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文檔簡介
前言肺癌是全球最常見的癌癥,據(jù)稱死亡人數(shù)比前列腺癌,結(jié)腸癌和乳腺癌的總和還多,《1990-2017年中國及其各省的死亡率、發(fā)病率和危險因素:2017年全球疾病負(fù)擔(dān)研究的一個系統(tǒng)分析》的研究,是一項關(guān)于中國人口健康的全面研究報告。該研究根據(jù)壽命損失年數(shù)(YLL,因某種疾病少活了多少年)的多少,從282類致死原因中找出了2017年中國人的前三大死亡原因,分別是:中風(fēng)、缺血性心臟病、癌癥,而肺癌居眾多癌癥之首。根據(jù)腫瘤類型和發(fā)病階段,肺癌患者的治療通常包括手術(shù)切除和放化療。盡管外科手術(shù)切除為肺癌患者提供了最佳的治療效果,但90%患者在剛診斷時已處于中晚期,失去了最佳手術(shù)的時期,目前,服用化療藥物仍是大多數(shù)患者的唯一選擇。近年來,肺癌的靶向治療取得了較大進(jìn)展,但這些方法仍受到適用人群、應(yīng)答率等限制,因而研發(fā)針對性更強(qiáng)的治療方法具有重要意義[1]。DEAD-boxRNA解旋酶3(DDX3)是DEAD-box蛋白的高度保守家族成員,DEAD-box蛋白是ATP依賴的簇,是最大的RNA解旋酶家族。能夠解開RNA雙鏈體并涉及多個RNA加工程序,包括mRNA剪接,RNA編輯,出口,RNA衰變,核糖體生物發(fā)生轉(zhuǎn)錄和翻譯調(diào)控等[2,3]。DEAD-box家族的特征在于ATP酶和解旋酶活性的調(diào)節(jié),RNA代謝的調(diào)節(jié)以及RNA結(jié)合蛋白或分子伴侶與其他蛋白或RNA相互作用的參與者。DDX3有兩個指定的同源物分別位于X和Y染色體上的DDX3X和DDX3Y[4,5]。而DDX3Y位于無精子癥的無精子因子a(AZFa)區(qū)域Y染色體,在睪丸中特異性表達(dá),在精子成熟和雄性育性中起重要作用[6,7]。DDX3X與DDX3Y在蛋白質(zhì)上有92%的相似性,序列同一性,并編碼為662-或661個氨基酸的多肽,具體取決于mRNA選擇性剪接[8]DDX3X在大多數(shù)情況下無所不在,而DDX3Y表達(dá)僅限于男性種系在雄性育性中起作用[9]。前人的研究結(jié)果證實DDX3和KRAS都是肺癌發(fā)生發(fā)展的關(guān)鍵癌基因.對于DDX3作為一個RNA解旋酶在包括肺癌在內(nèi)的多種癌癥中表達(dá)失調(diào)。乳腺癌中,超過30%的患者DDX3高表達(dá)[10]。宮頸癌細(xì)胞中,DDX3通過直接調(diào)控細(xì)胞周期蛋白E1(CyclinE1)的翻譯來調(diào)控細(xì)胞周期[11,12]。髓母細(xì)胞瘤中,DDX3是Wnt/β-catenin信號通路的重要組成因子[13]。盡管上述研究證實了DDX3在多種癌癥中發(fā)揮癌基因的作用,但DDX3在肺癌發(fā)生發(fā)展中的具體作用仍處于探索階段。
材料與方法一.實驗材料1.WesternBlot所需試劑表1所需試劑配方2×Lysisbuffer30%丙烯酰胺儲存液1.5MTris-HCl(pH=8.8)1.0MTris-HCl(pH=6.8)10%SDSTris-Glycine電泳緩沖液Tris-Glycine電轉(zhuǎn)緩沖液10%過硫酸銨10XTBST洗膜緩沖液1×TBST洗膜緩沖液5%TBST-Milk封閉液1.211gTris,1.753gNaCl,2mLNP-40,調(diào)節(jié)pH值至7.5,用雙蒸水定容到100mL29g丙烯酰胺,1gN,N'-亞甲基雙丙烯酰胺,雙蒸水溶解定容到100mL,0.45μm濾膜過濾至棕色瓶,4℃保存Tris18.17g,雙蒸水溶解,濃鹽酸調(diào)節(jié)pH值到8.8,定容到100mLTris12.11g,雙蒸水溶解,濃鹽酸調(diào)節(jié)pH值到6.8,定容到100mLSDS10g,雙蒸水溶解,定容到100mL3.02gTris,18.8g甘氨酸,10mL10%SDS定容至1L3.03gTris,14.41g甘氨酸,850mL雙蒸水,150mL甲醇現(xiàn)用現(xiàn)加,提前預(yù)冷過硫酸銨1g,雙蒸水溶解定容到10mL,分裝到1.5mLEP管中,-20℃保存2.92gNaCl,0.5mLTween-20,10mL1.0MTris-HCl(pH=8.0),定容到500mL50mL10×TBST洗膜緩沖液,450mL雙蒸水,混勻5g脫脂奶粉,100mL1×TBST充分混勻攪拌2.