Analyst軟件應(yīng)用培訓(xùn)教程Analyst軟件應(yīng)用培訓(xùn)教程關(guān)于本教程的說明：本教程為ABSciex公司為在中國使用的客戶培訓(xùn)的輔助材料。本教程僅提供給經(jīng)過ABSciex公司培訓(xùn)合格的操作人員使用。本教程內(nèi)容僅限于Analyst軟件基本操作和應(yīng)用部分。本教程提供的分析方法僅對用戶起參考作用。本教程解釋權(quán)在ABSciex公司。Analyst軟件應(yīng)用培訓(xùn)教程全文共173頁，當(dāng)前為第1頁。目錄Analyst軟件應(yīng)用培訓(xùn)教程全文共173頁，當(dāng)前為第1頁。1、定量分析簡明流程2、成功定量分析應(yīng)注意的問題3、定性分析原則與方法4、LC-MS實驗經(jīng)驗與儀器維護常識5、Analyst軟件操作簡介：Calculator功能與使用Library功能與使用部分Script功能與使用其他6、Analyst軟件QTRAP功能基本操作簡介：QTRAP掃描速度的校正QTRAP系統(tǒng)的掃描方式QTRAP系統(tǒng)IDA指南7、部分化合物液質(zhì)分析參考方法和信息8、壓力單位轉(zhuǎn)換表LC-MS/MS定量分析簡明教程Analyst軟件應(yīng)用培訓(xùn)教程全文共173頁，當(dāng)前為第2頁。首先確認儀器已經(jīng)校準(zhǔn)，氣體、電壓工作正常Analyst軟件應(yīng)用培訓(xùn)教程全文共173頁，當(dāng)前為第2頁。一．溶液配制分別將待分析化合物的標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì)配制成1～10ppm(1～10ug/ml)的溶液，用于注射泵連續(xù)進樣，以優(yōu)化質(zhì)譜參數(shù)。二．Q1Scan，確定母離子a．選擇或建立Project建立一個新項目(Project)：點擊Tools→Project→CreatProject，出現(xiàn)下圖對話框，鍵入項目名稱，點擊“AddAll”添加項目功能，點擊OK，完成。Analyst軟件應(yīng)用培訓(xùn)教程全文共173頁，當(dāng)前為第3頁。Analyst軟件應(yīng)用培訓(xùn)教程全文共173頁，當(dāng)前為第3頁。b.硬件配制：激活MS主機，如果是API2000、3200，硬件配置文件中的質(zhì)譜主機中應(yīng)選擇IntegratedSyringePump。c.進入MS的ManualTuning界面，并設(shè)置注射泵流速5～10ul/min。d．選擇質(zhì)譜掃描方式：Q1Scan，設(shè)置掃描范圍(應(yīng)包含待分析的化合物)；根據(jù)化合物性質(zhì)，選擇掃描極性e．手動調(diào)節(jié)DP、GS1等參數(shù)，使噴霧平穩(wěn)、待分析化合物信號靈敏度較高f．MCAon，點擊Acquire，采集并存儲20～50張加和圖譜(根據(jù)靈敏度)，并保存方法，例如：Q1.damAnalyst軟件應(yīng)用培訓(xùn)教程全文共173頁，當(dāng)前為第4頁。g．在質(zhì)譜圖區(qū)域，點擊右鍵－“OpenFile”打開圖譜，局部放大，確定母離子的質(zhì)荷比，準(zhǔn)確到0.1amu。，如下圖，母離子m/z應(yīng)為609.3。Analyst軟件應(yīng)用培訓(xùn)教程全文共173頁，當(dāng)前為第4頁。三．ProductIonScan，確定子離子以第一步測得值為母離子，做ProductIonScan（MS2），手動調(diào)節(jié)CE等參數(shù)，使母、子離子都具有一定強度，一般以母離子的強度占圖譜中基峰強度的1/3到1/4為宜。MCAon，點擊Acquire，采集并存儲20～50張加和圖譜，并保存方法，例如：609-MS2.dam。Analyst軟件應(yīng)用培訓(xùn)教程全文共173頁，當(dāng)前為第5頁。在質(zhì)譜圖區(qū)域，點擊右鍵“OpenFile”打開圖譜，選擇2個最高的子離子，如上圖中，選擇195、397，局部放大，確定子離子的質(zhì)荷比，準(zhǔn)確到0.1amu，則上面兩個子離子為195.2、397.3。Analyst軟件應(yīng)用培訓(xùn)教程全文共173頁，當(dāng)前為第5頁。四．MRM，優(yōu)化質(zhì)譜中與化合物相關(guān)的參數(shù)以前兩步選定的母離子、子離子，組成離子對，例如609.3/195.2，609.3/397.3等，做MRMScan，每個離子對的分析時間100或200ms。Analyst軟件應(yīng)用培訓(xùn)教程全文共173頁，當(dāng)前為第6頁。通過EditRamp，分別優(yōu)化Compound項下的各參數(shù)，如DP、EP、CE、CXP等：點擊EditRamp，選擇要優(yōu)化的參數(shù)→點擊OK，出現(xiàn)該參數(shù)的優(yōu)化窗口，可以根據(jù)需要改變該參數(shù)的優(yōu)化范圍(Start、Stop)和優(yōu)化步長(Step)。不同參數(shù)需逐一優(yōu)化。Analyst軟件應(yīng)用培訓(xùn)教程全文共173頁，當(dāng)前為第6頁。然后保存方法，例如609-MRM.dam。同樣步驟，優(yōu)化需要分析的另外化合物，分別保存方法。五、將MRM方法轉(zhuǎn)化為液質(zhì)聯(lián)用方法關(guān)掉所有質(zhì)譜分析界面，將現(xiàn)有質(zhì)譜體系滅活，激活液相色譜、質(zhì)譜設(shè)備。單擊Acquire中BuildAcquireMethod，打開上面保存過的MRM方法，右鍵顯示方法左邊導(dǎo)引條中第一行AcquireMethod，點擊Add/RemoveDeviceMethod添加設(shè)備：色譜泵、自動進樣器選中方法左邊導(dǎo)引條中第一行AcquireMethod參數(shù)頁，設(shè)置色譜同步。Analyst軟件應(yīng)用培訓(xùn)教程全文共173頁，當(dāng)前為第7頁。Analyst軟件應(yīng)用培訓(xùn)教程全文共173頁，當(dāng)前為第7頁。設(shè)置色譜參數(shù)，分析時間一般為0.8～1min，流動相組成和流量與實際樣品分析時相同；修改質(zhì)譜分析時間(Duration，一般設(shè)置0.8～1min)，與色譜參數(shù)一致；設(shè)置GS1、GS2、TEM初始值為40、40、400左右，保存方法，例如：LC-MRM.dam。六、源參數(shù)優(yōu)化將上面用過的樣品溶液稀釋100～1000倍。在Tune項下，雙擊QuantitativeOptimization，選擇FIA分析，根據(jù)向?qū)нM行自動優(yōu)化。Analyst軟件應(yīng)用培訓(xùn)教程全文共173頁，當(dāng)前為第8頁。注意：需要優(yōu)化的各可選值之間用“;”分隔。Analyst軟件應(yīng)用培訓(xùn)教程全文共173頁，當(dāng)前為第8頁。七．色譜條件優(yōu)化接好色譜柱，關(guān)掉Tune，在Acquire欄下調(diào)出上一步優(yōu)化好的方法，根據(jù)色譜柱規(guī)格和待分析體系的復(fù)雜程度設(shè)置液相色譜分離和質(zhì)譜分析時間，或編輯洗脫梯度，保存方法。用新保存的方法平衡色譜柱，平衡時間為5～10倍柱體積。色譜柱充分平衡后，設(shè)置Batch進樣，觀察色譜峰形及保留時間是否合適，根據(jù)具體情況，調(diào)節(jié)流動相，優(yōu)化色譜條件。用空白提取液配制同樣濃度標(biāo)樣，按上面方法進樣，觀察色譜峰形及保留時間是否合適，峰高有無變化，有無離子抑制現(xiàn)象，否則調(diào)節(jié)流動相，進一步優(yōu)化色譜條件。注意：等度洗脫，樣品之間不需要再平衡色譜柱，若為梯度洗脫，則進下一針樣品前色譜柱一定要充分平衡。八．工作曲線制備用空白提取液配制一系列不同濃度化合物的混合標(biāo)樣，按上一步方法，設(shè)置Batch進樣，例如，分別稀釋濃度為0.1μg/ml、0.2μg/ml、0.4μg/ml、0.8μg/ml和1.6μg/ml的混合標(biāo)準(zhǔn)溶液等。根據(jù)項目分析要求，有時也可只做單點校正，而不做多點線性。將采集的數(shù)據(jù)，根據(jù)峰面積，做標(biāo)準(zhǔn)曲線。根據(jù)檢測項目要求，進一步考證方法的最低檢測限、重現(xiàn)性、樣品提取回收率等性能參數(shù)。成功定量分析應(yīng)注意的問題Analyst軟件應(yīng)用培訓(xùn)教程全文共173頁，當(dāng)前為第9頁。一、準(zhǔn)備工作Analyst軟件應(yīng)用培訓(xùn)教程全文共173頁，當(dāng)前為第9頁。1.查閱文獻2.做好樣品前處理，萃取、濃縮、分離、純化等3.有條件的可先在HPLC上摸好LC條件，能夠基線分離更好，注意緩沖體系應(yīng)符合MS的要求4.溶劑(包括水)的純度，最好色譜純以上5.