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第三章病毒第一節(jié)概述第二節(jié)病毒的形態(tài)和結(jié)構(gòu)第三節(jié)病毒的復(fù)制第四節(jié)病毒的溶原性第五節(jié)病毒對理化因素抵抗力一、病毒的特點和定義第一節(jié)概述1、特點1)不具有細(xì)胞結(jié)構(gòu),具有一般化學(xué)大分子的特征。2)一種病毒的毒粒內(nèi)只含有一種核酸,DNA或者RNA。3)大部分病毒沒有酶或酶系極不完全,不含催化能量代謝的酶,不能進(jìn)行獨立的代謝作用。4)嚴(yán)格的活細(xì)胞內(nèi)寄生,沒有自身的核糖體,沒有個體生長,也不進(jìn)行二均分裂,必須依賴宿主細(xì)胞進(jìn)行自身的核酸復(fù)制,形成子代。5)個體微小,在電子顯微鏡下才能看見。6)對大多數(shù)抗生素不敏感,對干擾素敏感。例如一些簡單的病毒僅由核酸和蛋白質(zhì)外殼(coat)構(gòu)成,故可把它們視為核蛋白分子。朊病毒甚至僅由蛋白質(zhì)構(gòu)成例如利福平可抑制痘病毒復(fù)制病毒感染敏感宿主細(xì)胞后,病毒核酸進(jìn)入細(xì)胞,通過其復(fù)制與表達(dá)產(chǎn)生子代病毒基因組和新的蛋白質(zhì),然后由這些新合成的病毒組分裝配(assembly)成子代毒粒,并以一定方式釋放到細(xì)胞外。病毒的這種特殊繁殖方式稱做復(fù)制(replication)。第一節(jié)概述1、特點一、病毒的特點和定義病毒是一類既具有化學(xué)大分子屬性,又具有生物體基本特征;既具有細(xì)胞外的感染性顆粒形式,又具有細(xì)胞內(nèi)的繁殖性基因形式的獨特生物類群。超顯微的、沒有細(xì)胞結(jié)構(gòu)的、專性活細(xì)胞內(nèi)寄生的實體第一節(jié)概述1、特點一、病毒的特點和定義單細(xì)胞微生物與病毒性質(zhì)的比較aDNA病毒和RNA病毒中的一部分;b利福平可抑制痘病毒復(fù)制第一節(jié)概述2、定義一、病毒的特點和定義迄今仍無一個科學(xué)而嚴(yán)謹(jǐn)?shù)亩x病毒為具有獨立于其宿主的進(jìn)化史的絕對細(xì)胞內(nèi)寄生物,它的DNA或RNA基因組被其所編碼的蛋白質(zhì)殼體化(encapsidation)。
(Fields等,1990年)非細(xì)胞生物(真)病毒:至少含核酸和蛋白質(zhì)二種組分亞病毒(subvirus)類病毒(viroid):只含具侵染性的RNA組分?jǐn)M病毒(virusoid):只含有不具侵染性的RNA組分朊病毒(prion):只含蛋白質(zhì)二病毒的宿主范圍第一節(jié)概述病毒幾乎可以感染所有的細(xì)胞生物,并具有宿主特異性噬菌體(phage)、植物病毒(plantviruses)動物病毒(animalviruses)Microbiology雙層平板法優(yōu)點:①彌補玻璃皿底面不平的缺陷②所形成全部噬菌體斑都接近處于同一平面上③形成的噬菌斑較大,更有利于計數(shù)Microbiology噬菌斑四、病毒的培養(yǎng)和純化
1、病毒的培養(yǎng)動物病毒實驗動物雞胚多種細(xì)胞培養(yǎng)四、病毒的培養(yǎng)和純化
1、病毒的培養(yǎng)植物病毒敏感植物葉片產(chǎn)生壞死斑,或稱枯斑
蛋白質(zhì)提純方法(鹽析、等電點沉淀、有機溶劑沉淀、凝膠層析、離子交換等)四、病毒的培養(yǎng)和純化
