子、轉(zhuǎn)錄因子現(xiàn)在是9頁\一共有106頁\編輯于星期四現(xiàn)在是10頁\一共有106頁\編輯于星期四核心酶(coreenzyme)全酶(holoenzyme)ωω現(xiàn)在是11頁\一共有106頁\編輯于星期四大腸桿菌RNA聚合酶的組成分析亞基基因相對分子量亞基數(shù)組分功能αrpoA365002核心酶核心酶組裝,啟動子識別βrpoB1510001核心酶β和β'共同形成RNA合成的活性中心β'rpoC1550001核心酶ω?110001核心酶?σrpoD700001全酶存在多種σ因子,用于識別不同的啟動子現(xiàn)在是12頁\一共有106頁\編輯于星期四2、真核生物RNA聚合酶酶位置轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物相對活性對α-鵝膏蕈堿的敏感性RNA聚合酶Ⅰ核仁rRNA50-70%不敏感RNA聚合酶Ⅱ核質(zhì)hnRNA20-40%敏感RNA聚合酶Ⅲ核質(zhì)tRNA5SRNAsnRNA約10%存在物種特異性真核細(xì)胞的三種RNA聚合酶特征比較現(xiàn)在是13頁\一共有106頁\編輯于星期四RNA聚合酶與DNA聚合酶的區(qū)別RNA聚合酶DNA聚合酶大小(M)大,4.8×105小,1.09×105引物無有產(chǎn)物較短,游離較長,與模板以氫鍵相連作用方式一條鏈的某一段兩條鏈同時進(jìn)行外切酶活性無5’3’,3’5’校對合成能力無有修復(fù)能力無有現(xiàn)在是14頁\一共有106頁\編輯于星期四(二)啟動子(promoter)啟動子定義:指能被RNA聚合酶識別、結(jié)合并啟動基因轉(zhuǎn)錄的一段DNA序列。現(xiàn)在是15頁\一共有106頁\編輯于星期四RNA聚合酶保護(hù)法41-44bp1、原核生物啟動子結(jié)構(gòu)現(xiàn)在是16頁\一共有106頁\編輯于星期四開始轉(zhuǎn)錄TTGACAAACTGT-35區(qū)(Pribnowbox)TATAATPuATATTAPy-10區(qū)1-30-5010-10-40-205335原核生物啟動子保守序列RNA-pol辨認(rèn)位點(recognitionsite)55RNA聚合酶保護(hù)區(qū)結(jié)構(gòu)基因33現(xiàn)在是17頁\一共有106頁\編輯于星期四模板鏈AACTGTATATTATTGACATATAAT3’5’DNA轉(zhuǎn)錄起始點Probnow盒子啟動子35

10

+1轉(zhuǎn)錄區(qū)5’3’RNA轉(zhuǎn)錄起始點與新生RNA鏈第一個核甘酸相對應(yīng)DNA鏈上的堿基。編碼鏈現(xiàn)在是18頁\一共有106頁\編輯于星期四

-35區(qū):TTGACA保守序列(Sextamabox)。是RNA聚合酶全酶對轉(zhuǎn)錄起始的辨認(rèn)位點(recognition)-10區(qū):TATAAT保守序列(PribnowBox)。

是RNA聚合酶的緊密結(jié)合位點(富含AT堿基,有利于雙鏈打開)現(xiàn)在是19頁\一共有106頁\編輯于星期四大腸桿菌RNA聚合酶全酶所識別的啟動子區(qū)T85T83G81A61C69A52T89A89T50A65A100現(xiàn)在是20頁\一共有106頁\編輯于星期四原核生物典型啟動子的結(jié)構(gòu)

-35-10轉(zhuǎn)錄起點TTGACA16-19bpTATAAT5-9bp-10區(qū)與-35區(qū)的最佳間距現(xiàn)在是21頁\一共有106頁\編輯于星期四Pribnow框與Sextama框之間的堿基序列并不重要,但兩個序列之間的距離十分重要;天然啟動子這段距離多為16~19bp,距離的大小可能是決定啟動子強(qiáng)度的因素之一。實驗表明:兩個序列之間的距離為17bp時,轉(zhuǎn)錄效率最高。啟動子上升突變,提高轉(zhuǎn)錄活性;啟動子下降突變,降低轉(zhuǎn)錄水平。

