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核酸的生物合成ppt核酸的生物合成ppt第1頁一、DNA生物合成
(一)DNA自我復(fù)制
1.DNA復(fù)制特點(diǎn)(1)半保留復(fù)制
1953年,Watson和Crick提出DNA半保留復(fù)制假說:DNA復(fù)制時(shí),以親代DNA每一條鏈作模板,合成完全相同兩個(gè)雙鏈子代DNA,每個(gè)子代DNA中都含有一股親代DNA鏈,這種現(xiàn)象稱為DNA半保留復(fù)制(semi-conservativereplication)。
核酸的生物合成ppt第2頁□1958年Meselson&stahl用同位素(15N)示蹤標(biāo)識(shí)加密度梯度離心技術(shù)試驗(yàn),該試驗(yàn)跟蹤了生長(zhǎng)了三代大腸桿菌,證實(shí)了DNA是采取半保留方式進(jìn)行復(fù)制。MesselsonStahl核酸的生物合成ppt第3頁“Heavy”DNA“Hybrid”
DNA“l(fā)ight”DNA“Hybrid”DNA核酸的生物合成ppt第4頁(2)從復(fù)制起始點(diǎn)開始,多雙向進(jìn)行DNA復(fù)制時(shí),在一些含有特定核苷酸排列次序位點(diǎn)起始,即復(fù)制起始點(diǎn)。在原核生物中,復(fù)制起始點(diǎn)通常為一個(gè),而在真核生物中則為多個(gè)。
DNA復(fù)制時(shí),以復(fù)制起始點(diǎn)為中心,向兩個(gè)方向進(jìn)行復(fù)制(在低等生物中,也可進(jìn)行單向復(fù)制,如滾環(huán)復(fù)制)。核酸的生物合成ppt第5頁(3)半不連續(xù)復(fù)制因?yàn)镈NA聚合酶只能以5’→3’方向聚合子代DNA鏈,即模板DNA鏈方向必須為3’→5’。所以,分別以兩條親代DNA鏈作為模板聚合子代DNA鏈時(shí)方式是不一樣。以3’→5’方向親代DNA鏈作模板子代鏈在復(fù)制時(shí)基礎(chǔ)上是連續(xù)進(jìn)行,其子代鏈聚合方向?yàn)?’→3’,這一條鏈被稱為前導(dǎo)鏈(leadingstrand)。核酸的生物合成ppt第6頁以5’→3’方向親代DNA鏈為模板子代鏈在復(fù)制時(shí)則是不連續(xù),其鏈聚合方向也是5’→3’,這條鏈被稱為后隨鏈(laggingstrand)。核酸的生物合成ppt第7頁因?yàn)橛H代DNA雙鏈在復(fù)制時(shí)是逐步解開,所以,后隨鏈合成也是一段一段。DNA在復(fù)制時(shí),由后隨鏈所形成一些子代DNA短鏈稱為岡崎片段(Okazakifragment)。岡崎片段大小,在原核生物中約為1000~個(gè)核苷酸,而在真核生物中約為100-200個(gè)核苷酸。
核酸的生物合成ppt第8頁2.DNA復(fù)制條件
(1)原料:四種脫氧核苷三磷酸(dATP、dGTP、
dCTP、dTTP)。(2)模板:以DNA兩條鏈為模板鏈,合成子代DNA。(3)引物:DNA合成需要一段RNA鏈作為引物。(4)還需要各種蛋白質(zhì):
核酸的生物合成ppt第9頁●
解螺旋酶和拓?fù)洚悩?gòu)酶解螺旋酶(unwindingenzyme),又稱解鏈酶,是用于解開DNA雙鏈酶蛋白,每解開一對(duì)堿基,需消耗2分子ATP。拓?fù)洚悩?gòu)酶Ⅰ可使DNA雙鏈中一條鏈切斷,松開雙螺旋后再將DNA鏈連接起來。拓?fù)洚悩?gòu)酶Ⅱ可切斷DNA雙鏈,使DNA超螺旋松解后,再將其連接起來。核酸的生物合成ppt第10頁●單鏈結(jié)合蛋白單鏈結(jié)合蛋白(singlestrandbindingprotein,SSB):能夠與單鏈DNA結(jié)合。其作用為:①使解開雙螺旋后DNA單鏈能夠穩(wěn)定存在,便于以其為模板復(fù)制子代DNA;②保護(hù)單鏈DNA,防止核酸酶降解。核酸的生物合成ppt第11頁●
DNA聚合酶
