SUMMIT軟件一打開SUMMIT軟件1雙擊電腦桌面上的SUMMIT軟件的快捷鍵，顯示出SELECTDATABASE對話框。2從下拉菜單中選擇MOFLOXDP，與主機進行連接。也可以用該軟件進行離線數(shù)據(jù)的分析。二創(chuàng)建一個新的數(shù)據(jù)庫數(shù)據(jù)庫是方案，樣本以及數(shù)據(jù)的集合，打開一個新的數(shù)據(jù)庫后會出現(xiàn)一個工作區(qū)，在工作區(qū)里可以創(chuàng)建直方圖和點圖，也可以打開已有的方案。1打開SUMMIT軟件，點擊NEW出現(xiàn)CREATEDATABASE的對話框。2選擇要保存數(shù)據(jù)庫的文件夾，輸入名字，點擊SAVE。進入到SUMMIT軟件主屏。1主菜單2控制面板3額外菜單4額外菜單5工作區(qū)6工具欄控制面板軟件中的大部分操作可以通過控制面板進入，上面有幾個按鈕，每個按鈕代表一個菜單，在它下面還有次級菜單。三INSTRUMENTTab，當連接到自動進樣是會出現(xiàn)，手動進樣沒有。四AquisitionTab可以定義將要獲取的文件類型，可以設置樣本運行的信息，看到樣本運行的統(tǒng)計。獲取樣本面板可以顯示合保存一個樣本的信息。如下圖

修改樣本的信息：1點擊上圖1號位的藍色圖標，選擇EDITVIEW，該區(qū)域就可以進行修改了。再點擊一次EDITVIEW就可以回到以前狀態(tài)。2在VALUE欄下，改變信息。3選擇ADDKEYWORD，可以增加NAME，VALUE，鍵入新信息，點擊OK。選擇參數(shù)在建立直方圖和點圖之前要選擇用于實驗的參數(shù)。1點擊AcquisitionTab，在左下方出現(xiàn)AcquisitionParameter的面板。2雙擊Disable單詞，選擇想要進行收集的參數(shù)。H=線形高度信號L=對數(shù)高度信號A=線形面積信號W=脈沖寬度LA=對數(shù)面積打開已有的方案選擇FILE〉PROTOCOL〉LOAD，選擇一個已經(jīng)保存過方案，點擊OPEN。建立新方案1選擇FILE〉PROTOCOL〉NEW，會出現(xiàn)一個新的工作區(qū)。2確保已經(jīng)選擇好了參數(shù)。3創(chuàng)建點圖和直方圖。改變方案在方案工具欄上，從下來菜單中選擇一個新方案。（只要當前數(shù)據(jù)庫中的方案才會出現(xiàn)在下拉菜單中）。獲取數(shù)據(jù)點擊鍵盤上的F2鍵開始收集數(shù)據(jù)，再按一次F2，停止收集。（如果使用自動上樣，先確證一下InstrumentTab下的設置。保存獲取的數(shù)據(jù)點擊F3鍵保存，輸入文件名。也可以點擊Acquisition下拉菜單，選擇AutoSave，則獲取停止后自動保存。循環(huán)模式（CycleMode）只顯示收集過程中最近的數(shù)據(jù)，主要用于儀器調校。1點擊Acquisition下拉菜單，選擇CycleAmount，設置數(shù)據(jù)循環(huán)的數(shù)目，點擊OK。2點擊Acquisition下拉菜單，選擇Cycle或點擊屏幕右側的CycleMode圖標。3重新進行獲取，循環(huán)模式生效。五SortTab用于設置分選門。建立或修改分選門在設置分選門之前要獲取要分選的樣本數(shù)據(jù)，設置一個或多個區(qū)域來定義用于分選的細胞群。1在SortLogicandStatistic面板上，點擊菜單圖標，選擇NEWDecision。2雙擊要建立或修改的液流，進行修改。六SampleTab顯示選擇樣本的參數(shù)，該狀態(tài)下可以進行數(shù)據(jù)的顏色補償。