新的色譜柱可能要先沖洗很長時間才能干凈，某些樣品非常容易吸附在進樣閥和管路中，應(yīng)及時用溶劑清洗6.質(zhì)譜儀須校準(zhǔn)，預(yù)熱時間要足夠長，氣流的穩(wěn)定也很重要，液氮氣閥開度要注意，達到穩(wěn)定程度二、MS條件優(yōu)化——先定性后定量1.首先，根據(jù)待分析化合物的性質(zhì)，確定離子化方式：ESIorAPCI，POSorNEG2.用1-100ppm的純樣，Q1SCAN察看存在哪些離子，要能夠看到待測的母離子，應(yīng)明顯比周圍的噪聲離子高，通過改變DP，觀察離子的增減，若為POS方式，看M+1，M+18，M+23等等，初步判斷分子離子，如看不到則可能是濃度太低或離子化方式不合適，或選擇的溶劑體系不合適。3.母離子選M+H，或M-H最好，但有時只有M+NH4，M+Na等，此時CAD能量可能需要高些。選擇[M+H]+，還是+NH4，+Na等，要由化合物決定。加合離子若穩(wěn)定，則可用，不穩(wěn)定則可能需要更換流動相，但+H的離子通常好些，所需碰撞能量低，靈敏度高；如含Cl可選擇2個母離子峰。4.SIM與MRM方式的選擇：單級Q只能SIM，MRM可看成2個SIM，選擇性更好。5.再根據(jù)上一步確定的母離子進行ProductScan，確保所有碎片離子都來自待測化合物，而不是溶液中的雜質(zhì)，找出較強的碎片離子信息。通過改變CE，從中選定MRM需要測定的一對或更多離子對，為最后LC-MS/MS聯(lián)用做準(zhǔn)備。6.做ProductScan時，注意小數(shù)點后的位數(shù)。MRM離子對信息輸入準(zhǔn)確，靈敏度才會高。7.先多選幾個離子對，待出現(xiàn)基質(zhì)干擾時可換，最后根據(jù)法規(guī)要求確定離子對數(shù)目。8.MRM方式優(yōu)化儀器，通過優(yōu)化儀器參數(shù)，使得母、子離子都達到一定強度水平，使MRM靈敏度最高?？上茸寖x器自動優(yōu)化參數(shù)，然后再手動細致優(yōu)化，只檢測一對離子時根據(jù)TIC的強度來確定儀器參數(shù)，一次優(yōu)化多對離子時，要根據(jù)每對離子的XIC強度來分別確定儀器參數(shù)。9.先用注射泵優(yōu)化Compound項下面的參數(shù)，如DP、CE及CAD等，再接通LC，用FIA優(yōu)化其他參數(shù)如溫度，氣流和IS電壓及離子源位置，或接一個三通，樣品仍由注射泵進入離子源，同時LC保持需要的流量。然后進行MRM測定。10.CurtainGas在不降低靈敏度情況下盡量大些，溫度在達到靈敏度時不用太高，氣流也不用太大，這樣可以提高信噪比，保持信號穩(wěn)定。11.分辨率的選擇：當(dāng)樣品較純，Q3可選LOW，提高靈敏度，若選LOW后本底噪聲太高則意義不大。三、LC條件優(yōu)化：Analyst軟件應(yīng)用培訓(xùn)教程全文共173頁，當(dāng)前為第10頁。1.色譜柱長度可根據(jù)分離的要求而定，定性可長些，定量在能有效排除干擾情況下盡量短，提高效率；內(nèi)徑最好選細徑柱如2mm、1mm，IS可不分流，4.6mm柱用1ml流量時如不分流靈敏度還不是最佳，不如流量低時更好。流速高，峰形好。Analyst軟件應(yīng)用培訓(xùn)教程全文共173頁，當(dāng)前為第10頁。2.不同牌號色譜柱，效果很可能不同。3.pH的影響：正離子方式pH要低些，負離子方式pH要高些，除對離子化有影響外，還影響LC的峰形，以至定量誤差。流動相加乙酸銨可適合大部分測定要求。4.用流動相配制標(biāo)樣，初步優(yōu)化確定LC條件是否合適。5.標(biāo)準(zhǔn)品工作液現(xiàn)配現(xiàn)做，尤其是較低濃度，時間長了可能因吸附分解等降低。6.進樣順序要先稀后濃。7.洗針液要常換，進過濃樣后要進一針空白，檢驗是否有殘留污染。8.順序：純樣-添加樣-實際樣品。9.流動相配制的標(biāo)準(zhǔn)品溶液優(yōu)化后，用空白提取液配制標(biāo)準(zhǔn)品再次優(yōu)化，考察干擾情況，空白添加再提取后，考察回收率。10.用空白提取液配制標(biāo)準(zhǔn)樣品做工作曲線，可以有效排除干擾因素。四、前處理方法的優(yōu)化1.LC，MS都優(yōu)化過，還是達不到靈敏度要求或無法檢測，需要改進提取方法2.離子抑制：改變前處理方法或LC條件3.內(nèi)標(biāo)用法，藥代動力學(xué)時多采用內(nèi)標(biāo)，選擇原則：內(nèi)標(biāo)物與被測物的化學(xué)性質(zhì)有區(qū)別時，要注意干擾基質(zhì)對他們的離子化影響的不同，盡量選同系物。還可利用同位素標(biāo)記的同一化合物作為內(nèi)標(biāo)。衍生化：有時有助于使信號增強，且穩(wěn)定，例如硝基呋喃類，衍生化后容易測定。五、數(shù)據(jù)處理1.最低檢出限，信噪比3:1，定量限10:12.同一物質(zhì)幾對離子的比例應(yīng)相對恒定，誤差不超過15%峰面積，比使用峰高定量準(zhǔn)確3.當(dāng)濃度低，信號弱，自動積分不準(zhǔn)時，可對峰面積手動積分4.平滑次數(shù)與峰寬因子、保留時間等設(shè)置都會影響積分值5.曲線過零點時，可用4個點；不用，則需要5個點6.線性范圍太寬，有時意義不大定性分析原則與方法一、準(zhǔn)備工作1.核對樣品名稱、編號Analyst軟件應(yīng)用培訓(xùn)教程全文共173頁，當(dāng)前為第11頁。2.通過詢問樣品提供人，查閱文獻等，了解樣品其他知識，例如熔點，沸點，溶解性等理化性質(zhì)以及樣品來源、合成路線、光譜、波譜數(shù)據(jù)等Analyst軟件應(yīng)用培訓(xùn)教程全文共173頁，當(dāng)前為第11頁。3.可能含有的雜質(zhì)，樣品大致含量4.樣品保存狀況，對溫度，光是否敏感5.進行LC-MS分析前最好大致清楚LC條件，使體系得到比較好的分離，流動相緩沖體系符合MS要求6.色譜柱和管路的清洗：新的色譜柱以及分析過大量樣品的色譜柱，可能要先沖洗很長時間才能干凈；某些樣品非常容易吸附在進樣閥和管路中，尤其是采用針泵進樣時，應(yīng)先用空白溶劑充分清洗管路。7.如果原來溶解樣品的溶劑不合適LC-MS分析，此時應(yīng)用N2吹干，再用流動相定量溶解。溶解樣品的溶劑一定要和流動相一致，否則得到的譜圖不純，峰形不好，變寬，出怪峰等等；某些固體直接用流動相不溶，可以先加一滴DMSO(二甲亞砜)，再加甲醇或乙腈等稀釋。8.進樣順序要先稀后濃，定量溶解，濃度控制在幾個ppm級，不然易污染系統(tǒng)，造成本底太高影響分析結(jié)果。9.濃度非常低的樣品不能保存太長時間，容器吸附、分解等原因使樣品濃度降低，樣品工作液應(yīng)現(xiàn)配現(xiàn)做。二、色譜柱的選擇1.選擇原則：可長一些，最好能夠基線分離，若做不到，可以通過提取離子(XIC)來得到較好的色譜圖。內(nèi)徑無要求，粗細均可，但注意應(yīng)使流動相的流速與色譜柱的內(nèi)徑相匹配(一般，4.6mm柱，流速1ml/min；3mm柱，流速500ml/min；2.1mm柱，流速200ml/min；1mm柱，流速50ul/min左右)。2.流動相流量大小，MS分析前是否需要分流，取決于使用的離子源。一般API2000/3000，流速高于600ml/min，需要分流；對于API3200/4000/5000，由于使用TurboV離子源，流速低于2ml/min的情況，皆不需要分流。3.要對各種廠家的色譜柱有所了解，對于一些特殊的化合物必需使用特殊的色譜柱進行分離，相關(guān)的知識可以向色譜柱供應(yīng)商索取。大多數(shù)著名的色譜柱廠商都有自己的色譜柱分析數(shù)據(jù)庫，里面可能會有你想要的信息。三、LC條件的優(yōu)化1.LC梯度的設(shè)定，目的是快速分離，峰形好，縮短時間，提高效率，可以將所有化合物都沖出，防止影響下一個樣品的測定。2.采取梯度洗脫，如分析多肽類化合物一般采取梯度洗脫，此時的信號會比等度洗脫時強很多，而且加大進樣量，是提高靈敏度的一種有效措施，但是分析時間較長，且需要有色譜柱平衡的時間。四、確定離子化方式1.根據(jù)樣品性質(zhì)確定離子化方式：對于高極性的化合物，如：大分子(蛋白質(zhì)、肽類、低聚核苷酸等生物分子)、胺類、季銨鹽等、含雜原子化合物如氨基甲酸酯等，適合ESI；弱極性/中等極性的小分子，如脂肪酸，鄰苯二甲酸等；含雜原子化合物如氨基甲酸酯、脲等，適合APCI2.不適合用ESI方式的化合物：極端非極性化合物如苯等；不適合用APCI方式的化合物：非揮發(fā)性、熱穩(wěn)定性差的樣品3.一般堿性化合物宜用正離子方式，酸性化合物宜用負離子方式，如未知，可能正負都要做，有些化合物正負都出峰，選擇靈敏度高的方式，不明確的優(yōu)先用正離子方式試Analyst軟件應(yīng)用培訓(xùn)教程全文共173頁，當(dāng)前為第12頁。4.APPI，適合非極性化合物，同GC/MS有重復(fù)，但一般小型臺式GC/MS，分子量范圍小，APPI比GC/MS可測比較高分子量的化合物。Analyst軟件應(yīng)用培訓(xùn)教程全文共173頁，當(dāng)前為第12頁。五、初步定性-確定化合物的分子量1.