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文檔簡介
流調(diào)、監(jiān)測工作中常用的統(tǒng)計分析方法
一、統(tǒng)計分析的重要性
統(tǒng)計分析是流行病學調(diào)查靈魂所在。在動物疫病流行病學調(diào)查中,
統(tǒng)計分析具有以下四個方面的重要意義。
1、統(tǒng)計分析是信息交流的需要
2、是調(diào)查方案設計的需要
3、是正確分析調(diào)查結果的需要
4、是深入分析調(diào)查結果的需要
二、統(tǒng)計分析在流行病學調(diào)查中的應用
1、統(tǒng)計數(shù)據(jù)的計算
2、分布情況的描述
3、確定樣本量
4、從樣本的測量值估計總體情況
5、分析各組數(shù)據(jù)之間的差異是否顯著
6、分析某些變量是否相關
三,流行病學調(diào)查中常用的統(tǒng)計分析方法
7,料漳量確實定
(1)至少發(fā)現(xiàn)1個陽性病例的樣本量
公式n=ln(1-a)/In(1-pXs)
In為自然對數(shù),a為置信區(qū)間,p為預測感染率,s為檢測的靈敏
度。
如預測某豬場豬瘟感染率為10%,RT-PCR檢測的敏感性為90%,在置
信區(qū)間為95%,確保至少能檢出一例陽性動物需采集多少樣本?
n=ln(l-0.95)/ln(l-0.1X0.9)=32
假設32份樣品檢測結果全部為陰性,說明該豬場豬瘟感染率低于
10%o
(2)調(diào)查總體率的樣本量計算
在調(diào)查某種疫病在某個群體中的流行率或免疫抗體合格率。
公式:n=ZXZX(1-WXL)4-(WXLXeX£)
n為需要采集的樣本量,Z是置信度(P)的標準正態(tài)分布參數(shù)(P=95%
時,Z=1.96;P=99%時,Z=2.58),w為估計的流行率或合格率,L為檢測
的靈敏度,£為最大的相對誤差。
如某縣豬0型口蹄疫免疫合格率估計為70%,間接血凝檢測的靈敏度
為9096,最大相對誤差為10%,置信度P=95%,那么檢測該縣豬0型口蹄
疫免疫合格率,需要抽取多少樣本?
n=L96X1.96X(l-70%X90%).(0.7X90%X10%X10%)
4226
如估計的免疫合格率為90%,那么需采集90頭份,估計合格率為50%,
那么需采集470頭份。
對于養(yǎng)殖場采樣數(shù)量可參考下表:
置信度為9596,按估計的陽性率/合格率、群的大小計算的采樣數(shù)量
流行百分率%
504030252015105210.50.1
2046791012161920202020
3046891114192630303030
40568101215213140404040
50568101216223546505050
60568101216233855606060
705G81013172440G2707070
80568101317244268798080
90568101317254373879090
10056910131725457896100100
150569111318274995130148150
2005691113182751105155190200
50056911M192856129225349500
10005691114192957138258450950
2、足計撤據(jù)的計算
發(fā)病率、死亡率、合格率、陽性率、平均值、離散度等指標與去年
同期比擬(同比)、與上個月/季度比擬(環(huán)比)、與國家要求比擬(基線
比),來描述疫情的現(xiàn)狀和開展趨勢。
Excell軟件的應用:在Excell工具欄中點加載宏,在彈出的對話框
中選中分析工具庫和分析工具庫-VBA函數(shù),確認,以后使用t檢驗、相
關系數(shù)分析、方差分析等在工具欄中選中數(shù)據(jù)分析,然后選擇相應分析
方法即可。
Excell中最常用的統(tǒng)計分析方法是自己輸入相應的計算公式和選擇
插入函數(shù)。較為常用的函數(shù)有:
平均值一average-在插入函數(shù)中選定average,選定統(tǒng)計區(qū)域,確定;
標準差一stdev-同上;
離散度=標準差?平均值義100
樣本數(shù)一count-同平均值的方法;
合格數(shù)一countif-在插入函數(shù)中選定countif,選定統(tǒng)計區(qū)域,設
定合格參數(shù),確認;
合格率=合格數(shù):樣本數(shù)X100。
免疫抗體合格率描述了群體對每一種疫病免疫狀態(tài)的一個層面,不
