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腺病毒提取與純化物品準(zhǔn)備:離心管:BackmanCat:#331372(36000rpm離心用13.2ml);BackmanCat:#342412(65000rpm離心用5.1ml);消毒,多備用一套;離心管帽:離心管BackmanCat:#331372蓋,消毒;離心管BackmanCat:#342412外蓋;離心管BackmanCat:#342412中蓋,BackmanCat:#342883;熱封蓋:離心管BackmanCat:#342412熱封蓋,消毒;其他物品:MiniQ:2L,消毒;大燒杯(1L):2個(gè),消毒;中號(hào)鑷子,小號(hào)鑷子:1把中號(hào)和3把小號(hào),消毒;無(wú)菌注射器:1ml、5ml、10ml,若干;移液槍?zhuān)?把;移液管:2ml、10ml,若干;廢液缸:1個(gè);無(wú)菌手套:若干;酒精、棉球;Marker筆;配液:CsCl:1.25g/ml:9.04gCsCl+25mlPBS;1.35g/ml:12.8gCsCl+25mlPBS;1.40g/ml:15.5gCsCl+25mlPBS;配好后過(guò)濾。Viruslysisbuffer(pH7.4,50ml):0.1%SDS0.05g10mMTrisbase0.0606g1mMEDTA0.0186gDialysisbuffer(pH7.6,1.5L):10mMTrisbase1.82g135mMNaCl11.83g1mMMgCl250%Glycerol750ml三、裂解擴(kuò)增了腺病毒的293細(xì)胞:1、從-80℃冰箱中取出以前擴(kuò)增好的感染病毒的293細(xì)胞沉淀,解凍后用4mlPBS重懸,并轉(zhuǎn)移到置于冰上的50ml離心管中;2、用繩子拴好50ml離心管,置于液氮中30分鐘;3、取出后置于37℃水浴,搖至溶解,最大速度vortex一分鐘,離心,5000rpm,10分鐘;4、轉(zhuǎn)移上清到一個(gè)15ml的離心管中;5、向下層沉淀中加入3ml的PBS,vortex混勻,再放于液氮中,再反復(fù)凍融兩次,收集到的裂解液不超過(guò)9ml為宜;6、把收集到的上清再離心5000rpm,10分鐘(上清可暫時(shí)不取出,節(jié)省步驟),放于冰上。四、正式實(shí)驗(yàn):預(yù)冷轉(zhuǎn)頭至4℃(BackmanSW41Ti及其離心管套,BackmanVTi90),熱封儀充電。1、UV消毒超凈臺(tái),檢查離心機(jī)配件:轉(zhuǎn)頭SW41Ti及離心管套、離心管(Cat:#331372)、離心管蓋、離心管蓋固定器、離心管架;2、取出消毒好的離心管放在專(zhuān)用的離心管架上,用移液槍分別加2ml1.25g/mlCsCl,再在液體的底部緩慢加入1ml1.40g/mlCsCl;注:加入時(shí)將移液管伸入到離心管底部,將移液槍調(diào)到最低檔緩慢加入,拔出移液槍時(shí)也要慢,加好后可以看到不同濃度的CsCl之間有明顯的分層。用移液槍將293裂解液緩慢加滿(mǎn),配平,按1-4,2-5,3-6的順序;注:管子要注意做好標(biāo)記。5、用酒精擦離心管套,把裝好樣本的離心管輕輕放入,放上消毒好的蓋子,用離心管蓋固定器擰緊;注:離心時(shí)6個(gè)離心管套都要掛上,空的離心管套也需蓋上蓋子并擰緊,并掛在相應(yīng)的掛鉤上,注意平衡。6、離心36000rpm,65min,4℃;設(shè)置參數(shù):36000rpm―enter―65min―enter―4℃―enter―enter+star;當(dāng)真空<750時(shí),開(kāi)始加速,約3min可達(dá)36000rpm。7、離心時(shí),檢查下一步離心所需配件:轉(zhuǎn)頭BackmanVTi90、離心管(Cat:#342412)、離心管架、離心管外蓋、離心管中蓋(Cat:#342883)、專(zhuān)用螺絲、專(zhuān)用扳手、專(zhuān)用離心管加夾;8、離心完成后,小心取下離心管套,擰開(kāi)蓋子,用鑷子取出離心管,找到要抽取的完整病毒帶;9、穿刺病毒帶:用5ml注射器從病毒帶下方約1ml處緩慢向斜上放刺入,抽取病毒帶,抽完后用手堵住離心管上口,再將枕頭抽出;注:穿刺處先用酒精消毒,刺入時(shí)旋轉(zhuǎn),不要太用力,針頭平面向上,注意不要回打,抽到病毒約1ml。FromAdEasyVectorSystem,Qbiogene,Inc.10、將抽出來(lái)的病毒轉(zhuǎn)移到5.1ml離心管(Cat:#342412)中,用1.35g/mlCsCl填滿(mǎn);注:加CsCl時(shí)要輕輕彈一彈管壁以清除氣泡,加CsCl時(shí)針頭應(yīng)在液面以下,以減少氣泡的產(chǎn)生,若殘留氣泡容易導(dǎo)致離心時(shí)不平衡,離心管變形。11、熱封:用消毒好的熱封蓋蓋好離心管口,用熱封儀(cat#358314)加熱,垂直輕輕下壓到離心管頸部與管身交界處(約30sec),用冷卻管套住熱封管蓋冷卻;12、將熱封好的離心管放入到轉(zhuǎn)頭BackmanVTi90的對(duì)稱(chēng)位置,依次加入內(nèi)蓋、外蓋,先用專(zhuān)用螺絲擰,再用專(zhuān)用扳手?jǐn)Q緊(用力到扳手指針達(dá)120即可);13、離心:轉(zhuǎn)頭BackmanVTi90,72300rpm,3h,4℃;
14、離心時(shí),用75%酒精消毒透析袋(剪成約5cm一個(gè),不要太短)、夾子(要配套,一個(gè)帶磁鐵和一個(gè)不帶磁鐵),30min以上;15、離心完后,用專(zhuān)用的離心管夾取出離心管后置于架子上;16、第二次穿刺:用10ml注射器針頭導(dǎo)氣,用1ml針管配5ml的針頭穿刺病毒帶(從病毒帶下方約0.5cm處斜向上刺入),方法同前;17、病毒帶抽完后,抽出注射器,用針頭套套住針頭,標(biāo)記好至于冰上;18、透析:取出浸泡于酒精中的透析袋,用牙簽撐開(kāi)透析袋,用消毒的milli-Q水沖凈其上的酒精,再末端折疊一下,用夾子夾好。將注射器中的液體注射入袋中,折疊上端,用夾子夾住,放于透析液中,隔1小時(shí)換液一次,反復(fù)3次。最后一次的透析緩沖液保存至下次使用;注:小心針頭不要刺穿透析袋,夾子要做好標(biāo)記。19、收集病毒:取出透析袋,用消毒milli-Q沖洗透析袋,用酒精棉球擦夾子內(nèi)緣,在夾子內(nèi)緣剪開(kāi)透析袋,用200ul槍吸出液體轉(zhuǎn)移到標(biāo)記好的1.5mlEP管中-20℃保存;20、測(cè)濃度:1)、要用復(fù)溫好的Viruslysisbuffe裂解腺病毒:取6ul病毒加入54ulViruslysisbuffe,第三次透析液為空白對(duì)照,
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