瓊脂糖凝膠電泳所需試劑表2所需試劑配方50×TAE電泳緩沖液10×loading10g/L溴化乙錠(EB)溶液1%瓊脂糖凝膠Tris堿242g冰乙酸57.1mLEDTA18.6g,20gNaOH溶于終體積1000mLddH2O中,使用時稀釋50倍0.25%溴酚蘭、0.25%二甲苯青、30%甘油混勻后保存于4℃0.2gEB溶于20mL去離子水中,混勻后4℃避光保存,使用時終濃度為0.5mg/L1%瓊脂糖分別溶于1×TAE中,微波爐加熱至完全溶解細(xì)菌培養(yǎng)所需試劑表3細(xì)菌培養(yǎng)所需試劑配方LB液體培養(yǎng)基LB瓊脂平板固體培養(yǎng)基將2g胰蛋白胨,2gNaCl、1g酵母提取物溶于200mLddH2O中,121℃高壓滅菌30min,4℃保存?zhèn)溆迷?00mLLB液體培養(yǎng)基中加入3g瓊脂粉,121℃高壓滅菌30min,待溫度降至40-50℃以下時加入200μL氨芐青霉素(Amp+),混勻直接倒入平板中,待冷卻凝固后用封口膜封好倒置放于4℃保存?zhèn)溆眉?xì)胞培養(yǎng)所需試劑表4細(xì)胞培養(yǎng)所需試劑配方10%FBS-RPMI1640完全培養(yǎng)液磷酸鹽緩沖液(PBS)PBS-EDTA0.25%胰蛋白酶消化液細(xì)胞凍存液含5mLFBS、45mLRPMI1640和0.1%青鏈霉素4gNaCl,0.1gKCl、1.79gNa2HPO4?12H2O、0.12gKH2PO4,溶于500mLddH2O中,121℃高壓滅菌30min,4℃保存?zhèn)溆?.37gEDTA溶于500mLPBS中,121℃高壓滅菌30min,4℃保存?zhèn)溆?.25g胰蛋白酶溶于100mLPBS中,0.22μm濾器過濾,4℃保存?zhèn)溆?0%二甲亞砜(DMSO)、90%FBS試劑盒表5試劑盒公司來源SuperscriptTMIII逆轉(zhuǎn)錄試劑盒SYBR?PremixExTaqTMDNA快速膠純化回收試劑盒質(zhì)粒小量提取試劑盒BCA蛋白濃度測定試劑盒質(zhì)粒大量提取試劑盒慢病毒包裝、濃縮及病毒滴度測定試劑盒Invitrogen公司產(chǎn)品全式基因生物科技有限公司產(chǎn)品Transgen公司產(chǎn)品威格拉斯(Vigorous)公司產(chǎn)品威格拉斯(Vigorous)公司產(chǎn)品QIAGEN公司產(chǎn)品MiltenyiBiotec公司產(chǎn)品儀器與設(shè)備表6儀器設(shè)備品牌冷凍臺式離心機(jī)PCR儀Real-timePCR儀熒光顯微鏡及照相系統(tǒng)CO2培養(yǎng)箱-80oC冰柜MilliQPlus超純水系統(tǒng)微量加樣器電泳儀Hettich,GermanyBio-RadPTC-100Bio-RadIQ5,Bio-RadCFX96NikonRevcoThermoMilliporeEppendorf北京百晶&Bio-Rad二.實驗方法1.蛋白質(zhì)免疫印跡法(WesternBlot)1.1蛋白質(zhì)的提取和定量(1)細(xì)胞間收取所用細(xì)胞到1.5毫升EP管中,PBS洗沉淀兩次,加入加了100X蛋白酶抑制劑的細(xì)胞裂解液,冰上裂解30min,隔十分鐘渦旋幾次,4℃離心機(jī)12000rpm離心15min,吸取上清。(2)使用BCA試劑盒測樣品濃度,加入計算好的ddH2O和5×loading的體積,100℃金屬浴煮10min,存于-20℃?zhèn)溆谩?.2蛋白的SDS電泳(1)先測試是否漏液,記錄上樣順序,樣品左右兩側(cè)用蛋白Marker作為對照。(3)通電,電壓80V跑出濃縮膠后調(diào)成120V,距膠底部0.5cm處關(guān)閉電源。1.3轉(zhuǎn)膜(1)準(zhǔn)備新配好的1升電轉(zhuǎn)液和PVDF(PolyvinylideneFluoride,聚偏氟乙稀)膜(83mm×50mm),甲醇激活PVDF膜5秒。