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2025年大學(xué)《化學(xué)生物學(xué)》專業(yè)題庫——RNA干擾技術(shù)在基因沉默中的應(yīng)用考試時間:______分鐘總分:______分姓名:______一、選擇題(每題2分,共20分。請將正確選項字母填入括號內(nèi))1.下列哪種RNA分子是RNA干擾的核心效應(yīng)分子?A.mRNAB.miRNAC.tRNAD.5SrRNA2.在RNA干擾的初始步驟中,負責(zé)切割雙鏈RNA(dsRNA)并將其加工成小干擾RNA(siRNA)的關(guān)鍵酶是?A.RISCB.ArgonauteC.DicerD.RNA聚合酶3.小干擾RNA(siRNA)進入細胞質(zhì)后,與其結(jié)合形成具有切割活性的復(fù)合物稱為?A.siRNPB.miRNPC.RISCD.siRNA:TRAP4.RNA干擾主要導(dǎo)致靶標(biāo)mRNA降解,這種基因沉默的現(xiàn)象被稱為?A.轉(zhuǎn)錄后基因沉默(PTGS)B.表觀遺傳沉默C.轉(zhuǎn)錄抑制D.RNA編輯5.下列哪個過程不是RNA干擾的主要機制?A.靶標(biāo)mRNA的切割B.靶標(biāo)mRNA的甲基化C.靶標(biāo)mRNA的翻譯抑制D.RNA聚合酶的活性抑制6.在設(shè)計siRNA時,通常建議選擇靶標(biāo)序列的哪些區(qū)域?A.5'非編碼區(qū)(UTR)B.蛋白質(zhì)結(jié)合位點C.GC含量高且穩(wěn)定的區(qū)域D.mRNA的3'端7.RNA干擾現(xiàn)象最早是在哪種生物中發(fā)現(xiàn)的?A.人B.酵母C.蟲子D.植物8.下列哪種小RNA主要在轉(zhuǎn)錄水平調(diào)控基因表達?A.siRNAB.miRNAC.piRNAD.snRNA9.RNA干擾技術(shù)在基因功能研究中主要被用來?A.增強基因表達B.降低基因表達C.改變基因序列D.引入基因突變10.RNA干擾技術(shù)在疾病治療中面臨的主要挑戰(zhàn)之一是?A.效率太低B.免疫原性C.易產(chǎn)生脫靶效應(yīng)D.以上都是二、填空題(每空1分,共15分。請將答案填入橫線內(nèi))1.RNA干擾的發(fā)現(xiàn)源于對______現(xiàn)象的研究。2.雙鏈RNA(dsRNA)在體內(nèi)或體外都可以引發(fā)RNA干擾,但通常需要通過______酶將其加工成siRNA。3.siRNA在進入細胞質(zhì)后,由______蛋白識別并結(jié)合,形成RISC復(fù)合物。4.在RISC復(fù)合物中,具有切割活性的亞基是______蛋白。5.RNA干擾主要通過切割靶標(biāo)mRNA或抑制其______來發(fā)揮基因沉默作用。6.除了siRNA,miRNA也是介導(dǎo)______的重要小RNA分子。7.siRNA的設(shè)計需要考慮靶標(biāo)序列的______、______以及二級結(jié)構(gòu)等因素。8.RNA干擾的特異性主要依賴于______與靶標(biāo)mRNA序列的精確配對。9.“脫靶效應(yīng)”是指siRNA錯誤地切割了______的mRNA,導(dǎo)致非預(yù)期的基因沉默。10.RNA干擾技術(shù)為研究______和開發(fā)新的______策略提供了強大工具。三、名詞解釋(每題3分,共15分。請給出簡潔準(zhǔn)確的定義)1.RNA干擾(RNAi)2.