在原核生物中,當(dāng)前發(fā)覺DNA聚合酶有三種,分別命名為DNA聚合酶Ⅰ(polⅠ)、DNA聚合酶Ⅱ(polⅡ)、DNA聚合酶Ⅲ(polⅢ),這三種酶都屬于含有各種酶活性多功效酶。參加DNA復(fù)制主要是polⅢ和polⅠ。核酸的生物合成ppt第12頁真核生物DNA聚合酶有五種:DNA聚合酶α(polα),β(polβ),γ(polγ),δ(polδ)和ε(polε)。參加染色體DNA復(fù)制是polα(后隨鏈)和polδ(前導(dǎo)鏈),參加線粒體DNA復(fù)制是polγ,polε與DNA損傷修復(fù)、校正和填補(bǔ)缺口相關(guān),polβ只在其它聚合酶無活性時(shí)才發(fā)揮作用。核酸的生物合成ppt第13頁DNA聚合酶大腸桿菌和哺乳動(dòng)物DNA聚合酶比較PolⅠPolⅡPolⅢPolPolPolPolPol5’3’聚合酶活性5’3’外切酶活性3’5’外切酶活性主要功效++++++++++++++++———除去后隨鏈上RNA引物,填補(bǔ)缺口DNA修復(fù)合成中新鏈延伸后隨鏈合成核DNA修復(fù)線粒體DNA復(fù)制前導(dǎo)鏈合成DNA修復(fù)大腸桿菌哺乳動(dòng)物核酸的生物合成ppt第14頁●
DNA連接酶DNA連接酶(DNAligase)可將后隨鏈上岡崎片段之間切口連接起來(DNA片段之間形成磷酸二酯鍵)。反應(yīng)需要能量。NAD+NMN+AMPATPPPi+AMP細(xì)菌中:動(dòng)物或噬菌體:核酸的生物合成ppt第15頁3.DNA復(fù)制過程
(1)解旋解鏈,形成復(fù)制叉由拓?fù)洚悩?gòu)酶和解鏈酶作用,使DNA超螺旋及雙螺旋結(jié)構(gòu)解開,堿基間氫鍵斷裂,形成兩條單鏈DNA。SSB結(jié)合在兩條單鏈DNA上,形成復(fù)制叉。
DNA復(fù)制時(shí),局部雙螺旋解開形成兩條單鏈,這種叉狀結(jié)構(gòu)稱為復(fù)制叉。核酸的生物合成ppt第16頁核酸的生物合成ppt第17頁(2)引發(fā)由蛋白因子(如DnaB等)識(shí)別復(fù)制起始點(diǎn),并與其它蛋白因子、引物酶一起組裝形成引發(fā)體。在引物酶催化下,以DNA為模板,合成一段短RNA片段,從而取得3'端自由羥基(3'-OH)。
核酸的生物合成ppt第18頁(3)延長(zhǎng)
由DNA聚合酶催化,前導(dǎo)鏈從5’→3’方向連續(xù)聚合子代DNA鏈,后隨鏈則按5’→3’方向合成一個(gè)個(gè)短岡崎片段。核酸的生物合成ppt第19頁ThetwonewDNAstrandshavedifferentfeatures核酸的生物合成ppt第20頁去除引物,填補(bǔ)缺口:在原核生物中,DNA聚合酶Ⅰ(5’→3’外切酶活性)水解去除RNA引物,并由該酶催化延長(zhǎng)引物缺口處DNA,直到剩下最終一個(gè)磷酸酯鍵切口。在真核生物中,RNA引物去除,由一個(gè)特殊核酸酶來水解,而岡崎片段仍由DNA聚合酶來延長(zhǎng)。核酸的生物合成ppt第21頁*在合成過程中,假如插入了一個(gè)錯(cuò)配核苷酸,DNApolⅠ、DNApolⅢ就能識(shí)別、并除掉錯(cuò)配核苷酸(3’5’外切酶活性)
(4)連接岡崎片段在DNA連接酶催化下,形成最終一個(gè)磷酸酯鍵,將岡崎片段連接起來,形成完整DNA長(zhǎng)鏈。核酸的生物合成ppt第22頁
真核生物細(xì)胞中DNA復(fù)制除了多起始點(diǎn)、聚合酶種類不一樣外,還有一個(gè)不一樣于原核細(xì)胞之處:端粒形成:端粒(telomere)是指真核生物染色體線性DNA分子末端膨大成粒狀結(jié)構(gòu)。其共同結(jié)構(gòu)特征是由一些富含G、C短重復(fù)序列組成,可重復(fù)數(shù)十次至數(shù)百次。
核酸的生物合成ppt第23頁線性DNA在復(fù)制完成后,其末端因?yàn)橐颮NA水解可能出現(xiàn)縮短。故需要在端粒酶(telomerase)催化下,進(jìn)行延長(zhǎng)反應(yīng)。端粒酶是一個(gè)RNA-蛋白質(zhì)復(fù)合體,它能以RNA為模板,經(jīng)過逆轉(zhuǎn)錄過程對(duì)末端DNA鏈進(jìn)行延長(zhǎng)。正常細(xì)胞中端粒酶活性較低,細(xì)胞每分裂一次端粒就變短一點(diǎn),到一定程度細(xì)胞就衰老死亡;癌細(xì)胞中端粒酶活性較高,所以,癌細(xì)胞不易死亡。
