基因測(cè)序服務(wù)合同第一條定義與釋義除非本協(xié)議上下文另有明確約定，下列術(shù)語(yǔ)具有如下含義：1.1基因測(cè)序服務(wù)：指乙方利用測(cè)序平臺(tái)（包括但不限于IlluminaNovaSeq、PacBioSequelII等）及生物信息學(xué)分析技術(shù)，對(duì)甲方提供的生物樣本進(jìn)行DNA/RNA提取、文庫(kù)構(gòu)建、測(cè)序運(yùn)行、數(shù)據(jù)處理及變異檢測(cè)等服務(wù)的總稱。1.2樣本：指甲方按照乙方《樣本采集與運(yùn)輸指南》提供的用于測(cè)序的生物材料，包括但不限于血液、組織、唾液、細(xì)胞系等，其質(zhì)量需符合乙方指定的OD值、濃度及完整性標(biāo)準(zhǔn)。1.3測(cè)序報(bào)告：指乙方交付的包含原始數(shù)據(jù)（如BAM/FASTQ格式文件）、質(zhì)控指標(biāo)（Q30比例、覆蓋深度）、變異注釋（SNP/InDel/CNV）及定制化分析結(jié)果的技術(shù)文檔。1.4保密信息：包括但不限于樣本來(lái)源信息、測(cè)序數(shù)據(jù)、分析算法、未公開(kāi)的技術(shù)參數(shù)、商業(yè)報(bào)價(jià)及本協(xié)議條款內(nèi)容，無(wú)論以書(shū)面、電子或口頭形式傳遞。第二條服務(wù)內(nèi)容與技術(shù)標(biāo)準(zhǔn)2.1服務(wù)范圍基礎(chǔ)服務(wù)：樣本接收與質(zhì)檢、DNA/RNA提取、文庫(kù)構(gòu)建（含片段篩選、末端修復(fù)、接頭連接）、高通量測(cè)序、原始數(shù)據(jù)質(zhì)控（去除接頭污染及低質(zhì)量reads）。標(biāo)準(zhǔn)分析：序列比對(duì)（基于人類參考基因組GRCh38/hg38）、變異檢測(cè)（采用GATK最佳實(shí)踐流程）、拷貝數(shù)變異分析（CNVnator算法）、基因表達(dá)定量（FPKM/TPM標(biāo)準(zhǔn)化）。定制化分析：根據(jù)甲方書(shū)面需求，提供腫瘤突變負(fù)荷（TMB）計(jì)算、融合基因檢測(cè)、通路富集分析等增值服務(wù)，具體內(nèi)容以《服務(wù)訂單確認(rèn)函》為準(zhǔn)。2.2技術(shù)指標(biāo)全基因組測(cè)序（WGS）：平均覆蓋深度≥30×，覆蓋均一性≥95%，Q30≥90%，單堿基錯(cuò)誤率≤0.001%；全外顯子測(cè)序（WES）：目標(biāo)區(qū)域覆蓋度≥98%，平均深度≥100×，變異檢出率（經(jīng)Sanger驗(yàn)證）≥99%；RNA測(cè)序：數(shù)據(jù)量≥6Gcleandata，基因檢出率≥95%（基于RefSeq數(shù)據(jù)庫(kù)）。2.3交付物電子數(shù)據(jù)：原始測(cè)序數(shù)據(jù)（加密硬盤或FTP下載鏈接）、標(biāo)準(zhǔn)化分析結(jié)果（VCF/CSV格式）；紙質(zhì)報(bào)告：一式三份，包含實(shí)驗(yàn)流程、質(zhì)控圖表、變異列表及生物學(xué)意義初步解讀。第三條服務(wù)流程與周期3.1訂單確認(rèn)：甲方通過(guò)乙方官網(wǎng)提交《測(cè)序申請(qǐng)單》，明確樣本類型、測(cè)序項(xiàng)目、分析需求及交付時(shí)間，乙方在3個(gè)工作日內(nèi)完成評(píng)估并出具《服務(wù)訂單確認(rèn)函》。3.2樣本交付：甲方需在訂單確認(rèn)后5個(gè)工作日內(nèi)送達(dá)樣本，每份樣本附《樣本信息表》（含唯一標(biāo)識(shí)、采集日期、保存條件），運(yùn)輸過(guò)程需符合生物安全要求（如-80℃干冰運(yùn)輸）。3.3實(shí)驗(yàn)周期：自樣本質(zhì)檢合格之日起計(jì)算，WGS服務(wù)周期為25個(gè)工作日，WES為15個(gè)工作日，RNA測(cè)序?yàn)?2個(gè)工作日，定制化分析另增5-10個(gè)工作日。3.4結(jié)果交付：乙方通過(guò)加密郵件發(fā)送電子報(bào)告，紙質(zhì)報(bào)告以順豐快遞寄送至甲方指定地址，雙方確認(rèn)簽收后視為交付完成。第四條費(fèi)用與支付4.1服務(wù)定價(jià)（單位：人民幣/樣本）|服務(wù)類型|基礎(chǔ)分析價(jià)格|每增加10G數(shù)據(jù)|定制化分析（單樣本）||----------------|--------------|---------------|----------------------||全基因組測(cè)序|12,000元|1,500元|另議||全外顯子測(cè)序|5,800元|-|另議||轉(zhuǎn)錄組測(cè)序|4,200元|800元|另議|4.2結(jié)算方式預(yù)付款：甲方在訂單確認(rèn)后7個(gè)工作日內(nèi)支付總費(fèi)用的50%作為預(yù)付款，乙方收到款項(xiàng)后啟動(dòng)服務(wù)；尾款：甲方在收到測(cè)序報(bào)告并確認(rèn)無(wú)誤后15個(gè)工作日內(nèi)支付剩余50%，乙方在收到尾款后提供完整數(shù)據(jù)下載權(quán)限。