小干擾RNA(siRNA)3.核糖核酸酶III(RnaseIII)4.Argonaute蛋白5.脫靶效應(yīng)四、簡答題(每題5分,共20分。請簡潔明了地回答問題)1.簡述RNA干擾的核心分子機制。2.簡述siRNA設(shè)計時需要考慮的主要原則。3.簡述RNA干擾技術(shù)可能引起的脫靶效應(yīng)及其原因。4.簡述RNA干擾技術(shù)在基因功能研究中的主要應(yīng)用。五、論述題(10分。請結(jié)合所學(xué)知識,進行深入分析和闡述)討論RNA干擾技術(shù)在疾病治療中的應(yīng)用潛力及其面臨的主要挑戰(zhàn)。試卷答案一、選擇題1.B2.C3.C4.A5.B6.C7.C8.B9.B10.D二、填空題1.基因沉默2.Dicer3.Argonaute4.Ago2(或切片酶)5.翻譯6.轉(zhuǎn)錄后基因沉默7.互補性、穩(wěn)定性8.siRNA9.其他(非靶標(biāo))10.基因功能、疾病治療三、名詞解釋1.RNA干擾(RNAi):指在真核生物中,由雙鏈RNA(dsRNA)誘導(dǎo)的、通過序列特異性方式抑制基因轉(zhuǎn)錄或翻譯的現(xiàn)象。2.小干擾RNA(siRNA):由大約21個核苷酸組成的、具有堿基互補性的雙鏈RNA分子,是RNA干擾的核心效應(yīng)分子。3.核糖核酸酶III(RnaseIII):一類能夠特異性切割雙鏈RNA或雙鏈DNA的酶,Dicer就屬于這種酶。4.Argonaute蛋白:參與RNA干擾的核心蛋白家族成員,負責(zé)識別siRNA并將其整合入RISC復(fù)合物中,同時具有切割靶mRNA或引導(dǎo)RISC進行切割的活性。5.脫靶效應(yīng):指siRNA錯誤地識別并切割了與靶標(biāo)序列相似但不完全相同的非靶標(biāo)mRNA,導(dǎo)致非預(yù)期的基因沉默現(xiàn)象。四、簡答題1.RNA干擾的核心分子機制:首先,細胞內(nèi)的雙鏈RNA(dsRNA)或長鏈單鏈RNA(如經(jīng)Dicer加工前體)被Dicer(一種RnaseIII酶)識別并切割成具有莖環(huán)結(jié)構(gòu)的短雙鏈RNA(dsRNA),即pre-siRNA。pre-siRNA隨后被出口蛋白運出細胞核。在細胞質(zhì)中,pre-siRNA被出口蛋白復(fù)合體識別并切割成大約21nt的成熟雙鏈siRNA。siRNA隨后被Argonaute蛋白識別并結(jié)合,組裝成RNA誘導(dǎo)沉默復(fù)合物(RISC)。在RISC中,siRNA的一個鏈(稱為引導(dǎo)鏈或反義鏈)保持完整,其序列與靶標(biāo)mRNA互補。Argonaute蛋白(特別是其中的Ago2亞基,在哺乳動物中)作為RISC的催化核心,利用其切割活性,在siRNA與靶mRNA的雜交位點附近,特異性地切割靶mRNA。切割后的靶mRNA片段被降解,從而抑制了靶基因的蛋白質(zhì)翻譯,實現(xiàn)了基因沉默。2.siRNA設(shè)計時需要考慮的主要原則:①序列特異性:siRNA序列必須與靶標(biāo)mRNA具有高度互補性,以確保有效的結(jié)合和切割。同時,要避免與基因組中其他基因的非特異性結(jié)合。②GC含量:靶標(biāo)序列的GC含量通常建議在40%-60%之間,以保證siRNA的穩(wěn)定性和活力。③Tm值:兩條鏈的Tm值應(yīng)相近且在15-25℃之間,以確保siRNA在生理條件下能保持雙鏈結(jié)構(gòu)。④靶位點選擇:通常選擇位于基因的編碼區(qū)(CDS),特別是起始密碼子上下游的序列。