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文檔簡介
一、原位分子雜交技術(shù)DNA變性:當(dāng)溶液中DNA分子處于高溫或高pH值(13)條件下,維持雙螺旋在一起堿基互補對就被破壞,DNA雙鏈解離成兩條單鏈,這一過程叫DNA變性。DNA復(fù)性:當(dāng)溫度降低至適當(dāng)溫度或恢復(fù)pH值至中性,兩條裂解單鏈按堿基互補配對標(biāo)準(zhǔn)重新形成雙鏈結(jié)構(gòu),這一過程叫DNA復(fù)性,又叫DNA雜交。細胞分子生物學(xué)研究方法第1頁細胞分子生物學(xué)研究方法第2頁細胞分子生物學(xué)研究方法第3頁
核酸分子雜交:按照堿基互補配對標(biāo)準(zhǔn),將不一樣起源序列互補單鏈DNA/DNA,RNA/RNA,RNA/DNA,互補配對成雙鏈雜交分子,這一過程叫核酸分子雜交。細胞分子生物學(xué)研究方法第4頁
原位雜交:用核苷酸探針對特殊核苷酸次序在其原位進行雜交,叫原位雜交??捎糜贒NA、RNA定位研究。細胞分子生物學(xué)研究方法第5頁熒光原位雜交(fluorescenceinsituhybridization,FISH)細胞分子生物學(xué)研究方法第6頁二、聚合酶鏈反應(yīng)技術(shù)(polymerasechainreaction,PCR)又叫體外基因擴增技術(shù)。利用人工合成一對引物,在被擴增DNA模板鏈兩端形成雙鏈,由DNA聚合酶催化一對引物之間聚合反應(yīng)。細胞分子生物學(xué)研究方法第7頁詳細過程:①變性:將雙鏈DNA加熱(95℃)使之變性,DNA雙鏈變成單鏈②退火:降低溫度至56℃使引物與模板DNA單鏈結(jié)合③延伸:將溫度升至72℃,在DNA聚合酶作用下,在引物3’端進行延伸,使原模板DNA一條鏈變成兩條鏈。細胞分子生物學(xué)研究方法第8頁三、反義技術(shù)反義核酸技術(shù)主要是引入目標(biāo)基因mRNA反義序列或與目標(biāo)基因互補配正確反義基因,經(jīng)過它們雜交而阻遏或降低目標(biāo)基因表示一個方法。當(dāng)引入反義核酸與對應(yīng)序列互補配對后,用于表示目標(biāo)基因mRNA量大大降低,使細胞中靶基因編碼蛋白合成量也大為降低細胞分子生物學(xué)研究方法第9頁反義技術(shù)應(yīng)用:①基因功效研究②病毒基因組功效研究③作為藥品④抗腫瘤作用細胞分子生物學(xué)研究方法第10頁四、基因轉(zhuǎn)移技術(shù)將外源基因轉(zhuǎn)移到受體菌或細胞內(nèi)使之在細胞內(nèi)實現(xiàn)轉(zhuǎn)入基因擴增或表示技術(shù)。它是重組DNA、基因功效研究、基因治療關(guān)鍵技術(shù)之一。方式:轉(zhuǎn)化轉(zhuǎn)染細胞分子生物學(xué)研究方法第11頁轉(zhuǎn)染技術(shù)是指將外源分子如DNA,RNA等導(dǎo)入真核細胞技術(shù),它是研究基因表示調(diào)控,突變分析等常規(guī)工具。伴隨功效研究興起,其應(yīng)用越來越廣泛。細胞分子生物學(xué)研究方法第12頁常規(guī)轉(zhuǎn)染技術(shù)可分為兩大類,一類是瞬時轉(zhuǎn)染,一類是穩(wěn)定轉(zhuǎn)染(永久轉(zhuǎn)染)。前者外源DNA/RNA不整合到宿主染色體中,所以一個宿主細胞中可存在多個拷貝數(shù),產(chǎn)生高水平表示,但通常只連續(xù)幾天,多用于開啟子和其它調(diào)控元件分析。后者也稱穩(wěn)定轉(zhuǎn)染,外源DNA既能夠整合到宿主染色體中,也可能作為一個游離體(episome)存在。外源DNA整合到染色體中概率很小,大約1/104轉(zhuǎn)染細胞能整合,通常需要經(jīng)過一些選擇性標(biāo)識,如來氨丙基轉(zhuǎn)移酶(APH新霉素抗性基因),潮霉素B磷酸轉(zhuǎn)移酶(HPH),胸苷激酶(TK)等重復(fù)篩選,得到穩(wěn)定轉(zhuǎn)染同源細胞系。細胞分子生物學(xué)研究方法第13頁影響轉(zhuǎn)染效率主要原因有:
1、細胞培養(yǎng)物
健康細胞培養(yǎng)物是成功轉(zhuǎn)染基礎(chǔ)。不一樣細胞有不一樣培養(yǎng)基,血清和添加物。高轉(zhuǎn)染效率需要一定細胞密度,普通推薦在轉(zhuǎn)染前24小時將細胞傳代,這么可提供正常細胞代謝,增加對外源DNA攝入可能。另外一定要防止細菌、支原體或真菌污染。細胞分子生物學(xué)研究方法第14頁2、血清
大多數(shù)培養(yǎng)基在使用前需要加血清。通常血清是一個包含生長因子及其它輔助因子不確切成份添加物,對不一樣細胞生長作用有很大差異。血清質(zhì)量改變直接影響轉(zhuǎn)染效率。所以在轉(zhuǎn)染前提議先測試出對細胞生長良好血清批號,轉(zhuǎn)染時用同一批號血清,并同時做負對照(不加轉(zhuǎn)染試劑及外源DNA)以測試細胞生長是否正常。有些轉(zhuǎn)染技術(shù)如脂質(zhì)體轉(zhuǎn)染在有血清存在情況下效率很低,所以在轉(zhuǎn)染前要除血清。但有些對此敏感細胞如原代細胞會受到損傷,甚至死亡造成轉(zhuǎn)染效率極低。細胞分子生物學(xué)研究方法第15頁3、載體構(gòu)建
轉(zhuǎn)染載體構(gòu)建(病毒載體,質(zhì)粒DNA、RNA、PCR產(chǎn)物、寡核苷酸等)也影響轉(zhuǎn)染結(jié)果。病毒載體對特定宿主細胞感染效率較高,但不一樣病毒載體有其特定宿主,有還要求特定細胞周期,另外還需考慮一些安全問題(如基因污染)。除載體構(gòu)建外,載體形態(tài)及大小對轉(zhuǎn)染效率也有不一樣影響,假如基因產(chǎn)物對細胞有毒性作用,轉(zhuǎn)染也極難進行,所以選擇組成及適當(dāng)開啟子也很主要,同時做空載體及其它基因相同載體構(gòu)建正對照可排除毒性影響干擾。細胞分子生物學(xué)研究方法第16頁4、DNA質(zhì)量
DNA質(zhì)量對轉(zhuǎn)染效率影響非常大。普通轉(zhuǎn)染技術(shù)(如脂質(zhì)體等)基于電荷吸引原理,假如DNA不純,帶少許鹽離子、蛋白、代謝物污染都會顯著影響轉(zhuǎn)染復(fù)合物有效形成及轉(zhuǎn)染進行。核酸純化世界第一品牌德國QIAGEN企業(yè)提供超純質(zhì)粒抽提試劑盒使您無須為DNA質(zhì)量操心。另外,對一些內(nèi)毒素敏感細胞(如原代細胞,懸浮細胞和造血細胞),QIAGEN還提供可去除內(nèi)毒素污染質(zhì)粒抽提試劑盒,在質(zhì)粒抽提過程中有效去除脂多糖分子,確保理想轉(zhuǎn)染效果。細胞分子生物學(xué)研究方法第17頁5、轉(zhuǎn)染技術(shù)
轉(zhuǎn)染技術(shù)選擇對轉(zhuǎn)染結(jié)果影響也很大,許多轉(zhuǎn)染方法需要優(yōu)化DNA與轉(zhuǎn)染試劑百分比,細胞數(shù)量,培養(yǎng)及檢測時間等。細胞分子生物學(xué)研究方法第18頁細胞分子生物學(xué)研究方法第19頁五、基因敲除與敲進
基因敲除(knockoutofgene):利用基因打靶技術(shù),用無功效外源基因轉(zhuǎn)入細胞與基因組中同源序列進行同源重組,把含有功效同源序列置換出來,造成功效基因缺失或失活,這一技術(shù)叫基因敲除。
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