蒺藜苜蓿TML2基因在原核系統(tǒng)中的表達(dá)_第1頁
蒺藜苜蓿TML2基因在原核系統(tǒng)中的表達(dá)_第2頁
蒺藜苜蓿TML2基因在原核系統(tǒng)中的表達(dá)_第3頁
蒺藜苜蓿TML2基因在原核系統(tǒng)中的表達(dá)_第4頁
蒺藜苜蓿TML2基因在原核系統(tǒng)中的表達(dá)_第5頁
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文檔簡介

蒺藜苜蓿TML2基因在原核系統(tǒng)中的表達(dá)摘要:蒺藜苜蓿(Medicago

truncatula)是近年來被廣泛用來研究豆科植物生長發(fā)育的模式植物。在豆科植物中,根據(jù)環(huán)境條件根系除了形成側(cè)根外,還可以形成特殊的器官根瘤。TML

基因在根瘤發(fā)育調(diào)控中起著至關(guān)重要的作用,但其影響根瘤發(fā)育的分子機(jī)制尚不明確,作為一

F-Box

類蛋白,它在豆科植物根瘤自調(diào)節(jié)途徑(AON)的后期可能參與目的蛋白酶體降解,從而控制根瘤數(shù)目及根瘤的發(fā)育過程。因此,關(guān)于蒺藜苜蓿