核酸的生物合成ppt第24頁端粒酶(telomerase)作用機(jī)制移位作用核酸的生物合成ppt第25頁(二)反轉(zhuǎn)錄作用1970年,Temin和Baltimore發(fā)覺致癌RNA病毒中存在反轉(zhuǎn)錄酶(“逆轉(zhuǎn)錄酶”),為此榮獲1976年諾貝爾醫(yī)學(xué)獎(jiǎng)。依賴于RNADNA聚合酶稱為反轉(zhuǎn)錄酶。反轉(zhuǎn)錄酶催化、以RNA為模板合成互補(bǔ)DNA過程稱為反轉(zhuǎn)錄。核酸的生物合成ppt第26頁在反轉(zhuǎn)錄酶作用下,以RNA為模板合成、與RNA堿基序列互補(bǔ)DNA稱為互補(bǔ)DNA(cDNA)。反轉(zhuǎn)錄時(shí)引物:一段連接在單鏈RNA模板上RNA或DNA。反轉(zhuǎn)錄時(shí)新鏈延伸方向:5’→3’核酸的生物合成ppt第27頁mRNARNA-DNA雜交分子cDNA雙鏈加入dNTP和短oligo(dT)反轉(zhuǎn)錄酶polⅠKlenow片段RNaseHS1核酸酶(催化合成第二條DNA鏈)(把RNA鏈降解)(可打開發(fā)夾結(jié)構(gòu),并把雙鏈DNA分子兩端切平)(與polyA配對(duì),作為引物提供3’-OH)核酸的生物合成ppt第28頁(三)DNA損傷和修復(fù)
1.DNA損傷產(chǎn)生盡管DNA聚合酶含有高度準(zhǔn)確聚合反應(yīng)和高效校正功效,但DNA復(fù)制時(shí),還可能發(fā)生堿基錯(cuò)誤配對(duì),如大腸桿菌每104~105bp中約有一個(gè)錯(cuò)配出現(xiàn)。另外,細(xì)胞正常生理活動(dòng)也能夠引發(fā)DNA自發(fā)性損傷。常見DNA損傷包含堿基脫落、堿基修飾、交聯(lián),鏈斷裂、重組等。*引發(fā)突變?cè)颍?1)自發(fā)原因:自發(fā)脫堿基、自發(fā)脫氨基、復(fù)制錯(cuò)配。
核酸的生物合成ppt第29頁(2)物理原因:由紫外線、電離輻射、X射線等引發(fā)DNA損傷。其中,X射線和電離輻射經(jīng)常引發(fā)DNA鏈斷裂,而紫外線經(jīng)常引發(fā)嘧啶二聚體形成,如TT,TC,CC等二聚體。這些嘧啶二聚體因?yàn)樾纬闪斯矁r(jià)鍵連接環(huán)丁烷結(jié)構(gòu),因而引發(fā)復(fù)制障礙。
(3)化學(xué)原因:脫氨劑(如亞硝酸與亞硝酸鹽)、烷基化劑、DNA加合劑(如苯并芘)、堿基類似物(如5-FU)、斷鏈劑(如過氧化物)核酸的生物合成ppt第30頁基因損傷引發(fā)mRNA閱讀框架內(nèi)堿基發(fā)生插入或缺失,可能造成移碼突變。核酸的生物合成ppt第31頁點(diǎn)突變是指由單個(gè)核苷酸改變引發(fā)突變。點(diǎn)突變能夠分為轉(zhuǎn)換和顛換兩類。
轉(zhuǎn)換:嘌呤和嘌呤之間替換,或嘧啶和嘧啶之間替換。
顛換:嘌呤和嘧啶之間替換。錯(cuò)義突變是指編碼某種氨基酸密碼子經(jīng)堿基替換以后,變成編碼另一個(gè)氨基酸密碼子,從而使多肽鏈氨基酸種類和序列發(fā)生改變。無義突變是指因?yàn)槟硞€(gè)堿基改變使代表某種氨基酸密碼子突變?yōu)榻K止密碼子,從而使肽鏈合成提前終止。同義突變或中性突變,不引發(fā)氨基酸替換突變。核酸的生物合成ppt第32頁DNA修復(fù)系統(tǒng)功效錯(cuò)配修復(fù)恢復(fù)錯(cuò)配堿基切除修復(fù)切除突變堿基核甘酸切除修復(fù)重組修復(fù)修復(fù)被破壞DNA復(fù)制后修復(fù),重新開啟停滯復(fù)制叉DNA直接修復(fù)SOS系統(tǒng)修復(fù)嘧啶二體或甲基化DNADNA修復(fù),造成變異2.DNA損傷修復(fù)
核酸的生物合成ppt第33頁1)錯(cuò)配修復(fù)
錯(cuò)配修復(fù)是以模板鏈信息來糾正新合成鏈錯(cuò)配堿基一個(gè)修復(fù)方式?!馜am甲基化酶使母鏈位于5’GATC序列中腺甘酸(N-6)甲基化;●甲基化緊隨在DNA復(fù)制之后進(jìn)行;●依據(jù)復(fù)制叉上DNA甲基化程度,切除還未甲基化子鏈上錯(cuò)配堿基;核酸的生物合成ppt第34頁