能反映其整體面貌。合格率、平均值、離散度相結合根本可以反映群體
的免疫狀況。
例1:A養(yǎng)雞場新城疫檢測效價分別為:4、4、4、4、4、4、4、4、
3、3,合格率為80%;
B場分別為:8、8、8、8、8、8、8、8、3、3,合格率也為80%;但
A場抗體效價平均值為3.8,而B場平均值為7.0,說明A場已低于保護臨
界線,應盡快進行補免,而B場僅個別雞只低于保護臨界線,需密切觀
察。
例2:A場新城疫免疫抗體分別為:5、5、5、5、5、6、6、6、3、3,
合格率為80%,平均值為4.9。
B場:11、12、4、4、4、、4、,5、5、0、0,合格率為80%,平均值
為4.9o
但是A場離散度為22.46,而B場為80.17,什么A場免疫狀況良好,
只是近期需要補免而已,而B場離散度較高,極有可能現(xiàn)在正在發(fā)生該
病的疫情。
序號A雞場B雞場C雞場D雞場
148511
248512
34854
44854
54854
64864
74865
84865
93330
103330
平均值3.807.004.904.90
標準差0.422.111.103.93
合格數(shù)8888
離散度11.1030.1222.4680.17
樣本數(shù)10101010
合格率80.0080.0080.0080.00
離散度低于40%,表示抗體水平較為一致,整齊度高;介于40%—
60%之間,表示個體間有一定的差異,如此時平均值較高,那么說明免
疫狀況良好,如平均值略高于保護臨界值,應立即補免;介于60%—80%
之間,說明個體間離散度較大,群體有可能已被感染;離散度大于80%,
那么表示個體間差異非常大,多數(shù)情況為群體已被感染。
合格率符合要求,平均值越高于保護臨界值、離散度越低,表示群
體免疫越好。
3.就針臺新演弧的刷作
應用Excell可以制作各種酶聯(lián)方法檢測出的0D值換算為抗體值或
阻斷率模板,以利檢測結果的計算。還可以制作檢測結果統(tǒng)計分析模板,
只要將檢測結果分組輸入,即可自動計算出合格率/陽性率、平均值、離
散度等相關結果和圖表。
久寺祈各俶盛據(jù)之間埼妻異是否支得
4.1、卡方檢驗
x2=[(ad_bc)2]Xn4-[(a+b)X(c+d)X(a+c)X(b+d)]
例1:甲乙2個養(yǎng)殖場,在某一時段的存欄數(shù)和死亡數(shù)見下表,試分
析2個場間的死亡率是否存在差異。
場名死亡數(shù)存活數(shù)存欄數(shù)死亡率
甲30(a)250(b)28010.7
乙22(c)398(d)4205.2
合計526487007.4
n=a+b+c+d
X2=7.32
從卡方分布界值表查得,a=0.05,v=l時,卡方值為3.84;a=0.01,
v=l時,卡方值為6.63,2個臨界值都小于本例計算的卡方值。所以,無
論在a=0.05水平上,還是在a=0.01水平二,甲乙2個養(yǎng)殖場的死亡率
都有顯著差異。
4.2、t檢驗
用于2組數(shù)據(jù)差異性檢驗。如同場、相同飼養(yǎng)條件下,60頭體重相
近的仔豬隨機分為2組,1組使用豬瘟細胞苗,1組使用豬瘟脾淋苗,免
疫后20天分別采集血清進行免疫效價測定,比擬哪種疫苗免疫的效價水
三高即可應用t檢驗。
編號12345678910
匆胞苗組5465645645
脾淋苗組6756754766
使用Excell表有2種進行t檢驗的方法。
A、上述數(shù)據(jù)輸入Excell表中,在菜單“插入”欄選擇“函數(shù)”,從
口選擇“TTEST”,將上述數(shù)據(jù)輸送到TTEST的界面中,尾值(Tails)設
置為2(雙側(cè)檢驗),上例檢驗類型[Type)設置為2(屬于等方差的2
人獨立樣本t檢驗)【檢驗類型(Type)設置為1〔實驗動物為1組)(屬
二配對資料的t檢驗,一般用于使用某項技術前與使用后的比照)】。
計算結果為0.0401,此值小于0.05,即P<0.05,說明豬瘟脾淋苗免
疫豬產(chǎn)生的免疫抗體與細胞苗產(chǎn)生的抗體有顯著差異。
如P<0.01,那么差異極顯著。
B、上述數(shù)據(jù)輸入Excell表中,在工具欄選中“數(shù)據(jù)分析”,選中“t
檢驗等方差假設”,將上述數(shù)據(jù)輸如即可。
P(T<=t)雙尾值為0.0401。
A法中:檢驗類型(Type)設置為1(屬于配對資料的t檢驗,一般
月于使用某項技術前與使用后的比照)的在B法中使用“t檢驗-平均值
的成對二樣本分析:
各組樣本數(shù)超過100時,也可使用Z檢驗,多組之間差異性分析可