避免選擇存在于基因3'UTR、內(nèi)含子或啟動子區(qū)域的序列,因為這些區(qū)域可能產(chǎn)生非特異性效應(yīng)或影響切割效率。⑤避免PAM序列:設(shè)計的siRNA序列不應(yīng)包含核酸酶的識別位點(PAM序列),如Dicer或Ago2的切割位點。⑥序列uniqueness:設(shè)計的siRNA序列最好在數(shù)據(jù)庫中是獨一無二的,以減少脫靶效應(yīng)。3.RNA干擾技術(shù)可能引起的脫靶效應(yīng)及其原因:脫靶效應(yīng)是指siRNA錯誤地識別并切割了與靶標(biāo)序列相似但不完全相同的非靶標(biāo)mRNA,導(dǎo)致非預(yù)期的基因沉默現(xiàn)象。其原因主要包括:①序列相似性:siRNA與靶標(biāo)mRNA的序列同源性不是100%,當(dāng)存在一定的序列相似性(通常大于70%)時,siRNA就可能與這些非靶標(biāo)mRNA結(jié)合并引起切割。②二級結(jié)構(gòu)干擾:靶標(biāo)mRNA可能存在復(fù)雜的二級結(jié)構(gòu),影響siRNA的有效結(jié)合和Argonaute蛋白的識別。③Ago蛋白活性:不同的Argonaute蛋白亞基可能具有不同的序列識別偏好性。④Dicer加工誤差:Dicer在加工前體RNA時可能產(chǎn)生不完全互補或帶有錯配的siRNA。⑤RNA結(jié)合蛋白影響:細胞質(zhì)中存在的其他RNA結(jié)合蛋白可能影響siRNA與靶mRNA的相互作用。4.RNA干擾技術(shù)在基因功能研究中的主要應(yīng)用:RNA干擾技術(shù)是研究基因功能的有力工具,其主要應(yīng)用包括:①基因功能篩選:通過大規(guī)模siRNA文庫篩選,可以鑒定對特定細胞表型或通路至關(guān)重要的基因。②基因功能驗證:針對已知基因,使用siRNA進行敲低實驗,可以驗證其生物學(xué)功能。③研究信號通路:通過分別敲低通路中的上游或下游基因,可以研究信號通路的傳遞和調(diào)控機制。④亞細胞定位研究:利用組織特異性表達載體,可以在特定細胞器或區(qū)域進行基因敲低,研究基因的亞細胞功能。5.討論RNA干擾技術(shù)在疾病治療中的應(yīng)用潛力及其面臨的主要挑戰(zhàn)。RNA干擾技術(shù)在疾病治療中展現(xiàn)出巨大的應(yīng)用潛力,尤其是在治療由單基因缺陷引起的遺傳病和癌癥方面。其應(yīng)用潛力主要體現(xiàn)在:①遺傳病治療:對于一些單基因遺傳病(如鐮狀細胞貧血、血友病),可以通過向患者體內(nèi)遞送針對致病基因的siRNA來降低致病蛋白的表達,從而達到治療目的。②癌癥治療:可以通過靶向致癌基因或其上游調(diào)控基因的siRNA來抑制腫瘤細胞的生長和轉(zhuǎn)移。③抗病毒感染:可以設(shè)計針對病毒基因組或關(guān)鍵病毒蛋白的siRNA,干擾病毒的復(fù)制周期。④炎癥性疾?。嚎梢园邢蛞种蒲装Y相關(guān)基因的表達,從而控制炎癥反應(yīng)。然而,RNA干擾技術(shù)在走向臨床應(yīng)用時仍面臨諸多挑戰(zhàn):①遞送效率低:將siRNA有效且特異性地遞送到靶細胞(尤其是中樞神經(jīng)系統(tǒng)或腫瘤組織)內(nèi)部,并維持足夠長的作用時間,是巨大的技術(shù)難題。②遞送載體安全性:目前常用的遞送載體(如脂質(zhì)體、病毒載體)可能存在免疫原性、細胞毒性或靶向性不
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