對于純樣品，首先可采用針泵直接進樣，察看存在哪些離子，設(shè)置低的DP電壓可使譜圖簡單。通過改變DP，觀察離子的增減，M+1、+18、+23、+39、2M+1等等，初步判斷分子量2.注意要采集一段時間的溶解樣品的溶劑本底信息，DP同實際樣品相同，以便扣除本底干擾，可使用高、低DP電壓各做一次，例如20V、80V等，一般低流速FIA方式最適合3.注意，當(dāng)樣品溶液內(nèi)含有強離子抑制物質(zhì)時，直接進樣可能看不到化合物的分子峰，此時需要經(jīng)色譜柱分離或重新處理樣品。4.選擇一種通用的源參數(shù)及源位置，以適合樣品中大部分化合物的分析，該參數(shù)的確定可按照定量方法中FIA優(yōu)化，通常主要取決于流動相有機溶劑比例和流速。正離子方式常出現(xiàn)如下離子：1.-Na22Da.higherthanM+H-K38Da.higherthanM+H-Li6Da.higherthanM+H-NH417Da.higherthanM+H-ACN40Da.higherthanM+HAnalyst軟件應(yīng)用培訓(xùn)教程全文共173頁，當(dāng)前為第13頁。2.有時還可能出現(xiàn)M+H2O+H、2M+H、3M+H、2M+Na等Analyst軟件應(yīng)用培訓(xùn)教程全文共173頁，當(dāng)前為第13頁。3.有意添加可以幫助確定化合物的分子量：例如有幾個峰無法判斷分子離子是哪個，此時加入微量Li+，有可能觀察到增加6的峰，而通常碎片峰很少加合。負離子方式常出現(xiàn)如下離子：1.-TFA114Da.higherthanM-H(113、227為背景離子)2.-Acetate60Da.higherthanM-H3.-Formic46Da.higherthanM-H4.-Cl36Da.higherthanM-HLC-MS中常見的本底離子：1.m/z50-150,溶劑離子，[(H2O)nH+，n=3-112]2.m/z102,H+乙腈+乙酸,C4H7NO2H+,102.05493.m/z102,三乙胺,(C2H5)3NH+,102.12834.m/z149,管路中鄰苯二甲酸酯的酸酐，C8H4O3H+,149.02335.m/z288,2ml離心管產(chǎn)生的特征離子6.m/z279,管路中鄰苯二甲酸二丁酯C16H22O4H+,279.15917.m/z316,2ml離心管產(chǎn)生的特征離子8.m/z384,樣品瓶光穩(wěn)定劑產(chǎn)生的離子9.m/z391,管路中鄰苯二甲酸二辛酯,C24H38O4H+,391.284310.m/z413,鄰苯二甲酸二辛酯+鈉,C24H38O4Na+,413.266811.m/z538,乙酸+氧+鐵（噴霧管）,Fe3O(O2CCH3)6,537.8793同位素離子1.各種元素的同位素，基本上按照其在自然界的豐度比出現(xiàn)在質(zhì)譜中，這對于利用質(zhì)譜確定化合物及碎片的元素組成有很大方便，如氯35和37，溴79和81。2.同位素分布圖，可用Analyst中計算器(Calculator)功能模擬，對于分子量較大，含C較多的分子，最高峰可能是C13同位素峰，分析數(shù)據(jù)時要注意。3.利用穩(wěn)定同位素合成標(biāo)記化合物，如：氘等標(biāo)記的化合物，再用質(zhì)譜法檢出這些化合物，在質(zhì)譜圖外貌上無變化，只是質(zhì)量數(shù)的位移，從而說明化合物結(jié)構(gòu)，反應(yīng)歷程等。六、提取特征離子色譜圖(XIC)1.利用提取離子色譜圖來確定特征離子，在復(fù)雜混合物分析及痕量分析時是LC/MS測定中最有用的方式。當(dāng)樣品濃度很低時LCMS的TIC上往往看不到峰，此時，根據(jù)上一步得到的分子量信息，輸入M+1或M+23等數(shù)值，觀察提取離子的質(zhì)量色譜圖，檢驗直接進樣得到的信息是否在LC-MS上都能反映出來，確定LC條件是否合適，以后進行MRM等其他掃描方式的測定時參考。2.調(diào)機時，注意質(zhì)量數(shù)不要偏差太大，先用標(biāo)準(zhǔn)品校準(zhǔn)儀器，如偏差很小，可不用重新校準(zhǔn)儀器，讀取分子量數(shù)值時要多采集幾次，用平均或累加后得到的質(zhì)譜圖來讀取離子質(zhì)量，會相對準(zhǔn)確。Analyst軟件應(yīng)用培訓(xùn)教程全文共173頁，當(dāng)前為第14頁。Analyst軟件應(yīng)用培訓(xùn)教程全文共173頁，當(dāng)前為第14頁。七、影響分子量測定的因素1.pH的影響-正離子方式pH要低些，負離子方式pH要高些，除對離子化有影響外，還影響LC的峰形2.氣流和溫度，當(dāng)水含量高及流量大時要相應(yīng)增加3.溶劑和緩沖液流量，流速適當(dāng)高可以提高出峰靈敏度4.溶劑和緩沖液的類型，通常正離子甲醇好，負離子乙腈好些5.不揮發(fā)性鹽的影響：大量累積，會使儀器的靈敏度下降6.根據(jù)樣品結(jié)構(gòu)和性質(zhì)，選擇合適的液相色譜類型：正相、反相、C4、C18…7.合適的電壓：DP電壓高時，樣品在源內(nèi)分解或碎裂；高DP電壓會使多電荷離子比例低，多聚體也減少8.雜質(zhì)的影響：溶劑的純度、水的純凈程度等。當(dāng)成分復(fù)雜，雜質(zhì)太多時，競爭使被測物離子化不好，同時使LC分離不好9.樣品濃度不夠，有時需要濃縮八、樣品預(yù)處理的常用方法：a）超濾b）溶劑萃取/去鹽c）固相萃取d）灌注（Perfusion）凈化/去鹽e）色譜分離：反相色譜分離、親和技術(shù)分離…Analyst軟件應(yīng)用培訓(xùn)教程全文共173頁，當(dāng)前為第15頁。f）甲醇或乙睛沉淀蛋白Analyst軟件應(yīng)用培訓(xùn)教程全文共173頁，當(dāng)前為第15頁。g）酸水解，酶解h）衍生化…九、目標(biāo)化合物的檢測和譜圖解析1.如果是純樣，則直接進行ProductScan，找出碎片信息，同樣要扣本底。做ProductScan時，注意輸入母離子質(zhì)荷比小數(shù)點后的位數(shù)，輸入準(zhǔn)確，靈敏度才會高，而且不容易出錯，得到的譜圖相對干凈。2.處理得到的數(shù)據(jù)，一種方法是庫檢索，另外就是手工譜圖解析。為使庫檢索的結(jié)果準(zhǔn)確，可使用不同的碎裂能量(如CE：20，35，50V)各采集一張MS2圖譜(QTRAP用戶可以使用新的CES功能：三張圖譜疊加)。因為化合物性質(zhì)不同，需要CE不同。對同一化合物，可以使用高、低能量分別碰撞，高質(zhì)量區(qū)的碎片和低質(zhì)量區(qū)碎片對推測結(jié)構(gòu)都很重要；低碎裂能量可以判斷主要碎片，高碎裂能量可看到更多信息；手工解析可以參考質(zhì)譜解析書籍。Analyst軟件應(yīng)用培訓(xùn)教程全文共173頁，當(dāng)前為第16頁。Analyst軟件應(yīng)用培訓(xùn)教程全文共173頁，當(dāng)前為第16頁。3.若為混合物或含有基質(zhì)的實際樣品，則首先由標(biāo)準(zhǔn)品建立方法，按照定量的步驟，選擇至少2對MRM(四個數(shù)據(jù)點)，進行LC-MS/MS分析，可以利用IDA中MRM-MS2工作流程，提高檢測靈敏度。Analyst軟件應(yīng)用培訓(xùn)教程全文共173頁，當(dāng)前為第17頁。譜圖解析：Analyst軟件應(yīng)用培訓(xùn)教程全文共173頁，當(dāng)前為第17頁。1.IDA：FullScan-MS2，一次進樣，得到大部分信息，進一步可以再細一些，采用靈敏度更高的方法確證。2.加大DP，用串聯(lián)四極桿實現(xiàn)擬MS3功能，以進行進一步的結(jié)構(gòu)解析。3.前體離子掃描(PREC)和中性碎片丟失掃描(NL)：尋找代謝產(chǎn)物，解析肽磷段酸化位點等4.互補性方法，選已知同系物，研究其裂解規(guī)律，有共同的碎片或相差同樣質(zhì)量數(shù)，再擴展到未知物。下圖為天然產(chǎn)物結(jié)構(gòu)分析的一種思路：LC-MS實驗技巧與儀器維護常識Analyst軟件應(yīng)用培訓(xùn)教程全文共173頁，當(dāng)前為第18頁。樣品制備方面：Analyst軟件應(yīng)用培訓(xùn)教程全文共173頁，當(dāng)前為第18頁。樣品處理的好壞直接關(guān)系到整個LC-MS分析的成敗，必須要有成熟規(guī)范的樣品制備方法。樣品預(yù)處理各步不能隨意省略，如萃取、分離、去鹽等。某些化合物必須化學(xué)衍生化以適應(yīng)LC-MS要求，如磷酸酯水解。若MS信號實在太低，考慮更換樣品處理方法。濃度非常低的樣品不能保存太長時間，容器吸附、分解等原因使樣品濃度降低，標(biāo)準(zhǔn)品工作液現(xiàn)配現(xiàn)用。離子化方法選擇一般原則：根據(jù)樣品性質(zhì)確定離子化方式適合ESI(IS)的樣品類型：高極性化合物、蛋白質(zhì)、肽類、低聚核苷酸等生物分子；胺類、季銨鹽等；含雜原子化合物如氨基甲酸酯等適合APCI的樣品類型：弱極性/中等極性的小分子，如脂肪酸，鄰苯二甲酸等含雜原子化合物如氨基甲酸酯、脲等ESI不適合的化合物：極端非極性化合物如苯等；APCI不適合的化合物：非揮發(fā)性樣品；熱穩(wěn)定性差的樣品堿性化合物宜用正離子方式酸性化合物宜用負離子方式如未知,可能正負都要做有些化合物正、負模式都出峰，選擇靈敏度高的方式，不明確的優(yōu)先試用正離子方式LC條件的選擇：1.