(2)提前準(zhǔn)備好轉(zhuǎn)膜物品,注意黑膠白膜,膠和膜還有濾紙之間要將氣泡排干凈。(3)轉(zhuǎn)膜放在冰盒中,通電,恒流320mA開始。1.4封閉現(xiàn)用現(xiàn)配5%脫脂牛奶,用1XTBST清洗膜5分鐘,把膜浸沒在封閉液中,搖床緩慢搖1小時。1.5孵一抗裁膜放到稀釋好的一抗中,4℃搖床過夜。1.6洗膜回收一抗,用1XTBST洗膜三次每次10min。1.7孵二抗:將膜放入用封閉液稀釋好的二抗溶液中,室溫?fù)u床輕搖一小時。1.8洗膜用1XTBST漂洗膜每次5min,洗四次。1.9發(fā)光鑒定(1)膜從TBST中取出,在干凈衛(wèi)生紙上輕點吸除溶液殘留。提前配好顯色液,切記要避光,將膜放進(jìn)凝膠成像儀中,滴加混合液到膜上,根據(jù)結(jié)果調(diào)整曝光時間和區(qū)域,得到最佳結(jié)果。2.分子克隆構(gòu)建敲低質(zhì)粒DDX3X2.1.設(shè)計敲低DDX3X的shRNA送于北京擎科測序公司進(jìn)行合成。2.2酶切空載體plko.1,體系如下:Age12ulEcoR12ulplko.12ul10*cutsmartbuffer5ulddH2O39ul條件:37度水浴過夜2.3膠回收:將酶切的載體進(jìn)行膠回收,膠回收步驟如下:(1)切膠:先配好瓊脂糖凝膠,電泳跑膠,在UVUA光下切取目的條帶,放入稱量好的1.5毫升EP管內(nèi)。(2)加入量為膠塊質(zhì)量三倍的融膠液GM,水浴37℃,每2min震蕩一次直至完全溶解。(3)溶液移到收集柱中,室溫離心12000rpm,1min。(4)倒去融膠液,加入700ulWB,室溫離心12000rpm,1min并重復(fù)一次。(5)棄去WB,室溫空離一次12000rpm2min。(6)加入65度預(yù)熱的ddH2O,室溫離心12000rpm1min。(7)使用Nandrop測濃度。2.4合成的shRNA先融水然后退火,95度10min,關(guān)機(jī)退火4h,自然冷卻要貼條,不能開蓋。2.5連接:退火后shRNA與酶切完的載體連接,使用NEB的T4連接酶置于16度大于4h。2.6轉(zhuǎn)化:提前用紫外燈照射30min細(xì)菌工作臺。(1)從-80℃冰箱取出stbl3感受態(tài),取感受態(tài)50ul,加入連接產(chǎn)物10ul,冰浴30min。(2)然后42度金屬浴熱激45s立即放于冰上不少于2min。(3)加入無抗生素LB500ul于37度孵箱搖床上200rpm1h。(4)在細(xì)菌工作臺輕離菌液,去一半上清,剩余菌液渦旋均勻涂布在平板上,37度孵箱過夜。(5)次日挑單克隆菌落,加入含A+抗性的LB,37度搖床搖大約6h,取一半送測序。2.7質(zhì)粒DNA中小劑量提取及定量(1)在細(xì)菌臺接種單個菌落到LB培養(yǎng)基,37℃搖床過夜;室溫1200rpm離心5分鐘,去干凈上清;(2)加入500μl已加入RNaseA的重懸液BufferP1,用移液器充分懸浮混勻細(xì)菌沉淀;(3)再加入500μlBufferP2,溫和緩慢的上下顛倒5-10次,靜置2min。裂解時間控制在5min以內(nèi),混勻動作不可劇烈;(4)加入500μlBufferP4,立即輕柔地顛倒EP管6-8次,此時會出現(xiàn)白色絮狀沉淀;室溫放大約10min,12,000rpm離心10分鐘,管底部形成白色沉淀。(5)柱平衡:用500μl的平衡液BL平衡吸附柱CP4,12,000rpm離心1分鐘。(6)吸取上清液不要觸碰沉淀分批加入過濾柱CS中,12,000rpm離心2min,濾液置于2mlEP管中。(7)加入0.3倍濾液體積的異丙醇,上下混勻后用移液槍吸到CP4中。(8)CP4室溫12,000rpm離心1min,倒掉廢液。(9)加入500μl去蛋白液PD,12,000rpm離心1min,棄去廢液。(10)繼續(xù)加入600μl加入無水乙醇的漂洗液PW,靜置2-5分鐘,12,000rpm離心1分鐘,倒掉廢液,重復(fù)漂洗一次。(11)空離2分鐘,將CP4開蓋放在室溫十分鐘,保證晾干殘留的漂洗液。(12)將CP4換一個新的干凈的1.5ml離心管,向吸附膜中間部位加入ddH2O(ddH2O提前在65度金屬浴上預(yù)熱),室溫放置2分鐘,12000rpm離心2分鐘收集質(zhì)粒溶液。