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船長(zhǎng)系列轉(zhuǎn)錄后的加工修飾演示文稿目前一頁(yè)\總數(shù)九十一頁(yè)\編于十七點(diǎn)(優(yōu)選)船長(zhǎng)系列轉(zhuǎn)錄后的加工修飾目前二頁(yè)\總數(shù)九十一頁(yè)\編于十七點(diǎn)順式作用元件反式作用因子啟動(dòng)子轉(zhuǎn)錄因子基本轉(zhuǎn)錄因子增強(qiáng)子沉默子CTD拼板理論目前三頁(yè)\總數(shù)九十一頁(yè)\編于十七點(diǎn)真核生物的轉(zhuǎn)錄后修飾Post-transcriptionalModification第四節(jié)目前四頁(yè)\總數(shù)九十一頁(yè)\編于十七點(diǎn)02030401真核與原核轉(zhuǎn)錄后區(qū)別真核mRNA加工(加帽,加尾,剪接,甲基化)tRNA,rRNA加工核酶本節(jié)重難點(diǎn)目前五頁(yè)\總數(shù)九十一頁(yè)\編于十七點(diǎn)目前六頁(yè)\總數(shù)九十一頁(yè)\編于十七點(diǎn)轉(zhuǎn)錄后的修飾轉(zhuǎn)錄生成的RNA,稱為初級(jí)轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物。無論在真核生物或原核生物中,初級(jí)轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物都經(jīng)過一定程度的修飾加工,才能表現(xiàn)其功能。目前七頁(yè)\總數(shù)九十一頁(yè)\編于十七點(diǎn)目前八頁(yè)\總數(shù)九十一頁(yè)\編于十七點(diǎn)目前九頁(yè)\總數(shù)九十一頁(yè)\編于十七點(diǎn)幾種主要的修飾方式1.剪接(splicing)2.剪切(cleavage)3.修飾(modification)4.添加(addition)目前十頁(yè)\總數(shù)九十一頁(yè)\編于十七點(diǎn)020304015’端帽子結(jié)構(gòu)3’端尾巴。切除內(nèi)含子,連接外顯子。甲基化一mRNA加工目前十一頁(yè)\總數(shù)九十一頁(yè)\編于十七點(diǎn)真核生物mRNA轉(zhuǎn)錄完成之后,進(jìn)行加帽加尾剪接等活動(dòng)。?X目前十二頁(yè)\總數(shù)九十一頁(yè)\編于十七點(diǎn)目前十三頁(yè)\總數(shù)九十一頁(yè)\編于十七點(diǎn)目前十四頁(yè)\總數(shù)九十一頁(yè)\編于十七點(diǎn)(一)首、尾修飾帽子結(jié)構(gòu)(m7GpppGp—)一mRNA加工多聚腺苷酸尾巴(polyAtail)53目前十五頁(yè)\總數(shù)九十一頁(yè)\編于十七點(diǎn)目前十六頁(yè)\總數(shù)九十一頁(yè)\編于十七點(diǎn)目前十七頁(yè)\總數(shù)九十一頁(yè)\編于十七點(diǎn)一mRNA加工帽子結(jié)構(gòu)(m7GpppGp—)目前十八頁(yè)\總數(shù)九十一頁(yè)\編于十七點(diǎn)磷酸水解酶鳥苷酸轉(zhuǎn)移酶5’-5’磷酸二酯鍵在鳥嘌呤-7-甲基轉(zhuǎn)移酶的催化下,將一個(gè)甲基基團(tuán)加到鳥嘌呤環(huán)的第7位N原子上,使鳥嘌呤轉(zhuǎn)變成7-甲基鳥嘌呤CH3帽子結(jié)構(gòu)的生成目前十九頁(yè)\總數(shù)九十一頁(yè)\編于十七點(diǎn)o型帽子:N7-甲基鳥腺呤核苷酸部分,其符號(hào)為m7GpppX。