根據(jù)化合物類型選擇流動相組成，甲醇-水，乙腈-水或甲醇-乙腈-水2.某些化合物只有某種流動相體系才出峰3.一般正離子方式用甲醇，負離子方式用乙腈好些4.通常有機相比例高些，可以提高離子化效率5.梯度的設(shè)定：梯度變化太快對離子化效率影響很大，相應(yīng)源參數(shù)也應(yīng)該改變，所以恒定比例流動相能滿足分離分析要求時，盡量不用梯度，尤其定量分析時6.流動相中加入甲酸、乙酸銨等可提高正離子化效率7.是否加酸不是絕對的，具體應(yīng)根據(jù)LC的分離情況、樣品在酸性條件下的穩(wěn)定性等決定Analyst軟件應(yīng)用培訓(xùn)教程全文共173頁，當(dāng)前為第19頁。8.通常pH值低時，[M+H]+比率高；pH值高時，[M+Na]+、[M+K]+，或[M+NH4]+比率高Analyst軟件應(yīng)用培訓(xùn)教程全文共173頁，當(dāng)前為第19頁。9.定性分析時，有時加一些NH4+，Li+等，可幫助確定判斷母離子，對碎片較少的化合物，可以增加其質(zhì)譜特征性，但會使生物大分子的質(zhì)譜復(fù)雜化10.水的選擇：娃哈哈純凈水比普通蒸餾水好；若在玻璃瓶中已存放時間太長，有可能變質(zhì)。當(dāng)本底增大，LC壓力增高，應(yīng)更換水相。11.溶解樣品的溶劑：用流動相或甲醇、乙腈溶比用含水多的溶劑LC峰系形好。如果常用的流動相不能很好溶解樣品，可用少量特殊溶劑先將樣品溶解后再用流動相稀釋。12.LC流量在色譜柱和MS允許情況下適當(dāng)高可以壓縮峰寬，使峰強度提高。13.使用長的色譜柱，對定性分離效果好，但分析時間延長，如峰形仍不理想，可考慮另選其他型號色譜柱。14.柱后補償：當(dāng)不得不用高濃度TFA時，常用異丙醇，解決信號抑制問題。柱后衍生化，有時可以增加離子化效率。調(diào)機準(zhǔn)備1.儀器平衡時間：真空，溫度，LC流動相比例，寧可長些。2.容器注意，塑料離心管添加劑很容易混入，尤其是被有機溶劑浸泡時間較長時，干擾物信號有可能超過待測物。3.LCPump脫氣，可以快速放掉柱前部管路中液體，排凈氣泡；還要注意檢查LC流動相儲液瓶液面的高度。儀器參數(shù)的優(yōu)化：1.先用PPG或一已知化合物校準(zhǔn)，如偏差不大，可以不用做質(zhì)量校正，但偏高、偏低要心中有數(shù)。2.先用濃度大約0.1-1ppm的標(biāo)樣，通過syringepump，以5-10ul/min優(yōu)化Compound項下面的參數(shù)，如DP，CE，EP，CXP及CAD等。3.順序：Q1Scan–ProductionScan–MRM。4.不同化合物參數(shù)有可能差別很大。5.再接通LC用FIA優(yōu)化其他參數(shù)及源位置,(或接一個三通，樣品仍由注射泵進入離子源，同時LC保持需要的流量)，優(yōu)化溫度和Gas1及Gas2，CXP、CAD、EP，優(yōu)化后通常不用再改，在保證樣品充分離子化的基礎(chǔ)上，DP低些使母離子豐度提高，總靈敏度也會相應(yīng)提高。6.質(zhì)量范圍不要太寬，涵蓋待測離子再增加20-30amu即可。7.采樣時間適當(dāng)長些噪聲低，當(dāng)同時檢測數(shù)十對離子時，MRM采樣時間可以數(shù)十毫秒；同時檢測數(shù)對離子時，可100-200毫秒。8.母、子離子輸入的質(zhì)量數(shù)值要選準(zhǔn)，要根據(jù)Q1Scan及ProductionScan得到的結(jié)果輸入，不能只是整數(shù)。當(dāng)不能確定精確質(zhì)量數(shù)時，可選待測質(zhì)量數(shù)上下各0.1amu，同時數(shù)對離子優(yōu)化，最終找出靈敏度最佳的一對離子。例如321.0-152.0，321.1-152.0，320.9-151.9…。9.若樣品較雜，同一化合物要選擇幾對母、子離子，經(jīng)進樣實驗找出哪對有干擾，去掉，保留不易受干擾的1-2對離子。10.每對離子各參數(shù)分別設(shè)，如DP、CE、Time等，對較弱離子對，采樣時間可適當(dāng)長些。11.運行Ramp分別優(yōu)化各參數(shù)一次，Step選小些更準(zhǔn)，范圍不用太寬，每次優(yōu)化重復(fù)兩次以上，以減小偶然誤差。Analyst軟件應(yīng)用培訓(xùn)教程全文共173頁，當(dāng)前為第20頁。12.根據(jù)LC流量和流動相組成確定溫度和Gas1及Gas2，當(dāng)流量大，水相多時，溫度及氣流要大。離子源噴霧位置是根據(jù)LC流量調(diào)節(jié)的，基本上流量固定位置就固定。Analyst軟件應(yīng)用培訓(xùn)教程全文共173頁，當(dāng)前為第20頁。13.調(diào)節(jié)噴霧電壓，但太高有可能會導(dǎo)致放電。14.調(diào)節(jié)Q1及Q3分辨率。15.許多源參數(shù)互相影響，需要反復(fù)細調(diào),使信噪比得以改善。儀器清洗：1.做完含生物體液樣品后，LC需多沖些時間，使吸附到色譜柱上的干擾物完全洗脫下來。2.若本底高，清洗離子源噴霧針管和orifice，噴霧針可拆下超聲清洗，orifice要用無塵紙沾溶劑(甲醇:水1:1)擦。3.清洗管路，可從源上拆下Peek，或?qū)⒃磸膬x器上取下，用SyringePump洗，換不同溶劑，極性、非極性、酸等輪番沖洗，最后甲醇/水。4.清洗進樣針，進樣閥5.用過含酸的流動相后，色譜柱，離子源都要用甲醇/水沖，延長儀器和色譜柱的壽命。6.做完MRM后，用手動使儀器處于Q1SCAN，降溫，停大流量LC，最后關(guān)氣，但管路中最好有些水，不要完全干。提高靈敏度的其他方法：1.做純標(biāo)樣時，Q1、Q3的分辨率可以選擇Low，S/N提高一倍，而噪聲并不增高；若復(fù)雜混合物，因為有基質(zhì)干擾，不宜選LOW。2.適當(dāng)加大進樣量，可以延伸檢測下限。3.濃縮樣品，測定后再推算回原始濃度。4.譜圖平滑后可提高信噪比，可多次平滑。5.負離子模式時，使用零級空氣比氮氣靈敏度提高。6.適當(dāng)提高檢測器電壓。7.當(dāng)化合物很穩(wěn)定不易產(chǎn)生碎片，可考慮采用Ar、Xe等原子量較大的氣體，以增加碰撞能量。儀器無信號診斷與處理：1.在需要工程師到達之前，首先說明出現(xiàn)此現(xiàn)象的時機，是正在工作時突然出現(xiàn)，還是一段時間沒用儀器，開機后出現(xiàn)的，在此之前，動了儀器哪些部位，是某些掃描方式?jīng)]有信號還是都沒有信號。2.例如MRM無信號，先看Q1、Q3有無信號。若Q1、Q3有信號，則通常是Analyst參數(shù)設(shè)置問題，若無，則繼續(xù)下一步。3.看有無本底信號，即有沒有電噪聲，如有，則可能是離子源或軟件問題。4.檢查真空，Q1SCAN方式時，通常應(yīng)該0.7-1.2×10-5torr之間，過好可能是Orifice堵塞，過差則可能是漏氣或真空泵有問題。5.電源電壓是否超限，UPS顯示正常否？6.更換了離子源以后，高壓線是否插好到位？噴霧電壓設(shè)置正確與否?7.各路氣體壓力是否正常，閥門是否打開，加熱氣開了嗎？8.離子源噴霧針重裝后，有無漏氣，漏液？有無液體從針外壁流出？Analyst軟件應(yīng)用培訓(xùn)教程全文共173頁，當(dāng)前為第21頁。9.管路有否堵塞，一節(jié)一節(jié)拆開測試，看通否；噴霧是否均勻，泵壓是否過高。通常不接色譜柱，200ul/min流速，壓力應(yīng)不超過幾十psi。Analyst軟件應(yīng)用培訓(xùn)教程全文共173頁，當(dāng)前為第21頁。10.若為APCI，檢查流速是否過低(如沒接LC，只用注射泵)，放電尖端對正方向沒有，放電電流是否加上?11.若為APPI，有沒有通甲苯？12.若為NanoSpray，檢查噴霧針是否損壞：針尖碰斷了沒有？高壓放電燒壞或樣品堵塞針尖？外涂金屬層被磨掉？加不上高壓，需提高噴霧電壓才有信號等，都要更換新的噴霧針。13.有無氣泡，注射針里面，LC流動相管路是否有空氣，流速低時多等一會兒，可手推一下注射針，幫助液體快速到達噴霧針。14.診斷軟件的使用要在工程師指導(dǎo)下進行，一定要OffLine15.在工程師指導(dǎo)下，可用萬用表測量各點電壓值，判斷故障點。進樣管及spraytube堵塞：1.用Syringe推：直線噴出——沒有堵塞2.若堵，取下用50水/50甲醇超聲清洗3.超聲仍無效，則需要更換進樣管及噴霧針Orifice堵塞：現(xiàn)象：靈敏度下降或真空度異常的好處理方法：a.50水/50甲醇清洗orifice外部b.不能解決問題時再清洗orifice內(nèi)部儀器靈敏度低時的診斷與處理：1.首先按照無信號處理方法檢查。2.Orifice臟也可引起真空變差，當(dāng)CurtainGas很高才好，說明臟了，清洗。3.機械泵油半年以上沒換，或顏色加深，換油；低于刻度下限，補充。注意要用同型號的油。