以用t檢驗、Z檢驗,也可以用q檢驗。
5、今祈慕的愛/是否依關
相關系數(shù):是用以反映變量之間相關關系密切程度的統(tǒng)計指標。相
關系數(shù)是按積差方法計算,同樣以兩變量與各自平均值的離差為根底,
通過兩個離差相乘來反映兩變量之間相關程度;著重研究線性的單相關
系數(shù)。
相關系數(shù)分為011正相關1和(TTi負相關)。一般來說相關系數(shù)
的絕對值大于0.7,表示高度相關,0.5-0.7表示中度相關,0.3-0.5為
弱相關,小于0.3表示不相關。
例1
2007年我們調(diào)查的豬“高熱病”發(fā)病率、死亡率以及豬場豬瘟免疫
合格率見下表。
序號豬瘟免疫合格率高熱病發(fā)病率高熱病死亡率
19500
296.772010
377.366050
在Excell表中錄入上述數(shù)據(jù),選擇工具欄中的“數(shù)據(jù)分析)在對
話框中選擇“相關系數(shù)”,輸入相關數(shù)據(jù),即得以下數(shù)據(jù)。
豬瘟免疫合格率高熱病發(fā)病率高熱病死亡率
豬瘟免疫合格率1
高熱病發(fā)病率-0.9147002091
高熱病死亡率-0.9630517140.9897433191
豬瘟免疫合格率與高熱病的發(fā)病率、死亡率的相關系數(shù)分別為
-0.9K-0.96,絕對值均大于0.7,說明豬瘟免疫合格率與高熱病的發(fā)病
玄和死亡率之間存在高度的負相關,也就是說養(yǎng)豬場豬瘟免疫的越好,
高熱病的發(fā)病率和死亡率就越低。
6、比值比和風險比
病例對照調(diào)查和暴露對照調(diào)查可以獲得重要的原始數(shù)據(jù),依據(jù)這些
原始數(shù)據(jù),可以計算比值比(0R)、風險比(RR)。
OR值得意義
OR值被調(diào)查的因素與被調(diào)查的疾病的關聯(lián)程度
有較強的關聯(lián)
<0.4
被調(diào)查的因素可能防止被調(diào)查疾病的發(fā)生,且可能性較大
有中等程度的關聯(lián)
被調(diào)查的因素可能防止被調(diào)查疾病的發(fā)生,可能性一般
有較弱的關聯(lián)
被調(diào)查的因素可能防止被調(diào)查疾病的發(fā)生,但可能性較小
無關聯(lián)
有較弱的關聯(lián)
被調(diào)查的因素可能防止被調(diào)查疾病的發(fā)生,但可能性較小
有中等程度的關聯(lián)
1.5-3
被調(diào)查的因素可能防止被調(diào)查疾病的發(fā)生,可能性一般
有較強的關聯(lián)
>3
被調(diào)查的因素可能防止被調(diào)查疾病的發(fā)生,且可能性較大
RR值的意義
RR值被調(diào)查的因素與被調(diào)查的疾病的關聯(lián)程度
有很強的關聯(lián)
<0.1
被請查的因素可能防止被調(diào)查疾病的發(fā)生,且可能性很大
有較強的關聯(lián)
被調(diào)查的因素可能防止被調(diào)查疾病的發(fā)生,且可能性較大
有中等程度的關聯(lián)
被調(diào)查的因素可能防止被調(diào)查疾病的發(fā)生,可能性一般
有較弱的關聯(lián)
被調(diào)查的因素可能防止被調(diào)查疾病的發(fā)生,但可能性較小
無關聯(lián)
有較弱的關聯(lián)
被調(diào)查的因素可能防止被調(diào)查疾病的發(fā)生,但可能性較小
有中等程度的關聯(lián)
被調(diào)查的因素可能防止被調(diào)查疾病的發(fā)生,可能性一般
有較強的關聯(lián)
被調(diào)查的因素可能防止被調(diào)查疾病的發(fā)生,且可能性較大
有很強的關聯(lián)
>10
被調(diào)查的因素可能防止被調(diào)查疾病的發(fā)生,且可能性很大
A、OR值的計算
0R=(A+B)+(C+D)
暴露非暴露合計
病例ABG=A+B
非病例CDH=C+D
合計E=A+CF=B+DN=A+B+C+D
例1:調(diào)查奶??谔阋甙l(fā)生情況時,設定一組為發(fā)病牛場,二組是沒
有發(fā)病的牛場,各組含有的牛場規(guī)模、飼養(yǎng)方式、衛(wèi)生狀況相似,都調(diào)
查了50個牛場。結果為:發(fā)病組接種0、亞I、A型疫苗的為36個,未
發(fā)病組接種上述疫苗的為
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