細(xì)菌中常見兩種啟動子突變:現(xiàn)在是22頁\一共有106頁\編輯于星期四2、真核生物啟動子真核生物有三種不同的啟動子和有關(guān)的元件。啟動子Ⅱ最為復(fù)雜,它和原核的啟動子有很多不同現(xiàn)在是23頁\一共有106頁\編輯于星期四真核生物啟動子的結(jié)構(gòu)核心啟動子(corepromoter)上游啟動子元件(upstreampromoterelement,UPE)現(xiàn)在是24頁\一共有106頁\編輯于星期四(1)核心啟動子●定義:指保證RNA聚合酶Ⅱ轉(zhuǎn)錄正常起始所必需的、最少的DNA序列,包括轉(zhuǎn)錄起始位點及轉(zhuǎn)錄起始位點上游TATA區(qū).●作用:選擇正確的轉(zhuǎn)錄起始位點,保證精確起始TATA常在-25bp左右,相當(dāng)于原核的-10序列T85A97T93A85A63A83A50現(xiàn)在是25頁\一共有106頁\編輯于星期四現(xiàn)在是26頁\一共有106頁\編輯于星期四(2)上游啟動子元件●包括CAAT盒(CCAAT)和GC盒(GGGCGG)等●作用:控制轉(zhuǎn)錄起始頻率,基本不參與起始位點

的確定。尤其是CAAT區(qū)的影響最大。CAAT:-70—-80bpGGGCGGG:-80——-110bp現(xiàn)在是27頁\一共有106頁\編輯于星期四轉(zhuǎn)錄起始點TATA盒CAAT盒GC盒

增強(qiáng)子AATAAA切離加尾轉(zhuǎn)錄終止點修飾點外顯子翻譯起始點內(nèi)含子OCT-1OCT-1:ATTTGCAT八聚體真核生物RNApolⅡ轉(zhuǎn)錄的基因現(xiàn)在是28頁\一共有106頁\編輯于星期四SV40早期啟動子組蛋白H2BTATACAATGC現(xiàn)在是29頁\一共有106頁\編輯于星期四(三)轉(zhuǎn)錄起始復(fù)合物●原核生物轉(zhuǎn)錄起始復(fù)合物現(xiàn)在是30頁\一共有106頁\編輯于星期四

轉(zhuǎn)錄因子轉(zhuǎn)錄復(fù)合體TBPTAFsTFIIATFIIBTFIIFPolIITFIIE

RNApolⅡ的轉(zhuǎn)錄起始●真核生物轉(zhuǎn)錄起始復(fù)合物現(xiàn)在是31頁\一共有106頁\編輯于星期四真核細(xì)胞基本轉(zhuǎn)錄因子結(jié)構(gòu)與功能轉(zhuǎn)錄因子功能TFⅡD

與TATA盒結(jié)合,起始點固定TBP與TATA盒特異結(jié)合TAF決定啟動子和RNApol特異性TFⅡA穩(wěn)定TFⅡD與TATA間的相互作用TFⅡB起始點選擇,幫助其它因子進(jìn)入,與上游轉(zhuǎn)錄因子作用TFⅡF與RNApolⅡ結(jié)合,共同進(jìn)入起始復(fù)合物TFⅡE與polⅡ相互作用,協(xié)助TFⅡH的作用TFⅡH蛋白激酶活性,解鏈酶及ATP酶活性TFⅡJ功能不清楚現(xiàn)在是32頁\一共有106頁\編輯于星期四現(xiàn)在是33頁\一共有106頁\編輯于星期四能結(jié)合反式作用因子,決定基因的時間和空間特異性表達(dá),增強(qiáng)啟動子轉(zhuǎn)錄活性的DNA序列。

增強(qiáng)子作用特點:⑴遠(yuǎn)距離效應(yīng):一般位于-200bp處。⑴無方向性:增強(qiáng)子無論位于基因的上游、下游或

或內(nèi)部都有增強(qiáng)轉(zhuǎn)錄的作用。⑵順式調(diào)節(jié):只調(diào)節(jié)位于同一染色體上的靶基因。⑶無物種和基因的特異性。⑷具有嚴(yán)密的組織或細(xì)胞特異性。⑸具有相位性:其作用與DNA的構(gòu)象有關(guān)。⑹許多增強(qiáng)子受外部信號的調(diào)控。(四)增強(qiáng)子現(xiàn)在是34頁\一共有106頁\編輯于星期四●基本概念●轉(zhuǎn)錄機(jī)器的主要成分———