依據(jù)母鏈甲基化標(biāo)準(zhǔn)找犯錯(cuò)配堿基示意圖發(fā)覺錯(cuò)配堿基在水解ATP作用下,MutS,MutL與堿基錯(cuò)配點(diǎn)DNA雙鏈結(jié)合MutS-MutL在DNA雙鏈上移動(dòng),發(fā)覺甲基化DNA后由MutH切開非甲基化子鏈核酸的生物合成ppt第35頁
甲基化指導(dǎo)錯(cuò)配修復(fù)示意圖錯(cuò)配堿基位于切口3’下游端,錯(cuò)配堿基位于切口5’上游端,核酸的生物合成ppt第36頁小結(jié):大腸桿菌錯(cuò)配修復(fù)機(jī)制
①M(fèi)utS蛋白與錯(cuò)配堿基結(jié)合,MutH與GATC結(jié)合,MutL使MutS和MutH連結(jié)成復(fù)合體,MutH位點(diǎn)專一核酸內(nèi)切酶活力在未甲基化鏈GATC序列中G5’側(cè)切割。②核酸外切酶在Helicase及SSB幫助下將無甲基化鏈從GATC位點(diǎn)至錯(cuò)配位點(diǎn)整段去除。③若被切割GATC位點(diǎn)在錯(cuò)配位點(diǎn)3‘端,由exoⅠ從3’→5‘將核酸鏈降解。④若被切割GATC位點(diǎn)在錯(cuò)配位點(diǎn)5‘端,則由exoⅦ(3‘→5’或5’→3‘降解單鏈)或RecJ(5’→3‘降解單鏈)從5’→3‘降解核酸鏈。⑤DNApolⅢ及l(fā)igase依據(jù)模板股序列填補(bǔ)新鏈被切除個(gè)別,包含錯(cuò)配堿基。
GATC位點(diǎn)與錯(cuò)配位點(diǎn)距離可能長(zhǎng)達(dá)1000nt以上。所以,為了修復(fù)一個(gè)錯(cuò)配堿基,有時(shí)需重新合成一千個(gè)以上堿基。核酸的生物合成ppt第37頁2)堿基切除修復(fù)一些堿基在自發(fā)或誘變下會(huì)發(fā)生脫酰胺,然后改變配對(duì)性質(zhì),造成氨基轉(zhuǎn)換突變腺嘌呤變?yōu)榇吸S嘌呤與胞嘧啶配對(duì)鳥嘌呤變?yōu)辄S嘌呤與胞嘧啶配對(duì)胞嘧啶變?yōu)槟蜞奏づc腺嘌呤配對(duì)▲切除修復(fù)(excisionrepair)對(duì)各種DNA損傷包含堿基脫落形成無堿基位點(diǎn)、嘧啶二聚體、堿基烷基化、單鏈斷裂等都能起修復(fù)作用。
核酸的生物合成ppt第38頁鳥嘌呤腺嘌呤黃嘌呤脫氨基次黃嘌呤脫氨基核酸的生物合成ppt第39頁胞嘧啶尿嘧啶脫氨基核酸的生物合成ppt第40頁假如復(fù)制發(fā)生就會(huì)產(chǎn)生一個(gè)突變核酸的生物合成ppt第41頁.糖苷水解酶識(shí)別改變了堿基,把堿基從N-β-糖苷鍵處切下來,在DNA鏈上形成去嘌呤或去嘧啶位點(diǎn),統(tǒng)稱為AP位點(diǎn)。核酸的生物合成ppt第42頁由AP核酸內(nèi)切酶將受損核苷酸糖苷-磷酸鍵切開核酸的生物合成ppt第43頁。DNA連接酶連接利用DNA聚合酶I切除損傷部位,補(bǔ)上核苷酸核酸的生物合成ppt第44頁▲
小結(jié):堿基切除修復(fù)糖苷水解酶:細(xì)胞中各種能特異切除受損核苷酸上N-β-糖苷鍵,在DNA鏈上形成AP位點(diǎn)(去嘌呤或去嘧啶位點(diǎn))。AP核酸內(nèi)切酶:能在AP位點(diǎn)附近(5`或3`位置)將DNA鏈切開;核酸外切酶:移去包含AP位點(diǎn)核苷酸在內(nèi)小片段DNA;DNA聚合酶I:合成新片段;DNA連接酶:連接切口而修復(fù)。核酸的生物合成ppt第45頁3)核苷酸切除修復(fù)1)經(jīng)過特異核酸內(nèi)切酶識(shí)別損傷部位;2)由酶復(fù)合物(DNA解鏈酶)在損傷兩邊切除幾個(gè)核苷酸;3)DNA聚合酶(Ⅰ或ε)以母鏈為模板復(fù)制合成新子鏈;4)DNA連接酶將切口補(bǔ)平。核酸的生物合成ppt第46頁識(shí)別損傷部位損傷兩邊切除幾個(gè)核苷酸DNA聚合酶以母鏈為模板復(fù)制合成新子鏈DNA連接酶將切口補(bǔ)平核酸的生物合成ppt第47頁4)重組修復(fù)(recombinantrepair)
