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———分子克隆技術(shù)中常見載體質(zhì)粒的分類及結(jié)構(gòu)原件
分子克隆技術(shù)運用的載體只要是指將DNA片段(目的基因)轉(zhuǎn)移至受體細(xì)胞的一種能自我復(fù)制的DNA分子工具。常見的載體主要有質(zhì)粒、噬菌體、病毒等。今天咱們要聊的主角是質(zhì)粒。一、什么是質(zhì)粒?
天然質(zhì)粒是可于染色體外可自行復(fù)制的環(huán)狀DNA分子,通常帶有一些基因,特別是一些與抗生素耐藥性有關(guān)的基因,可以在不同的細(xì)菌細(xì)胞之間傳遞。質(zhì)粒主要存在于細(xì)胞、古生菌及真核生物中,比較特殊的在植物的葉綠體和線粒體等胞器中也有出現(xiàn)。
研究報道指出質(zhì)粒也不全是環(huán)狀的哦!1984年,在Streptomycescoelicoler(天藍(lán)色鏈霉菌)等放線菌以及在Borreliahermsii(赫氏蜱疏螺旋體)等原核生物中,又相繼發(fā)現(xiàn)線形質(zhì)粒?;谫|(zhì)粒能夠攜帶基因,并且能夠在不同細(xì)胞中傳代基因的特性,質(zhì)粒被運用到分子克隆技術(shù)中。在分子克隆技術(shù)中運用的質(zhì)粒載體是在天然質(zhì)粒的基礎(chǔ)上為適應(yīng)實驗室操作而進行人工改造得來,通常所用的是細(xì)菌載體質(zhì)粒。
它在分子克隆技術(shù)中的運用是將某種目標(biāo)基因片段重組到質(zhì)粒中,構(gòu)成重組基因或重組體。將這種重組體經(jīng)微生物學(xué)的轉(zhuǎn)化技術(shù),轉(zhuǎn)入受體細(xì)胞(如大腸桿菌)中,使重組體中的目標(biāo)基因在受體菌中得以繁殖或表達(dá),從而改變寄主細(xì)胞原有的性狀或產(chǎn)生新的物質(zhì)。
細(xì)菌質(zhì)粒是基因工程中最常用的載體,這些質(zhì)粒至少要有復(fù)制起點、篩選標(biāo)記和克隆位點?;A(chǔ)的部分我們都來詳細(xì)了解下。二、質(zhì)粒結(jié)構(gòu)原件有哪些?
圖1質(zhì)粒圖譜1)復(fù)制起始位點(OriginofReplication,ORI)
ORI是一段DNA序列,質(zhì)粒復(fù)制的起始位置。DNA解螺旋酶可以作用于這段序列,然后DNA的雙鏈被分開,復(fù)制隨即開始。質(zhì)粒必須是能夠復(fù)制的,否則隨著細(xì)菌的生長,質(zhì)粒的數(shù)量將會被迅速稀釋。2)抗生素抗性基因(AntibioticResistanceGene)
抗生素抗性基因存在作用是快速篩選。在含有抗生素的培養(yǎng)基中培養(yǎng)細(xì)菌,能夠生長的就是含有目的質(zhì)粒,不含質(zhì)粒的細(xì)菌已經(jīng)被"殺死'了。3)篩選標(biāo)記(SelectableMarker)
篩選已經(jīng)成功攝取質(zhì)粒的細(xì)胞。該篩選標(biāo)記需要區(qū)別于細(xì)菌中的抗性篩選。細(xì)菌抗性基因篩選用于質(zhì)粒擴增過程,篩選標(biāo)記用于篩選或標(biāo)記轉(zhuǎn)染后的細(xì)胞。篩選標(biāo)記通常是抗性篩選或者熒光蛋白。4)啟動子(Promoter)
啟動子是能夠使基因進行轉(zhuǎn)錄的一段DNA序列。啟動子可以被RNA聚合酶辨別,并開始轉(zhuǎn)錄。啟動子常位于目的基因上游100-1000bp位置處,是質(zhì)粒非常重要的一個元件,它決定著目的基因可以在何種細(xì)胞中進行表達(dá),也決定蛋白質(zhì)的表達(dá)量。5)多克隆位點(MultipleCloningSite,MCS)
多克隆位點是一段短DNA片段,包括多個限制性酶切的單一位點,便于外源基因的插入。一般來說,外源DNA片段越長,越難插入,越不穩(wěn)定,轉(zhuǎn)化效率越低。在表達(dá)型質(zhì)粒中,MCS常處于啟動子的后面。6)引物結(jié)合位點(PrimerBindingSite)
引物結(jié)合位點為一小段DNA片段,用來進行質(zhì)粒的PCR擴增或者測序。7)插入片段(InsertedGene)
插入片段又稱為外源性基因,是克隆到MCS中的基因、啟動子或其他DNA片段,通常是人們所希望研究的遺傳元件。三、質(zhì)粒的分類有哪些?
1)表達(dá)質(zhì)粒:用于基因表達(dá)(基因功能的研究)。表達(dá)載體必須包含啟動子、轉(zhuǎn)錄終止子序列和插入基因。啟動子驅(qū)動插入DNA轉(zhuǎn)錄生成RNA,合成的RNA上的終止子序列發(fā)出停止轉(zhuǎn)錄過程的信號。表達(dá)載體可以通過增強子序列增加蛋白質(zhì)或RNA的產(chǎn)量。表達(dá)載體可以在各種細(xì)胞類型(哺乳動物、酵母、細(xì)菌等)中驅(qū)動表達(dá),這在很大程度上取決于用于啟動轉(zhuǎn)錄的啟動子。2)克隆質(zhì)粒:用于促進DNA片段的克隆。克隆載體往往非常簡單,通常只包含細(xì)菌抗性基因、復(fù)制起點和MCS。3)報告質(zhì)粒:用于研究遺傳元件的功能。這些質(zhì)粒包含一個報告基因(例如,熒光素酶或GFP),可提供遺傳元件活性的讀數(shù)。4)病毒質(zhì)粒:通過修飾的病毒基因組,有效地將遺傳物質(zhì)遞送到靶細(xì)胞中??梢允褂眠@些質(zhì)粒來制造病毒顆粒,例如慢病毒、逆轉(zhuǎn)錄病毒、AAV或腺病毒顆粒,從而高效感染靶細(xì)胞。5)基因敲減質(zhì)粒:用于減少內(nèi)源基因的表達(dá)。通過表達(dá)靶向目的基因mRNA的shRNA來實現(xiàn)。這些質(zhì)粒具有可以驅(qū)動短
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