(13)為了提高質(zhì)粒的回收效率,重復(fù)步驟12,測定質(zhì)粒OD260,OD280以及濃度。2.8質(zhì)粒DNA的大劑量制備及純化(1)大搖菌液接種到500ul培養(yǎng)基中活化,然后吸取50μl-100μl接種到200ml液體LB培養(yǎng)基(含氨芐青霉素)中,37℃搖床振蕩過夜;(2)4℃離心機(jī)提前預(yù)冷,6000g,15min,離心過夜的LB培養(yǎng)基;(3)10mLBufferP1重懸細(xì)菌沉淀到50ml無酶離心管,加了lysisBlue的P1在層析柜。(4)加入10mLBufferP2,緩慢顛倒4-6次充分混勻,室溫孵育5min(此時溶液慢慢變成藍(lán)色)。(5)在孵育期間,準(zhǔn)備QIAfilterCartridge帽子,QIAfilter管口和離心管(QIArack)。(6)加10ml預(yù)冷的BufferP3,顛倒4-6次成雞蛋花狀,藍(lán)色消失。(7)溶解產(chǎn)物加到QIAfilterCartridge桶內(nèi),室溫孵育10min。輕推塞子將溶解產(chǎn)物過濾到50ml無酶離心管中,濾液20-25ml左右。(8)加2.5ml的BufferER,顛倒10次左右充分混勻,冰上孵育30min。(9)10mlBufferQBT來平衡QIAGEN-tip500,使液體靠重力流干凈。(10)孵育好的溶解產(chǎn)物過一遍QAGEN-TiP500柱子(即液體靠重力流干凈)。(11)加30ml的BufferQC洗QIAGEN-tip兩遍。(12)加入15ml的BufferQN(提前烘箱65度預(yù)熱)洗脫DNA于一個無內(nèi)毒素?zé)o熱源質(zhì)的管子里。(13)加10.5ml常溫的異丙醇(無RNase)沉淀DNA,小心去上清,離心1h。(14)加入5ml無內(nèi)毒素的室溫的70%的乙醇,6000g,4℃離心30min,小心吸出上清。(15)室溫放幾分鐘晾干,加300ul的無內(nèi)毒素的BufferTE溶解DNA,在干凈環(huán)境中進(jìn)行。(16)提出的質(zhì)粒應(yīng)測濃度并跑電泳驗證,-20度儲存?zhèn)溆谩?.敲低質(zhì)粒DDX3X轉(zhuǎn)染細(xì)胞1.細(xì)胞生長條件本課題所用人胚腎細(xì)胞系293TN用DMEM培養(yǎng)基、人肺癌細(xì)胞系A(chǔ)549用1640培養(yǎng)基,均為貼壁細(xì)胞。培養(yǎng)基中都添加10%FBS,100U/ML青霉素和100U/ML鏈霉素。兩種細(xì)胞在37℃,5%CO2和濕度飽和的孵箱培養(yǎng)。2.凍存細(xì)胞復(fù)蘇提前30min將復(fù)蘇細(xì)胞所用培養(yǎng)基及PBS等放置室溫,提前30min開紫外線消毒。液氮中取出細(xì)胞后我們把凍存管用PE手套包裹,放到37℃水浴鍋中,手輕微搖凍存管,促使細(xì)胞快速溶解。800rpm離心5min,棄上清。用槍吸1ml培養(yǎng)基懸浮細(xì)胞沉淀,移到10厘米培養(yǎng)皿中,雙手用十字交叉法緩慢晃動培養(yǎng)皿讓細(xì)胞均勻分布,置于37℃孵箱培養(yǎng)。3.細(xì)胞傳代細(xì)胞密度在80%-90%時需傳代。顯微鏡下觀察后在生物安全柜中操作,倒掉培養(yǎng)基,先加2mlPBS,輕微晃動用移液器小心吸掉PBS。加入2ml胰酶消化2-3min,等顯微鏡下看到貼壁細(xì)胞變圓,細(xì)胞的間隙變大后就加入2ml完全培養(yǎng)基中和胰酶。用移液器輕柔緩慢吹散細(xì)胞吸到15毫升離心管中。800rpm離心5min,去上清,用1ml培養(yǎng)基重懸細(xì)胞沉淀,按需求比例移至培養(yǎng)皿中。置于37℃孵箱孵育。4.細(xì)胞系的轉(zhuǎn)染(脂質(zhì)體介導(dǎo)真核生物轉(zhuǎn)染系統(tǒng))(1)轉(zhuǎn)染前天我們計數(shù)鋪板達(dá)到實驗所需密度。(2)按比例分別稀釋轉(zhuǎn)染試劑和目的質(zhì)粒,靜置5min。(4)取100ul混合液加入到稀釋質(zhì)粒中,室溫靜置20min。期間為細(xì)胞換液,更換為無抗生素的1ml培養(yǎng)基。