重組修復(fù)又被稱為“復(fù)制后修復(fù)”,他發(fā)生在復(fù)制后。機(jī)體細(xì)胞對(duì)在復(fù)制起始時(shí)還未修復(fù)DNA損傷部位能夠先復(fù)制再修復(fù),即先跳過該損傷部位,在新合成鏈中留下一個(gè)對(duì)應(yīng)于損傷序列缺口。該缺口由DNA重組來修復(fù):先從同源DNA母鏈上將對(duì)應(yīng)核苷酸序列片段移至子鏈缺口處,然后再用新合成序列補(bǔ)上母鏈空缺。核酸的生物合成ppt第48頁詳細(xì)來說,①受損傷DNA鏈復(fù)制時(shí),產(chǎn)生子代DNA在損傷對(duì)應(yīng)部位出現(xiàn)缺口。②完整另一條母鏈DNA與有缺口子鏈DNA進(jìn)行重組交換,將母鏈DNA上對(duì)應(yīng)片段填補(bǔ)子鏈缺口處,而母鏈DNA出現(xiàn)缺口。③以另一條子鏈DNA為模板,經(jīng)DNA聚合酶催化合成一新DNA片段填補(bǔ)母鏈DNA缺口,最終由DNA連接酶連接,完成修補(bǔ)。重組修復(fù)不能完全去除損傷,損傷DNA段落依然保留在親代DNA鏈上,只是重組修復(fù)后合成DNA分子是不帶有損傷,但經(jīng)屢次復(fù)制后,損傷就被“沖淡”了,在子代細(xì)胞中只有一個(gè)細(xì)胞是帶有損傷DNA。
核酸的生物合成ppt第49頁5)DNA直接修復(fù)在DNA光解酶作用下將環(huán)丁烷胸腺嘧啶二體和6-4光化物還原成為單體甲基轉(zhuǎn)移酶使O6-甲基鳥嘌呤脫甲基生成鳥嘌呤,預(yù)防G-T配對(duì)核酸的生物合成ppt第50頁6)SOS系統(tǒng)
SOS反應(yīng)(SOSresponse)是細(xì)胞DNA受到損傷或復(fù)制系統(tǒng)受到抑制緊急情況下,細(xì)胞為求得生存而產(chǎn)生一個(gè)應(yīng)急辦法。SOS反應(yīng)包含誘導(dǎo)DNA損傷修復(fù)、誘變效應(yīng)、細(xì)胞分裂抑制以及溶原性細(xì)胞釋放噬菌體等,細(xì)胞癌變等,細(xì)胞癌變也與SOS反應(yīng)相關(guān)。含有DNA修復(fù)作用,同時(shí)也是唯一造成突變一個(gè)修復(fù)系統(tǒng)。核酸的生物合成ppt第51頁當(dāng)前對(duì)真核細(xì)胞DNA修復(fù)反應(yīng)類型、參加修復(fù)酶類和修復(fù)機(jī)制了解還不多,但DNA損傷修復(fù)與細(xì)胞突變、壽命、衰老、腫瘤發(fā)生、輻射效應(yīng)、一些毒物作用都有親密關(guān)系。
人類遺傳性疾病已發(fā)覺4000各種,其中不少與DNA修復(fù)缺點(diǎn)相關(guān),這些DNA修復(fù)缺點(diǎn)細(xì)胞表現(xiàn)出對(duì)輻射和致癌劑敏感性增加。核酸的生物合成ppt第52頁(四)細(xì)菌限制-修飾系統(tǒng)細(xì)菌體內(nèi)存在能識(shí)別外源DNA特定核苷酸序列、并切斷雙鏈DNA一個(gè)酶稱為限制性核酸內(nèi)切酶(限制酶)。細(xì)菌和宿主細(xì)胞DNA不被水解原因:修飾甲基化酶(使特定堿基序列上產(chǎn)生種屬專一甲基化模式)、限制酶(水解斷裂任何一條特定序列、卻未甲基化DNA雙鏈)保護(hù)。核酸的生物合成ppt第53頁重組DNA技術(shù)(五)基因重組與DNA克隆核酸的生物合成ppt第54頁核酸的生物合成ppt第55頁基因之間以隨機(jī)或定向方式進(jìn)行重排稱為基因重組。DNA重組技術(shù)(基因工程、DNA克隆):采取類似工程設(shè)計(jì)方法,人為地在體外將核酸分子插入質(zhì)粒、病毒或其它載體中,組成遺傳物質(zhì)新組合,并將它轉(zhuǎn)移到寄主細(xì)胞中擴(kuò)增和表示。常見載體:質(zhì)粒、噬菌體、柯斯質(zhì)粒、YAC(酵母人工染色體)載體※
探針:能識(shí)別克隆DNADNA片段,即與克隆DNA互補(bǔ)放射性核酸片段?;蚩寺』A(chǔ)步驟:核酸的生物合成ppt第56頁核酸的生物合成ppt第57頁藍(lán)白斑篩選核酸的生物合成ppt第58頁基因載體目標(biāo)基因
質(zhì)粒噬菌體病毒PCRcDNA人工合成基因文庫限制性內(nèi)切酶有切口載體有切口目標(biāo)基因DNA連接酶
重組體
轉(zhuǎn)化轉(zhuǎn)染體外包裝帶重組體宿主細(xì)胞
