第十二章的生物合成轉(zhuǎn)錄詳解_第1頁
第十二章的生物合成轉(zhuǎn)錄詳解_第2頁
第十二章的生物合成轉(zhuǎn)錄詳解_第3頁
第十二章的生物合成轉(zhuǎn)錄詳解_第4頁
第十二章的生物合成轉(zhuǎn)錄詳解_第5頁
已閱讀5頁,還剩70頁未讀, 繼續(xù)免費閱讀

下載本文檔

版權(quán)說明:本文檔由用戶提供并上傳,收益歸屬內(nèi)容提供方,若內(nèi)容存在侵權(quán),請進行舉報或認領(lǐng)

文檔簡介

第十二章的生物合成轉(zhuǎn)錄詳解演示文稿目前一頁\總數(shù)七十五頁\編于十七點優(yōu)選第十二章的生物合成轉(zhuǎn)錄目前二頁\總數(shù)七十五頁\編于十七點目前三頁\總數(shù)七十五頁\編于十七點復制和轉(zhuǎn)錄的區(qū)別目前四頁\總數(shù)七十五頁\編于十七點第一節(jié)RNA轉(zhuǎn)錄合成的特點Section1CharactersofRNABiosynthesis目前五頁\總數(shù)七十五頁\編于十七點

轉(zhuǎn)錄(transcription)的不對稱性就是指以雙鏈DNA中的一條鏈作為模板進行轉(zhuǎn)錄,從而將遺傳信息由DNA傳遞給RNA。對于不同的基因來說,其轉(zhuǎn)錄信息可以存在于兩條不同的DNA鏈上。一、轉(zhuǎn)錄的不對稱性目前六頁\總數(shù)七十五頁\編于十七點能夠轉(zhuǎn)錄RNA的那條DNA鏈稱為模板鏈(templatestrand),也稱作有意義鏈或Watson鏈。

與模板鏈互補的另一條DNA鏈稱為編碼鏈(codingstrand),也稱為反義鏈或Crick鏈。

模板鏈編碼鏈5’5’3’3’5’5’目前七頁\總數(shù)七十五頁\編于十七點5335模板鏈編碼鏈編碼鏈模板鏈轉(zhuǎn)錄方向轉(zhuǎn)錄方向模板鏈和編碼鏈的相對性目前八頁\總數(shù)七十五頁\編于十七點5′···GCAGTACATGTC···3′3′···cgtgatgtacag···5′編碼鏈模板鏈mRNA5′···GCAGUACAUGUC···3′轉(zhuǎn)錄N······Ala·Val·His·Val······C蛋白質(zhì)翻譯模板鏈、編碼鏈與轉(zhuǎn)錄及翻譯的關(guān)系目前九頁\總數(shù)七十五頁\編于十七點RNA轉(zhuǎn)錄合成時,以DNA作為模板,在RNA聚合酶的催化下,連續(xù)合成一段RNA鏈,各條RNA鏈之間無需再進行連接。二、轉(zhuǎn)錄的連續(xù)性目前十頁\總數(shù)七十五頁\編于十七點RNA轉(zhuǎn)錄合成時,只能向一個方向進行聚合,所依賴的模板DNA鏈的方向為3'→5',而RNA鏈的合成方向為5'→3'。

三、轉(zhuǎn)錄的單向性目前十一頁\總數(shù)七十五頁\編于十七點RNA轉(zhuǎn)錄合成時,只能以DNA分子中的某一段作為模板,故存在特定的起始位點和特定的終止位點。特定起始點和特定終止點之間的DNA鏈構(gòu)成一個轉(zhuǎn)錄單位,通常由轉(zhuǎn)錄區(qū)和有關(guān)的調(diào)節(jié)順序構(gòu)成。

四、有特定的起始和終止位點目前十二頁\總數(shù)七十五頁\編于十七點第二節(jié)參與轉(zhuǎn)錄合成的酶和蛋白因子Section2EnzymesandProteinFactorsforRNABiosynthesis目前十三頁\總數(shù)七十五頁\編于十七點原料:NTP(ATP,UTP,GTP,CTP)。模板:單鏈DNA。酶:RNA聚合酶(DDRP,RNA-pol)。其他蛋白質(zhì)因子:如轉(zhuǎn)錄因子、終止因子等。參與RNA轉(zhuǎn)錄合成的物質(zhì)目前十四頁\總數(shù)七十五頁\編于十七點這是一種不同于引物酶的依賴DNA的RNA聚合酶(DDRP)。該酶在單鏈DNA模板以及四種核糖核苷酸存在的條件下,不需要引物,即可從5'→3'聚合RNA。