2、病毒純化標(biāo)準(zhǔn)純化的病毒制備物應(yīng)保持其感染性病毒是有感染性的生物體病毒具有化學(xué)大分子的屬性純化的病毒制備物的理化性質(zhì)應(yīng)具有均一性方法主要化學(xué)組成為蛋白質(zhì)具有一定的大小、形狀和密度差速離心梯度離心(超速離心)第二節(jié)毒粒的性質(zhì)病毒是一類既具有化學(xué)大分子屬性,又具有生物體基本特征;既具有細(xì)胞外的感染性顆粒形式,又具有細(xì)胞內(nèi)的繁殖性基因形式的獨特生物類群。毒粒(病毒顆粒):
病毒的細(xì)胞外顆粒形式,也是病毒的感染性形式。一團能夠自主復(fù)制的遺傳物質(zhì)保護遺傳物質(zhì)免遭環(huán)境破壞,并作為將遺傳物質(zhì)從一個宿主細(xì)胞傳遞給另一個宿主細(xì)胞的載體。蛋白質(zhì)外殼包膜第二節(jié)毒粒的性質(zhì)一、毒粒的形態(tài)結(jié)構(gòu)1、病毒的大小和形狀個體小,必需在電鏡下觀察;不同病毒的毒粒大小差別很大;毒粒的形狀:動物病毒有球狀、卵圓狀、磚形植物病毒有桿狀、絲狀、球狀噬菌體有蝌蚪狀和絲狀采用各種電鏡技術(shù)觀察毒粒的形態(tài)結(jié)構(gòu)Orfvirus:口瘡病毒(接觸性膿皰皮炎病毒)(負(fù)染技術(shù))Ebolavirus:埃博拉病毒(正染技術(shù))Vacciniavirus痘苗病毒(投影技術(shù))第二節(jié)毒粒的性質(zhì)毒粒的化學(xué)組成毒粒(化學(xué)組成)核酸;蛋白質(zhì);脂類;碳水化合物;基本化學(xué)組成病毒顆粒在化學(xué)上表現(xiàn)為核蛋白二、毒粒的化學(xué)組成1、病毒的核酸核酸是病毒的遺傳物質(zhì);一種病毒的毒粒只含有一種核酸:DNA或是RNA;病毒核酸單鏈DNA(ssDNA,single-strandedDNA);雙鏈DNA(dsDNA);單鏈RNA(ssRNA);雙鏈RNA(dsRNA);二、毒粒的化學(xué)組成2、病毒的蛋白質(zhì)病毒蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)蛋白非結(jié)構(gòu)蛋白病毒基因組編碼的,在病毒復(fù)制過程中產(chǎn)生并具有一定功能,但并不結(jié)合于毒粒中的蛋白質(zhì)。構(gòu)成一個形態(tài)成熟的有感染性的病毒顆粒所必需的蛋白質(zhì)殼體蛋白;包膜蛋白;存在于毒粒中的酶;二、毒粒的化學(xué)組成2、病毒的蛋白質(zhì)病毒結(jié)構(gòu)蛋白的主要生理功能:1)構(gòu)成蛋白質(zhì)外殼,保護病毒核酸免受核酸酶及其它理化因子的破壞;2)決定病毒感染的特異性,與易感細(xì)胞表面存在的受體具特異性親和力,促使病毒粒子的吸附和入侵;3)決定病毒的抗原性,能刺激機體產(chǎn)生相應(yīng)的抗體;4)構(gòu)成毒粒酶,或參與病毒對宿主細(xì)胞的入侵(如T4噬菌體的溶菌酶等),或參與病毒復(fù)制過程中所需要病毒大分子的合成(如逆轉(zhuǎn)錄酶等);一般來說,病毒是不具酶或酶系極不完全的,所以一旦離開宿主就不能獨立進(jìn)行代謝和繁殖。第二節(jié)病毒的性質(zhì)2、病毒的殼體結(jié)構(gòu)殼體或衣殼(capsid):包圍著病毒核酸的蛋白質(zhì)外殼,由蛋白質(zhì)亞基按對稱的形式、有規(guī)律地排列而成,是病毒毒粒的基本結(jié)構(gòu)。