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1甘薯莖腐病菌檢疫鑒定方法綱(Gammaproteobacteria)、腸桿菌目(Enterobacterales狄克氏菌屬(Dickeya)、達(dá)旦提狄克氏菌(Dickeyadadantii)。革蘭氏陰性細(xì)菌,菌體短桿注:癥狀特征見附錄A。4縮略語CFU:菌落形成單位(Colony-FormingCTAB:溴代十六烷基三甲胺(CetyltrimethyDNA:脫氧核糖核酸(DeoxyribonucleicacidNTP:脫氧核苷三磷酸(DeoxyribHR:過敏性反應(yīng)(HypersensitiveReactioionization-timeoffligNA:營養(yǎng)瓊脂(NutrientAgar)NGM:營養(yǎng)瓊脂甘油培養(yǎng)基(NutrientAgarPCR:聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PolymerasechainreactRT-PCR:逆轉(zhuǎn)錄-聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(ReversetranscriptionpolymTaq:水生噬熱桿菌(Thermusaquati2根據(jù)甘薯莖腐病的菌落形態(tài)特征、田間危害癥狀特征、分子生物學(xué)PCR或RT-PCR反應(yīng)特征、蛋白質(zhì)7.18MALDI質(zhì)譜儀:需具有細(xì)菌鑒定分析39癥狀觀察對于植株樣品,參見附錄A中的癥狀描述觀察有無甘薯莖腐病典型癥狀,對出現(xiàn)典型癥狀或可疑癥培養(yǎng)2d~3d,獲得單菌落。4樣品DNA的提取可按CTAB方法,也可使用商品化的DNA提取試劑盒提取。提取的核酸用于PCR檢測或?qū)τ谟邪Y樣品,以標(biāo)準(zhǔn)菌株做陽性對照,健康植物組織做陰性對照,雙蒸水作為空白對照進(jìn)行PCR檢測,具體檢測步驟和判定標(biāo)準(zhǔn)按附錄C執(zhí)行。單菌落可制成菌懸液直接進(jìn)行P對照為無菌水接種,保濕1d,25℃~30℃,12h/12h生長。接種2d~4d后觀察接種位置現(xiàn)癥狀。根據(jù)柯赫氏法則,對發(fā)病處組織再分離病菌,對于有癥狀樣品,PCR檢測結(jié)果為陽性,即判定為檢出甘薯莖腐病菌;無癥狀樣品或新發(fā)生區(qū)的有癥狀樣品,PCR檢測結(jié)果陽性,且分離到病菌,參考致病性測試結(jié)果,判定檢出甘薯莖腐病菌。其中,PCR檢測可根據(jù)實驗條件,選擇本標(biāo)準(zhǔn)10.2.2或10.2.3的一種進(jìn)行檢測,任意一種檢測方法的結(jié)果為陽性則判定為PCR檢測結(jié)果為陽性。分離的疑似甘薯莖腐病菌單菌落鑒定可選用本標(biāo)準(zhǔn)10.2.2或10.2.3或薯莖腐病菌D.dadantii。5送樣人聯(lián)系方式和聯(lián)系地址、檢測時間、地點、方法和鑒定者。疑似癥狀等應(yīng)及時拍照保存,PCR檢測6A.1癥狀出現(xiàn)黑褐色斑,見圖A.1。早期發(fā)病全株枯死。中后期發(fā)病,在病斑部位上端的藤蔓有不定根深入土中發(fā)病斑一般以芽眼為中心圓形,稍凹陷,黑褐色,后逐A.2病原菌形態(tài)及培養(yǎng)性狀煙草上激發(fā)過敏性反應(yīng)(HR),見圖A.3。病原菌在NA平板上28℃培養(yǎng)2d后,菌落淡土黃色、不透明、邊緣不整齊、表面凸起稍皺縮,直徑2mm~3mm,見圖A.4的左圖。在NGM平板上28℃培養(yǎng)2d后,菌落呈煎雞蛋狀,邊緣不整齊,表面略凸起,產(chǎn)生靛藍(lán),直徑2mm~3mm,見圖A.478A.3接種癥狀分離物108CFU/mL菌懸液針刺接種甘薯藤蔓進(jìn)行致病性測試。對照為無菌水接種,保濕1d,25℃~30℃生長。接種2d~4d后觀察接種位置附近是否出現(xiàn)癥狀,見圖A.5。根據(jù)柯赫氏法則,對9B.2.1營養(yǎng)瓊脂(BectonDickinsonandCo),72℃延伸5min。反應(yīng)參數(shù)可根據(jù)不同儀器的要求作適當(dāng)調(diào)整。在NA培養(yǎng)基上28℃培養(yǎng)24h挑取單菌落,直接涂抹到質(zhì)
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