一、RNA聚合酶(DDRP)目前十五頁\總數(shù)七十五頁\編于十七點原核生物中的RNA聚合酶全酶由五個亞基構(gòu)成,即2'。亞基與轉(zhuǎn)錄起始點的識別有關(guān),在轉(zhuǎn)錄合成開始后被釋放;余下的部分(2')被稱為核心酶,與RNA鏈的聚合有關(guān)。

(一)原核生物的RNA聚合酶目前十六頁\總數(shù)七十五頁\編于十七點核心酶(coreenzyme)全酶(holoenzyme)原核生物RNA聚合酶的核心酶和全酶目前十七頁\總數(shù)七十五頁\編于十七點原核生物RNA聚合酶亞基的功能目前十八頁\總數(shù)七十五頁\編于十七點真核生物中的RNA聚合酶可按其對-鵝膏蕈堿的敏感性而分為三種,它們均由10~12個大小不同的亞基所組成,結(jié)構(gòu)非常復雜,其功能也不同。

(二)真核生物的RNA聚合酶目前十九頁\總數(shù)七十五頁\編于十七點RNA聚合酶Ⅱ的分子結(jié)構(gòu)目前二十頁\總數(shù)七十五頁\編于十七點酵母RNA聚合酶Ⅰ和Ⅱ的電子晶體圖目前二十一頁\總數(shù)七十五頁\編于十七點在真核生物中,轉(zhuǎn)錄的起始過程較為復雜,現(xiàn)已發(fā)現(xiàn)數(shù)百種蛋白因子與RNA轉(zhuǎn)錄合成有關(guān)。凡是與基因表達調(diào)控相關(guān)的蛋白因子統(tǒng)稱為反式作用因子(transactingfactor)。二、轉(zhuǎn)錄因子目前二十二頁\總數(shù)七十五頁\編于十七點在反式作用因子中,直接或間接參與轉(zhuǎn)錄起始復合體的形成的蛋白因子被稱為轉(zhuǎn)錄因子(transcriptionalfactor,TF)。不同的RNA聚合酶存在相應的轉(zhuǎn)錄因子,如與RNA聚合酶Ⅱ相關(guān)的轉(zhuǎn)錄因子包括TFⅡA,TFⅡB,TFⅡD,TFⅡE,TFⅡF,TFⅡH等。目前二十三頁\總數(shù)七十五頁\編于十七點真核生物RNA聚合酶Ⅱ轉(zhuǎn)錄因子及其功能目前二十四頁\總數(shù)七十五頁\編于十七點原核生物中的終止因子蛋白是一種六聚體的蛋白質(zhì),亞基的分子量為50kd。蛋白能識別轉(zhuǎn)錄終止信號,并與RNA緊密結(jié)合,導致RNA的釋放。三、終止因子目前二十五頁\總數(shù)七十五頁\編于十七點第三節(jié)RNA轉(zhuǎn)錄合成的過程Section3TheProcessofRNABiosynthesis目前二十六頁\總數(shù)七十五頁\編于十七點(一)轉(zhuǎn)錄起始轉(zhuǎn)錄起始需解決兩個問題:RNA聚合酶必須準確地結(jié)合在轉(zhuǎn)錄模板的起始區(qū)域。DNA雙鏈解開,使其中的一條鏈作為轉(zhuǎn)錄的模板。一、原核生物的轉(zhuǎn)錄過程目前二十七頁\總數(shù)七十五頁\編于十七點在原核生物中,若干功能相關(guān)的結(jié)構(gòu)基因常常串聯(lián)在一起,由其上游的同一調(diào)控序列進行調(diào)控,這種基因的組織形式稱為操縱子(operon)。1.模板與酶的辨認識別:5335結(jié)構(gòu)基因調(diào)控序列RNA-pol目前二十八頁\總數(shù)七十五頁\編于十七點DNA分子中參與轉(zhuǎn)錄調(diào)控的序列統(tǒng)稱為順式作用元件(cis-actingelement)。原核生物轉(zhuǎn)錄起始時,首先由RNA聚合酶中的因子識別轉(zhuǎn)錄起始點,并促使核心酶結(jié)合形成全酶復合物。目前二十九頁\總數(shù)七十五頁\編于十七點位于基因上游,與RNA聚合酶識別、結(jié)合并起始轉(zhuǎn)錄有關(guān)的一些DNA調(diào)控序列被稱為啟動子(promoter)。啟動子序列通常由一些帶共性的保守序列構(gòu)成。目前三十頁\總數(shù)七十五頁\編于十七點開始轉(zhuǎn)錄(Pribnowbox)TATAATPuATATTAPy-10區(qū)1-30-5010-10-40-205335原核生物啟動子的保守序列TTGACAAACTGT-35區(qū)RNA-pol辨認位點(recognitionsite)55RNA聚合酶保護區(qū)結(jié)構(gòu)基因33目前三十一頁\總數(shù)七十五頁\編于十七點原核生物轉(zhuǎn)錄起始區(qū)的一致性序列目前三十二頁\總數(shù)七十五頁\編于十七點被RNA聚合酶辨認的區(qū)段就是位于轉(zhuǎn)錄起始點-35區(qū)的TTGACA序列。RNA聚合酶與該區(qū)結(jié)合后,即滑動至-10區(qū)的TATAAT序列(Pribnow盒),并啟動轉(zhuǎn)錄。目前三十三頁\總數(shù)七十五頁\編于十七點RNA聚合酶全酶在轉(zhuǎn)錄起始區(qū)的結(jié)合目前三十四頁\總數(shù)七十五頁\編于十七點⑵DNA局部雙鏈解開。⑴RNA聚合酶全酶(2)與模板結(jié)合。⑶在RNA聚合酶作用下發(fā)生第一次聚合反應,形成轉(zhuǎn)錄起始復合物。RNApol(2)-DNA-pppGpN-OH3轉(zhuǎn)錄起始復合物:5-pppG-OH+

