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酵母核糖核酸的提取及測定植物098原碩0901080808摘要:用濃鹽法提取酵母RNA,經(jīng)過多步分離提純,在現(xiàn)有實(shí)驗(yàn)條件下,得到樣本RNA含量=67.5%,RNA提取率=1.2%關(guān)鍵字:酵母,濃鹽法,RNA含量,提取及測定研究背景及目的:RNA作為細(xì)胞中參與基因表達(dá)和蛋白質(zhì)合成的重要物質(zhì),在平時(shí)學(xué)習(xí)中多有涉及,本實(shí)驗(yàn)通過從酵母中提取RNA,掌握提制RNA的方法并掌握其測定手段,鞏固離心機(jī)和紫外分光光度計(jì)的使用。研究依據(jù)及原理:酵母作為工業(yè)上大量生產(chǎn)核酸的最為理想的微生物,因?yàn)榻湍负怂嶂兄饕荝NA(2.67~10.0%),DNA很少(0.03~0.516%),菌體容易收集,RNA也易于分離。此外,抽提后的菌體蛋白質(zhì),也具有很高的利用價(jià)值。RNA提取過程是先使RNA從細(xì)胞中釋放,并使它和蛋白質(zhì)分離,然后將菌體除去,再根據(jù)核酸在等電點(diǎn)溶解度最小的性質(zhì),將pH調(diào)到2.0~2.5使RNA沉淀,進(jìn)行離心收集。提取RNA的方法很多,在工業(yè)生產(chǎn)上常用的是稀堿性和濃鹽法。本實(shí)驗(yàn)采取濃鹽法(10%NaCl)核酸不論是DNA還是RNA,都是由核苷酸組成的多聚核苷酸化合物,而核苷酸是由糖,堿基和磷酸構(gòu)成。要測定生物體內(nèi)核酸的含量或者測定提取出來的核酸含量,只需要測定組成核苷酸的一種成分,如磷,糖或堿基,便可計(jì)算出核糖的含量,因?yàn)楹怂惴肿又羞@三個(gè)組份是以等分子比例存在的,即每一個(gè)嘌呤或嘧啶分子都與一分子戊糖及一分子磷酸相連接的,所以只要測出其中任何一組分的含量即可求出核糖的含量。本實(shí)驗(yàn)采用紫外吸收法測定核糖核酸含量,因?yàn)楹怂岬慕M成成分嘌呤及嘧啶堿基具有強(qiáng)烈的紫外吸收,最大吸收在260mm處,利用此特性可以對核酸進(jìn)行定量測定。實(shí)驗(yàn)材料與方法:材料:干酵母(安琪牌)灰藍(lán)色pH試紙和黃色pH試紙?jiān)噭海?)10%NaCl(2)6NHCl(3)95%乙醇(分析純)(4)5~6%的氨水(5)RNA沉淀劑取0.5克鉬酸銨,加水193ml,加7ml70%過氯酸,總體積200ml。(70%過氯酸即高氯酸,原液濃度即是70%)。儀器:量筒:50ml;具塞試管:15ml×2三角瓶:100ml;容量瓶:25ml×1,50ml×2燒杯:50ml×3表面皿:6cm×1滴管,玻棒,移液器,塑料碗烘箱離心機(jī)托盤天平,分析天平勻漿器紫外分光光度計(jì)(Rayleigh,UV-9600)實(shí)驗(yàn)方法:提取:稱取7g酵母,研缽中研磨成粉末,倒入三角瓶中,然后量取50ml10%NaCl溶液,倒入三角瓶,是酵母粉充分徹底懸浮,之后小心放入沸水浴中,浸提半小時(shí)。分離:將上述提取液取出,于冰浴中徹底冷卻,轉(zhuǎn)入離心管,以3500r/min離心30min。使提取液及菌體殘?jiān)确蛛x。沉淀RNA:將離心得到的上清液,小心傾倒于50ml小燒杯中,并置于冰浴中冷卻,待溶液冷卻至10℃以下后,于冰浴中在攪拌下(注意不要過分劇烈)小心用6MHCl調(diào)節(jié)pH至2.0~2.5(用灰藍(lán)色pH試紙),調(diào)好后繼續(xù)于冰水中放置10min。