一株高效降解菜籽餅粕中硫苷的枯草芽孢桿菌基因組鑒定及功能分析_第1頁
一株高效降解菜籽餅粕中硫苷的枯草芽孢桿菌基因組鑒定及功能分析_第2頁
一株高效降解菜籽餅粕中硫苷的枯草芽孢桿菌基因組鑒定及功能分析_第3頁
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文檔簡介

有較高含量的硫苷,對飼料的利用率較低,甚至會引起飼料中毒。因此,降解菜籽餅粕中的硫苷已成為一個熱點問題。枯草芽孢桿菌是一種常見Materialsand4℃下保IlluminaHiSeqXTen高通量測序MetaGeneMark軟件對其進行開放閱讀框預測。同時,使用MorphologicalandPhylogeneticAnalyzer(MPA)對菌株進行形態(tài)學和遺KEGG數(shù)據(jù)庫對該菌株進行基因注釋和代謝通路預測,并利用BLAST工具對其基因組序列進行同源性比對。同時,通過反轉(zhuǎn)錄實時熒PCR(qRT-PCR)RNA雜交技術(shù),對其特異性基因和23株枯草芽孢桿菌。通過基因測序BacillussubtilisCSBJ-1。依據(jù)MorphologicalandPhylogeneticAnalyzer(MPA)的分析結(jié)果,該菌株屬于枯草芽孢桿菌屬,菌株的線粒體基因為cox1、cox2和cob,核糖體RNA基因為16S、23S和5S。菌株基因組大小為4,720,057bp,GC含量為37.8%。clustlsCSBJ-1基因組進行生物信息學分析,發(fā)現(xiàn)該菌株含有多個與硫苷降解和營養(yǎng)轉(zhuǎn)化有關的特異性基因和適應基因,例如硫abyB,NAntKqT-RNA雜交實驗,發(fā)現(xiàn)此菌株在菜籽餅粕樣品中表達了諸多適應性dlAfd等。進一步分析表明,BacillussubtilisCSBJ-1有著較高的硫苷降解能力,可以將菜籽餅粕Bacilluss

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