數(shù)據(jù)的顏色補償在Compensation的面板上，點擊菜單圖標，選擇AutoLoadfromSample，當打開一個數(shù)據(jù)文件時會自動出現(xiàn)CompensationMatrix。單染樣本自動補償向導1上陰性對照或同型對照樣本，調節(jié)電壓。2上單染的對照樣本，保存數(shù)據(jù)文件。3把所有單染樣本的文件放到實驗文件夾中。4點擊SampleTab。5建立用于校正補償?shù)狞c圖，進行補償?shù)膮?shù)要放到X軸上。6點擊點圖上左上角的藍色圖標，然后點擊下拉菜單下的AutoCompensate7在Compensation的面板上，點擊菜單圖標，選擇AutoCompensate，出現(xiàn)AutoCompSample對話框。在Gate中選擇合適的門，在Experiment中選擇包含單染樣本文件的文件夾，然后選擇所有用于補償?shù)奈募?，點擊OK。8這時就會創(chuàng)建一個新的標有AutoComp的工作區(qū)，顯示第一組點圖。每一張點圖都會把單染的熒光通道放在X軸上，而需要進行補償?shù)膮?shù)放在Y軸上。顯示默認的自動補償?shù)腄im和Bright區(qū)域，如果選擇了門關聯(lián)，它會應用到每個點圖上。AutoCopmensate向導會出現(xiàn)。9檢查每一張點圖的%His統(tǒng)計。如果Dim或Bright區(qū)域的含量低于5%，拖拽門的位置，使Dim和Ｂright區(qū)域的含量大于５％。10當所有點圖上的所有區(qū)域的含量都大于５％，在AutoCompensate對話框內點擊Next，就會出現(xiàn)下一組點圖。11重復第9步，直至所有單染樣本都進行了補償。當自動補償完成，適當?shù)难a償數(shù)值就會出現(xiàn)在補償矩陣中。應用VisiComp觀察補償結果VisiComp可以顯示0和負值，因此可以確證自動補償?shù)慕Y果，并對補償進行微調和校正。1預先加載所有需要繼續(xù)補償?shù)臉颖疚募?創(chuàng)建所有的圖形，區(qū)域和門關聯(lián)。3在Compensation的面板上，點擊圖標，選擇VisiComp。4可以選擇自動補償向導建立圖形，也可以手動設置需要進行補償?shù)膱D形。5點擊Compensation的面板上的圖標，選擇AdjustVisiComp。可以調整VisiComp線性區(qū)域的寬度，利用滑動條或輸入合適的值完成調整。（VisiComp線性區(qū)域的寬度應用到所有圖形上，因此在調整寬度之前要顯示所有的數(shù)據(jù)，對一個參數(shù)合適并不意味著對另一個參數(shù)也合適。需要調整一個對所有圖形都合適的寬度。當關掉VisiComp，負值區(qū)的高度和寬度會變成0）。6創(chuàng)建區(qū)域和門關聯(lián)完成分析。增加或去掉FCS關鍵字1在SampleProperties面板上點擊圖標，選擇Add/RemoveKeywords。2選擇要顯示的關鍵字，在前面打勾，點擊OK。七HistogramTab創(chuàng)建直方圖和點圖在創(chuàng)建直方圖前要選擇合適的參數(shù)。1點擊HistogramTab，如果要創(chuàng)建單參數(shù)直方圖，雙擊X軸的某個參數(shù)，直方圖的框架就會在在工作區(qū)出現(xiàn)。如果要創(chuàng)建雙參數(shù)點圖，在X軸某個參數(shù)上點一下，在Y軸上某個參數(shù)上點一下，在工作區(qū)上就會出現(xiàn)點圖的框架。1HistogramTab2X軸參數(shù)3Y軸參數(shù)最大化點圖和直方圖在直方圖的標題欄雙擊，圖形就會最大化，再雙擊就會還原。