洗滌純化:將上述懸濁液小心轉(zhuǎn)入離心管,以3000r/min離心10min,得到RNA沉淀。小心傾去上清液,直接與離心管中用95%乙醇洗滌RNA沉淀兩次,每次用15ml乙醇,充分?jǐn)嚢柘礈?,然后?500r/min離心6min。干燥:用牛角勺仔細(xì)將洗滌后的RNA沉淀從離心管內(nèi)挖出涂于事先將邊緣折起成框的稱量紙上(預(yù)先用分析天平稱重并記錄數(shù)據(jù)),涂布均勻后,小心置于80℃烘箱內(nèi)5min左右,使沉淀充分干燥。將干燥后的RNA制品連同稱量紙一起準(zhǔn)確稱重,而后小心將RNA制品的大部分轉(zhuǎn)移至勻漿器中,將稱量紙和殘余RNA制品再次稱重,記錄下所有數(shù)據(jù)。含量測定(紫外分光光度法):采用比消光系數(shù)法,比消光系數(shù)本實(shí)驗(yàn)中給定A260=0.022。測定步驟:將第5步中得到的溶液,轉(zhuǎn)入小燒杯中,用5%氨水小心調(diào)pH至7.0(用黃色pH試紙),最后轉(zhuǎn)入25ml容量瓶,用蒸餾水定容。取兩支試管,按下表操作:管號RNA液H2O沉淀劑A5ml5ml——B5ml——5ml搖勻,冰浴20min,轉(zhuǎn)入離心管3500r/min離心10min,小心取上清液,各取0.5ml至50ml容量瓶,蒸餾水定容,其中一個(gè)做標(biāo)準(zhǔn)空白液,在紫外分光光度計(jì)上測定OD260值。實(shí)驗(yàn)結(jié)果及計(jì)算:原始數(shù)據(jù):稱取酵母量(樣品重)W=7g空白稱量紙重W1=0.6048g總制品+紙重W2=0.7282g殘余制品+紙重W3=0.6198g比消光系數(shù)A260=0.022測定消光值OD260=0.322透光度T=47.6%推演數(shù)據(jù):總制品重:G1=0.1234g定量樣品重:G2=0.1084g結(jié)果計(jì)算:RNA含量(%)=E260AV:被測樣品體積D:樣品測定時(shí)的稀釋倍數(shù)RNA提取率(%)=RNA含量×G1W結(jié)果分析:本實(shí)驗(yàn)使用濃鹽法和紫外分光光度法提取和測定了酵母的核糖核酸含量。實(shí)驗(yàn)中,有如下幾處可能產(chǎn)生誤差,1、研磨時(shí)的充分程度,研磨的充分程度的不同,將直接影響最后所能提取到的RNA含量的多少。2、本實(shí)驗(yàn)過程中,多次涉及到樣品轉(zhuǎn)移、離心、洗滌過程中,將不可避免的造成樣品的損失,直接造成最終RNA提取率的下降。3、實(shí)驗(yàn)操作過程中,實(shí)驗(yàn)人員并未佩戴手套,人體附帶的RNase一類的酶可能會造成一定量的RNA分解。4、烘干后的RNA樣品很輕,在稱量、轉(zhuǎn)移過程中很容易造成損失。綜上所述,本實(shí)驗(yàn)中一定未能提取出酵母的全部RNA,實(shí)驗(yàn)過程中必然造成了樣品一定程度上的損失,參考酵母RNA含量(2.67~10.0%),以及在A260/A280=1.983時(shí),90g濕酵母(相當(dāng)于20g干酵母)可提取1gRNA(選自:李志東邱峰張洪林,《影響濃鹽法提取啤酒酵母RNA的工藝參數(shù)研究》,《化工技術(shù)與開發(fā)》2007年第36卷第2期,12頁36卷),考慮到本實(shí)驗(yàn)的實(shí)驗(yàn)條件及上面提到的誤差因素,本實(shí)驗(yàn)結(jié)果在RNA含量和RNA提取率上都基本讓人滿意。