NTP

5-pppGpN

-OH3+ppi2.轉(zhuǎn)錄的起始過程:目前三十五頁\總數(shù)七十五頁\編于十七點因子從全酶上脫離,余下的核心酶繼續(xù)沿DNA鏈移動,按照堿基互補原則,不斷聚合RNA。

1.亞基脫落,RNA–pol聚合酶核心酶變構(gòu),與模板結(jié)合松弛,沿著DNA模板前移;2.在核心酶作用下,NTP不斷聚合,RNA鏈不斷延長。(二)轉(zhuǎn)錄延長(NMP)n

+NTP(NMP)n+1

+PPi目前三十六頁\總數(shù)七十五頁\編于十七點RNA轉(zhuǎn)錄的延長目前三十七頁\總數(shù)七十五頁\編于十七點轉(zhuǎn)錄空泡(transcriptionbubble)的形成目前三十八頁\總數(shù)七十五頁\編于十七點原核生物轉(zhuǎn)錄過程中的羽毛狀現(xiàn)象目前三十九頁\總數(shù)七十五頁\編于十七點RNA轉(zhuǎn)錄合成的終止機制有兩種:

1.依賴Rho因子的轉(zhuǎn)錄終止:由終止因子(因子)識別特異的終止信號,并促使RNA的釋放。(三)轉(zhuǎn)錄終止目前四十頁\總數(shù)七十五頁\編于十七點ATP依賴Rho因子的轉(zhuǎn)錄終止目前四十一頁\總數(shù)七十五頁\編于十七點模板DNA鏈在接近轉(zhuǎn)錄終止點處存在相連的富含GC和AT的區(qū)域,使RNA轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物形成寡聚U及發(fā)夾形的二級結(jié)構(gòu),引起RNA聚合酶變構(gòu)及移動停止,導致RNA轉(zhuǎn)錄的終止。2.非依賴Rho的轉(zhuǎn)錄終止:目前四十二頁\總數(shù)七十五頁\編于十七點5`UUGCAGCCUGACAAAUCAGGCUGAUGGCUGGUGACUUUUUAGUCACCAGCCUUUUU...3`5`UUGCAGCCUGACAAAUCAGGCUGAUGGCUGGUGACUUUUUAGUCACCAGCCUUUUU...3`

