第13章DNA復(fù)制教學(xué)課件_第1頁
第13章DNA復(fù)制教學(xué)課件_第2頁
第13章DNA復(fù)制教學(xué)課件_第3頁
第13章DNA復(fù)制教學(xué)課件_第4頁
第13章DNA復(fù)制教學(xué)課件_第5頁
已閱讀5頁,還剩95頁未讀 繼續(xù)免費(fèi)閱讀

下載本文檔

版權(quán)說明:本文檔由用戶提供并上傳,收益歸屬內(nèi)容提供方,若內(nèi)容存在侵權(quán),請進(jìn)行舉報(bào)或認(rèn)領(lǐng)

文檔簡介

中心法則生物的遺傳信息從DNA傳遞給DNA的過程稱為復(fù)制,由DNA傳遞給mRNA的過程稱為轉(zhuǎn)錄。根據(jù)mRNA鏈上的遺傳信息合成蛋白質(zhì)的過程,被稱為翻譯。轉(zhuǎn)錄和翻譯共稱為表達(dá)。1958年Crick將生物遺傳信息的這種傳遞方式稱為中心法則。1970年Temin提出“逆轉(zhuǎn)錄”概念,豐富了中心法則的內(nèi)容。ReversetranscriptionDNA生物合成復(fù)制(replication)是指遺傳物質(zhì)的傳代,以母鏈DNA為模板合成子鏈DNA的過程。復(fù)制親代DNA子代DNA復(fù)制的基本規(guī)律BasicRulesofDNAReplication

第一節(jié)子鏈繼承母鏈遺傳信息的幾種可能方式

全保留式半保留式混合式復(fù)制的特點(diǎn):復(fù)制的方式

——半保留復(fù)制(semi-conservativereplication)復(fù)制的高保真性(highfidelity)復(fù)制的方向:雙向或單向復(fù)制半不連續(xù)復(fù)制(semi-discontinuousreplication)一、半保留復(fù)制的實(shí)驗(yàn)依據(jù)和意義DNA生物合成時,母鏈DNA解開為兩股單鏈,各自作為模板(template)按堿基配對規(guī)律,合成與模板互補(bǔ)的子鏈。子代細(xì)胞的DNA,一股單鏈從親代完整地接受過來,另一股單鏈則完全從新合成。兩個子細(xì)胞的DNA都和親代DNA堿基序列一致。這種復(fù)制方式稱為半保留復(fù)制。半保留復(fù)制的概念A(yù)GGTACTGCCACTGGTCCATGACGGTGACCCCACTGGGGTGACCAGGTACTGTCCATGACTCCATGACAGGTACTGAGGTACTGCCACTGGTCCATGACGGTGACCAGGTACTGCCACTGGTCCATGACGGTGACC+母鏈DNA

復(fù)制過程中形成的復(fù)制叉子代DNA

密度梯度實(shí)驗(yàn)

——實(shí)驗(yàn)結(jié)果支持半保留復(fù)制的設(shè)想。含重氮-DNA的細(xì)菌培養(yǎng)于普通培養(yǎng)液

第一代繼續(xù)培養(yǎng)于普通培養(yǎng)液

第二代梯度離心結(jié)果按半保留復(fù)制方式,子代DNA與親代DNA的堿基序列一致,即子代保留了親代的全部遺傳信息,體現(xiàn)了遺傳的保守性。半保留復(fù)制的意義遺傳的保守性,是物種穩(wěn)定性的分子基礎(chǔ),但不是絕對的。原核生物復(fù)制時,DNA從起始點(diǎn)(origin)向兩個方向解鏈,形成兩個延伸方向相反的復(fù)制叉,稱為雙向復(fù)制。也有的生物的單向復(fù)制。二、復(fù)制方向復(fù)制中的放射自顯影圖象A.環(huán)狀雙鏈DNA及復(fù)制起始點(diǎn)B.復(fù)制中的兩個復(fù)制叉C.復(fù)制接近終止點(diǎn)(termination,ter)oriterABC真核生物每個染色體有多個起始點(diǎn),是多復(fù)制子的復(fù)制。習(xí)慣上把兩個相鄰起始點(diǎn)之間的距離定為一個復(fù)制子(replicon)。復(fù)制子是獨(dú)立完成復(fù)制的功能單位。5’3’oriorioriori5’3’5’5’3’3’5’5’3’復(fù)制子3’三、復(fù)制的半不連續(xù)性3535解鏈方向3′5′3′3′5′前導(dǎo)鏈(leadingstrand)隨從鏈(laggingstrand)順著解鏈方向生成的子鏈,復(fù)制是連續(xù)進(jìn)行的,這股鏈稱為前導(dǎo)鏈。另一股鏈因?yàn)閺?fù)制的方向與解鏈方向相反,不能順著解鏈方向連續(xù)延長,這股不連續(xù)復(fù)制的鏈稱為隨從鏈。復(fù)制中的不連續(xù)片段稱為岡崎片段(okazakifragment)。