參考文獻(xiàn):李良秋黃曉蘭,《高效液相色譜法測定酵母RNA中四種生物堿基的含量》,第二屆全國發(fā)酵工程學(xué)術(shù)討論會第二屆全國發(fā)酵工程學(xué)術(shù)討論會論文集,1998年徐希柱,《啤酒酵母中RNA、β-(1,3)-D-葡聚糖和蛋白質(zhì)的提取及應(yīng)用研究》,《山東農(nóng)業(yè)大學(xué)》2007年田寶勇趙星潔,《啤酒酵母RNA降解產(chǎn)物5′-核苷酸的高效液相色譜分析》,《釀酒科技》,2008年第3期李珊吳振強(qiáng),《鹽法提取啤酒廢酵母RNA的研究》,《釀酒科技》2005年第7期朱俊東黃國榮糜漫天郎海濱,《啤酒酵母中提取核糖核酸的研究》,《食品科學(xué)》1602006,Vol.27,No.02廖鮮艷李永仙等,《啤酒酵母胞內(nèi)RNA提取的研究》,《釀酒》2002年第29卷第2期李志東邱峰張洪林,《影響濃鹽法提取啤酒酵母RNA的工藝參數(shù)研究》,《化工技術(shù)與開發(fā)》2007年第36卷第2期曹成喜等,《生物化學(xué)儀器分析基礎(chǔ)》,2008,化學(xué)工業(yè)出版社孫培龍吳石金,《生物化學(xué)技術(shù)實(shí)驗(yàn)指導(dǎo)》,2008,化學(xué)工業(yè)出版社張龍翔張庭芳李玲媛,《生化試驗(yàn)方法和技術(shù)》,1997,高等教育出版社思考題:RNA中的嘌呤堿基和嘧啶堿基在不同pH條件下異構(gòu)情況不同,對紫外光的吸收值不同,摩爾消光系數(shù)會隨之改變。所以應(yīng)固定pH值;pH不固定會影響測定結(jié)果。因?yàn)閜H不同的條件下,OD值也會隨之改變,而實(shí)驗(yàn)中所給的比消光系數(shù)是在一定pH值下給定的。所以pH值不固定會影響測定結(jié)果。1)加鉬酸銨—過氯酸沉淀劑是為了沉淀RNA,然后用得到的上清液做空白對照,以減少定量樣品重的蛋白質(zhì)、糖類等物質(zhì)對RNA含量測定的干擾;2)由朗博—比爾定律A=εbc,當(dāng)吸光度在0.2~0.8時(shí),測量誤差最小,本實(shí)驗(yàn)中ε、b都已固定,只能改變濃度c,是A在上述范圍內(nèi),所以要稀釋。1)總體策略:保持物質(zhì)活性,結(jié)構(gòu)完整,純化到所需濃度,能夠大量提純(量產(chǎn));2)分離純化生命大分子時(shí)要注意:保持所提取物質(zhì)活性;抑制或避免接觸所能分解被提純物質(zhì)的酶,以免物質(zhì)被酶分解;反應(yīng)條件應(yīng)溫和,避免能破壞生命大分子的因素。實(shí)驗(yàn)小結(jié):酵母作為工業(yè)上大量生產(chǎn)核酸的最為理想的微生物,因?yàn)榻湍负怂嶂兄饕荝NA,DNA很少,菌體容易收集,RNA也易于分離。因而本實(shí)驗(yàn)使用濃鹽法和紫外分光光度法提取和測定了酵母的核糖核酸含量。實(shí)驗(yàn)過程中,通過濃鹽法提取出樣品酵母中的RNA,經(jīng)過多次分離提純,最后用紫外分光光度發(fā),通過吸光率,測定了樣品中的RNA含量。計(jì)算出RNA提取率。實(shí)驗(yàn)中從在幾處誤差,使得實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)在現(xiàn)有條件下不可避免偏低,但參考酵母RNA標(biāo)準(zhǔn)范圍(2.67~1
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