表型篩選電泳法核酸雜交免疫學(xué)方法目標(biāo)基因表示核酸的生物合成ppt第59頁基因克隆應(yīng)用:1、抗蟲轉(zhuǎn)基因植物※已問世轉(zhuǎn)基因抗蟲植物:
棉、玉米、馬鈴薯、番茄、大豆、蠶豆、煙草、蘋果、核桃、楊、菊花、和白花三葉草等?!糜跉⑾x基因主要有:
★Bt毒蛋白基因、蛋白酶抑制劑基因、淀粉酶抑制劑基因、核酸的生物合成ppt第60頁
※已用于殺蟲基因主要有:
病毒外殼蛋白質(zhì)基因、病毒復(fù)制酶(這些基因轉(zhuǎn)化植物表現(xiàn)出對(duì)同種病毒或相近病毒或病毒RNA侵染高水平抗性
)
幾丁質(zhì)酶基因、抗毒素合成基因抗CMV甜椒2、抗病轉(zhuǎn)基因植物※
已問世轉(zhuǎn)基因抗病植物:
小麥、甜椒、番茄核酸的生物合成ppt第61頁
比如,將魚抗凍蛋白基因?qū)藷煵莺头?,使煙草和番茄耐寒能力都有提升。另外,將抗除草劑基因?qū)舜蠖?、玉米等作物,噴灑除草劑時(shí),殺死田間雜草而不損傷作物。3、抗逆轉(zhuǎn)基因植物核酸的生物合成ppt第62頁※延長(zhǎng)果實(shí)儲(chǔ)備期
過程中需要乙烯形成酶。經(jīng)過基因工程能夠取得能抑制乙烯形成酶基因表示植物新品種,這些轉(zhuǎn)基因植物果實(shí)既保持了原有品質(zhì),又延長(zhǎng)了儲(chǔ)備期。4、利用轉(zhuǎn)基因改良植物品質(zhì)核酸的生物合成ppt第63頁5、用于提升動(dòng)物生長(zhǎng)速度轉(zhuǎn)基因鯉魚(上)和同齡鯉魚(下)核酸的生物合成ppt第64頁6、利用轉(zhuǎn)基因工程菌來生產(chǎn)細(xì)胞因子、抗體、疫苗、激素等核酸的生物合成ppt第65頁(六)PCR技術(shù)與DNA擴(kuò)增1、定義:
PCR技術(shù),即聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng),是一個(gè)模擬天然DNA復(fù)制過程,即在有DNA模板、TaqDNA聚合酶、RNA引物和四種dNTP情況下,經(jīng)過高溫變性、低溫退火、中溫延伸,這么重復(fù)循環(huán)過程中,在體外擴(kuò)增特異性DNA片段分子生物學(xué)技術(shù)。核酸的生物合成ppt第66頁2、PCR基礎(chǔ)原理:
1)標(biāo)準(zhǔn)PCR反應(yīng)體系4種dNTP混合物各200umol/L引物各10~100pmol模板DNA0.1~2ugTaqDNA聚合酶2.5uMg2+1.5mmol/L核酸的生物合成ppt第67頁變性
首次94℃,5min;以后每次94℃,30~60s復(fù)性延伸兩段引物45~65s每次72℃,
45s;最終一次72℃
,7minTaq聚合酶開始下一輪,共25~30個(gè)循環(huán)后,兩個(gè)引物之間特異DNA可擴(kuò)增106~109倍。2)PCR反應(yīng)過程核酸的生物合成ppt第68頁
①模板DNA變性:模板DNA經(jīng)加熱至94℃左右一定時(shí)間后,使模板DNA雙鏈或經(jīng)PCR擴(kuò)增形成雙鏈DNA解離,使之成為單鏈,方便它與引物結(jié)合,為下輪反應(yīng)作準(zhǔn)備;
②模板DNA與引物退火(復(fù)性):模板DNA經(jīng)加熱變性成單鏈后,溫度降至55℃左右,引物與模板DNA單鏈互補(bǔ)序列配對(duì)結(jié)合;
③引物延伸:DNA模板--引物結(jié)合物在TaqDNA聚合酶作用下,以dNTP為反應(yīng)原料,靶序列為模板,按堿基配對(duì)與半保留復(fù)制原理,合成一條新與模板DNA鏈互補(bǔ)半保留復(fù)制鏈重復(fù)循環(huán)變性--退火--延伸三過程,就可取得更多“半保留復(fù)制鏈”,而且這種新鏈又可成為下次循環(huán)模板。每完成一個(gè)循環(huán)需2~4分鐘,2~3小時(shí)就能將待擴(kuò)目標(biāo)基因擴(kuò)增放大幾百萬倍。核酸的生物合成ppt第69頁3、PCR技術(shù)應(yīng)用:
基因克隆,基因工程,人遺傳病分類和診療,腫瘤發(fā)生,DNA測(cè)序,法醫(yī)學(xué)判定等領(lǐng)域。核酸的生物合成ppt第70頁核酸的生物合成ppt第71頁2)基因工程核酸的生物合成ppt第72頁P(yáng)CR-RFLP法:限制性內(nèi)切酶3)惡性腫瘤(癌基因或抑癌基因)Ras基因核酸的生物合成ppt第73頁突變限制性內(nèi)切酶核酸的生物合成ppt第74頁正常突變電泳核酸的生物合成ppt第75頁4)基因判定女性男性Y引物PCR男性女性核酸的生物合成ppt第76頁二、RNA生物合成在RNA聚合酶催化下,以一段DNA鏈為模板合成RNA過程稱為轉(zhuǎn)錄。核酸的生物合成ppt第77頁□其它RNA:
snRNA:核內(nèi)小分子RNA,mRNA加工剪接和成熟。
snoRNA:核仁小分子RNA,rRNA切割和修飾。
asRNA:反義RNA,抑制RNA加工與翻譯,是原核基因表
達(dá)一個(gè)主要調(diào)控方式。
dsRNA:雙鏈RNA,可誘發(fā)與該RNA高度同源基因序列
特異性“緘默”。
siRNA:小分子干擾RNA,由細(xì)胞中較長(zhǎng)外源雙鏈RNA
(30個(gè)核苷酸以上)降解而成,特異地降解目標(biāo)
mRNA。(介導(dǎo)RNAi技術(shù),即RNA干涉技術(shù))
miRNA:微RNA,內(nèi)源性(細(xì)胞發(fā)育過程中產(chǎn)生),降解mRNA.●
經(jīng)轉(zhuǎn)錄生成RNA有各種,主要有rRNA,tRNA,mRNA。核酸的生物合成ppt第78頁(一)RNA轉(zhuǎn)錄合成
1.特點(diǎn)(1)轉(zhuǎn)錄不對(duì)稱性轉(zhuǎn)錄(transcription)不對(duì)稱性就是指以雙鏈DNA中一條鏈作為模板進(jìn)行轉(zhuǎn)錄,從而將遺傳信息由DNA傳遞給RNA。核酸的生物合成ppt第79頁對(duì)于不一樣基因來說,其轉(zhuǎn)錄信息能夠存在于兩條不一樣DNA鏈上。能夠轉(zhuǎn)錄RNA那條DNA鏈稱為模板鏈(反義鏈),而與之互補(bǔ)另一條DNA鏈稱為編碼鏈(有義鏈)。模板鏈編碼鏈5’5’3’3’5’5’核酸的生物合成ppt第80頁(2)轉(zhuǎn)錄單向性、連續(xù)性RNA轉(zhuǎn)錄合成時(shí),只能向一個(gè)方向進(jìn)行聚合,所依賴模板DNA鏈方向?yàn)?'→5',而RNA鏈合成方向?yàn)?'→3'。
轉(zhuǎn)錄時(shí),以DNA為模板,在RNA聚合酶催化下,連續(xù)合成一段RNA鏈,各條RNA鏈之間無需再進(jìn)行連接。核酸的生物合成ppt第81頁(3)有特定起始和終止位點(diǎn)RNA轉(zhuǎn)錄合成時(shí),只能以DNA分子中某一段作為模板,故存在特定起始位點(diǎn)和特定終止位點(diǎn)。特定起始點(diǎn)和終止點(diǎn)之間DNA鏈組成一個(gè)轉(zhuǎn)錄單位,通常由轉(zhuǎn)錄區(qū)和相關(guān)調(diào)整次序組成。
核酸的生物合成ppt第82頁2.RNA轉(zhuǎn)錄合成條件
除了需要底物(ATP、GTP、CTP、UTP)、模板(DNA鏈)外,RNA合成還需要:(1)RNA聚合酶依賴于DNARNA聚合酶(不一樣于DNA復(fù)制時(shí)引物酶)在DNA模板和四種核糖核苷酸存在條件下,不需要引物,即可從5'→3'聚合RNA。
核酸的生物合成ppt第83頁原核生物中RNA聚合酶全酶由五個(gè)亞基組成,即α2ββ'ωσ。σ亞基與轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)識(shí)別相關(guān),而在轉(zhuǎn)錄合成開始后被釋放,余下個(gè)別(α2ββ'ω)被稱為關(guān)鍵酶,與RNA鏈聚合相關(guān)。
核酸的生物合成ppt第84頁真核生物RNA聚合酶
酶位置轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物相對(duì)活性對(duì)α-鵝膏蕈堿敏感性RNA聚合酶Ⅰ核仁rRNA(5.8SrRNA18SrRNA28SrRNA)50-70%不敏感RNA聚合酶Ⅱ核質(zhì)
mRNA、snRNA20-40%敏感RNA聚合酶Ⅲ核質(zhì)tRNA5SrRNAU6snRNA約10%存在物種特異性核酸的生物合成ppt第85頁(2)終止因子ρ蛋白:是一個(gè)六聚體蛋白質(zhì),亞基分子量為50kd。該蛋白因子能識(shí)別終止信號(hào),并能與RNA緊密結(jié)合,造成RNA釋放。核酸的生物合成ppt第86頁3.RNA轉(zhuǎn)錄合成過程