前導(dǎo)鏈連續(xù)復(fù)制而隨從鏈不連續(xù)復(fù)制,就是復(fù)制的半不連續(xù)性。

岡崎片段與半不連續(xù)復(fù)制(okazaki1968年)復(fù)制的引物為什么需要引物?引物為RNA(體外復(fù)制為DNA)DNA復(fù)制后引物的去除和空隙填補(bǔ)

DNA復(fù)制的酶學(xué)TheEnzymologyofDNAReplication第二節(jié)參與DNA復(fù)制的物質(zhì)底物(substrate):

dATP,dGTP,dCTP,dTTP聚合酶(polymerase):

依賴DNA的DNA聚合酶,簡寫為DNA-pol模板(template):

解開成單鏈的DNA母鏈引物(primer):

提供3-OH末端使dNTP可以依次聚合Mg2+

其他的酶和蛋白質(zhì)因子一、復(fù)制的化學(xué)反應(yīng)

(dNMP)n

+dNTP→(dNMP)n+1

+PPi

聚合反應(yīng)的特點(diǎn)DNA新鏈生成需引物和模板;新鏈的延長只可沿5→3方向進(jìn)行。二、DNA聚合酶全稱:依賴DNA的DNA聚合酶(DNA-dependentDNApolymerase)簡稱:DNA-pol活性:1.53

的聚合活性

2.核酸外切酶活性5′AGCTTCAGGATA

3′

|||||||||||3′TCGAAGTCCTAGCGAC5′35外切酶活性53外切酶活性?能切除突變的DNA片段,DNA修復(fù)。能辨認(rèn)錯配的堿基對,并將其水解。

核酸外切酶活性(一)原核生物的DNA聚合酶DNA-polⅠDNA-polⅡDNA-polⅢ(一)原核生物的DNA聚合酶

酶作用DNA聚合酶Ⅰ5‘-3’聚合酶及外切酶作用,3‘-5’外切酶酶作用,可校正/修復(fù)DNA鏈,還可切除引物DNA聚合酶Ⅱ5‘-3’聚合酶及3‘-5’外切酶酶作用,可校正/修復(fù)DNA鏈DNA聚合酶Ⅲ與酶Ⅰ作用類似,酶活高,是主要的鏈延伸酶(聚合酶replicase)功能:對復(fù)制中的錯誤進(jìn)行校讀,對復(fù)制和修復(fù)中出現(xiàn)的空隙進(jìn)行填補(bǔ)。DNA-polⅠ(109kD)323個氨基酸小片段5核酸外切酶活性大片段/Klenow片段

604個氨基酸DNA聚合酶活性

5核酸外切酶活性N端C端木瓜蛋白酶DNA-polⅠKlenow片段是實(shí)驗(yàn)室合成DNA,進(jìn)行分子生物學(xué)研究中常用的工具酶。

DNA-polⅡ(120kD)

DNA-polII基因發(fā)生突變,細(xì)菌依然能存活。它參與DNA損傷的應(yīng)急狀態(tài)修復(fù)。

功能:是原核生物復(fù)制延長中真正起催化作用的酶。

DNA-polⅢ(250kD)(二)真核生物的DNA聚合酶DNA-pol起始引發(fā),有引物酶活性。延長子鏈的主要酶,有解螺旋酶活性。參與低保真度的復(fù)制。在復(fù)制過程中起校讀、修復(fù)和填補(bǔ)缺口的作用。在線粒體DNA復(fù)制中起催化作用。DNA-polDNA-polDNA-polDNA-pol(二)真核生物的DNA聚合酶三、復(fù)制保真性的酶學(xué)依據(jù)復(fù)制按照堿基配對規(guī)律進(jìn)行,是遺傳信息能準(zhǔn)確傳代的基本原理。復(fù)制保真性的酶學(xué)機(jī)制:(一)DNA-pol的核酸外切酶活性和及時校讀