4.管路漏液，樣品沒有完全進到離子源里。5.管路部分堵塞，噴霧時斷時續(xù)。6.先調(diào)出安裝儀器時的PPG等方法，用注射泵SyringePump，進PPG看看，CAL漂移否，若CAL不對，造成質(zhì)量數(shù)無法選準(zhǔn)，重新校準(zhǔn)儀器。7.若注射泵采集標(biāo)準(zhǔn)品正常，則再看樣品，然后用Reserpine等標(biāo)準(zhǔn)品，接通LC，如果有手動進樣閥，可從此處進樣，看FIA有無峰，若無，則可能是LC及源參數(shù)設(shè)置問題。8.如果正常，則排除MS，再自動進樣，看FIA有無峰，若無，則可能是自動進樣器問題。9.若FIA正常，則再繼續(xù)接上色譜柱采樣，判斷是色譜柱問題還是流動相問題。10.離子化方式是否對路，如非極性物質(zhì)用ESI效果很差，有機酸采用正離子方式?jīng)]什么信號。11.樣品本身的問題，如樣品沒有完全溶解，濃度不夠，所用溶劑與流動相不匹配等。12.樣品存貯時間過長，保存條件不好，則會因分解或被吸附等原因?qū)е聺舛冉档?。Analyst軟件應(yīng)用培訓(xùn)教程全文共173頁，當(dāng)前為第22頁。13.放在自動進樣器中的樣品小瓶內(nèi)套管底部有氣泡，沒取到樣品，或針頭位置太高，而樣品液面太低。Analyst軟件應(yīng)用培訓(xùn)教程全文共173頁，當(dāng)前為第22頁。14.前處理步驟中，標(biāo)準(zhǔn)品、內(nèi)標(biāo)樣品是否加進，提取過程中有無遺灑。15.離子抑制，改變前處理方法或LC梯度，或換為APCI也可以降低部分離子抑制效應(yīng)。16.離子對質(zhì)量數(shù)輸入準(zhǔn)確否，有無錯誤？數(shù)據(jù)重復(fù)性差時的診斷與處理：1.參考前面各步驟2.CurtainGas太低，有周期性降低現(xiàn)象。3.DwellTime太長，每個色譜峰采樣點太少，重現(xiàn)性下降，一般一個色譜峰，至少8點以上；DwellTime太短，則噪聲會增高，使信噪比降低。4.新色譜柱沒有充分平衡，舊色譜柱老化，重新清洗活化，或更換。5.離子對的選擇有問題，如：M+Na做為母離子不穩(wěn)定，子離子若為脫水峰亦不太好。6.源溫度太高，導(dǎo)致樣品分解。7.加樣前與標(biāo)液分別平行做處理，觀察有無區(qū)別，若標(biāo)準(zhǔn)品溶液無問題，而樣品重復(fù)性差，則問題可能出在基質(zhì)的干擾或前處理方法不當(dāng)。8.稀釋配制樣品的移液槍，移液管，容量瓶等有無問題。9.某些樣品正離子改為負離子試試，干擾少，重復(fù)性會好些。10.樣品管中吸附(尤其低濃度)，導(dǎo)致不成線性，如氨基糖甙，加些甲酸或乙酸，可以改善。11.盡量使用流動相溶解樣品，如果不同，例如用甲醇溶解樣品，流動相是乙腈/水，則出峰亂，稀釋時殘存甲醇都會有影響。12.梯度洗脫后平衡時間不夠，或臟東西沒洗干凈，累積使得，徹底洗柱子。13.手動閥如果沒問題了，再看自動進樣器有無問題。14.空調(diào)波動，與儀器在同一供電線路上，啟動/停止會影響儀器真空，進而影響實驗結(jié)果。15.當(dāng)液氮剩不多時，及使用鋼瓶時，尤其注意壓力變化。16.流動相雖有在線脫氣，但裝入前超聲還是必要的。17.Peek吸附，F(xiàn)IA時明顯，例：分析四環(huán)素，乙腈/水：（0.1%乙酸）30/70，由開始時一個峰最后可能變?yōu)閮蓚€峰。另外保留時間也會改變，應(yīng)該充分沖洗管路。軟件死機時處理方法：1.由于鼠標(biāo)操作太快，打開窗口太多造成的死機，重啟Analyst軟件，正在采集的數(shù)據(jù)不會丟失，用CTRL-ALT-DEL，Windows任務(wù)管理器結(jié)束Analyst任務(wù)。尤其當(dāng)采集數(shù)據(jù)時，實時查看譜圖不要用箭頭翻看前后一次的數(shù)據(jù)，可重新打開一個新的譜圖。注意不要在一張譜圖上過多次計算信噪比，本底范圍也不要選擇太寬。2.當(dāng)SyringePump到頭時（API2000，QTRAP，QSTAR），右下角圖標(biāo)變黃，須先點擊Standby，再點擊Ready。3.當(dāng)由于HPLC的原因，如漏夜等引起圖標(biāo)變紅，首先排除HPLC故障，并重新開關(guān)所有HPLC設(shè)備一次，待自檢通過后，先Deactivate，再重新激活。4.AnalystServicesStop，中斷計算機與儀器通訊，本次采集的數(shù)據(jù)丟失；重啟Windows-正在采集的數(shù)據(jù)會丟失。5.由于Exhaust排氣管不通暢，引起圖標(biāo)變紅，首先清理排氣管，如果圖標(biāo)仍然是紅色，有可能是閥憋住了，要打開Exhaust進氣口，放氣，然后再重新接好。Analyst軟件應(yīng)用培訓(xùn)教程全文共173頁，當(dāng)前為第23頁。6.以上步驟都失靈時，在C盤的ProgramFiles－Analyst－Frimware中雙擊SCU21，按F4，ResetSystemController，等儀器主機上指示燈不再閃碩，重新進入Analyst。Analyst軟件應(yīng)用培訓(xùn)教程全文共173頁，當(dāng)前為第23頁。7．重裝Analyst軟件前，先將APIInstrument中InstrumentDATA和ParameterSetting兩個文件Copy出來，然后卸載Analyst軟件，再重裝，不要修復(fù)。還要用SCU21查看Frimware版本號，如不對要Download，參見軟件安裝說明。注意計算機用戶名，不能有符號，只能是字母和數(shù)字，還要以管理員身份登陸。8．當(dāng)軟件運行速度很慢，經(jīng)常死機，可考慮增加計算機內(nèi)存，但要DELL專用的內(nèi)存。9．如果出現(xiàn)不能控制附加設(shè)備情況，檢查是否需要加補丁程序，具體看Hotfix的說明。10．有時由于計算機的問題，引起軟件工作異常，如提交后不采集數(shù)據(jù)等，試試重新編輯Method，Batch，Configuration。11．經(jīng)常清理計算機磁盤碎片，定期查殺病毒，如果中毒太深，可能需要硬盤格式化。12.Analyst1.4每次啟動出現(xiàn)如圖頁面，點“X”或“RegisterLater”按鈕即可。儀器日常維護方法：1.操作順序是先開氣，再加熱，然后通液體進樣，停止實驗時要相反的順序退出2.退出軟件及Standby前，把儀器設(shè)定到Q1正離子模式3.注射泵不要讓它推到頭4.隨時檢查氣壓curtaingas壓力0.35–0.4Mpa；Exhaustgas壓力0.35–0.4Mpa不能超限5.定期更換或清潔空氣過濾網(wǎng)Analyst軟件應(yīng)用培訓(xùn)教程全文共173頁，當(dāng)前為第24頁。Analyst軟件應(yīng)用培訓(xùn)教程全文共173頁，當(dāng)前為第24頁。7.注意儀器后面的排氣出口必須保持通暢機械泵維護方法：1.注意機械泵油的顏色，變深后換油，至少半年換一次2.經(jīng)常檢查機械泵油液面正常位置3.機械泵油的更換方法：首先關(guān)機，要在油處于溫?zé)釥顟B(tài)下排出，加新油不要過多，刻度一半即可。LC-MS/MS質(zhì)譜數(shù)據(jù)庫的使用因為LC-MS的高本底，很難獲得足夠純的化合物的碎片質(zhì)譜圖，所以這里的質(zhì)譜數(shù)據(jù)庫中都是二級質(zhì)譜圖，即通常的MS2或EPI譜。1、數(shù)據(jù)庫的導(dǎo)入Analyst軟件應(yīng)用培訓(xùn)教程全文共173頁，當(dāng)前為第25頁。原來默認的數(shù)據(jù)庫是compoundlib.mdb,存儲在D:\AnalystData目錄下，里面已經(jīng)包含了數(shù)據(jù)庫的所有功能，但其譜圖數(shù)量較少。將新的數(shù)據(jù)庫文件*.mdbCOPY到D:\AnalystData\，如果數(shù)據(jù)庫文件是由CD來的，則需將其文件的只讀屬性去掉。然后在Explore項下依次打開Tools--Settings—OptimizationOptions，此時出現(xiàn)如圖右側(cè)界面，在中間點擊Browse，找到你需要的庫文件名，選中并打開，選中的庫文件名則在左側(cè)下拉式菜單格中出現(xiàn)。Analyst軟件應(yīng)用培訓(xùn)教程全文共173頁，當(dāng)前為第25頁。繼續(xù)點擊右下的TestConnection，成功后再點擊Save將其存盤，最后OK退出。Analyst軟件應(yīng)用培訓(xùn)教程全文共173頁，當(dāng)前為第26頁。2、二級質(zhì)譜圖檢索打開一幅二級質(zhì)譜圖，點擊鼠標(biāo)右鍵，選擇SearchLibrary，開始搜索Analyst軟件應(yīng)用培訓(xùn)教程全文共173頁，當(dāng)前為第26頁。如果庫中沒有你要找的化合物，則出現(xiàn)如下提示，Analyst軟件應(yīng)用培訓(xùn)教程全文共173頁，當(dāng)前為第27頁。