改變軸參數(shù)要改變點圖或直方圖上顯示的參數(shù)，右擊需要改變的軸，選擇新的參數(shù)。改變軸標記要改變點圖或直方圖上顯示的標記，右擊需要改變的軸，選擇ParameterProperities?？梢栽贚ongName中輸入諸如熒光素，標志物或者抗體等信息，輸入的信息會顯示在軸上。創(chuàng)建直方圖上的區(qū)域在單參數(shù)直方圖上點右鍵，選擇Bar，建立線門，在雙參數(shù)點圖上點右鍵可以創(chuàng)建矩形，橢圓型，多邊形或十字區(qū)域。通過拖拽改變區(qū)域的大小和位置，一旦創(chuàng)建了區(qū)域，圖的下面就會有統(tǒng)計結果顯示。要刪除區(qū)域，在區(qū)域上點右鍵，選擇Select。重命名區(qū)域在需要進行重命名的區(qū)域內點右鍵，選擇Properties。會出現(xiàn)對話框，輸入新的名字，點擊OK。復制粘貼區(qū)域在需要復制的區(qū)域內點右鍵，選擇Copy，在下一張上，點右鍵，選擇Paste。自定義統(tǒng)計顯示點擊直方圖上左上方的圖標，選擇Statistics〉EditDisplay，顯示出EditColumns對話框，在所需要的統(tǒng)計結果前面打勾。也可以通過拖拽改變統(tǒng)計的排序。如果要應用到所有的圖形中，可以在對話框下面的框里打勾。手動調整標尺點擊屏幕右側的標尺上下的按鈕改變數(shù)據(jù)的顯示標尺。等高圖點擊直方圖上左上方的圖標，選擇Display〉Contour。在EnableContour前面打勾，下面的下拉菜單即可以進行等高線運算。直方圖輸出到WORD中點擊直方圖上左上方的圖標，選擇Copy〉WindowasBitmap。打開WORD把直方圖的圖片粘貼到文件中。CopyasGraphic不包括直方圖邊框和統(tǒng)計。多文件顯示1點擊SampleTab，點擊菜單圖標，選擇Duplicate，這樣就會復制現(xiàn)有方案中的直方圖和點圖。所有復制的版本以不同顏色顯示。可以手動排列圖形，也可以在工作區(qū)的白色空白區(qū)點右鍵，選擇ArrangeWindows.2要打開其他的樣本，在主菜單下選擇New〉Sample,點擊樣本名字拖拽到模板中。創(chuàng)建疊加圖1點擊HistogramTab,點擊下拉菜單圖標，選擇Overlay。雙擊需要進行疊加的參數(shù)。2點擊Overlay圖形的左上方菜單，選擇AddData，指針的樣子會改變。3在需要加到Overlay上的直方圖上點一下，即可以加到Overlay上。八GateLogicTab顯示和調整門邏輯關系，改變門的顏色。設置門邏輯關系在需要設立門的區(qū)域上點擊右鍵，從菜單中選擇SetGate，指針的樣子就會改變，在需要設置門關聯(lián)的圖上單擊，在最后一張圖上雙擊完成門關聯(lián)設置，這時就會建立門邏輯關系。要去除門關聯(lián)，則點擊圖形左上方的菜單，選擇Ungate。設置連續(xù)門邏輯關系1打開一張點圖，關聯(lián)到R1區(qū)域。2在點圖上創(chuàng)建R2區(qū)域。3在R2上點右鍵，點擊SetGate。會出現(xiàn)一個Combineregionandgate

?的對話框。4點擊Yes，激活連續(xù)門關聯(lián)，點擊NO，則只選擇已經(jīng)指定的門。5在需要關聯(lián)的圖上單擊或雙擊應用門關聯(lián)。GateLogicBuilderGateLogicBuilder位于GatingTab的左上方，可以定義門的邏輯關系。1點擊GateLogicBuilder面板的左上方的菜單，再點擊New建立一個新門。2在Expression列，雙擊文本區(qū)，Editga