(1)識(shí)別
原核生物RNA聚合酶中σ因子識(shí)別轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn),并與關(guān)鍵酶結(jié)合形成全酶復(fù)合物。開啟子(promoter):指能被RNA聚合酶識(shí)別、結(jié)合并開啟基因轉(zhuǎn)錄一段DNA序列。核酸的生物合成ppt第87頁●
原核生物開啟子結(jié)構(gòu)1975,Pribnow足跡法(footprint)確定開啟子序列核酸的生物合成ppt第88頁
大腸桿菌RNA聚合酶全酶所識(shí)別開啟子區(qū)-35區(qū):T85T83G81A61C69A52-10區(qū):T89A89T50A65A50T96核酸的生物合成ppt第89頁●經(jīng)典原核生物開啟子結(jié)構(gòu)
-35-10轉(zhuǎn)錄起點(diǎn)TTGACA
16-19bp
TATAAT5-9bp-35區(qū)~-10區(qū)間隔+1核酸的生物合成ppt第90頁
①TATA區(qū):酶緊密結(jié)合位點(diǎn)(富含AT堿基,利于雙鏈打開,并決定轉(zhuǎn)錄起始位置)。(-10區(qū),Pribnow區(qū))
②TTGACA區(qū):提供了RNA聚合酶全酶識(shí)別信號(hào)。(-35區(qū),與RNA聚合酶全酶結(jié)合相關(guān),以及與開啟子強(qiáng)弱活性相關(guān)。)※
細(xì)菌開啟子主要保守序列核酸的生物合成ppt第91頁●真核生物開啟子□真核有三種不一樣開啟子和相關(guān)元件□開啟子Ⅱ最為復(fù)雜,它和原核開啟子有很多不一樣核酸的生物合成ppt第92頁□真核生物開啟子結(jié)構(gòu)
◆關(guān)鍵開啟子(corepromoter)◆上游開啟子元件(upstreampromoterelement,UPE)核酸的生物合成ppt第93頁●
關(guān)鍵開啟子定義:指確保RNA聚合酶Ⅱ轉(zhuǎn)錄正常起始所必需、最少DNA序列,包含轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)及轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)上游TATA區(qū)。(Hogness區(qū))作用:選擇正確轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn),確保準(zhǔn)確起始。(DNA雙鏈開始解開)TATA常在-25bp左右,相當(dāng)于原核-10序列T85A97T93A85A63A83A50核酸的生物合成ppt第94頁(2)起始RNA聚合酶全酶促使局部雙鏈解開,并催化ATP或GTP與另外一個(gè)三磷酸核苷聚合,形成第一個(gè)3’,5’-磷酸二酯鍵。(3)延長(zhǎng)σ因子從全酶上脫離,余下關(guān)鍵酶繼續(xù)沿DNA鏈移動(dòng),按照堿基互補(bǔ)標(biāo)準(zhǔn),不停聚合RNA。
核酸的生物合成ppt第95頁●強(qiáng)終止子--不依賴因子終止
①終止位點(diǎn)上游普通存在一個(gè)富含GC堿基二重對(duì)稱區(qū),RNA形成發(fā)夾結(jié)構(gòu)。
②在終止位點(diǎn)前面有一段由4-8個(gè)A組成序列,RNA3’端為寡聚U。(4)終止核酸的生物合成ppt第96頁發(fā)夾式結(jié)構(gòu)和寡聚U共同作用使RNA從三元復(fù)合物中解離出來。核酸的生物合成ppt第97頁終止效率與二重對(duì)稱序列和寡聚U長(zhǎng)短相關(guān),長(zhǎng)度效率核酸的生物合成ppt第98頁●弱終止子--依賴因子終止因子:六聚體蛋白、水解各種核苷三磷酸促使新生RNA鏈從三元轉(zhuǎn)錄復(fù)合物中解離出來,從而終止轉(zhuǎn)錄。核酸的生物合成pp
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