如果搜索成功，則繼續(xù)顯示下圖結(jié)果：Analyst軟件應(yīng)用培訓(xùn)教程全文共173頁，當(dāng)前為第27頁。圖左上譜是未知物譜，左側(cè)第二和第三幅譜是庫中檢索出最匹配的兩個譜，左下是檢索出的結(jié)果，包括化合物名稱、分子式、分子量、符合率、純度和碰撞能量等內(nèi)容，右側(cè)是UV譜（如果有的話）和結(jié)構(gòu)式及化合物信息。通過點擊圖上部的ViewManager—HitList，可以編輯修改界面顯示內(nèi)容，例如下圖中將UV和結(jié)構(gòu)式去掉了，這樣可使界面簡單。點擊左上Subtract，使得未知物譜與檢索出的譜互相扣減，顯示于左側(cè)第三幅位置，便于觀察相似度。Analyst軟件應(yīng)用培訓(xùn)教程全文共173頁，當(dāng)前為第28頁。Analyst軟件應(yīng)用培訓(xùn)教程全文共173頁，當(dāng)前為第28頁。二級質(zhì)譜圖檢索還可以通過提供一些限制條件來進行，同樣打開一幅二級質(zhì)譜圖，點擊鼠標(biāo)右鍵，選擇SetSearchConstraints，出現(xiàn)下圖右側(cè)選項，根據(jù)你的需要打勾。如點擊右下角的PeakConstraints，出現(xiàn)中間畫面，可以加減質(zhì)譜峰來檢索，例如去掉明顯的雜質(zhì)峰或由于未知物峰太弱太少而加上，以提高檢索成功率。Analyst軟件應(yīng)用培訓(xùn)教程全文共173頁，當(dāng)前為第29頁。3、在數(shù)據(jù)庫中增加譜圖Analyst軟件應(yīng)用培訓(xùn)教程全文共173頁，當(dāng)前為第29頁。同樣打開一幅二級質(zhì)譜圖，點擊鼠標(biāo)右鍵，選擇AddaRecord，出現(xiàn)下圖右側(cè)界面，需要輸入化合物名稱等信息，允許你修改或刪除右側(cè)的峰數(shù)據(jù)，下半部分的信息是儀器采集數(shù)據(jù)時自動記錄的，但也允許修改，檢查無誤后OK確認。如果要在圖中加入化合物結(jié)構(gòu)式，則點擊上部的GeneralInformation，出現(xiàn)下面的界面，點擊Browse，尋找結(jié)構(gòu)式文件（需要你預(yù)先用結(jié)構(gòu)式畫圖軟件自己制做），如圖右下部，注意必須是后綴為.MOL格式的文件，才能聯(lián)接，打開后出現(xiàn)在圖中空白處。4、數(shù)據(jù)庫的編輯Analyst軟件應(yīng)用培訓(xùn)教程全文共173頁，當(dāng)前為第30頁。在Explore項下打開最下一行LibrarySearch--ListAnalyst軟件應(yīng)用培訓(xùn)教程全文共173頁，當(dāng)前為第30頁。得到如下一張表格，列出該數(shù)據(jù)庫的所有化合物名稱、分子式、分子量、CA號和該化合物質(zhì)譜圖數(shù)量，通過雙擊第一欄Title，可以按照你要求的順序重新排序。允許你執(zhí)行編輯、刪除、添加和打印等操作。Analyst軟件應(yīng)用培訓(xùn)教程全文共173頁，當(dāng)前為第31頁。Analyst軟件應(yīng)用培訓(xùn)教程全文共173頁，當(dāng)前為第31頁。首先選中你要編輯的譜的那一行任意一格，點擊Edit，出現(xiàn)同在數(shù)據(jù)庫中增加譜圖一樣的界面，可執(zhí)行同樣的操作。Analyst軟件應(yīng)用培訓(xùn)教程全文共173頁，當(dāng)前為第32頁。如果同一化合物有不同碰撞能量的譜，則首先需要將此譜在Explore中激活，然后點擊Append，則將此譜加入到同一化合物名稱內(nèi)。Analyst軟件應(yīng)用培訓(xùn)教程全文共173頁，當(dāng)前為第32頁。Analyst軟件應(yīng)用培訓(xùn)教程全文共173頁，當(dāng)前為第33頁。計算器使用指南Analyst軟件應(yīng)用培訓(xùn)教程全文共173頁，當(dāng)前為第33頁。該指南包括了Analyst軟件中關(guān)于計算器的各個方面。點擊Tools，從下拉菜單中選擇Calculators。Calculators鼠標(biāo)右鍵有各種功能可以利用。1、元素組成檢索(ElementalComposition)計算器可以根據(jù)輸入的質(zhì)荷比，確定目標(biāo)分子或氨基酸的可能組成，質(zhì)荷比可以手動輸入或者從一張擊活的圖譜中自動獲得。從一張擊活的圖譜中自動獲得質(zhì)荷比的方法：選擇TutorialData項目，使用導(dǎo)航欄中的OpenDataFile打開TOFMS829.wiff數(shù)據(jù)文件，也可以從File下拉菜單中選擇打開。Analyst軟件應(yīng)用培訓(xùn)教程全文共173頁，當(dāng)前為第34頁。將鼠標(biāo)置于TIC圖的邊上，左擊，然后拖著橫蓋過整張TIC圖并雙擊。拖著選擇數(shù)據(jù)，雙擊則對涂蘭的部分圖譜加以平均，平均后的質(zhì)譜圖出現(xiàn)在TIC圖下方。選中TIC窗口，點擊“DeletePane”圖標(biāo)，刪除TIC窗口。Analyst軟件應(yīng)用培訓(xùn)教程全文共173頁，當(dāng)前為第34頁。Analyst軟件應(yīng)用培訓(xùn)教程全文共173頁，當(dāng)前為第35頁。拖拉鼠標(biāo)選擇m/z829離子。打開Tools菜單，選擇Calculators并點擊ElememtalComposition表。所選峰的質(zhì)量數(shù)出現(xiàn)在Targetm/z框中。Analyst軟件應(yīng)用培訓(xùn)教程全文共173頁，當(dāng)前為第35頁。選擇一個新的峰，然后點擊Targetm/z表的灰色區(qū)域。所選峰的值將自動輸入Targetm/z框中。注意出現(xiàn)在Targetm/z窗口中的質(zhì)量數(shù)可能與圖譜中的值略有差異。圖譜根據(jù)AppearanceOptions指定的標(biāo)記優(yōu)先來標(biāo)記峰，而計算器所用的值永遠是中心質(zhì)量。打開Tools下拉菜單，然后選擇Settings和AppearanceOptions，可以改變圖譜中峰的標(biāo)記。在OtherGraphOptions表中，圖譜的標(biāo)記方法可以通過圖譜欄中的AutomaticLabeling選擇。Tolerance決定測量值和計算質(zhì)量數(shù)之間允許的差異，單位為ppm或mDa。這是QSTAR數(shù)據(jù)因而有精確質(zhì)量。對于QSTAR數(shù)據(jù)，Tolerance在100-300mDa之間，質(zhì)量Tolerance增加，給出可能的化合物的數(shù)目也相應(yīng)增加。選擇ResultType作為元素或氨基酸。在Maxnumofresults框中設(shè)定最多要求的結(jié)果數(shù)，即給出的化合物的數(shù)量，通常定在20-200。接下來，輸入Min/MaxDBE的限制。這是指預(yù)期的環(huán)+雙鍵數(shù)（不飽和度），并允許在指定的Min/MaxDBE范圍內(nèi)尋找化合物的分子式。MinDBE采用負值以便解釋簇離子的出現(xiàn)。根據(jù)化合物的電子數(shù)，electronstate可以被指定為even，odd或evenandodd。生物分子的電噴霧MS和MS/MS通常產(chǎn)生偶電子系統(tǒng)。在Numofcharges框中指定化合物含有的電荷數(shù)，電荷狀態(tài)可以是正、負或零。點擊SetElmentsandLimits指定潛在的氨基酸或化合物中出現(xiàn)的元素。關(guān)于化合物的信息可以作為定義每一個元素或氨基酸的參考。本例中，m/z829離子是不含S或P的多肽，所以這些設(shè)為零并點擊OK。Analyst軟件應(yīng)用培訓(xùn)教程全文共173頁，當(dāng)前為第36頁。設(shè)好上述參數(shù)后，點擊Calculate計算可能的分子式。分子式按照與目標(biāo)m/z值偏差大小排列，第一個結(jié)果最接近目標(biāo)m/z值。結(jié)果列舉分子式，分子式計算的m/z值，計算值與目標(biāo)m/z值之間的誤差（誤差以ppm或mDa表示）以及分子式的不飽和度DBE值。Analyst軟件應(yīng)用培訓(xùn)教程全文共173頁，當(dāng)前為第36頁。Highlight一個潛在的組成（以C39H73N8O11為例），并點擊ShowIsotopic顯示所選成分的同位素分布。如果圖譜被激活，同位素數(shù)據(jù)將以虛線疊加在圖譜上。否則一個只含有同位素數(shù)據(jù)的新圖譜將產(chǎn)生。點擊“ExporttoFile”將計算的元素組成數(shù)據(jù)輸出到一個新文件。輸入文件名并點擊保存。2、HypermassHypermass計算器確定基于不帶電荷物質(zhì)的多電荷質(zhì)譜形式。從TutorialDataproject中打開GlobinTOF10ug_uL1.wiff，由TIC顯示圖譜。接下來，從Tools下拉菜單打開Calculators。