(5)將混合物與細(xì)胞混勻,37℃培養(yǎng)箱中培養(yǎng)4-6h之后換液再培養(yǎng)24-48h。(6)轉(zhuǎn)染24h后收細(xì)胞檢測RNA變化,48h后檢測蛋白變化。5.慢病毒包裝目的質(zhì)粒:PSPAX.2:PMD2G為6:4.5:1.5,轉(zhuǎn)染試劑為neofect。(1)稀釋液Opti-MEM:轉(zhuǎn)染試劑neofect按6孔板一孔為100ul:5ul靜置5min。(2)稀釋液Opti-MEM:PSPAX2:PMD2G為100ul:4.5ug:1.5ug稀釋靜置5min。(3)取6ug目的質(zhì)粒對應(yīng)加入到稀釋后的雙質(zhì)粒系統(tǒng)輕柔混勻,做好標(biāo)記。(4)每孔100ulneofect加入到質(zhì)粒稀釋液中,靜置20min,為293T換液,換為1ml無雙抗的DMEM。(5)靜置后加入對應(yīng)孔中。培養(yǎng)48h(注:4--6h后補(bǔ)加雙抗防止細(xì)胞污染)(6)培養(yǎng)48h后收取上清,室溫離心10min,上清用0.45um過濾膜過濾。(7)病毒上清按體積比4:1加入PEG-it,充分混勻,4度冰箱靜置12h-72h。(8)6孔板鋪A549細(xì)胞,在密度為60%-70%時感染細(xì)胞。(9)感染細(xì)胞4-6h后加雙抗和puro藥篩,24h后收細(xì)胞檢測功能。4.實時定量PCR4.1Trizol法提取總RNA(1)往1.5毫升離心管內(nèi)加1毫升Trizol;(2)加200微升三氯甲烷,上下顛倒幾次混勻,室溫靜置10分鐘;(3)4℃離心15分鐘,吸取上清至新的離心管中;(4)加入同體積的異丙醇,渦旋混勻,-20℃放置一段時間來增加RNA沉淀;(5)離心15分鐘,棄上清,保留沉淀;(6)加入800微升75%乙醇,溫和振蕩懸浮沉淀;(7)離心5分鐘,盡量棄上清,重復(fù)兩次;(8)吸凈上清,室溫晾干數(shù)分鐘,沉淀不能太過干燥;(9)用無酶水溶解沉淀,測濃度。4.2逆轉(zhuǎn)錄與實時PCR(1)冰盒中向0.65mlEP管加入10ulDEPC水,1ul引物,1ul模板RNA,1uldNTP,短暫離心。(2)65℃金屬浴5min,立刻冰浴2min。(3)短暫離心,冰上操作:加入4ul5×First-StrandBuffer,1ulM-MLV,1ulRNAseInhibitor。(4)低速渦旋,42℃金屬浴1小時,70℃金屬浴15min,進(jìn)行PCR或-80℃保存。(7)每個樣品設(shè)三個復(fù)孔,反應(yīng)體積為20μL,反應(yīng)體系:2×SYBRMix(10mM)10μL10μMPrimer10.4μL10μMPrimer20.4μLcDNA0.2μLddH2O9.0μLTotal20μL(8)儀器設(shè)置完成運行程序并保存數(shù)據(jù)。(9)分析數(shù)據(jù):我們待程序完成后就設(shè)置樣本對照和內(nèi)參基因,分析目的基因的相對表達(dá)。5.cck8細(xì)胞增殖實驗(1)用細(xì)胞計數(shù)板計數(shù)細(xì)胞,細(xì)胞要吹打均勻,在細(xì)胞間用五板96孔板鋪成每孔為100微升的細(xì)胞懸液,分別設(shè)置為0h,24h.48h,72h和96h。(2)鋪完細(xì)胞后在0h的96孔板每孔加入10微升cck8溶液,一起放入細(xì)胞間孵箱中培養(yǎng)。(3)2-3h后將0h的96孔板先在酒精燈下將孔中氣泡去除,然后用酶標(biāo)儀測定450和630nm處的吸光度。其他板數(shù)在測定時間前4h內(nèi)加入cck8溶液。(4)最后制作出標(biāo)準(zhǔn)曲線,來測定樣品的細(xì)胞數(shù)量。結(jié)果1.病例水平證實DDX3X在肺癌中作為癌基因發(fā)揮作用收集了肺癌病例,并從正常組織,肺腺癌以及癌旁組織中提取出蛋白進(jìn)行WesternBlot實驗,結(jié)果顯示DDX3X在肺癌細(xì)胞中表達(dá)水平升高(圖1)。圖1.DDX3X在肺癌患者中的表達(dá)。a肺腺癌b癌旁c正常組織2.