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文檔簡(jiǎn)介
ICS65.020.20
CCSB15
!7,
DB32/T5099—2025
甘藍(lán)類蔬菜黑斑病菌分子檢測(cè)技術(shù)規(guī)程
Technicalcodeofpracticeformoleculardetectionof
Alternariabrassicicolaoncolevegetables
2025-03-25發(fā)布2025-04-25實(shí)施
江蘇省市場(chǎng)監(jiān)督管理局發(fā)布
中國(guó)標(biāo)準(zhǔn)出版社出版
DB32/T5099—2025
目次
前言……………………………Ⅲ
1范圍…………………………1
2規(guī)范性引用文件……………1
3術(shù)語(yǔ)和定義…………………1
4縮略語(yǔ)………………………1
5原理…………………………1
6試劑和材料…………………2
7儀器設(shè)備……………………2
8試驗(yàn)步驟……………………2
9結(jié)果判定……………………3
附錄A(資料性)甘藍(lán)類蔬菜黑斑病…………4
附錄B(規(guī)范性)RPA產(chǎn)物電泳圖……………5
Ⅰ
DB32/T5099—2025
前言
本文件按照GB/T1.1—2020《標(biāo)準(zhǔn)化工作導(dǎo)則第1部分:標(biāo)準(zhǔn)化文件的結(jié)構(gòu)和起草規(guī)則》的規(guī)定
起草。
請(qǐng)注意本文件的某些內(nèi)容可能涉及專利。本文件發(fā)布機(jī)構(gòu)不承擔(dān)識(shí)別專利的責(zé)任。
本文件由江蘇省園藝標(biāo)準(zhǔn)化技術(shù)委員會(huì)提出、歸口并組織實(shí)施。
本文件起草單位:江蘇省農(nóng)業(yè)科學(xué)院、江蘇省農(nóng)業(yè)技術(shù)推廣總站、江蘇益禾農(nóng)業(yè)科技有限公司。
本文件主要起草人:余方偉、曾曉萍、李建斌、夏冬健、王神云、張偉、楊偉國(guó)、周晗昕、黃鸝、王桂樓。
Ⅲ
DB32/T5099—2025
甘藍(lán)類蔬菜黑斑病菌分子檢測(cè)技術(shù)規(guī)程
1范圍
本文件規(guī)定了甘藍(lán)類蔬菜黑斑病菌分子檢測(cè)的原理、試劑和材料、儀器設(shè)備、試驗(yàn)步驟和結(jié)果判定。
本文件適用于甘藍(lán)類蔬菜葉片、花莖、角果等部位黑斑病菌的分子檢測(cè)。
2規(guī)范性引用文件
下列文件中的內(nèi)容通過文中的規(guī)范性引用而構(gòu)成本文件必不可少的條款。其中,注日期的引用文
件,僅該日期對(duì)應(yīng)的版本適用于本文件;不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改單)適用于本
文件。
GB/T6682分析實(shí)驗(yàn)室用水規(guī)格和試驗(yàn)方法
SN/T2965植物病原真菌分子生物學(xué)檢測(cè)規(guī)范
3術(shù)語(yǔ)和定義
下列術(shù)語(yǔ)和定義適用于本文件。
3.1
蕓薹生鏈格孢Alternariabrassicicola
引起甘藍(lán)類蔬菜黑斑病的主要病原,屬半知菌亞門,絲孢目,暗色菌科,鏈格孢屬。
注:甘藍(lán)類蔬菜黑斑病癥狀及病原菌形態(tài)特征見附錄A。
4縮略語(yǔ)
下列縮略語(yǔ)適用于本文件。
DNA:脫氧核糖核酸(Deoxyribonucleicacid)
PCR:聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(Polymerasechainreaction)
RPA:重組酶聚合酶擴(kuò)增(Recombinasepolymeraseamplification)
Tris:三羥甲基氨基甲烷[Tris(hydroxymethyl)aminomethane]
TAE:三羥甲基氨基甲烷/乙酸/乙二胺四乙酸(Tris/aceticacid/ethylenediaminetetraaceticacid)
5原理
重組酶聚合酶擴(kuò)增是一種快速分子檢測(cè)技術(shù),主要依靠重組酶、單鏈結(jié)合蛋白和鏈置換DNA聚合
酶,在特定恒溫條件下實(shí)現(xiàn)對(duì)甘藍(lán)類蔬菜黑斑病菌靶標(biāo)序列的高效擴(kuò)增。RPA反應(yīng)開始時(shí),重組酶在三
磷酸腺苷的參與下結(jié)合引物,形成重組酶?引物復(fù)合體。這些復(fù)合體能夠掃描與引物序列互補(bǔ)的目標(biāo)雙
鏈DNA,然后侵入5′端位點(diǎn),隨后單鏈結(jié)合蛋白與被置換單鏈結(jié)合使其穩(wěn)定。最后鏈置換DNA聚合酶