殼體結(jié)構(gòu)類型螺旋對稱殼體二十面體對稱殼體雙對稱結(jié)構(gòu)螺旋對稱殼體:亞基有規(guī)律地沿著中心軸(核酸)呈螺旋排列,進(jìn)而形成高度有序、對稱的穩(wěn)定結(jié)構(gòu)。二十面體對稱殼體:構(gòu)成對稱結(jié)構(gòu)殼體的第二種方式是蛋白質(zhì)亞基圍繞具立方對稱的正多面體的角或邊排列,進(jìn)而形成一個封閉的蛋白質(zhì)的鞘。具有雙對稱結(jié)構(gòu)的典型例子是有尾噬菌體(tailedphage),其殼體由頭部和尾部組成。包裝有病毒核酸的頭部通常呈二十面體對稱,尾部呈螺旋對稱。一、病毒的形態(tài)結(jié)構(gòu)3、病毒的包膜結(jié)構(gòu)病毒包膜的基本結(jié)構(gòu)與生物膜相似,是脂雙層膜。在包膜形成時,細(xì)胞膜蛋白被病毒的包糖蛋白取代。刺突(spike):包膜或核衣殼上的突起。第二節(jié)病毒的性質(zhì)一、病毒的形態(tài)結(jié)構(gòu)3、病毒的包膜結(jié)構(gòu)病毒的蛋白質(zhì)殼體和病毒核酸(核心)構(gòu)成的復(fù)合物,又稱核衣殼。核殼(nucleocapsid):僅由核衣殼構(gòu)成的病毒顆粒裸露毒粒(nakedvirion):如煙草花葉病毒、脊髓灰質(zhì)炎病毒(Poliovirus)等一些簡單的病毒的毒粒。包膜(envelope):有些病毒核衣殼包裹著的一層脂蛋白膜,它是病毒以出芽(budding)方式成熟時,由細(xì)胞膜衍生而來的。有維系毒粒結(jié)構(gòu),保護病毒核殼的作用。特別是病毒的包膜糖蛋白,具有多種生物學(xué)活性,是啟動病毒感染所必需的。有包膜的病毒第二節(jié)病毒的性質(zhì)一、病毒的形態(tài)結(jié)構(gòu)4、病毒的結(jié)構(gòu)類型四種主要結(jié)構(gòu)類型裸露的二十面體;裸露的螺旋;有包膜的二十面體;有包膜的螺旋;有些病毒,如有尾噬菌體、痘病毒等結(jié)構(gòu)更為復(fù)雜,不能包括在這些結(jié)構(gòu)類型之內(nèi)。不同病毒的毒粒結(jié)構(gòu)復(fù)雜程度有很大的區(qū)別第三節(jié)病毒的復(fù)制病毒的特點:嚴(yán)格細(xì)胞內(nèi)寄生物,只能在活細(xì)胞內(nèi)繁殖。毒粒宿主細(xì)胞有繁殖性的病毒基因組具有感染性的毒粒消失病毒基因組復(fù)制、表達(dá)病毒核酸和蛋白質(zhì)裝配形成具有感染性的毒粒釋放至細(xì)胞外原料;能量;生物合成場所;第三節(jié)病毒的復(fù)制病毒的復(fù)制:病毒感染敏感宿主細(xì)胞后,病毒核酸進(jìn)入細(xì)胞,通過其復(fù)制與表達(dá)產(chǎn)生子代病毒基因組和新的蛋白質(zhì),然后由這些新合成的病毒組分裝配(assembly)成子代毒粒,并以一定方式釋放到細(xì)胞外。病毒的這種特殊繁殖方式稱做復(fù)制(replication)。第三節(jié)病毒的復(fù)制一、病毒的復(fù)制周期1、一步生長曲線(onestepgrowthcurve)1939年,MaxDelbruck&EmoryEllis:E.coli/bacteriopage1、用噬菌體的稀釋液感染高濃度的宿主細(xì)胞;2、數(shù)分鐘后,加入抗噬菌體的抗血清(中和未吸附的噬菌體);3、將上述混合物大量稀釋,終止抗血清的作用和防止新釋放的噬菌體感染其它細(xì)胞;4、保溫培養(yǎng)并定期檢測培養(yǎng