RNA聚合酶、啟動子、增強(qiáng)子、轉(zhuǎn)錄因子●轉(zhuǎn)錄的基本過程●轉(zhuǎn)錄后加工●原核生物與真核生物mRNA的特征比較Contents現(xiàn)在是35頁\一共有106頁\編輯于星期四三、轉(zhuǎn)錄的基本過程1、模板(起始位點)的識別:RNA聚合酶與啟動子DNA雙鏈相互作用并與

之相結(jié)合的過程。轉(zhuǎn)錄分四個階段:

模板的識別、轉(zhuǎn)錄起始、轉(zhuǎn)錄延伸、轉(zhuǎn)錄終止現(xiàn)在是36頁\一共有106頁\編輯于星期四(4)

-10區(qū)DNA雙鏈解開12~17bp,形成開放的

二元啟動子復(fù)合物(模板-酶)。

(2)RNA聚合酶全酶(2ω)與模板-35序列結(jié)合,形成閉合的二元閉合啟動子復(fù)合物。(1)因子辨認(rèn)轉(zhuǎn)錄起始點(-35區(qū)的TTGACA序列)(3)RNA聚合酶向-10區(qū)轉(zhuǎn)移,并與之牢固結(jié)合。2、轉(zhuǎn)錄起始現(xiàn)在是37頁\一共有106頁\編輯于星期四RNApol(2)-DNA-pppGpN-OH3轉(zhuǎn)錄起始復(fù)合物:5-pppG-OH+

NTP

5-pppGpN

-OH3+ppi(5)在RNA聚合酶β亞基催化下形成第一個磷酸二酯鍵,形成三元復(fù)合物(模板-酶-RNA)。(6)當(dāng)三元復(fù)合物中RNA長達(dá)9個核苷酸以上時,

因子從全酶解離下來,進(jìn)入延長階段?,F(xiàn)在是38頁\一共有106頁\編輯于星期四現(xiàn)在是39頁\一共有106頁\編輯于星期四(1)亞基脫落,RNA–pol聚合酶核心酶變構(gòu),與模板結(jié)合松弛,沿著DNA模板前移;

(2)在核心酶作用下,NTP不斷聚合,RNA鏈不斷延長。(NMP)n

+NTP(NMP)n+1

+PPi(3)堿基配對原則:A-U,T-A,G-C(4)

延長中的轉(zhuǎn)錄復(fù)合物也叫轉(zhuǎn)錄空泡。隨著RNA

聚合酶前移,轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物RNA不斷移出轉(zhuǎn)錄空泡,已轉(zhuǎn)錄完畢的DNA雙鏈又重新復(fù)合而不再打開。(5)原核生物的轉(zhuǎn)錄和翻譯偶聯(lián)進(jìn)行。3、RNA鏈的延伸現(xiàn)在是40頁\一共有106頁\編輯于星期四轉(zhuǎn)錄空泡(transcriptionbubble):RNA-pol(核心酶)

····DNA····RNA現(xiàn)在是41頁\一共有106頁\編輯于星期四現(xiàn)在是42頁\一共有106頁\編輯于星期四53DNA原核生物轉(zhuǎn)錄過程中的羽毛狀現(xiàn)象核糖體RNARNA聚合酶現(xiàn)在是43頁\一共有106頁\編輯于星期四4、轉(zhuǎn)錄終止指RNA聚合酶在DNA模板上停頓下來不再前進(jìn),轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物RNA鏈從轉(zhuǎn)錄復(fù)合物上脫落下來。(1)不依賴Rho因子的轉(zhuǎn)錄終止-強(qiáng)終止子(2)依賴ρ因子的轉(zhuǎn)錄終止-弱終止子分類:現(xiàn)在是44頁\一共有106頁\編輯于星期四終止子(terminator,t)

●強(qiáng)終止子-內(nèi)部終止子(不依賴ρ因子)