(二)復(fù)制的保真性和堿基選擇(一)DNA-pol的核酸外切酶活性和及時校讀A:DNA-pol的外切酶活性切除錯配堿基;并用其聚合活性摻入正確配對的底物。B:堿基配對正確,DNA-polI不表現(xiàn)活性。(二)復(fù)制的保真性和堿基選擇?DNA聚合酶靠其大分子結(jié)構(gòu)協(xié)調(diào)非共價(jià)(氫鍵)與共價(jià)(磷酸二酯鍵)鍵的有序形成。?嘌呤的化學(xué)結(jié)構(gòu)能形成順式和反式構(gòu)型,與相應(yīng)的嘧啶形成氫鍵配對,嘌呤應(yīng)處于反式構(gòu)型。

1.遵守嚴(yán)格的堿基配對規(guī)律;2.聚合酶在復(fù)制延長時對堿基的選擇功能;3.復(fù)制出錯時DNA-pol的及時校讀功能。DNA復(fù)制的保真性至少要依賴三種機(jī)制

四、復(fù)制中的分子解鏈及DNA分子拓?fù)鋵W(xué)變化

DNA分子的堿基埋在雙螺旋內(nèi)部,只有把DNA解成單鏈,它才能起模板作用。

(一)解螺旋酶、引物酶和單鏈DNA結(jié)合蛋白E.Coli基因圖解螺旋酶(helicase)

——利用ATP供能,作用于氫鍵,使DNA雙鏈解開成為兩條單鏈引物酶(primase)——復(fù)制起始時催化生成RNA引物的酶單鏈DNA結(jié)合蛋白(singlestrandedDNAbindingprotein,SSB)——在復(fù)制中維持模板處于單鏈狀態(tài)并保護(hù)單鏈的完整

108

局部解鏈后(二)DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶(DNAtopoisomerase)

解鏈過程中正超螺旋的形成拓?fù)洚悩?gòu)酶作用特點(diǎn)既能水解、又能連接磷酸二酯鍵

拓?fù)洚悩?gòu)酶Ⅰ

拓?fù)洚悩?gòu)酶Ⅱ分類:拓?fù)洚悩?gòu)酶Ⅰ切斷DNA雙鏈中一股鏈,使DNA解鏈旋轉(zhuǎn)不致打結(jié);適當(dāng)時候封閉切口,DNA變?yōu)樗沙跔顟B(tài)。反應(yīng)不需ATP。拓?fù)洚悩?gòu)酶Ⅱ切斷DNA分子兩股鏈,斷端通過切口旋轉(zhuǎn)使超螺旋松弛。利用ATP供能,連接斷端,DNA分子進(jìn)入負(fù)超螺旋狀態(tài)。作用機(jī)制

五、DNA連接酶連接DNA鏈3-OH末端和相鄰DNA鏈5-P末端,使二者生成磷酸二酯鍵,從而把兩段相鄰的DNA鏈連接成一條完整的鏈。DNA連接酶(DNAligase)作用方式HO5’3’3’5’DNA連接酶ATPADP5’3’5’3’DNA連接酶在復(fù)制中起最后接合缺口的作用。在DNA修復(fù)、重組及剪接中也起縫合缺口作用。也是基因工程的重要工具酶之一。功能DNA復(fù)制過程TheProcessofDNAReplication第三節(jié)(一)復(fù)制的起始需要解決兩個問題:1.DNA解開成單鏈,提供模板。2.合成引物,提供3-OH末端。一、原核生物的DNA生物合成

E.coli復(fù)制起始點(diǎn)oriCGATTNTTTATTT···GATCTNTTNTATT···GATCTCTTATTAG···11317293244···TGTGGATTA-‖-TTATACACA-‖-TTTGGATAA-‖-TTATCCACA5866166174201209237245

串聯(lián)重復(fù)序列

反向重復(fù)序列53531.DNA解鏈DnaADnaB、DnaCDNA拓?fù)洚悩?gòu)酶引物酶SSB35352.引發(fā)體和引物含有解螺旋酶、DnaC蛋白、引物酶和DNA復(fù)制起始區(qū)域的復(fù)合結(jié)構(gòu)稱為引發(fā)體。