是單細(xì)胞的真核生物(如酵母)的帽子類型1型帽子:在0型帽子的基礎(chǔ)上,在原轉(zhuǎn)錄物的第一個(gè)核苷酸的2’-OH位上發(fā)生甲基化,其符號(hào)為m7GpppXm。這是除了單細(xì)胞真核生物外的其余真核生物的主要帽子形式目前二十頁(yè)\總數(shù)九十一頁(yè)\編于十七點(diǎn)一mRNA加工目前二十一頁(yè)\總數(shù)九十一頁(yè)\編于十七點(diǎn)阻止降解輸出標(biāo)記提高剪接提高翻譯RNA聚合酶II轉(zhuǎn)錄的RNA均在5’端加帽,這是RNA分子進(jìn)出細(xì)胞核的識(shí)別標(biāo)記5’帽結(jié)合蛋白涉及第一個(gè)內(nèi)含子剪接復(fù)合物的形成阻止細(xì)胞內(nèi)的RNase對(duì)RNA從5’端的攻擊,延長(zhǎng)mRNA的半衰期帶帽后促進(jìn)5’帽結(jié)合蛋白識(shí)別,繼而才能接觸核糖體,沒帽的翻譯效率比加帽的mRNA低約20倍。mRNA的5’端“帽子”的功能目前二十二頁(yè)\總數(shù)九十一頁(yè)\編于十七點(diǎn)1靠近mRNA3’端有一個(gè)加尾信號(hào)5’-AAUAAA-3’。2加尾信號(hào)下游10-30堿基處有一個(gè)5’-CA-3’二聯(lián)體3二聯(lián)體的后面有一段富含GU或U的序列3’端加尾目前二十三頁(yè)\總數(shù)九十一頁(yè)\編于十七點(diǎn)目前二十四頁(yè)\總數(shù)九十一頁(yè)\編于十七點(diǎn)3’端加上聚腺苷酸尾巴1可能與mRNA細(xì)胞核進(jìn)入細(xì)胞質(zhì)的轉(zhuǎn)運(yùn)有關(guān)。加poly(A)尾巴一般發(fā)生RNA拼接之前,但對(duì)于拼接作用并無太大的影響。但是相當(dāng)數(shù)量(占大約三分之一)的沒有poly(A)尾巴的mRNA如組蛋白mRNA,也可以照樣通過核膜而進(jìn)入細(xì)胞質(zhì)。2可能保護(hù)mRNA,延長(zhǎng)mRNA的壽命。3可能參與控制翻譯的效率。mRNA的3’端“加尾”的功能目前二十五頁(yè)\總數(shù)九十一頁(yè)\編于十七點(diǎn)1.hnRNA和snRNA核內(nèi)的初級(jí)mRNA稱為核不均一RNA(heterogeneousnuclear,hnRNA)又叫pre-mRNAsnRNA(smallnuclearRNA)核內(nèi)的蛋白質(zhì)小分子核糖核酸蛋白體(剪接體,splicesome)snRNA一mRNA剪接目前二十六頁(yè)\總數(shù)九十一頁(yè)\編于十七點(diǎn)真核生物結(jié)構(gòu)基因,由若干個(gè)編碼區(qū)和非編碼區(qū)互相間隔開但又連續(xù)鑲嵌而成,去除非編碼區(qū)再連接后,可翻譯出由連續(xù)氨基酸組成的完整蛋白質(zhì),這些基因稱為斷裂基因。斷裂基因(splitegene)CABD編碼區(qū)A、B、C、D非編碼區(qū)一mRNA加工目前二十七頁(yè)\總數(shù)九十一頁(yè)\編于十七點(diǎn)2.外顯子(exon)和內(nèi)含子(intron)外顯子在斷裂基因及其初級(jí)轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物上出現(xiàn),并表達(dá)為成熟RNA的核酸序列。內(nèi)含子隔斷基因的線性表達(dá)而在剪接過程中被除去的核酸序列。一mRNA加工目前二十八頁(yè)\總數(shù)九十一頁(yè)\編于十七點(diǎn)雞卵清蛋白基因hnRNA首、尾修飾hnRNA剪接成熟的mRNA雞卵清蛋白基因及其轉(zhuǎn)錄、轉(zhuǎn)錄后修飾一mRNA加工目前二十九頁(yè)\總數(shù)九十一頁(yè)\編于十七點(diǎn)雞卵清蛋白成熟mRNA與DNA雜交電鏡圖DNAmRNA一mRNA加工目前三十頁(yè)\總數(shù)九十一頁(yè)\編于十七點(diǎn)mRNA的剪接DNA模板與hnRNA是完全配對(duì)的,而成熟的mRNA與hnRNA或DNA雜交都只是部分配對(duì)。