細(xì)胞水平敲低DDX3X顯著抑制肺癌細(xì)胞的生長(1)構(gòu)建敲低DDX3X的shRNA,以質(zhì)粒plko.1為載體骨架,構(gòu)建敲低DDX3X的shRNA1,shRNA2和shRNA3,使用293T進(jìn)行慢病毒包裝,感染肺癌細(xì)胞A549,WesternBlot檢測構(gòu)建shRNA的敲低效率,結(jié)果顯示:DDX3X敲低成功,其中shRNA1和shRNA2敲低效果更顯著(圖2)。圖2.DDX3X在A549細(xì)胞中敲低效率的檢測。(2)取敲低效率顯著的shRNA1和shRNA2進(jìn)行細(xì)胞增殖實驗,結(jié)果顯示,敲低DDX3X后能夠顯著抑制肺癌細(xì)胞的增殖(圖3)。圖3敲低DDX3X后肺癌細(xì)胞增殖的檢測。討論我們從收集的肺癌患者病例中首先通過組織提取出蛋白進(jìn)行蛋白定量,然后用蛋白質(zhì)免疫印跡法檢測出DDX3的蛋白水平異常升高,根據(jù)文獻(xiàn)中對DDX3在各種癌癥中表達(dá)失調(diào)的表現(xiàn),RNA解旋酶是基因表達(dá)的重要調(diào)節(jié)劑,在RNA代謝的幾乎所有方面都發(fā)揮作用,我們可以確定DDX3在肺癌中有很大可能作為癌基因在發(fā)揮作用,DDX3可能的致癌作用是通過調(diào)節(jié)細(xì)胞周期。它通過誘導(dǎo)細(xì)胞周期G1/S過渡,從而促進(jìn)細(xì)胞生長。它調(diào)節(jié)G1/S特定的翻譯cyclinE1mRNA,RNA解旋酶活性是必需的過程[12,13,14]。此外,DDX3與DDX5交互在小鼠胚胎發(fā)育過程中的細(xì)胞周期的G2/M期[15,16]證據(jù)表明DDX3可以調(diào)節(jié)在腫瘤發(fā)生中至關(guān)重要的基因的轉(zhuǎn)錄。所以我們從細(xì)胞水平通過構(gòu)建敲低DDX3X的質(zhì)粒進(jìn)一步檢測DDX3在肺癌中的作用。我們以質(zhì)粒plko.1為載體骨架,構(gòu)建敲低DDX3X的shRNA1,shRNA2和shRNA3,使用293T進(jìn)行慢病毒包裝,感染肺癌細(xì)胞A549,之后蛋白質(zhì)免疫印跡法證實DDX3X敲低成功,用敲低效果更加明顯的shRNA1和shRNA2進(jìn)行了細(xì)胞增殖實驗,結(jié)果顯示敲低后的DDX3X能夠顯著抑制肺癌細(xì)胞的增殖,這更加確定了DDX3在肺癌發(fā)生發(fā)展中發(fā)揮癌基因的作用。此外我們發(fā)現(xiàn)DDX3在肺癌細(xì)胞中表達(dá)水平異常增高的同時,DDX6和KRAS在肺癌細(xì)胞中的表達(dá)水平于鄰近正常組織相比也是高表達(dá)。在大腸癌中,DDX6調(diào)節(jié)基因Wnt信號轉(zhuǎn)導(dǎo)的轉(zhuǎn)錄表達(dá)譜以及翻譯控制。DDX6的酵母同系物據(jù)報道DNA損傷后細(xì)胞周期停滯在G1/S的恢復(fù)中也很重要。其負(fù)責(zé)恢復(fù)在mRNA代謝的功能調(diào)節(jié)[17,18]。在人類宮頸癌細(xì)胞系中Hela,DDX6的表達(dá)在細(xì)胞過程中被上調(diào),分化過程中增殖和下調(diào)。DDX6的耗盡會通過誘導(dǎo)DDX6阻礙細(xì)胞生長細(xì)胞周期停滯在S期。DDX6與eIF4E的交互暗示可能翻譯的翻譯啟動基因參與細(xì)胞增殖[19]。85%的患肺癌患者都被診斷為非小細(xì)胞肺癌,這里面70%的患者為肺腺癌。研究表明,肺腺癌中有30.9%的患者都攜帶著Kras基因突變,K-Ras對人類各種癌癥的影響非常大,KRAS基因可以控制調(diào)控細(xì)胞生長的路徑;異常時會讓細(xì)胞持續(xù)生長,KRAS參與細(xì)胞內(nèi)的信號傳遞,當(dāng)K-ras基因發(fā)生突變不能產(chǎn)生正常功能蛋白就使胞內(nèi)信號傳導(dǎo)功能紊亂,細(xì)胞突變增殖失去控制進(jìn)而發(fā)生癌變。在結(jié)直腸癌的一項研究表明,DDX3通過增強(qiáng)SP1結(jié)合在KRAS啟動子上可以促進(jìn)Kras的轉(zhuǎn)錄[20]。而目前肺癌治療中仍然沒有靶向Kras的藥物。因此尋找新的下游信號通路具有重要研究意義。綜上所述,雖然現(xiàn)在醫(yī)學(xué)領(lǐng)域發(fā)展越開越迅速,但是肺癌的治愈率依舊很低,許多癌基因在肺癌的治療中起到關(guān)鍵性作用,肺癌也因各類靶基因的出現(xiàn)而發(fā)生革命性變化,所以從基因水平研究肺癌的各種發(fā)生機(jī)制,對今后肺癌的早期診斷和治療更加有關(guān)鍵指導(dǎo)意義,在此實驗中可以將DDX3X作為治療肺癌的靶基因進(jìn)行研究,從而使更多的肺癌患者在靶向治療中獲益。結(jié)論DDX3X在肺癌中作為癌基因發(fā)揮作用,敲低DDX3可以抑制肺癌細(xì)胞的增殖。