4.3發(fā)票開(kāi)具：乙方應(yīng)在收到款項(xiàng)后5個(gè)工作日內(nèi)開(kāi)具等額增值稅專用發(fā)票，發(fā)票類目為“研發(fā)和技術(shù)服務(wù)*基因測(cè)序服務(wù)費(fèi)”。第五條雙方權(quán)利與義務(wù)5.1甲方權(quán)利與義務(wù)保證樣本來(lái)源合法，已獲得倫理審查批準(zhǔn)（如涉及人類樣本）及捐贈(zèng)者知情同意，若因此產(chǎn)生法律糾紛由甲方承擔(dān)全部責(zé)任；及時(shí)提供樣本相關(guān)臨床信息（如適用），并對(duì)信息真實(shí)性負(fù)責(zé)；按約定支付費(fèi)用，逾期付款每日按未付金額的0.05%支付違約金，逾期超30日乙方有權(quán)暫停服務(wù)。5.2乙方權(quán)利與義務(wù)對(duì)樣本進(jìn)行唯一性標(biāo)識(shí)管理，建立實(shí)驗(yàn)記錄追溯系統(tǒng)（保存期不少于5年）；如樣本質(zhì)量不達(dá)標(biāo)（如降解、污染），應(yīng)在3個(gè)工作日內(nèi)通知甲方重新送樣，因此導(dǎo)致的周期延誤不視為違約；提供免費(fèi)技術(shù)支持，包括報(bào)告解讀咨詢（限3次/樣本）及實(shí)驗(yàn)方案優(yōu)化建議。第六條知識(shí)產(chǎn)權(quán)與數(shù)據(jù)歸屬6.1數(shù)據(jù)所有權(quán)：測(cè)序原始數(shù)據(jù)及分析結(jié)果的所有權(quán)歸甲方所有，乙方僅為履行服務(wù)之目的臨時(shí)存儲(chǔ)，服務(wù)結(jié)束后6個(gè)月內(nèi)刪除備份（甲方書(shū)面要求保留的除外）。6.2技術(shù)知識(shí)產(chǎn)權(quán)：乙方對(duì)測(cè)序平臺(tái)、分析算法及流程文件享有專有權(quán)利，甲方不得用于商業(yè)用途或向第三方轉(zhuǎn)讓；甲方基于測(cè)序數(shù)據(jù)產(chǎn)生的研究成果（如論文、專利），需在致謝部分注明乙方技術(shù)支持。6.3衍生成果：雙方合作過(guò)程中發(fā)現(xiàn)的新基因變異或生物標(biāo)志物，其專利申請(qǐng)權(quán)由甲方享有，乙方享有免費(fèi)使用權(quán)。第七條保密義務(wù)7.1雙方應(yīng)對(duì)在合作中獲取的對(duì)方商業(yè)秘密（如報(bào)價(jià)體系、客戶信息）、技術(shù)秘密（如實(shí)驗(yàn)參數(shù)、分析腳本）及個(gè)人敏感信息（如樣本供體數(shù)據(jù)）嚴(yán)格保密，未經(jīng)書(shū)面許可不得向任何第三方披露。7.2保密義務(wù)不因本協(xié)議終止而失效，持續(xù)期限為信息披露之日起10年，但不適用于以下情形：（1）已為公眾所知悉的信息；（2）依法律法規(guī)或有權(quán)機(jī)關(guān)要求必須披露的信息；（3）接收方獨(dú)立開(kāi)發(fā)或從第三方合法獲取的信息。第八條違約責(zé)任8.1乙方違約：若乙方未按期交付報(bào)告，每逾期1日按總費(fèi)用的0.1%支付違約金，累計(jì)不超過(guò)合同金額的10%；若因技術(shù)原因?qū)е聰?shù)據(jù)無(wú)效，乙方應(yīng)免費(fèi)重新測(cè)序或退還已收款項(xiàng)。8.2甲方違約：甲方單方面取消訂單的，預(yù)付款不予退還；逾期提供樣本導(dǎo)致周期延誤的，乙方不承擔(dān)違約責(zé)任，且服務(wù)周期相應(yīng)順延。8.3不可抗力：因地震、疫情等不可抗力導(dǎo)致服務(wù)中斷的，雙方應(yīng)及時(shí)通知對(duì)方，根據(jù)影響程度協(xié)商延期或解除合同，互不承擔(dān)賠償責(zé)任。第九條爭(zhēng)議解決與其他9.1因本協(xié)議引起的爭(zhēng)議，雙方應(yīng)首先通過(guò)友好協(xié)商解決；協(xié)商不成的，任何一方有權(quán)向乙方所在地有管轄權(quán)的人民法院提起訴訟。9.2本協(xié)議未盡事宜，由雙方簽訂《補(bǔ)充協(xié)議》約定，補(bǔ)充協(xié)議與本協(xié)議具有同等法律效力。9.3本協(xié)議一式肆份，甲乙雙方各執(zhí)貳份，自雙方法定代表人或授權(quán)代表簽字并加蓋公章之日起生效，有效期至服務(wù)完成且款項(xiàng)結(jié)清之日止。（以下無(wú)正文）甲方（蓋章）