因此真核生物的基因有斷裂性。目前三十一頁(yè)\總數(shù)九十一頁(yè)\編于十七點(diǎn)目前三十二頁(yè)\總數(shù)九十一頁(yè)\編于十七點(diǎn)3.內(nèi)含子的分類根據(jù)基因的類型和剪接的方式,通常把內(nèi)含子分為4類。I:主要存在于線粒體、葉綠體及某些低等真核生物的rRNA基因;II:也發(fā)現(xiàn)于線粒體、葉綠體,轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物是mRNA;III:是常見的形成套索結(jié)構(gòu)后剪接,大多數(shù)mRNA基因有此類內(nèi)含子;IV:是tRNA基因及其初級(jí)轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物中的內(nèi)含子,剪接過程需酶及ATP。mRNA剪接目前三十三頁(yè)\總數(shù)九十一頁(yè)\編于十七點(diǎn)CABD切哪里誰切怎么切連接呢目前三十四頁(yè)\總數(shù)九十一頁(yè)\編于十七點(diǎn)1ABC如果酶來剪切,那么酶如何識(shí)別酶有沒有特異性,不同RNA要不同剪切酶嗎切除的RNA現(xiàn)狀存在還是環(huán)狀存在,命運(yùn)如何23斷裂基因提出后不久,1978年crick提出一系列問題目前三十五頁(yè)\總數(shù)九十一頁(yè)\編于十七點(diǎn)目前三十六頁(yè)\總數(shù)九十一頁(yè)\編于十七點(diǎn)目前三十七頁(yè)\總數(shù)九十一頁(yè)\編于十七點(diǎn)目前三十八頁(yè)\總數(shù)九十一頁(yè)\編于十七點(diǎn)目前三十九頁(yè)\總數(shù)九十一頁(yè)\編于十七點(diǎn)目前四十頁(yè)\總數(shù)九十一頁(yè)\編于十七點(diǎn)切哪里-識(shí)別形成套目前四十一頁(yè)\總數(shù)九十一頁(yè)\編于十七點(diǎn)5種RNA和50多種蛋白質(zhì)參與誰切小分子RNA,
small
nuclear
RNAs,SnRNAs
<200ntU1
U2
U4
U5
U6稱作包含每種SnRNA和至少7種蛋白質(zhì)結(jié)合成5種小核糖核蛋白(顆粒)存在方式Small
nuclear
ribonucleo-protein
(particle),snRNP英文名稱snRNP為核心,加其他蛋白構(gòu)成剪切體作用方式目前四十二頁(yè)\總數(shù)九十一頁(yè)\編于十七點(diǎn)——除去hnRNA中的內(nèi)含子,將外顯子連接。snRNP與hnRNA結(jié)合成為剪切體①mRNA剪接目前四十三頁(yè)\總數(shù)九十一頁(yè)\編于十七點(diǎn)目前四十四頁(yè)\總數(shù)九十一頁(yè)\編于十七點(diǎn)目前四十五頁(yè)\總數(shù)九十一頁(yè)\編于十七點(diǎn)A目前四十六頁(yè)\總數(shù)九十一頁(yè)\編于十七點(diǎn)3
U2snRNP與分支點(diǎn)配對(duì)置換BBP和U2AF,但U2只和分支點(diǎn)7個(gè)堿基中的6個(gè)配對(duì),游離出一個(gè)A,且活化狀態(tài)1
BBP
(branch-point
binding
protein)和U2AF與分支點(diǎn)結(jié)合2