3535引物是由引物酶催化合成的短鏈RNA分子。

引物3'HO5'引物酶(二)復(fù)制的延長復(fù)制的延長指在DNA-pol催化下,dNTP以dNMP的方式逐個加入引物或延長中的子鏈上,其化學(xué)本質(zhì)是磷酸二酯鍵的不斷生成。

5'3'5'dATPdGTPdTTPdCTPdTTPdGTPdATPdCTPOH3'3'DNA-pol前導(dǎo)鏈的合成隨從鏈的合成階段一階段二階段三階段四復(fù)制過程簡圖原核生物基因是環(huán)狀DNA,雙向復(fù)制的復(fù)制片段在復(fù)制的終止點(diǎn)(ter)處匯合。oriter

E.coli8232oriterSV40500(三)復(fù)制的終止555RNA酶OHP5DNA-polⅠdNTP55PATPADP+Pi55DNA連接酶

隨從鏈上不連續(xù)性片段的連接哺乳動物的細(xì)胞周期DNA合成期G1G2SM二、真核生物的DNA生物合成

?細(xì)胞能否分裂,決定于進(jìn)入S期及M期這兩個關(guān)鍵點(diǎn)。G1→S及G2→M的調(diào)節(jié),與蛋白激酶活性有關(guān)。?蛋白激酶通過磷酸化激活或抑制各種復(fù)制因子而實(shí)施調(diào)控作用。?真核生物每個染色體有多個起始點(diǎn),是多復(fù)制子復(fù)制。復(fù)制有時序性,即復(fù)制子以分組方式激活而不是同步起動。?復(fù)制的起始需要DNA-polα(引物酶活性)和polδ(解螺旋酶活性)參與。還需拓?fù)涿负蛷?fù)制因子(replicationfactor,RF)。?增殖細(xì)胞核抗原(proliferationcellnuclearantigen,PCNA)在復(fù)制起始和延長中起關(guān)鍵作用。(一)復(fù)制的起始3553領(lǐng)頭鏈3535親代DNA隨從鏈引物核小體(二)復(fù)制的延長染色體DNA呈線狀,復(fù)制在末端停止。復(fù)制中岡崎片段的連接,復(fù)制子之間的連接。染色體兩端DNA子鏈上最后復(fù)制的RNA引物,去除后留下空隙。(三)復(fù)制的終止53355335+5333355端粒(telomere)

指真核生物染色體線性DNA分子末端的結(jié)構(gòu)。功能:?維持染色體的穩(wěn)定性?維持DNA復(fù)制的完整性結(jié)構(gòu)特點(diǎn):?由末端單鏈DNA序列和蛋白質(zhì)構(gòu)成。?末端DNA序列是多次重復(fù)的富含G、T堿基的短序列。TTTTGGGGTTTTGGGG…端粒酶(telomerase)端粒酶RNA(humantelomeraseRNA,hTR)端粒酶協(xié)同蛋白(humantelomeraseassociatedprotein1,hTP1)端粒酶逆轉(zhuǎn)錄酶(humantelomerasereversetranscriptase,hTRT)

組成:端粒酶的催化延長作用爬行模型DNA聚合酶復(fù)制子鏈進(jìn)一步加工逆轉(zhuǎn)錄和其他復(fù)制方式ReverseTranscription&OtherDNAReplicationWays第四節(jié)逆轉(zhuǎn)錄酶(reversetranscriptase)逆轉(zhuǎn)錄(reversetranscription)RNADNA

逆轉(zhuǎn)錄酶一、逆轉(zhuǎn)錄病毒和逆轉(zhuǎn)錄酶

逆轉(zhuǎn)錄病毒細(xì)胞內(nèi)的逆轉(zhuǎn)錄現(xiàn)象RNA模板逆轉(zhuǎn)錄酶DNA-RNA雜化雙鏈RNA酶單鏈DNA逆轉(zhuǎn)錄酶雙鏈DNA逆轉(zhuǎn)錄酶

AAAA

TTTTAAAASI核酸酶

DNA聚合酶Ⅰ堿水解

TTTT分子生物學(xué)研究可應(yīng)用逆轉(zhuǎn)錄酶,作為獲取基因工程目的基因的重要方法之一,此法稱為cDNA法。

以mRNA為模板,經(jīng)逆轉(zhuǎn)錄合成的與mRNA堿基序列互補(bǔ)的DNA鏈。試管內(nèi)合成cDNAcDNAcomplementaryDNA二、逆轉(zhuǎn)錄研究的意義