參考文獻(xiàn)[1]SiegelRebecca,NaishadhamDeepa,JemalAhmedin.Cancerstatistics,2013.[J].CA:acancerjournalforclinicians,2013,63(1):11-30.[2]LinderPatrick,Fuller-PaceFrances.Happybirthday:25yearsofDEAD-boxproteins.[J].Methodsinmolecularbiology(Clifton,N.J.),2015,1259:11-30.[3]AndreouAlexandraZ,KlostermeierDagmar.FluorescencemethodsintheinvestigationoftheDEAD-boxhelicasemechanism.[J].EXS,2014,105:161-92.[4]EplingLeslieB,GraceChristyR,LoweBrandonR,PartridgeJanetF,EnemarkEricJ.Cancer-associatedmutantsofRNAhelicaseDDX3XaredefectiveinRNA-stimulatedATPhydrolysis.[J].Journalofmolecularbiology,2015,427:1779-96.[5]OjhaJuhi,SecretoCharlaR,RabeKariG,VanDykeDanielL,KortumKlausM,SlagerSusanL,ShanafeltTaitD,FonsecaRafael,KayNeilE,BraggioEsteban.IdentificationofrecurrenttruncatedDDX3Xmutationsinchroniclymphocyticleukaemia.[J].Britishjournalofhaematology,2015,169:445-8.[6]RamathalCyril,AnguloBenjamin,SukhwaniMeena,CuiJun,Durruthy-DurruthyJens,FangFang,SchanesPaula,TurekPaulJ,OrwigKyleE,ReijoPeraRenee.DDX3YgenerescueofaYchromosomeAZFadeletionrestoresgermcellformationandtranscriptionalprograms.[J].Scientificreports,2015,5:15041.[7]VakilianHaghighat,MirzaeiMehdi,SharifiTabarMehdi,PooyanParia,HabibiRezaeeLida,ParkerLindsay,HaynesPaulA,GourabiHamid,BaharvandHossein,SalekdehGhasemHosseini.DDX3Y,aMale-SpecificRegionofYChromosomeGene,MayModulateNeuronalDifferentiation.[J].Journalofproteomeresearch,2015,14(9):3474-83.[8]RauschendorfMarc-Alexander,ZimmerJutta,OhnmachtCaroline,VogtPeterH.DDX3X,theXhomologueofAZFageneDDX3Y,expressesacomplexpatternoftranscriptvariantsonlyinthemalegermline.[J].Molecularhumanreproduction,2014,20(12):1208-22.