U1snRNP與5’端配對(duì)目前四十七頁(yè)\總數(shù)九十一頁(yè)\編于十七點(diǎn)U6更容易和5’剪切位點(diǎn)結(jié)合,故置換U1。U4也排擠出剪切體U4/U6-U5復(fù)合物加入U(xiǎn)6,U2形成特殊構(gòu)象,A-2’OH攻擊內(nèi)左OH親核攻擊外左目前四十八頁(yè)\總數(shù)九十一頁(yè)\編于十七點(diǎn)外顯子連接內(nèi)含子套索含U一起,然后被降解目前四十九頁(yè)\總數(shù)九十一頁(yè)\編于十七點(diǎn)BBP
(branch-point
binding
protein)和U2AF與分支點(diǎn)結(jié)合U1snRNP通過堿基互補(bǔ)方式識(shí)別mRNA前體5’剪接位點(diǎn)U2snRNP與分支點(diǎn)配對(duì)置換BBP和U2AF,但U2只和分支點(diǎn)7個(gè)堿基中的6個(gè)配對(duì),游離出一個(gè)A,且活化狀態(tài)U4/U6-U5復(fù)合物加入U(xiǎn)6更容易和5’剪切位點(diǎn)結(jié)合,故置換U1。U4也排擠出剪切體目前五十頁(yè)\總數(shù)九十一頁(yè)\編于十七點(diǎn)U6,U2形成特殊構(gòu)象,A-2’OH攻擊內(nèi)左OH親核攻擊外左目前五十一頁(yè)\總數(shù)九十一頁(yè)\編于十七點(diǎn)內(nèi)含子5’端斷開前一個(gè)外顯子3’末端OH攻擊下后個(gè)外顯子的5末端前后外顯子的連接目前五十二頁(yè)\總數(shù)九十一頁(yè)\編于十七點(diǎn)目前五十三頁(yè)\總數(shù)九十一頁(yè)\編于十七點(diǎn)目前五十四頁(yè)\總數(shù)九十一頁(yè)\編于十七點(diǎn)目前五十五頁(yè)\總數(shù)九十一頁(yè)\編于十七點(diǎn)
ModificationresultinginthematuremRNAineukaryoticcells目前五十六頁(yè)\總數(shù)九十一頁(yè)\編于十七點(diǎn)外顯子內(nèi)含子DNAmRNA轉(zhuǎn)錄形成套索RNA,外顯子靠近剪接體去除套索RNA,外顯子連接成熟mRNAmRNA的剪接目前五十七頁(yè)\總數(shù)九十一頁(yè)\編于十七點(diǎn)成熟mRNA前mRNA3w1500一般28500目前五十八頁(yè)\總數(shù)九十一頁(yè)\編于十七點(diǎn)成熟mRNA前mRNA20w1w凝血因子VIII基因19w目前五十九頁(yè)\總數(shù)九十一頁(yè)\編于十七點(diǎn)成熟mRNA前mRNA200w1.6w杜興氏肌肉營(yíng)養(yǎng)不良癥198w目前六十頁(yè)\總數(shù)九十一頁(yè)\編于十七點(diǎn)I型內(nèi)含子的自我剪接I型內(nèi)含子的自我剪接主要是轉(zhuǎn)酯反應(yīng),即兩次磷酸二酯鍵的轉(zhuǎn)移。第一次轉(zhuǎn)酯反應(yīng)是由GTP,GDP,GMP,GM中鳥苷酸上的3’-OH作為親核基團(tuán)攻擊內(nèi)含子5’端的磷酸二酯鍵,從上游切開RNA鏈。第二次轉(zhuǎn)酯反應(yīng)是由上游外顯子的自由3’-OH作為親核基團(tuán)攻擊內(nèi)含子3’端的磷酸二酯鍵,將內(nèi)含子完全切除。目前六十一頁(yè)\總數(shù)九十一頁(yè)\編于十七點(diǎn)II型內(nèi)含子的自我剪接II型內(nèi)含子的自我剪接同樣是發(fā)生兩次磷酸二酯鍵的轉(zhuǎn)移第一次轉(zhuǎn)酯反應(yīng)是由內(nèi)含子中腺苷酸上的2’-OH作為親核基團(tuán)攻擊內(nèi)含子5’端的磷酸二酯鍵,從上游切開RNA鏈。內(nèi)含子形成套索結(jié)構(gòu)。第二次轉(zhuǎn)酯反應(yīng)是由上游外顯子的自由3’-OH作為親核基團(tuán)攻擊內(nèi)含子3’端的磷酸二酯鍵,將內(nèi)含子完全切除。