指定UnchargedMass（本例中輸入15215作為質(zhì)量數(shù)）以及相應(yīng)的框中離子化加和。指定儀器的極性（正或負）并點擊Calculate。通過點擊窗口下端的表，多電荷質(zhì)譜形式可以被顯示為Hypermassseries或Text。Analyst軟件應(yīng)用培訓(xùn)教程全文共173頁，當(dāng)前為第37頁。Analyst軟件應(yīng)用培訓(xùn)教程全文共173頁，當(dāng)前為第37頁。選擇OverlayonPlot可以將計算的Hypermassbars疊加到一張激活的數(shù)據(jù)圖譜上。點擊Eraseexistinghighlight可以在疊加新的圖譜之前從一張激活的數(shù)據(jù)圖譜上檫去所有前面計算的Hypermass數(shù)據(jù)。3、ElementalTargeting根據(jù)指定形式采用ElementalTargeting計算器簡化數(shù)據(jù)圖譜，或者尋找指定形式峰的MS數(shù)據(jù)圖譜。簡化數(shù)據(jù)圖譜只包括一個感興趣的化合物，在Matchtypes中選擇IS，并在Formula框中輸入希望的分子式。指定搜尋的Tolerance，包括質(zhì)量數(shù)（amu）和強度（%）。該程序在數(shù)據(jù)圖譜中尋找相對于指定分子式的同位素形式的峰，以分子式的m/z值為中心，以Tolerance指定的為限。點擊Calculate得到簡化的數(shù)據(jù)圖譜。Analyst軟件應(yīng)用培訓(xùn)教程全文共173頁，當(dāng)前為第38頁。根據(jù)分子式尋找同位素形式分布，選中Contains，并在Formula框中輸入分子式。這個工具可以尋找與指定分子式相同的同位素分布，但是這次簡化圖譜的m/z值不必以分子式的m/z值為中心。再次指定尋找的Tolerance。點擊Calculate得到Analyst軟件應(yīng)用培訓(xùn)教程全文共173頁，當(dāng)前為第38頁?；谀撤N形式的簡化圖譜，選中Pattern，并在表中手動輸入MassDiff和Rel.Int.值。質(zhì)荷比最小的峰作為起點并指定質(zhì)量差異為0。4、質(zhì)量特性使用MassProperty窗口決定各種特性，如精確質(zhì)量，平均質(zhì)量，質(zhì)量精度和感興趣質(zhì)量數(shù)的質(zhì)量偏移。計算分子式的精確質(zhì)量，在分子式框中輸入分子式，點擊Calculate。精確質(zhì)量數(shù)值，標(biāo)稱質(zhì)量數(shù)，平均質(zhì)量，質(zhì)量偏移將顯示出來。找出精確質(zhì)量數(shù)值，輸入Formula或Exactmass。Measuremass也需要填入，可以手動輸入也可以在激活的圖譜上拖拉橫蓋過峰并點灰Measuremass文本附近區(qū)域?qū)崿F(xiàn)自動輸入。點擊Calculate將出現(xiàn)精確質(zhì)量數(shù)值（ppm和amu）。點擊ExporttoFile以一個獨立的數(shù)據(jù)文件形式輸出數(shù)值。5、同位素分布根據(jù)輸入的分子式采用IsotopicDiatribution計算器確定同位素分布。Analyst軟件應(yīng)用培訓(xùn)教程全文共173頁，當(dāng)前為第39頁。從TutorialDataproject中打開TOFMS829.wiff，由TIC顯示圖譜。接下來，從Tools下拉菜單打開Calculators并且選擇IsotopicDiatribution表。輸入感興趣的分子式（C39H73N8O11）從下拉菜單中選擇Elemental。輸入與選定的峰本身相同的分辨率值。在Numofcharges框中輸入化合物的電荷狀態(tài)。選擇AminoAcid，然后使用Addwater反映化合物的狀態(tài)。通過點擊Graph或Text表可以將同位素的分布顯示為圖譜或文本文件。Analyst軟件應(yīng)用培訓(xùn)教程全文共173頁，當(dāng)前為第39頁。在Eraseexistinghighlights打勾，在疊加新的圖譜之前檫去前面的同位素分布數(shù)據(jù)。最后點擊Overlayonplot，在激活的圖譜上疊加計算的同位素分布數(shù)據(jù)。Analyst軟件其他常用功能Analyst軟件應(yīng)用培訓(xùn)教程全文共173頁，當(dāng)前為第40頁。一、修改Batch實驗隊列Queue設(shè)置的默認值：Analyst軟件應(yīng)用培訓(xùn)教程全文共173頁，當(dāng)前為第40頁。Analyst軟件默認上樣數(shù)量為100，對應(yīng)于色譜自動進樣器的100位上樣瓶(較常用的自動進樣器配置)。如果使用其他類型的自動進樣器，或100位自動進樣器中有幾位瓶需要重復(fù)進樣，即默認的上樣數(shù)量100不夠用，需要增多，可以在軟件中修改次數(shù)目，方法如下：選中Configuration，點擊Tools下拉菜單中的Settings，選擇QueueOptions出現(xiàn)窗口：MaxNumWaiting：允許的最大上樣數(shù)目，默認值是100，輸入需要的實際數(shù)目MaxIdle：隊列中的實驗完成后，自動Standby的時間，默認值60min指隊列中的實驗完成60min后儀器自動Standby，可以根據(jù)需要修改DiskSpace：硬盤可用的空間二、報告打印模板及其編輯：Analyst軟件應(yīng)用培訓(xùn)教程全文共173頁，當(dāng)前為第41頁。雙擊Configure中ReportTemplateEditor，出現(xiàn)下面界面：Analyst軟件應(yīng)用培訓(xùn)教程全文共173頁，當(dāng)前為第41頁。將需要的信息添加到打印模板的相應(yīng)位置，實驗相關(guān)內(nèi)容為數(shù)據(jù)自動生成，不需要手工輸入。添加方法：選擇所需添加項目的位置，點擊所要添加的項目，點擊“>>”按鈕將其添加到指定的相應(yīng)位置中Analyst軟件應(yīng)用培訓(xùn)教程全文共173頁，當(dāng)前為第42頁。點擊“Font”可以選擇該項目的字體、字的大小等。Analyst軟件應(yīng)用培訓(xùn)教程全文共173頁，當(dāng)前為第42頁。如果需要手工輸入信息，如單位名稱，可以在“CustomField”項目中進行輸入。點擊該項目，出現(xiàn)下面窗口：設(shè)置完成后，保存模板。打印報告時，選擇建立好的報告模板，設(shè)置好的頁眉、頁腳會自動出現(xiàn)在設(shè)置好的位置。常用Script功能與使用方法簡介Script的安裝與卸載：Analyst軟件應(yīng)用培訓(xùn)教程全文共173頁，當(dāng)前為第43頁。Script的安裝：Analyst軟件應(yīng)用培訓(xùn)教程全文共173頁，當(dāng)前為第43頁。Analyst軟件應(yīng)用培訓(xùn)教程全文共173頁，當(dāng)前為第45頁。當(dāng)Analyst軟件安裝完成后，有幾個Script已經(jīng)安裝到軟件中。其他多數(shù)的Script其實也已經(jīng)在你的硬盤系統(tǒng)里，只是沒有被安裝到Analyst軟件中。Script的位置：C:\ProgramFiles\Analyst\Scripts中。Analyst軟件應(yīng)用培訓(xùn)教程全文共173頁，當(dāng)前為第45頁。Analyst軟件應(yīng)用培訓(xùn)教程全文共173頁，當(dāng)前為第46頁。安裝方法：打開相應(yīng)的Script文件夾，一般文件夾中會有3個文件，點擊Setup.exe可以完成相應(yīng)的安裝。如果點擊此安裝文件，無法完成安裝，則打開Install文件夾，將其中的*.dll文件拷貝到：D:\AnalystData\Projects\APIinstrument\ProcessScripts文件夾中。Analyst軟件應(yīng)用培訓(xùn)教程全文共173頁，當(dāng)前為第46頁。注意，通過Copy方式安裝的Script，多數(shù)可以正常使用，個別Script可能不能使用，或在使用時出錯。另外，多數(shù)Script尚未經(jīng)過完全的安全性測試，可能會引起系統(tǒng)的不穩(wěn)定，如果發(fā)現(xiàn)，請停止使用，二、Script的卸載：只要將D:\AnalystData\Projects\APIinstrument\ProcessScripts文件夾中的相應(yīng)*.dll文件刪除即可。注意：如果MS3不能正常安裝，則不僅將相應(yīng)*.dll文件拷貝到Analyst系統(tǒng)中，同時須將OptMS3.exe也一起拷貝到系統(tǒng)，即D:\AnalystData\Projects\APIinstrument\ProcessScripts文件夾中?；蛑苯狱c擊該Script\Install文件中的應(yīng)用文件OptMS3.exe打開并運行此功能其他，類似。