RNA5TTGCAGCCTGACAAATCAGGCTGATGGCTGGTGACTTTTTAGTCACCAGCCTTTTT...3

DNAUUUUU...…UUUU...…5`UUGCAGCCUGACAAAUCAGGCUGAUGGCUGGUGACUUUUUAGUCACCAGCCUUUUU...3`莖環(huán)(stem-loop)/發(fā)夾(hairpin)結(jié)構(gòu)目前四十三頁\總數(shù)七十五頁\編于十七點莖環(huán)結(jié)構(gòu)使轉(zhuǎn)錄終止的機理使RNA聚合酶變構(gòu),轉(zhuǎn)錄停頓;使轉(zhuǎn)錄復合物趨于解離,RNA產(chǎn)物釋放。目前四十四頁\總數(shù)七十五頁\編于十七點二、真核生物的轉(zhuǎn)錄過程1.轉(zhuǎn)錄起始的上游區(qū)段:真核生物的轉(zhuǎn)錄起始點上游-25bp區(qū)也存在一段富含TA的順序,被稱為Hogness盒或TATA盒,通常認為是啟動子的核心序列。(一)轉(zhuǎn)錄起始目前四十五頁\總數(shù)七十五頁\編于十七點除此之外,在真核生物中還可見到其他帶共性的序列,如CAAT盒及GC盒等。在遠離受控基因處存在的,能夠增強基因轉(zhuǎn)錄活性的調(diào)控序列稱為增強子(enhancer)。目前四十六頁\總數(shù)七十五頁\編于十七點真核生物啟動子保守序列目前四十七頁\總數(shù)七十五頁\編于十七點真核生物轉(zhuǎn)錄起始時,首先由TFⅡD的TBP亞基識別并結(jié)合TATA盒,然后在其他轉(zhuǎn)錄因子的配合下,與RNA聚合酶Ⅱ組裝形成轉(zhuǎn)錄起始前復合物(pre-initiationcomplex,PIC)。2.轉(zhuǎn)錄起始過程:目前四十八頁\總數(shù)七十五頁\編于十七點RNA聚合酶Ⅱ催化第一個磷酸二酯鍵形成。RNA聚合酶Ⅱ的羧基末端結(jié)構(gòu)域(CTD)被磷酸化修飾,大部分轉(zhuǎn)錄因子脫離,聚合酶向下游移動延伸RNA鏈。目前四十九頁\總數(shù)七十五頁\編于十七點(二)轉(zhuǎn)錄延長真核生物轉(zhuǎn)錄延長過程與原核生物類似,但由于存在核小體的高級結(jié)構(gòu),故在轉(zhuǎn)錄延長過程中可觀察到核小體移位和解聚現(xiàn)象。目前五十頁\總數(shù)七十五頁\編于十七點(三)轉(zhuǎn)錄終止真核生物轉(zhuǎn)錄終止與轉(zhuǎn)錄后修飾,即polyA尾巴結(jié)構(gòu)的添加密切相關(guān)。在polyA修飾位點的下游存在一組共同序列AATAAA和GTGTGT……,為轉(zhuǎn)錄終止的識別修飾位點。在轉(zhuǎn)錄越過修飾點后,RNA鏈在修飾點處被切斷,隨即進行加帽和加尾修飾。目前五十一頁\總數(shù)七十五頁\編于十七點真核生物RNA的轉(zhuǎn)錄終止5------AAUAAA-5------AAUAAA--核酸酶-GUGUGUGRNA-polAATAAAGTGTGTG轉(zhuǎn)錄終止的修飾點55333加尾AAAAAAA······3mRNA目前五十二頁\總數(shù)七十五頁\編于十七點第四節(jié)真核生物的轉(zhuǎn)錄后修飾Section4Post-transcriptionalModificationinEukaryote目前五十三頁\總數(shù)七十五頁\編于十七點

1.加帽(addingcap):即在mRNA的5'-端加上m7GTP的結(jié)構(gòu)。此過程發(fā)生在細胞核內(nèi),即HnRNA即可進行加帽。加工過程首先是在磷酸酶的作用下,將5'-端的磷酸基水解,然后再加上鳥苷三磷酸,形成GpppN的結(jié)構(gòu),再對G進行甲基化。

一、真核生物mRNA的轉(zhuǎn)錄后加工(一)首、尾的修飾目前五十四頁\總數(shù)七十五頁\編于十七點

Pi5ppGp…磷酸酶5pppGp…5GpppGp…pppG

ppi鳥苷酸轉(zhuǎn)移酶5

m7GpppGp…甲基轉(zhuǎn)移酶SAM帽子結(jié)構(gòu)的生成目前五十五頁\總數(shù)七十五頁\編于十七點

2.加尾(addingtail):這一過程也是細胞核內(nèi)完成,首先由核酸外切酶切去3'-端一些過剩的核苷酸,然后再加入polyA。polyA結(jié)構(gòu)與mRNA的半壽期有關(guān)。

