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第二章蛋白質(zhì)化學(xué)(續(xù))▲第二節(jié)蛋白質(zhì)的分子結(jié)構(gòu)(Themolecularstructureofproteins)基本結(jié)構(gòu)空間結(jié)構(gòu)蛋白質(zhì)的分子結(jié)構(gòu)一級結(jié)構(gòu)二級結(jié)構(gòu)三級結(jié)構(gòu)四級結(jié)構(gòu)學(xué)習(xí)要求:概念、主要化學(xué)鍵和結(jié)構(gòu)特點?!诙?jié)蛋白質(zhì)的分子結(jié)構(gòu)蛋白質(zhì)的四級結(jié)構(gòu)多肽鏈(主鏈+側(cè)鏈)肽鍵主鏈:肽鍵(CO-NH),相鄰的兩個中心C及H肽平面或肽單元?
▲一、蛋白質(zhì)一級結(jié)構(gòu)N端C端一般將多肽鏈的方向定義為:N端到C端。
一、蛋白質(zhì)一級結(jié)構(gòu)牛胰島素的一級結(jié)構(gòu)(一)概念多肽鏈中由N端到C端得氨基酸的數(shù)量、種類和排列順序稱為蛋白質(zhì)的一級結(jié)構(gòu)。多肽鏈,線性結(jié)構(gòu)。(二)化學(xué)鍵
肽鍵、二硫鍵蛋白質(zhì)一級結(jié)構(gòu)在空間是否會發(fā)生改變?每種氨基酸的結(jié)構(gòu)和理化性質(zhì),多肽鏈中氨基酸殘基都會與相鄰氨基酸殘基產(chǎn)生作用力,在力量的驅(qū)使下,自然在三維結(jié)構(gòu)空間發(fā)生結(jié)構(gòu)改變,形成獨特的結(jié)構(gòu)。
二、蛋白質(zhì)的空間結(jié)構(gòu)肽單元(peptideunit)組成肽鍵的四個原子和與之相連的兩個C
,即C
1、C、O、N、H、C
2位于同一平面,此平面叫肽平面。C1和C2處平面對角。不能自由旋轉(zhuǎn)
肽單元平面1
肽單元平面2其中一個Cα存在兩個肽單元平面交點,分別與N-H和C=O相連的鍵都是單鍵,可以自由旋轉(zhuǎn),方位可以千變?nèi)f化。肽單元是蛋白質(zhì)空間結(jié)構(gòu)的基本單位。肽單元(peptideunit)(一)蛋白質(zhì)的二級結(jié)構(gòu)一條多肽鏈局部的構(gòu)像;局部肽鏈主鏈骨架原子空間上的相對位置,并不涉及其側(cè)鏈構(gòu)像。什么是主鏈骨架原子?肽鍵中的C、N及Cα原子。1、概念
涉及局部肽鏈主鏈骨架原子的局部空間位置,不涉及氨基酸殘基側(cè)鏈的構(gòu)象。
▲▲3、主要形式
α-螺旋、β-折疊
、β-轉(zhuǎn)角、無規(guī)則卷曲(一)蛋白質(zhì)的二級結(jié)構(gòu)▲▲2、主要化學(xué)鍵
氫鍵(一般指C=O中O與N-H中H之間形成)RNA酶的分子結(jié)構(gòu)α-螺旋β-折疊β-轉(zhuǎn)角無規(guī)卷曲▲(1)α-螺旋
逆時針順時針蛋白質(zhì)的α-螺旋是順指針,即右手螺旋。蛋白質(zhì)的右手螺旋①右手螺旋②每圈含3.6個殘基
螺距0.54nm③側(cè)鏈伸向螺旋外側(cè)④氫鍵方向與α-螺旋長軸平行▲α-螺旋結(jié)構(gòu)特點(0.54nm)氫鍵α-螺旋僅涉及肽鍵中的C、N及Cα原子。某蛋白二級結(jié)構(gòu):α/β型,11個α-螺旋和8個β-折疊。α-螺旋是蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu)中最常見的構(gòu)像形式。總結(jié):α-螺旋▲(2)
-折疊①概念就是不同肽段互相靠近時,通過氫鍵維系起來的,每條肽段都成為折紙裝(或鋸齒狀)結(jié)構(gòu)。②
形式:平行式和反平行式。NNNN平行式反平行式▲(2)
-折疊氫鍵▲③特點※鋸齒狀※兩種形式:平行式和反平行式※肽鏈間形成氫鍵,方向與肽鏈長軸垂直β-
※-折疊是蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu)的主要構(gòu)成方式?!?)
-折疊(3)β-轉(zhuǎn)角多肽鏈局部在走向上發(fā)生180度回折,這個位置構(gòu)像稱為β-轉(zhuǎn)角。主要存在于球形蛋白表面,參與轉(zhuǎn)角的氨基酸:Pro和Gly。1、概念肽鏈主鏈和側(cè)鏈中所有原子或基團在空間排布的分子結(jié)構(gòu),包括側(cè)鏈的構(gòu)像。是一條多肽鏈的最高空間結(jié)構(gòu)?!?、主要化學(xué)鍵疏水鍵、離子鍵,氫鍵,范德華力▲(二)蛋白質(zhì)的三級結(jié)構(gòu)▲維持蛋白質(zhì)空間結(jié)構(gòu)的化學(xué)鍵次級鍵:氫鍵,離子鍵,疏水作用,范德華力一條多肽鏈(153個AA)+一個血紅素輔基(鐵卟啉環(huán))肌紅蛋白:具由三級結(jié)構(gòu)的球形蛋白。C端N端血紅素(又稱鐵卟啉,含F(xiàn)e2+)Fe2+功能:結(jié)合并儲存氧,是肌肉中氧的貯存庫。①親水基團位于分子的表面,疏水R-側(cè)鏈埋藏在分子內(nèi)部,親水性。②親水表面上常有一些疏水口袋,蛋白質(zhì)的輔基或金屬離子分布在其中。③三級結(jié)構(gòu)是任何蛋白質(zhì)都能形成的。★3、蛋白質(zhì)的三級結(jié)構(gòu)特點▲
(三)蛋白質(zhì)的四級結(jié)構(gòu)(兩條以上多肽鏈)血紅蛋白α2β2
1、概念:兩個以上具有三級結(jié)構(gòu)的多肽鏈組合
形成。每條多肽鏈稱為一個亞基。▲2、化學(xué)鍵
氫鍵和離子鍵?!?、特點
亞基,無生物學(xué)活性。亞基按照特定方式形成四級結(jié)構(gòu)的蛋白質(zhì)分子時,有生物學(xué)活性。血紅蛋白的四級結(jié)構(gòu)血紅蛋白(Hb):珠蛋白+血色素輔基(含F(xiàn)e2+卟啉環(huán))α鏈血紅素β鏈既能在肺泡氧分壓高的情況下,充分與氧結(jié)合;又能在周圍組織氧分壓低的條件下,將大部分氧釋放出來?!?、對于一條多肽鏈組成的蛋白質(zhì)分子,最高空間結(jié)構(gòu)為三級結(jié)構(gòu),該蛋白質(zhì)具有生物活性?!?/p>
2、對于兩條或兩條以上具有獨立三級結(jié)構(gòu)的
多肽鏈集結(jié),通過非共價鍵組成的蛋白質(zhì)
的四級結(jié)構(gòu),才有生物活性
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