)物中的噬菌體效價(對噬菌體含量進(jìn)行計數(shù));5、以感染時間為橫坐標(biāo),病毒的感染效價為縱坐標(biāo),繪制出病毒特征性的繁殖曲線;該實驗標(biāo)志著分子病毒學(xué)、分子生物學(xué)和分子遺傳學(xué)的建立MaxDelbruck因此榮獲1969年NobelPrize一、病毒的復(fù)制周期1、一步生長曲線(onestepgrowthcurve)噬菌體復(fù)制(繁殖)的三個階段:1、吸附期;游離的噬菌體吸附到宿主細(xì)胞2、潛伏期;從噬菌體吸附到細(xì)胞到釋放出新噬菌體的最短時期3、裂解期;隨著菌體不斷破裂,新噬菌體數(shù)目增加,直到最高值一、病毒的復(fù)制周期1、一步生長曲線(onestepgrowthcurve)取培養(yǎng)物直接測定病毒數(shù)量將培養(yǎng)物過濾去細(xì)胞后測定病毒數(shù)量將細(xì)胞裂解后測定病毒的數(shù)量。前期可將培養(yǎng)物先離心去上清以消除未吸附病毒的影響裂解量:每個受染細(xì)胞所產(chǎn)生的子代病毒顆粒的平均數(shù)目。其值等于潛伏期受染細(xì)胞的數(shù)目除以穩(wěn)定期受染細(xì)胞所釋放的全部子代病毒數(shù)目,即等于穩(wěn)定期病毒效價與潛伏期病毒效價之比。一、病毒的復(fù)制周期2、隱蔽期(eclipseperiod)在潛伏期的前一段,受染細(xì)胞內(nèi)檢測不到感染性病毒,后一階段,感染性病毒在受染細(xì)胞內(nèi)的數(shù)量急劇增加。自病毒在受染細(xì)胞內(nèi)消失到細(xì)胞內(nèi)出現(xiàn)新的感染性病毒的時間為為隱蔽期。隱蔽期病毒在細(xì)胞內(nèi)存在的動力學(xué)曲線呈線性函數(shù),而非指數(shù)關(guān)系,從而證明子代病毒顆粒是由新合成的病毒基因組與蛋白質(zhì)經(jīng)裝配成熟,而不是通過雙分裂方式產(chǎn)生的。不同病毒的隱蔽期長短不同,例如,DNA動物病毒的隱蔽期為5~20小時,RNA動物病毒為2~10小時。一、病毒的復(fù)制周期1、一步生長曲線(onestepgrowthcurve)一步生長曲線是研究病毒復(fù)制的一個經(jīng)典試驗,最初是為研究噬菌體的復(fù)制而建立,以后推廣到動物病毒和植物病毒的復(fù)制研究中。以適量的病毒接種于標(biāo)準(zhǔn)培養(yǎng)的高濃度的敏感細(xì)胞,待病毒吸附后,離心除去未吸附的病毒,或以抗病毒抗血清處理病毒—細(xì)胞培養(yǎng)物以建立同步感染,然后繼續(xù)培養(yǎng)并定時取樣測定培養(yǎng)物中的病毒效價,并以感染時間為橫坐標(biāo),病毒的感染效價為縱坐標(biāo),繪制出病毒特征性的繁殖曲線,即一步生長曲線。不同病毒的潛伏期長短不同,噬菌體以分鐘計,動物病毒和植物病毒以小時或天計。潛伏期:噬菌體的裂解量一般為幾十到上百個,植物病毒和動物病毒可達(dá)數(shù)百乃至上萬個。裂解量:一、病毒的復(fù)制周期3、病毒的復(fù)制周期復(fù)制周期(replicativecircle)或稱復(fù)制循環(huán):自病毒吸附于細(xì)胞開始,到子代病毒從感染細(xì)胞釋放到細(xì)胞外的病毒復(fù)制過程。①吸附;
②侵入;
③脫殼;