目前五十六頁\總數(shù)七十五頁\編于十七點(二)mRNA的剪接(splicing)雞卵清蛋白成熟mRNA與DNA雜交電鏡圖mRNADNA目前五十七頁\總數(shù)七十五頁\編于十七點1.斷裂基因(splitegene)CABD編碼區(qū)A、B、C、D非編碼區(qū)真核生物結(jié)構(gòu)基因,由若干個編碼區(qū)和非編碼區(qū)互相間隔開但又連續(xù)鑲嵌而成,去除非編碼區(qū)再連接后,可翻譯出由連續(xù)氨基酸組成的完整蛋白質(zhì),這些基因稱為斷裂基因。目前五十八頁\總數(shù)七十五頁\編于十七點外顯子(exon)和內(nèi)含子(intron)外顯子——在斷裂基因及其初級轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物上出現(xiàn),并表達為成熟RNA的核酸序列(結(jié)構(gòu)基因中能夠指導多肽鏈合成的編碼順序)。內(nèi)含子——隔斷基因的線性表達而在剪接過程中被除去的核酸序列(不能指導多肽鏈合成的非編碼順序)。目前五十九頁\總數(shù)七十五頁\編于十七點內(nèi)含子的分類I:主要存在于線粒體、葉綠體及某些低等真核生物的rRNA基因;II:也發(fā)現(xiàn)于線粒體、葉綠體,轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物是mRNA;根據(jù)基因的類型和剪接的方式,通常把內(nèi)含子分為4類。目前六十頁\總數(shù)七十五頁\編于十七點III:是常見的形成套索結(jié)構(gòu)后剪接,大多數(shù)mRNA基因有此類內(nèi)含子;IV:是tRNA基因及其初級轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物中的內(nèi)含子,剪接過程需酶及ATP。目前六十一頁\總數(shù)七十五頁\編于十七點核內(nèi)帶有外顯子和內(nèi)含子編碼序列的初級RNA轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物稱為雜化核RNA(hetero-nuclearRNA,hnRNA)。hnRNA經(jīng)剪接加工除去內(nèi)含子編碼序列并將外顯子編碼序列連接起來才能形成成熟的mRNA。2.hnRNA和snRNA:目前六十二頁\總數(shù)七十五頁\編于十七點snRNA為核內(nèi)小RNA,富含尿嘧啶,故以U作分類和命名,如U1、U2等。snRNA與核內(nèi)蛋白質(zhì)組裝形成小核蛋白體(snRNP),參與hnRNA的剪接加工。目前六十三頁\總數(shù)七十五頁\編于十七點3.hnRNA的剪接過程:①snRNP與hnRNA結(jié)合成為剪接體。目前六十四頁\總數(shù)七十五頁\編于十七點②剪接體結(jié)構(gòu)調(diào)整,U2和U6形成催化中心,發(fā)生轉(zhuǎn)酯反應。目前六十五頁\總數(shù)七十五頁\編于十七點UpAGpU外顯子1內(nèi)含子外顯子2pG-OH(ppG-OH,pppG-OH)U-OHGpUpGpA第一次轉(zhuǎn)酯反應第二

溫馨提示

  • 1. 本站所有資源如無特殊說明,都需要本地電腦安裝OFFICE2007和PDF閱讀器。圖紙軟件為CAD,CAXA,PROE,UG,SolidWorks等.壓縮文件請下載最新的WinRAR軟件解壓。
  • 2. 本站的文檔不包含任何第三方提供的附件圖紙等,如果需要附件,請聯(lián)系上傳者。文件的所有權(quán)益歸上傳用戶所有。
  • 3. 本站RAR壓縮包中若帶圖紙,網(wǎng)頁內(nèi)容里面會有圖紙預覽,若沒有圖紙預覽就沒有圖紙。
  • 4. 未經(jīng)權(quán)益所有人同意不得將文件中的內(nèi)容挪作商業(yè)或盈利用途。
  • 5. 人人文庫網(wǎng)僅提供信息存儲空間,僅對用戶上傳內(nèi)容的表現(xiàn)方式做保護處理,對用戶上傳分享的文檔內(nèi)容本身不做任何修改或編輯,并不能對任何下載內(nèi)容負責。
  • 6. 下載文件中如有侵權(quán)或不適當內(nèi)容,請與我們聯(lián)系,我們立即糾正。
  • 7. 本站不保證下載資源的準確性、安全性和完整性, 同時也不承擔用戶因使用這些下載資源對自己和他人造成任何形式的傷害或損失。

評論

0/150

提交評論