●弱終止子-需要ρ因子(rhofactor)又稱為ρ依賴性終止子(Rho-dependentterminator)現(xiàn)在是45頁\一共有106頁\編輯于星期四轉(zhuǎn)錄方向3′3′5′TCGGGCGAGCCCGCCGCCCGAGCGGGCTAAAAAATTTTTT3′3′5′5′DNA模板鏈編碼鏈AAAAAAUUUUUU5′CGCCCGAGCGGGCU5′TTTTTTDNA模板鏈編碼鏈轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物3′

不依賴ρ因子的終止子現(xiàn)在是46頁\一共有106頁\編輯于星期四不依賴因子的終止終止位點上游一般存在一個富含GC堿基的反向重復(fù)序列,轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物RNA形成發(fā)夾結(jié)構(gòu);在終止位點前面有一段由4-8個A組成的序列,RNA的3’端為寡聚U現(xiàn)在是47頁\一共有106頁\編輯于星期四發(fā)夾式結(jié)構(gòu)和寡聚U的共同作用使RNA從三元復(fù)合物中解離出來?,F(xiàn)在是48頁\一共有106頁\編輯于星期四終止效率與反向重復(fù)序列和寡聚U的長短有關(guān),長度效率現(xiàn)在是49頁\一共有106頁\編輯于星期四依賴因子的轉(zhuǎn)錄終止因子:六聚體蛋白、水解各種核甘三磷酸促使新生RNA鏈從三元轉(zhuǎn)錄復(fù)合物中解離出來,從而終止轉(zhuǎn)錄?,F(xiàn)在是50頁\一共有106頁\編輯于星期四現(xiàn)在是51頁\一共有106頁\編輯于星期四轉(zhuǎn)錄的基本過程現(xiàn)在是52頁\一共有106頁\編輯于星期四

轉(zhuǎn)錄與復(fù)制的相似之處:⑴都以DNA為模板;⑵都需依賴DNA的聚合酶;⑶聚合過程都是核苷酸之間生成磷酸二酯鍵;⑷都從5′→3′方向延伸成新鏈多聚核苷酸;⑸都遵從堿基配對規(guī)律。但轉(zhuǎn)錄忠實性要低于DNA復(fù)制。

現(xiàn)在是53頁\一共有106頁\編輯于星期四轉(zhuǎn)錄和復(fù)制的區(qū)別復(fù)制轉(zhuǎn)錄模板兩股鏈均復(fù)制模板鏈轉(zhuǎn)錄(不對稱轉(zhuǎn)錄)原料dNTPNTP酶DNA聚合酶RNA聚合酶產(chǎn)物子代雙鏈DNA(半保留復(fù)制)mRNA,tRNA,rRNA配對A-T,G-CA-U,T-A,G-C引物需要RNA引物無現(xiàn)在是54頁\一共有106頁\編輯于星期四●基本概念●轉(zhuǎn)錄機(jī)器的主要成分———

RNA聚合酶、啟動子、增強(qiáng)子、轉(zhuǎn)錄因子●轉(zhuǎn)錄的基本過程●轉(zhuǎn)錄后加工●原核生物與真核生物mRNA的特征比較Contents現(xiàn)在是55頁\一共有106頁\編輯于星期四四、轉(zhuǎn)錄后加工現(xiàn)在是56頁\一共有106頁\編輯于星期四

原核細(xì)胞轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物特點:⑴原核細(xì)胞沒有核膜,轉(zhuǎn)錄和翻譯場所不是分開的。⑵mRNA的轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物不是前體的形式,其初級產(chǎn)物本身就具備活性,不必加工和運(yùn)輸就可執(zhí)行翻譯功能,且邊轉(zhuǎn)錄RNA邊翻譯蛋白質(zhì)。即轉(zhuǎn)錄和翻譯是緊密偶聯(lián)進(jìn)行的。⑶tRNA和rRNA的初級轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物仍為前體的形式,需經(jīng)過加工處理才能執(zhí)行各自的功能?,F(xiàn)在是57頁\一共有106頁\編輯于星期四