目前六十二頁(yè)\總數(shù)九十一頁(yè)\編于十七點(diǎn)I型和II型內(nèi)含子剪接的比較目前六十三頁(yè)\總數(shù)九十一頁(yè)\編于十七點(diǎn)01為什么先轉(zhuǎn)錄成內(nèi)含子,然后切除?02RNA拼接耗能巨大,收益是什么?03內(nèi)含子怎么來的?04為什么內(nèi)含子主要見于真核生物?05內(nèi)含子沒有生物學(xué)功能?Anythingthatcanhappendoeshappensomewhere.目前六十四頁(yè)\總數(shù)九十一頁(yè)\編于十七點(diǎn)我們有3萬基因但10萬種蛋白質(zhì),可以怎么實(shí)現(xiàn)?目前六十五頁(yè)\總數(shù)九十一頁(yè)\編于十七點(diǎn)人典型基因3種剪接方式。故我們有3萬基因但10萬種蛋白質(zhì)。極端,果蠅一個(gè)gene3.8w多種剪接方式隨機(jī)事件導(dǎo)致染色體斷裂,相連的時(shí)候若在編碼序列?若在內(nèi)含子呢?可變剪接進(jìn)化目前六十六頁(yè)\總數(shù)九十一頁(yè)\編于十七點(diǎn)目前六十七頁(yè)\總數(shù)九十一頁(yè)\編于十七點(diǎn)0102030405內(nèi)含子剪接的生物學(xué)意義進(jìn)化調(diào)節(jié)起源真核編碼大概半數(shù)gene外顯子和和pro結(jié)構(gòu)域或亞基等對(duì)應(yīng)。例如,血紅蛋白3個(gè)外顯子,對(duì)應(yīng)其四個(gè)亞基豆血紅蛋白4個(gè)外顯子和4個(gè)亞基完全對(duì)應(yīng)外顯子內(nèi)含子外顯子內(nèi)含子蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)域亞基目前六十八頁(yè)\總數(shù)九十一頁(yè)\編于十七點(diǎn)0102030405內(nèi)含子剪接的生物學(xué)意義進(jìn)化調(diào)節(jié)起源真核編碼可以通過選擇剪接控制不同發(fā)育階段或不同組織的gene表達(dá)目前六十九頁(yè)\總數(shù)九十一頁(yè)\編于十七點(diǎn)0102030405內(nèi)含子剪接的生物學(xué)意義進(jìn)化調(diào)節(jié)起源真核編碼I自我拼接,分布極廣。II自我拼接。III真核生物最多的剪接形式。IV核內(nèi)tRNA,應(yīng)該在真核前35177-10目前七十頁(yè)\總數(shù)九十一頁(yè)\編于十七點(diǎn)0102030405內(nèi)含子剪接的生物學(xué)意義進(jìn)化調(diào)節(jié)起源真核編碼主要見于真核生物,原核生物可能為了快速生長(zhǎng)拋棄了內(nèi)含子。隨機(jī)事件導(dǎo)致染色體斷裂,相連的時(shí)候若發(fā)生在內(nèi)含子?如果發(fā)生在編碼序列?促進(jìn)新蛋白質(zhì)的合成,新舊蛋白并存利于機(jī)體長(zhǎng)時(shí)間自然選擇,有益的固定。目前七十一頁(yè)\總數(shù)九十一頁(yè)\編于十七點(diǎn)0102030405內(nèi)含子剪接的生物學(xué)意義進(jìn)化調(diào)節(jié)起源真核編碼外顯子內(nèi)含子是相對(duì)的I有的編碼核酸內(nèi)切酶,可以轉(zhuǎn)座II有的編碼核酸內(nèi)切酶或逆轉(zhuǎn)錄酶,協(xié)助內(nèi)含子專一。