結(jié)合在核酸蛋白復(fù)合體的游離3′端,進(jìn)行鏈延伸。以上步驟循環(huán)進(jìn)行,實(shí)現(xiàn)甘藍(lán)類蔬菜黑斑病菌靶標(biāo)序
列的指數(shù)式擴(kuò)增。
1
DB32/T5099—2025
6試劑和材料
6.1水:實(shí)驗(yàn)室用水符合GB/T6682的規(guī)定。
6.2RPA所用的引物序列見表1。
表1引物序列
引物序列(5′→3′)
正向引物CAGACATGAACACGCCAACATGACTAGACC
反向引物GTGAGGCTTAGCGTAGAGTGTCAACGGTTC
6.3液氮。
6.4基因組DNA提取試劑盒。
6.5RPA試劑盒:包含A緩沖液、B緩沖液和含有凍干粉劑的反應(yīng)管。
6.6DNA抽提液:Tris飽和酚、氯仿、異戊醇按體積比25∶24∶1混合。
6.750×TAE緩沖液(pH8.5)。
6.8瓊脂糖。
6.9核酸染料。
6.10DL2000DNAmarker。
6.11微量移液器配套的帶濾芯吸頭。
6.12離心管:1.5mL。
7儀器設(shè)備
7.1電子天平:分度值為0.001g。
7.2臺(tái)式低溫高速離心機(jī):轉(zhuǎn)速≥13000r/min,溫度4℃可控。
7.3微量移液器:量程分別為2.5μL、10μL、20μL、100μL和1000μL。
7.4PCR儀或恒溫水浴鍋。
7.54℃冰箱和-20℃冰箱。
7.6水平電泳儀。
7.7凝膠成像儀。
8試驗(yàn)步驟
8.1樣品采集
樣品保存于4℃冰箱,保存期不超過48h。
8.2樣品處理
按照SN/T2965的規(guī)定處理樣品,處理后的樣品置于液氮中充分研磨,稱取約100mg于1.5mL離
心管中,使用基因組DNA提取試劑盒提取基因組DNA,保存于-20℃冰箱備用。
2
DB32/T5099—2025
8.3RPA反應(yīng)
以提取的樣品基因組DNA為模板,采用DNA恒溫快速擴(kuò)增試劑盒進(jìn)行RPA反應(yīng)。同時(shí)設(shè)置以
下對(duì)照:陽(yáng)性對(duì)照中添加蕓薹生鏈格孢基因組DNA作為模板;陰性對(duì)照中添加健康甘藍(lán)類蔬菜葉片來(lái)
源的基因組DNA作為模板;空白對(duì)照中添加滅菌超純水作為模板。檢測(cè)體系見表2。
表2蕓薹生鏈格孢RPA檢測(cè)反應(yīng)體系
組分體積/μL
A緩沖液29.4
正向引物(10μmol/L)2
反向引物(10μmol/L)2
模板2
滅菌超純水12.1
B緩沖液2.5
總體積50
依次向含有凍干粉劑的反應(yīng)管中加入上述組分,充分混勻后置于PCR儀或恒溫水浴鍋中,38℃孵
育30min。反應(yīng)結(jié)束后加入等體積DNA抽提液,4℃條件下以不低于13000r/min的轉(zhuǎn)速離心5min,
轉(zhuǎn)移上清至新的離心管中。配制1×TAE緩沖液和1%瓊脂糖凝膠(每50mL瓊脂糖溶液中加入5μL
10000×核酸染料),用微量移液器各吸取5μLDL2000DNAmarker和10μL上清點(diǎn)樣,進(jìn)行瓊脂糖凝
膠電泳檢測(cè)。
9結(jié)果判定
9.1試驗(yàn)成立條件
試驗(yàn)成立應(yīng)符合附錄B的要求,即陽(yáng)性對(duì)照出現(xiàn)目的條帶,陰性對(duì)照和空白對(duì)照無(wú)目的條帶;如陽(yáng)
性對(duì)照、陰性對(duì)照和空白對(duì)照任意一項(xiàng)不滿足以上條件,此次試驗(yàn)視為無(wú)效。
9.2試驗(yàn)結(jié)果判定
被檢樣品出現(xiàn)目的條帶,判為檢出蕓薹生鏈格孢,否則判為未檢出。
3
DB32/T5099—2025
附錄A
(資料性)
甘藍(lán)類蔬菜黑斑病
A.1甘藍(lán)類蔬菜黑斑病癥狀
甘藍(lán)類蔬菜的葉片、花莖和角果均能發(fā)病。該病多發(fā)生在外葉上,發(fā)病初期在葉面上產(chǎn)生黑色小斑
點(diǎn),直徑3mm~7mm,同心輪紋不顯著。溫度高時(shí),病斑迅速擴(kuò)大為灰褐色圓形病斑,直徑5mm~
30mm,具明顯的同心輪紋,并伴有黃色暈環(huán),濕度大時(shí)病斑上產(chǎn)生黑色霉層。后期葉片上多個(gè)病斑匯
合,有時(shí)中間穿孔或破裂。花莖、角果染病,則現(xiàn)出黑褐色長(zhǎng)梭形條狀斑,導(dǎo)致結(jié)實(shí)少或種子瘦癟。
A.2病菌生物學(xué)特性
蕓薹生鏈格孢的菌落(見圖A.1)呈青褐色,氣生菌絲少,易產(chǎn)生孢子。分生孢子梗單生或簇生,常見
直立生長(zhǎng),少見屈膝狀彎曲。分生孢子常串生,倒棍棒狀,淡褐色至深褐色,具橫膈膜
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