真核細(xì)胞轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物特點:⑴每種轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物都是各種RNA的前身,即無活性,亦無功能。⑵初級轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物必須在胞核內(nèi)經(jīng)過適當(dāng)加工,使之變成具有活性的成熟RNA后,由胞核運(yùn)至胞質(zhì)才能執(zhí)行翻譯功能。⑶真核細(xì)胞轉(zhuǎn)錄作用和翻譯作用無論在空間上還是時間上都是彼此分開進(jìn)行的。現(xiàn)在是58頁\一共有106頁\編輯于星期四tRNA前體RNApolⅢTGGCNNAGTGCGGTTCGANNCCDNA(一)tRNA前體的加工

真核tRNA基因大多成簇存在?,F(xiàn)在是59頁\一共有106頁\編輯于星期四現(xiàn)在是60頁\一共有106頁\編輯于星期四tRNA前體的加工反應(yīng)剪接去除內(nèi)含子

剪切作用——剪掉5′端前導(dǎo)序列:

添加或修飾3′端CCA序列某些堿基的化學(xué)修飾⑴甲基化:如A→mA,G→mG。⑵還原反應(yīng):尿嘧啶還原為雙氫尿嘧啶

(U→DHU)。⑶核苷內(nèi)的轉(zhuǎn)位反應(yīng):尿嘧啶核苷轉(zhuǎn)變?yōu)榧倌蜞奏ず塑?φ)。(N1-C1′→C5-C1′)⑷脫氨反應(yīng):腺苷酸脫氨成為次黃嘌呤核苷

(A→I)?,F(xiàn)在是61頁\一共有106頁\編輯于星期四(二)rRNA前體的加工

原核生物rRNA基因轉(zhuǎn)錄的初

級產(chǎn)物為30SrRNA。經(jīng)加工形成成熟的16SrRNA、23SrRNA、5SrRNA及tRNA分子。大腸桿菌共有7個轉(zhuǎn)錄單位,每個轉(zhuǎn)錄單位由16SrRNA、23SrRNA、5SrRNA及一個或幾個tRNA基因組成。

真核生物rRNA基因轉(zhuǎn)錄的初級產(chǎn)物為

48SrRNA。經(jīng)加工形成成熟的18SrRNA、

28SrRNA、5.8SrRNA。現(xiàn)在是62頁\一共有106頁\編輯于星期四大腸桿菌rRNA前體加工過程現(xiàn)在是63頁\一共有106頁\編輯于星期四18S5.8S28S18S-rRNA5.8S和28S-rRNA內(nèi)含子45S轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物剪接終產(chǎn)物rDNA基因間隔哺乳動物細(xì)胞rRNA前體加工過程現(xiàn)在是64頁\一共有106頁\編輯于星期四5’端加帽3’端加尾(polyA)mRNA的剪接RNA的編輯(三)真核生物mRNA前體的加工現(xiàn)在是65頁\一共有106頁\編輯于星期四5’端的第一個核苷酸總是7-甲基鳥嘌呤核苷三磷酸(m7Gppp)。mRNA5’端的這種結(jié)構(gòu)稱為帽子(cap)。1、在5’端加帽現(xiàn)在是66頁\一共有106頁\編輯于星期四m7Gppp鳥甘酸轉(zhuǎn)移酶現(xiàn)在是67頁\一共有106頁\編輯于星期四5′端加帽的作用:①保護(hù)mRNA,防止降解。因為RNA酶的5′→3′

外切酶活性不能裂解三磷酸連接。②增強(qiáng)mRNA的可翻譯性。帽結(jié)合蛋白首先識別和結(jié)合5′端帽子,促進(jìn)mRNA與核糖體結(jié)合。③促進(jìn)mRNA從細(xì)胞核運(yùn)輸?shù)郊?xì)胞漿。④增強(qiáng)mRNA的剪接效率。5′端帽子對于第一個外顯子的剪接非常重要?,F(xiàn)在是68頁\一共有106頁\編輯于星期四2、3’端加尾多聚腺苷酸尾巴AAUAAA:★準(zhǔn)確切割★加poly(A)現(xiàn)在是69頁\一共有106頁\編輯于星期四現(xiàn)在是70頁\一共有106頁\編輯于星期四3′端poly(A)的作用:①保護(hù)mRNA免于迅速降解;