逆轉(zhuǎn)錄酶和逆轉(zhuǎn)錄現(xiàn)象,是分子生物學(xué)研究中的重大發(fā)現(xiàn)。

逆轉(zhuǎn)錄現(xiàn)象說明:至少在某些生物,RNA同樣兼有遺傳信息傳代與表達(dá)功能。對逆轉(zhuǎn)錄病毒的研究,拓寬了20世紀(jì)初已注意到的病毒致癌理論。

滾環(huán)復(fù)制(rollingcirclereplication)三、滾環(huán)復(fù)制和D環(huán)復(fù)制

是某些低等生物的復(fù)制形式,如X174和M13噬菌體等。3-OH5-P55533335'滾環(huán)復(fù)制5'5335dNTPDNA-polγ

D環(huán)復(fù)制(D-loopreplication)

是線粒體DNA(mitochondrialDNA,mtDNA)的復(fù)制形式。

DNA損傷(突變)與修復(fù)DNADamage(Mutation)&Repair第五節(jié)遺傳物質(zhì)的結(jié)構(gòu)改變而引起的遺傳信息改變,均可稱為突變。在復(fù)制過程中發(fā)生的DNA突變稱為DNA損傷(DNAdamage)。從分子水平來看,突變就是DNA分子上堿基的改變。

一、突變的意義(一)突變是進(jìn)化、分化的分子基礎(chǔ)(二)突變導(dǎo)致基因型改變(三)突變導(dǎo)致死亡(四)突變是某些疾病的發(fā)病基礎(chǔ)

二、引發(fā)突變的因素物理因素:紫外線(ultraviolet,UV)、各種輻射

UV化學(xué)因素:三、突變的分子改變類型錯配(mismatch)缺失(deletion)插入(insertion)重排(rearrangement)

框移(frame-shift)

DNA分子上的堿基錯配稱點(diǎn)突變(pointmutation)。發(fā)生在同型堿基之間,即嘌呤代替另一嘌呤,或嘧啶代替另一嘧啶。1.轉(zhuǎn)換發(fā)生在異型堿基之間,即嘌呤變嘧啶或嘧啶變嘌呤。

2.顛換(一)錯配鐮形紅細(xì)胞貧血病人Hb(HbS)β亞基N-val

·

his

·

leu

·

thr

·

pro·

val

·

glu

·

·

·

·

·

·

C肽鏈CACGTG基因正常成人Hb(HbA)β亞基N-val

·

his

·

leu

·

thr

·

pro·

glu

·

glu

·

·

·

·

·

·

C肽鏈CTCGAG基因(二)缺失、插入和框移缺失:一個堿基或一段核苷酸鏈從DNA大分子上消失。插入:原來沒有的一個堿基或一段核苷酸鏈插入到DNA大分子中間??蛞仆蛔兪侵溉?lián)體密碼的閱讀方式改變,造成蛋白質(zhì)氨基酸排列

溫馨提示

  • 1. 本站所有資源如無特殊說明,都需要本地電腦安裝OFFICE2007和PDF閱讀器。圖紙軟件為CAD,CAXA,PROE,UG,SolidWorks等.壓縮文件請下載最新的WinRAR軟件解壓。
  • 2. 本站的文檔不包含任何第三方提供的附件圖紙等,如果需要附件,請聯(lián)系上傳者。文件的所有權(quán)益歸上傳用戶所有。
  • 3. 本站RAR壓縮包中若帶圖紙,網(wǎng)頁內(nèi)容里面會有圖紙預(yù)覽,若沒有圖紙預(yù)覽就沒有圖紙。
  • 4. 未經(jīng)權(quán)益所有人同意不得將文件中的內(nèi)容挪作商業(yè)或盈利用途。
  • 5. 人人文庫網(wǎng)僅提供信息存儲空間,僅對用戶上傳內(nèi)容的表現(xiàn)方式做保護(hù)處理,對用戶上傳分享的文檔內(nèi)容本身不做任何修改或編輯,并不能對任何下載內(nèi)容負(fù)責(zé)。
  • 6. 下載文件中如有侵權(quán)或不適當(dāng)內(nèi)容,請與我們聯(lián)系,我們立即糾正。
  • 7. 本站不保證下載資源的準(zhǔn)確性、安全性和完整性, 同時也不承擔(dān)用戶因使用這些下載資源對自己和他人造成任何形式的傷害或損失。

評論

0/150

提交評論