[9]AriumiYasuo.MultiplefunctionsofDDX3RNAhelicaseingeneregulation,tumorigenesis,andviralinfection.[J].Frontiersingenetics,2014,5.[10]MahendranBotlagunta,BalajiKrishnamachary,FarhadVesuna,PaulT.Winnard,GuusM.Bol,ArvindH.Patel,VenuRaman.ExpressionofDDX3IsDirectlyModulatedbyHypoxiaInducibleFactor-1AlphainBreastEpithelialCells[J].PLOSONE,2011,6(3):p.e17563.[11]ByrneMJ,PhillipsM,PowellA,CameronF,JosephD,SpryN,DewarJ,VanHazelG,BuckM,LundH,DeMelkerY,NewmanM.Cisplatinandgemcitabineinductionchemotherapyfollowedbyconcurrentchemoradiotherapyorsurgeryforlocallyadvancednon-smallcelllungcancer.[J].Internalmedicinejournal,2005,35(6).[12]LaiMing-Chih,ChangWen-Cheng,ShiehSheau-Yann,TarnWoan-Yuh.DDX3regulatescellgrowththroughtranslationalcontrolofcyclinE1.[J].Molecularandcellularbiology,2010,30(22):p.5444-53.[13]PughTrevorJ,WeeraratneShyamalDilhan,ArcherTenleyC,PomeranzKrummelDanielA,AuclairDaniel,BochicchioJames,CarneiroMauricioO,CarterScottL,CibulskisKristian,ErlichRachelL,GreulichHeidi,LawrenceMichaelS,LennonNiallJ,McKennaAaron,MeldrimJames,RamosAlexH,RossMichaelG,RussCarsten,SheflerErica,SivachenkoAndrey,SogoloffBrian,StojanovPetar,TamayoPablo,MesirovJillP,AmaniVladimir,TeiderNatalia,SenguptaSoma,FrancoisJessicaPierre,NorthcottPaulA,Taylor.Medulloblastomaexomesequencinguncoverssubtype-specificsomaticmutations.[J].Nature,2012,488(7409):p.106-10.[14]JunkoFukumura,EishiNoguchi,TakeshiSekiguchi,TakeharuNishimoto.ATemperature-SensitiveMutantoftheMammalianRNAHelicase,DEAD-BOXXIsoform,DBX,DefectiveintheTransitionfromG1toSPhase[J].TheJapaneseBiochemicalSociety,2003,134(1).[15]ChoiYJ,LeeSG.TheDEAD-boxRNAhelicaseDDX3interactswithDDX5,co-localizeswithitinthecytoplasmduringtheG2/Mphaseofthecycle,andaffectsitsshuttlingduringmRNPexport[J].JournalofCellularBiochemistry,2012,113(3):985-996.[16]LiQ,ZhangP,
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