提高了mRNA在細(xì)胞質(zhì)中的穩(wěn)定性。②促進(jìn)mRNA的翻譯效率。

除去poly(A)和poly(A)結(jié)合蛋白

(PABP)都會抑制翻譯的起始。現(xiàn)在是71頁\一共有106頁\編輯于星期四3、mRNA的剪接——剪去內(nèi)含子(P93)①5′端邊界序列為GU;5′端保守序列5′GUPuAGU②

3′端邊界序列為AG;③距3′端18-40個核苷酸處有一個“分支點”,一定含保守A﹡,A﹡發(fā)動第一次轉(zhuǎn)酯反應(yīng)。④

在3′端與“分子點”中間有一段富含嘧啶的區(qū)域。

核mRNA前體的剪接信號:

真核mRNA基因平均含有8-10個內(nèi)含子。多數(shù)核mRNA基因內(nèi)含子遵循GU-AG法則?,F(xiàn)在是72頁\一共有106頁\編輯于星期四現(xiàn)在是73頁\一共有106頁\編輯于星期四①snRNA種類:20多種,U族13種,其余為非U族。②U族snRNA特點:

尿嘧啶核苷酸占35%以上,故而得名;

5′端也有帽子結(jié)構(gòu)(m32,2,7G-或mPPPN-);二級結(jié)構(gòu)含有若干個發(fā)夾氏結(jié)構(gòu),極大保守;

剪接參與因素:snRNA與snRNPU族snRNA與蛋白結(jié)合構(gòu)成snRNP;

snRNP與hnRNA結(jié)合成為剪接體,進(jìn)行剪接;參與mRNA剪切的snRNP包括U1、U2

、U4

、U5

、U6剪接反應(yīng):現(xiàn)在是74頁\一共有106頁\編輯于星期四剪接過程CAG=UAG》AAG》GAG3′AG的剪接效率:現(xiàn)在是75頁\一共有106頁\編輯于星期四

5’..AAGUAAGU…….CURAY..(10-40)…(U/C)11NCAGG….3’IntronexonexonPolyprimidineCAG=UAG>AAG>GAG現(xiàn)在是76頁\一共有106頁\編輯于星期四生物體內(nèi)內(nèi)含子的主要類型:

GU-AG

細(xì)胞核pre-mRNA(真核)

AU-AC

細(xì)胞核pre-mRNA(真核)

Ⅰ類內(nèi)含子細(xì)胞核pre-rRNA(真核)

Ⅱ類內(nèi)含子線粒體和葉綠體pre-rRNA

Ⅲ類內(nèi)含子細(xì)胞器pre-mRNA

雙內(nèi)含子細(xì)胞器RNA

tRNA前體中的內(nèi)含子細(xì)胞核pre-tRNA

現(xiàn)在是77頁\一共有106頁\編輯于星期四Ⅰ類內(nèi)含子的自我剪接最終形成穩(wěn)定的線形產(chǎn)物L(fēng)-19,具有酶的活性和特征現(xiàn)在是78頁\一共有106頁\編輯于星期四Ⅱ類內(nèi)含子的自我剪接現(xiàn)在是79頁\一共有106頁\編輯于星期四現(xiàn)在是80頁\一共有106頁\編輯于星期四現(xiàn)在是81頁\一共有106頁\編輯于星期四4、RNA的編輯編輯(editing)是指轉(zhuǎn)錄后的RNA在編碼區(qū)發(fā)生堿基的突變、加入或丟失等現(xiàn)象。

近年發(fā)現(xiàn)某些mRNA前體的核苷酸序列需加以改編,才能變成正確的有翻譯活性的模板。

mRNA的這種編輯作用廣泛存在于原生動物及植物細(xì)胞的線粒體。

改編過程包括:在mRNA前體中插入、剔除或置換一些核苷酸?,F(xiàn)在是82頁\一共有106頁\編輯于星期四C變?yōu)閁堿基的突變現(xiàn)在是83頁\一共有106頁\編輯于星期四尿苷酸的缺失和添加在研究錐蟲線粒體mRNA轉(zhuǎn)錄加工時發(fā)現(xiàn)mRNA的多個編碼位置上加入或丟失尿苷酸,1990年在高等動物和病毒中也發(fā)現(xiàn)了編輯現(xiàn)象?,F(xiàn)在是84頁\一共有106頁\編輯于星期四錐蟲coxII基因的編輯現(xiàn)在是85頁\一共有106頁\編輯于星期四現(xiàn)在是86頁\一共有106頁\編輯于星期四RNA編輯的生物學(xué)意義:

校正作用;調(diào)控翻譯;如Apo-B基因在腸道的表達(dá)。擴(kuò)充遺傳信息:按照基因信息傳遞的理論,這種mRNA的編輯作用無疑是對傳統(tǒng)分子生物學(xué)原理的挑戰(zhàn)。RNA編輯的四種類型:①簡單編輯:單堿基的轉(zhuǎn)變;②插入編輯:插入單個核苷酸;③泛編輯:插入或丟失多個尿嘧啶核苷酸;④多聚腺嘌呤編輯:在轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物末端加A?,F(xiàn)在是87頁\一共有106頁\編輯于星期四RNA的再編碼:mRNA在某些情況下不是以固定的方式被翻譯,而可以改變原來的編碼信息,以不同的方式進(jìn)行翻譯。這種RNA編碼和讀碼方式的改變稱為RNA的再編碼。核糖體程序性+1/-1移位;核糖體跳躍;終止子通讀——硒代半胱氨酸、吡咯賴氨酸RNA的化學(xué)修飾現(xiàn)在是88頁\一共有106頁\編輯于星期四

核酶:具有催化功能的RNA分子。L-19具有酶的主要特征:專一性強(qiáng),加快反應(yīng)速度,反應(yīng)前后酶分子保持不變,這種由

RNA構(gòu)成的酶稱之為核酶。

核酶首先是美國Colorado大學(xué)Cech在研究四膜蟲rRNA剪接機(jī)制時發(fā)現(xiàn)的(1982年)。他一方面證明了四膜蟲rRNA的剪接機(jī)制;另一方面證明了L-19分子的催化活性。

繼而在1983年,耶魯大學(xué)SidneyAltamn

發(fā)現(xiàn)了第二個核酶,參與tRNA前體加工的

RNaseP。1992年,加州大學(xué)的HarryNoller

又證明了核糖體大亞基rRNA的催化活性?,F(xiàn)在是89頁\一共有106頁\編輯于星期四

核酶研究的意義核酶的發(fā)現(xiàn),對中心法則作了重要修正;核酶的發(fā)現(xiàn)是對傳統(tǒng)酶學(xué)的挑戰(zhàn);為基因治療提供了新的策略;為生命起源的研究提供了新思路。核酶分類:

剪切型核酶:如RNaseP

剪接型核酶:Ⅰ類和Ⅱ類內(nèi)含子現(xiàn)在是90頁\一共有106頁\編輯于星期四RNA在生物進(jìn)化中的地位:1、RNA比相應(yīng)DNA序列含有更多的遺傳信息;2、RNA是獲得性遺傳的分子基礎(chǔ)。DNA是信息分子蛋白質(zhì)是功能分子RNA既是信息分子,又是功能分子3類生物大分子現(xiàn)在是91頁\一共有106頁\編輯于星期四●基本概念●轉(zhuǎn)錄機(jī)器的主要成分———

RNA聚合酶、啟動子、增強(qiáng)子、轉(zhuǎn)錄因子●轉(zhuǎn)錄的基本過程●轉(zhuǎn)錄后加工●原核生物與真核生物mRNA的特征比較Contents現(xiàn)在是92頁\一共有106頁\編輯于星期四五、原核生物與真核生物mRNA的特征比較

1、原核生物mRNA的特征●半衰期短●多以多順反子的形式存在多順反子mRNA:編碼多個蛋白質(zhì)的mRNA。單順反子mRNA:只編碼一個蛋白質(zhì)的mRNA?,F(xiàn)在是93頁\一共有106頁\編輯于星期四結(jié)構(gòu)基因Z:β-半乳糖苷酶Y:透過酶A:乙?;D(zhuǎn)移酶ZYAOPDNA現(xiàn)在是94頁\一共有106頁\編輯于星期四●5’

端無“帽子”結(jié)構(gòu),3’

端沒有或只有較短的poly(A)結(jié)構(gòu)。起始密碼子AUG上游7-1

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