④病毒大分子的合成,包括病毒基因組的表達(dá)與復(fù)制;⑤裝配與釋放;第三節(jié)病毒的復(fù)制二、病毒感染的起始1、吸附:毒粒敏感細(xì)胞隨機碰撞而接觸(靜電引力或氫鍵)可逆吸附,無特異性(非細(xì)胞顆粒也可吸附)病毒表面蛋白與細(xì)胞受體的結(jié)合特異性,不可逆吸附,啟動病毒感染的第一階段二、病毒感染的起始1、吸附:病毒吸附蛋白與細(xì)胞受體間的結(jié)合力來源于空間結(jié)構(gòu)的互補性,相互間的電荷、氫鍵、疏水性相互作用及范得華力。不同種系的細(xì)胞具有不同病毒的細(xì)胞受體,病毒受體的細(xì)胞種系特異性決定了病毒的宿主范圍。二、病毒感染的起始2、侵入:侵入又稱病毒內(nèi)化,它是一個病毒吸附后幾乎立即發(fā)生,依賴于能量的感染步驟。不同的病毒-宿主系統(tǒng)的病毒侵入機制不同二、病毒感染的起始2、侵入:有尾噬菌體:注射方式將噬菌體核酸注入細(xì)胞通過尾部刺突固著于細(xì)胞;尾部的酶水解細(xì)胞壁的肽聚糖,是細(xì)胞壁產(chǎn)生小孔;尾鞘收縮,核酸通過中空的尾管壓入胞內(nèi),蛋白質(zhì)外殼留在胞外;吸附尾釘固著尾鞘收縮尾管穿入DNA注入如果大量噬菌體在短時間內(nèi)吸附于同一細(xì)胞上,使細(xì)胞壁產(chǎn)生許多小孔,也可引起細(xì)胞立即裂解,但并未進(jìn)行噬菌體的增殖,這種現(xiàn)象稱為自外裂解(lysisfromwithout)。二、病毒感染的起始2、侵入:植物病毒:通過因人為地或自然的機械損傷所形成的微傷口進(jìn)入細(xì)胞;或者靠攜帶有病毒的媒介,主要靠是有吮吸式口器的昆蟲取食將病毒帶入細(xì)胞。植物病毒一旦進(jìn)入細(xì)胞后,增殖產(chǎn)生的子代病毒或病毒核酸可通過病毒編碼的運動蛋白(movementprotein)與胞間連絲的相互作用從受染細(xì)胞進(jìn)入鄰近細(xì)胞。二、病毒感染的起始3、脫殼:脫殼是病毒侵入后,病毒的包膜和/或殼體除去而釋放出病毒核酸的過程。脫殼是病毒基因組進(jìn)行功能表達(dá)所必需的感染事件。T-偶數(shù)噬菌體脫殼與侵入是一起發(fā)生的動物病毒存在不同的結(jié)構(gòu)類型和不同的侵入方式,其脫殼過程也較復(fù)雜。第三節(jié)病毒的復(fù)制三、病毒大分子的合成病毒基因組進(jìn)入胞內(nèi)宿主細(xì)胞的代謝發(fā)生改變病毒利用宿主的生物合成機構(gòu)和場所,使病毒核酸表達(dá)和復(fù)制,產(chǎn)生大量的病毒蛋白質(zhì)和核酸。四、病毒的裝配與釋放第三節(jié)病毒的復(fù)制新合成的毒粒結(jié)構(gòu)組分組裝成完整的病毒顆粒,稱做病毒的裝配,亦稱成熟(maturation)或形態(tài)發(fā)生(morphogenesis)。成熟的子代病毒顆粒然后依一定途徑釋放到細(xì)胞外病毒的釋放標(biāo)志病毒復(fù)制周期結(jié)束吸附侵入早期:病毒特異性酶的合成病毒核酸復(fù)制病毒結(jié)構(gòu)蛋白質(zhì)合成裝配釋放病毒大分子合成噬菌體與宿主關(guān)系1、烈性噬菌體:凡能引起宿主細(xì)胞迅速裂解的噬菌體。2、溫和性噬菌體:噬菌體侵染宿主后,并不增殖,裂解,而與宿主DNA結(jié)合,隨宿主DNA復(fù)制而復(fù)制,此時細(xì)胞中找不到形態(tài)上可見的噬菌體,這種噬菌體稱為溫和性噬菌體。含有溫和性噬菌體的細(xì)菌稱為溶源性細(xì)菌lysogenicbacteria第四節(jié)病毒的非增殖性感染溫和噬菌體的溶源性反應(yīng):烈性噬菌體(virulentphage):感染宿主細(xì)胞后能在細(xì)胞內(nèi)正常復(fù)制并最終殺死細(xì)胞,形成裂解循環(huán)(lyticcycle)。