ScriptIndex：1.S-to-NusingPeaktoPeak2.S-to-NusingStdDev3.DeleteOthers4.PeakResolution5.ExportIDASpectra6.ExporttoJCampAnalyst軟件應(yīng)用培訓(xùn)教程全文共173頁，當(dāng)前為第44頁。7.BuildMetIDMethodsAnalyst軟件應(yīng)用培訓(xùn)教程全文共173頁，當(dāng)前為第44頁。8.MakeSubsetFile9.ManuallyIntegrate10.MergeMRM11.MergeMethods12.BatchScriptDriver13.MultipleBatchScripts14.OpenInWorkspace15.Savitzky-GolaySmooth16.SelectionAverageamdStdDev17.UnitConversion18.XICfromTable19.ConvertMethodsToolsforAnalystSoftware20.QuanMethodFromandToText21.AutoTune22.MS3QuantOptimization23.MSn(4000QTRAP)1．S-to-NusingPeaktoPeak功能：信噪比計算工具。算法：峰-峰比，該算法是以噪音區(qū)域的極值噪音(即最大噪音與最小噪音的差值)作為噪音水平，計算信噪比。適用機型或軟件：所有QTRAP、API-3Q機型，Analyst1.4。使用方法：1．打開一張圖譜，用shift鍵，選中兩塊區(qū)域，其中，一為信號區(qū)域，另一為噪音區(qū)域2．點擊Script中S-to-NusingPeaktoPeak，此時選擇信號的信噪比值，以及信號強度、噪音水平一起在圖譜中顯示。2．S-to-NusingStdDev功能：信噪比計算工具。算法：是以噪音區(qū)域的個噪音的標(biāo)準(zhǔn)偏差值作為噪音水平，計算信噪比。適用機型或軟件：所有QTRAP、API-3Q機型，Analyst1.4。使用方法：1．打開一張圖譜，用shift鍵，選中兩塊區(qū)域，其中，一為信號區(qū)域，另一為噪音區(qū)域2．點擊Script中S-to-NusingStdDev3．出現(xiàn)S/N×stdDev窗口出現(xiàn)，輸入作為噪音水平的標(biāo)準(zhǔn)偏差的倍數(shù)，例如3，點擊Go，點擊此時選擇信號的信噪比值，以及信號強度、噪音水平一起在圖譜中顯示。當(dāng)輸入此倍數(shù)為1時，計算所得的信噪比也稱為均方根(RootMeanSquare，RMS)信噪比。若點擊該窗口中EraseLabels按鈕，可以清除圖譜中的已經(jīng)計算好的信噪比標(biāo)記。Analyst軟件應(yīng)用培訓(xùn)教程全文共173頁，當(dāng)前為第47頁。Analyst軟件應(yīng)用培訓(xùn)教程全文共173頁，當(dāng)前為第47頁。Analyst軟件應(yīng)用培訓(xùn)教程全文共173頁，當(dāng)前為第48頁。Analyst軟件應(yīng)用培訓(xùn)教程全文共173頁，當(dāng)前為第48頁。3．DeleteOthers功能：快速關(guān)閉多個窗口適用機型或軟件：所有QTRAP和API-3Q機型使用方法：選中需要保留的窗口，在Script下拉菜單中點擊“DeleteOthers”，則只有選中的窗口保留，其他窗口全部關(guān)閉。此項功能用于同時打開許多窗口，而只想保留一個窗口的情況。Analyst軟件應(yīng)用培訓(xùn)教程全文共173頁，當(dāng)前為第49頁。任何工作模式都可以用此項功能。如下圖顯示的是在手動調(diào)諧模式下使用此功能的例子。Analyst軟件應(yīng)用培訓(xùn)教程全文共173頁，當(dāng)前為第49頁。4．PeakResolution功能：計算給定峰值的分辨率適用機型或軟件：所有QTRAP、API-3Q機型，Analyst1.4.1Analyst軟件應(yīng)用培訓(xùn)教程全文共173頁，當(dāng)前為第50頁。使用方法：Analyst軟件應(yīng)用培訓(xùn)教程全文共173頁，當(dāng)前為第50頁。1、打開一個數(shù)據(jù)文件，按住左鍵脫拽選中一個峰2、點擊Scrpit中的PeakResolution打開窗口3、輸入用來計算分辨率峰寬的峰高位置。如輸入50％，指以峰高50％處的峰寬計算分辨率4、點擊Go，此時所選峰處顯示峰位、峰寬以及分辨率的值。5．ExportIDASpectra功能：將IDA數(shù)據(jù)文件中的產(chǎn)物離子掃描圖譜，分別輸出成數(shù)據(jù)文件適用機型或軟件：Analyst軟件應(yīng)用培訓(xùn)教程全文共173頁，當(dāng)前為第51頁。所有QTRAP和API-3Q機型，IDA數(shù)據(jù)文件，Analyst1.4使用方法：Analyst軟件應(yīng)用培訓(xùn)教程全文共173頁，當(dāng)前為第51頁。1．打開一個IDA數(shù)據(jù)文件，選擇Explore→Show→ShowTIC，顯示TIC圖譜(或點擊快捷鍵實現(xiàn)此功能)Analyst軟件應(yīng)用培訓(xùn)教程全文共173頁，當(dāng)前為第52頁。2．選擇Script→ExportIDASpectra，打開ExportIDASpectra窗口Analyst軟件應(yīng)用培訓(xùn)教程全文共173頁，當(dāng)前為第52頁。3．點擊Go，出現(xiàn)選擇地址對話框，可以選擇存儲地址和文件類型，鍵入文件名，點擊“保存”開始進行產(chǎn)物離子掃描圖譜輸出4．ExportIDASpectra窗口中參數(shù)的含義：MasstoleranceforcombiningMS/MSspectra：定義了識別相鄰兩個母離子的最小m/z值。如果兩個母離子的m/z的差值小于給定值，則對應(yīng)的兩張產(chǎn)物離子掃描圖譜相加，以一個文件輸出。MS/MSexportthreshold：定義產(chǎn)物離子的輸出閾值。如果產(chǎn)物離子圖譜中某個碎片離子的強度低于給定值，則軟件認為其是噪音，而不輸出。MinimumnumberofMS/MSionsforexport：定義了每張產(chǎn)物離子圖譜中應(yīng)包含的最少碎片離子數(shù)。如果產(chǎn)物離子圖譜中的碎片離子數(shù)少于給定值，則軟件認為該圖譜質(zhì)量太差，而不輸出。Analyst軟件應(yīng)用培訓(xùn)教程全文共173頁，當(dāng)前為第53頁。Centroidheightpercentage：定義了質(zhì)心高度百分比的閾值，如設(shè)為40％，指在計算m/z的值時，取峰高大于總峰高40％的部分。Analyst軟件應(yīng)用培訓(xùn)教程全文共173頁，當(dāng)前為第53頁。Centroidmergedistance：定義了計算某一m/z質(zhì)心時，識別峰的閾值。如設(shè)為0.05，指在計算m/z的質(zhì)心值時，m/z差值小于0.05的不同峰將作為一個峰計算。Separatevaluesinoutputwithaspace,notatab：規(guī)定輸出的文件中不同值之間的間隔。選中，指以“空格”作為間隔；不選，則指以“Tab”制表鍵操作最為間隔。Use“_”not“.”todelimitparentm/zin*.dtafilename：規(guī)定輸出的文件名中區(qū)別母離子的方法。選中，指以“_”作為區(qū)別；不選，則指以“.”最為區(qū)別。6．ExporttoJCamp功能：Analyst軟件應(yīng)用培訓(xùn)教程全文共173頁，當(dāng)前為第54頁。將色譜或質(zhì)譜圖輸出成數(shù)據(jù)文件。有時你需要用其他的數(shù)據(jù)分析軟件處理數(shù)據(jù)時，需要將Analyst中產(chǎn)生的圖譜轉(zhuǎn)化成相應(yīng)格式。Analyst軟件應(yīng)用培訓(xùn)教程全文共173頁，當(dāng)前為第54頁。適用機型或文件：所有QTRAP和API-3Q機型，Analyst1.4。使用方法：1．質(zhì)譜數(shù)據(jù)的輸出：打開一張質(zhì)譜圖，選擇Script→ExporttoJCamp，出現(xiàn)目標(biāo)文件存儲路徑對話窗口，選擇路徑、文件類型，鍵入文件名，點擊保存，完成數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)化。2.LC-MS/MS數(shù)據(jù)的輸出：打開一個LC-MS/MS數(shù)據(jù)文件，如果直接選擇“ExporttoJCamp”script，則將LC-MS/MS過程中的所有質(zhì)譜數(shù)據(jù)分別轉(zhuǎn)化成相應(yīng)的數(shù)據(jù)文件，輸出在同一個給定文件中；如果選中TIC圖中的某一區(qū)域，則將該區(qū)域中的所有質(zhì)譜圖進行平均后得到的一張質(zhì)譜圖的數(shù)據(jù)進行輸出，同樣，如果用“shift”選擇兩個或多個區(qū)域，則將每個區(qū)域的質(zhì)譜圖進行平均得到各自的平均圖譜，分別輸出到同一個數(shù)據(jù)文