有些核仁小RNA由內(nèi)含子產(chǎn)生目前七十二頁(yè)\總數(shù)九十一頁(yè)\編于十七點(diǎn)真核和原核生物轉(zhuǎn)錄比較共同點(diǎn)不同點(diǎn)模板原料大致過程連接方式配對(duì)方式產(chǎn)物發(fā)生位置RNA聚合酶RNA聚合酶的作用方式啟動(dòng)子順式作用元件反式作用因子延長(zhǎng)過程終止過程產(chǎn)物終止后加工目前七十三頁(yè)\總數(shù)九十一頁(yè)\編于十七點(diǎn)RNA編輯作用說明,基因的編碼序列經(jīng)過轉(zhuǎn)錄后加工,是可有多用途分化的,因此也稱為分化加工(differentialRNAprocessing)。人類apoB基因mRNA(14500個(gè)核苷酸)肝臟apoB100(分子量為500000)腸道細(xì)胞apoB48(分子量為240000)mRNA編輯目前七十四頁(yè)\總數(shù)九十一頁(yè)\編于十七點(diǎn)為什么mRNA可以不必太多3%-5%,而rRNA相對(duì)要對(duì)目前七十五頁(yè)\總數(shù)九十一頁(yè)\編于十七點(diǎn)原核生物mRNA幾乎不需要編輯,就可以進(jìn)行翻譯但rRNA和tRNA前體需要加工。目前七十六頁(yè)\總數(shù)九十一頁(yè)\編于十七點(diǎn)原核生物rRNA轉(zhuǎn)錄后的加工大腸桿菌共有三種rRNA,5SrRNA、16SrRNA和23SrRNA。3種rRNA基因和1個(gè)tRNA基因組成一個(gè)操縱子tRNA數(shù)量種類和位置都可能變化,但三種rRNA十分保守。目前七十七頁(yè)\總數(shù)九十一頁(yè)\編于十七點(diǎn)真核細(xì)胞有4種rRNA,其中一種為5SrRNA,幾乎不需要加工。其余3種(18S,5.8S和28SrRNA)轉(zhuǎn)錄為一條rRNA前體。前體含有18S,5.8S,和28SrRNA序列各一個(gè)拷貝45S前體rRNA修飾酶RNA聚合酶I目前七十八頁(yè)\總數(shù)九十一頁(yè)\編于十七點(diǎn)rRNA修飾酶小分子核仁RNA(smallnucleolarRNA,snoRNA)由什么構(gòu)成蛋白質(zhì)1.獨(dú)立基因編碼2.編碼核糖體蛋白的mRNA前體剪切下的內(nèi)含子來源目前七十九頁(yè)\總數(shù)九十一頁(yè)\編于十七點(diǎn)四膜蟲rRNA的結(jié)構(gòu)目前八十頁(yè)\總數(shù)九十一頁(yè)\編于十七點(diǎn)四膜蟲rRNA內(nèi)含子的二級(jí)結(jié)構(gòu)四膜蟲rRNA的剪接采用自我剪接方式5′-端核苷酸序列目前八十一頁(yè)\總數(shù)九十一頁(yè)\編于十七點(diǎn)與mRNA和rRNA剪接不同,負(fù)責(zé)tRNA加工的酶全是蛋白質(zhì)構(gòu)成。目前八十二頁(yè)\總數(shù)九十一頁(yè)\編于十七點(diǎn)tRNA前體RNApolⅢTGGCNNAGTGCGGTTCGANNCCDNA真核生物tRNA的轉(zhuǎn)錄后加工目前八十三頁(yè)\總數(shù)九十一頁(yè)\編于十七點(diǎn)RNaseDRNaseP切除核酸內(nèi)切酶tRNA連接酶甲基化還原等稀有堿基修飾tRNA的轉(zhuǎn)錄后加工16個(gè)核苷酸的5’端前導(dǎo)區(qū)14個(gè)核苷酸的內(nèi)含子3’端2個(gè)額外的核苷酸目前八十四頁(yè)\總數(shù)九十一頁(yè)\編于十七點(diǎn)四個(gè)亞基組成的核酸內(nèi)切酶切除內(nèi)含子(藍(lán)色部分)目前八十五頁(yè)\總數(shù)九十一頁(yè)\編于十七點(diǎn)tRNA核苷酸轉(zhuǎn)移酶、連接酶ADPATPtRNA的轉(zhuǎn)錄后加工目前八十六頁(yè)\總數(shù)九十一頁(yè)\編
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