溫和噬菌體或稱溶源性噬菌體(lysogenicphage):感染宿主細(xì)胞后不能完成復(fù)制循環(huán),噬菌體基因組長期存在于宿主細(xì)胞內(nèi),沒有成熟噬菌體產(chǎn)生。這一現(xiàn)象稱做溶源性(lysogeny)現(xiàn)象在大多數(shù)情況下,溫和噬菌體的基因組都整合于宿主染色體中(如λ噬菌體),亦有少數(shù)是以質(zhì)粒形成存在(如P1噬菌體)。溫和性噬菌體存在狀態(tài)1)游離具感染性的virion;2)前噬菌體(prophage):附著或整合在宿主染色體上,一道復(fù)制;3)營養(yǎng)期噬菌體:指導(dǎo)合成。溫和噬菌體的溶源性反應(yīng):整合于細(xì)菌染色體或以質(zhì)粒形成存在的溫和噬菌體基因組稱做原噬菌體(prophage)在原噬菌體階段,噬菌體的復(fù)制被抑制,宿主細(xì)胞正常地生長繁殖,而噬菌體基因組與宿主細(xì)菌染色體同步復(fù)制,并隨細(xì)胞分裂而傳遞給子代細(xì)胞。細(xì)胞中含有以原噬菌體狀態(tài)存在的溫和噬菌體基因組的細(xì)菌稱做溶源性細(xì)菌(lysogenicbacteria)溶源性細(xì)菌經(jīng)自發(fā)裂解或誘發(fā)裂解,進(jìn)入裂解循環(huán)5節(jié):病毒對理化因素抵抗力1、物理因素主要是溫度、光、干燥??傻蜏乇4?,但不耐熱,60度,30分鐘。X射線、γ射線、紫外線可滅活。無包膜病毒在相對濕度(RH)較高時存活較好,而有包膜病毒在低RH時存活最好。2、化學(xué)因素:體內(nèi)滅活物質(zhì)是抗體和干擾素體外一般消毒劑可滅活,對氯耐受力比腸道菌強,對酸性不敏感,對高pH敏感??捎弥軇选⑹榛蛩徕c、氯仿、去氧膽酸鈉等)鑒別有無包膜。3、病毒在環(huán)境中存活:在海水和淡水中,溫度是影響病毒存活的主要因素,與病毒類型也有關(guān);土壤中受溫度和濕度影響最大,干燥易使病毒滅活;空氣中病毒附著在塵埃上,存活時間受多種因素影響。污水處理中一級處理是物理過程,去除病毒效果很差,最多30%。二級處理是生物處理,病毒去除率90-99%。三級處理可進(jìn)一步去除病毒。亞病毒1、類病毒viroid:沒有衣殼包裹的RNA分子。2、擬病毒virusoids(類類病毒):一類包括在植物病毒粒子中的類病毒,RNA。3、朊病毒prion,virino:一類能侵染動物并在宿主細(xì)胞內(nèi)復(fù)制的小分子無免疫性的疏水性蛋白。Microbiology類病毒(viroid)目前所知道的最小、只含RNA一種成分、專性細(xì)胞內(nèi)寄生的分子生物。只在植物體中發(fā)現(xiàn)。馬鈴薯紡錘形塊莖病是1922年在美國發(fā)現(xiàn)的,它可使馬鈴薯減產(chǎn)20~70%——馬鈴薯紡錘形塊莖病類病毒:它是一條長50nm的棒狀dsRNA分子Microbiology擬病毒(virusoids)又稱類類病毒(viroid-like),可認(rèn)為是一類包裹在植物病毒粒子中的有缺陷的類病毒一般僅由裸露的RNA或DNA組成“寄生”于真病毒內(nèi)——輔助病毒(helpervirus)其復(fù)制必須依賴輔助病毒Microbiology朊病毒(prion,virino)朊病毒有哪些特點
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