TML

基因的研究對豆科植物共生固氮、信號轉(zhuǎn)導(dǎo)等領(lǐng)域有著重要的意義。本項目通過RNA提取和反轉(zhuǎn)錄、PCR技術(shù)成功從中克隆得到TML2基因;利用無縫克隆技術(shù)完成了pGEX-6P-1-TML2和pCold-TF-TML2原核表達(dá)載體的構(gòu)建;成功將表達(dá)載體轉(zhuǎn)入表達(dá)菌株Rosetta并完成表達(dá);確定了TML2蛋白的表達(dá)部位少量位于上清,大量位于沉淀中,形成包涵體。前言:1.蒺藜苜蓿簡介蒺藜苜蓿(Medicagotruncatula)是一年生的豆科草本植物,是一種放牧型牧草,具有強(qiáng)耐旱性且適宜堿性土壤,在可持續(xù)性農(nóng)業(yè)體系中可以被用作放牧草地的主要草種。同時,由于蒺藜苜蓿具有染色體倍數(shù)?。?n=16),基因組?。▎伪扼w基因組大小約為500Mb),生長周期短,自花授粉植物并具有較短的生物周期,能產(chǎn)生大量種子,遺傳轉(zhuǎn)化效率高,與大多數(shù)豆科作物及牧草(例如紫花苜蓿)親緣關(guān)系近等特點(diǎn),常常被用作研究豆科植物基因組以及基因功能的模式植物。2003年,國際上啟動了蒺藜苜蓿基因組大規(guī)模測序項目。生態(tài)型JemalongA17基因組測序已經(jīng)完成并且可以利用,目前,蒺藜苜?;蚪M草圖新版本(Mt4.0V2)已經(jīng)構(gòu)建完成,這將提供更為全面,準(zhǔn)確度更高的基因組數(shù)據(jù)庫。2.豆科共生固氮生物固氮對自然界的氮素循環(huán)有著十分重要的意義。每年全球的生物固氮量為175×107噸,是工業(yè)固氮的3倍。其中農(nóng)田固定的氮素約9×107噸,而根瘤菌與豆科植物的共生固氮能力居各類固氮體系之首,為3.7×107噸。此外,根瘤菌與豆科植物共生固氮體系對農(nóng)業(yè)的可持續(xù)性發(fā)展至關(guān)重要,也是研究原核與真核生物互利共生的模式體系之一,因此蒺藜苜蓿的研究對豆科植物的共生固氮(SymbioticNitrogenFixation)研究有著重要參考意義。根瘤菌在根皮層中繁殖,刺激皮層細(xì)胞分裂,導(dǎo)致根組織膨大突出形成根瘤。根瘤菌能把空氣中游離的氮轉(zhuǎn)變?yōu)橹参锬芾玫暮衔铮垂痰饔?。聚集在根毛頂端的根瘤菌分泌一種纖維素酶,這種酶可以將根毛細(xì)胞壁溶解掉,隨后根瘤菌從根毛尖端侵入根的內(nèi)部,產(chǎn)生感染絲(即由根瘤菌排列成行,外面包有一層黏液的結(jié)構(gòu))。根瘤菌不斷地進(jìn)入根毛,并且大量繁殖。在根瘤菌侵入的刺激下,根細(xì)胞分泌一種纖維素,將感染絲包圍起來,形成一條分枝或不分枝的纖維素鞘,即侵入線。侵入線不斷地延伸,直到根的內(nèi)皮層。根的內(nèi)皮層處的薄壁細(xì)胞,受到根瘤菌分泌物的刺激,產(chǎn)生大量的皮層細(xì)胞,從而使該處的組織膨大,最后形成根瘤。3.根瘤調(diào)節(jié)途徑研究觀察發(fā)現(xiàn),蒺藜苜蓿Mt.CompactRootArchitecture2(CRA2)基因突變體與野生型植株相比具有更多的側(cè)根和更少的根瘤。CRA2分別參與兩條獨(dú)立的信號通路調(diào)節(jié)植物側(cè)根和根瘤的形成:一條為根系局部信號通路,MtCRA2通過未知途徑抑制根系中生長素生物合成基因MtYUC2的轉(zhuǎn)錄水平,抑制生長素生物合成,從而調(diào)節(jié)側(cè)根的形成;在低氮條件下,MtCEP1激活MtCRA2并磷酸化MtEIN2,抑制乙烯對根瘤菌感染的抑制作用;另一條為地下-地上-地下的長距離結(jié)瘤自調(diào)節(jié)通路(Autoregulation,AON),在此通路中,植物根系產(chǎn)生的CEP小肽被地上部分的CRA2識別,促進(jìn)miR2111microRNA的表達(dá),從而促進(jìn)根瘤的形成。miR2111是一種可以系統(tǒng)轉(zhuǎn)運(yùn)的保守小RNA,通過靶向降解根系中的負(fù)調(diào)控根瘤數(shù)目的TML(toomuchlove)蛋白,對根瘤形成起正向調(diào)節(jié)作用。同時在豆科植物中還存在著與CEP-CRA2類似的CLE-SUNN負(fù)調(diào)控結(jié)瘤的信號途徑:根系中產(chǎn)生的CLE小肽由地上部分的SUNN識別,抑制miR2111的表達(dá)從而抑制結(jié)瘤。由此可見miR2111作用于SUNN負(fù)調(diào)控通路和CRA2正調(diào)控通路的交叉點(diǎn),以CEP-CRA2、CLE-SUNN代表的AON途徑是豆科植物調(diào)節(jié)根瘤數(shù)目,平衡能量消耗與共生固氮的關(guān)鍵(圖1)。miR2111-TML對結(jié)瘤的調(diào)控是AON途徑共有的后期調(diào)控,起到十分重要的作用。因此,TML基因在根瘤發(fā)育調(diào)控中起著至關(guān)重要的作用。但其影響根瘤發(fā)育的分子機(jī)制尚不明確。TML基因編碼一種含Kelch重復(fù)結(jié)構(gòu)域的F-box蛋白,在蒺藜苜蓿中有同源的兩個基因MtTML1,MtTML2,作為一種F-Box類蛋白,它在豆科植物根瘤自調(diào)節(jié)途徑(AON)的后期可能參與目的蛋白酶體降解,從而控制根瘤數(shù)目及根瘤的發(fā)育過程。因此,關(guān)于蒺藜苜蓿TML基因的研究對豆科植物共生固氮、信號轉(zhuǎn)導(dǎo)等領(lǐng)域有著重要的意義。本研究利用原核表達(dá)系統(tǒng)對蒺藜苜蓿TML基因進(jìn)行表達(dá),從而為后續(xù)驗證該基因在調(diào)控豆科植物根瘤發(fā)育方面提供理論基礎(chǔ)。圖1miR2111-TML作用于SUNN負(fù)調(diào)控通路和CRA2正調(diào)控通路的交叉點(diǎn)[2]1材料與方法1.1材料1.1.1實驗材料大腸桿菌Rosetta;表達(dá)質(zhì)粒pCold-TF,pGEX-6P-1;野生型蒺藜苜蓿A17植株1.1.2試劑購自TaKaRa公司的限制性內(nèi)切酶EcoRⅠ、購自NEB公司的XhoⅠ、羧芐青霉素、IPTG、瓊脂糖、溴酚蘭、DNAMarker、蛋白Marker、酵母提取物、蛋白胨、瓊脂粉、凝膠回收試劑盒(Tiangen)、質(zhì)粒小提中量試劑盒(Tiangen)、RNA提取試劑盒(Trandge)、

ClonExpress?IIOneStepCloningKit(Vazyme)、TaqDNAPolymerase(Vazyme)、GST-TagmAb(ABMART)、Phanta?MaxSuper-FidelityDNAPolymerase(Vazyme)SDS相關(guān)試劑

12%分離膠(5mL體系):依次加入雙蒸水1.65mL,pH8.81.5mol/L的Tris-HCl

1.25mL,Acr/Bis

2.0mL,10%SDS

50μL混勻,臨灌膠前再加入TEMED

5μL和10%AP

50μL后混勻;

4%濃縮膠(1.5mL體系):依次加入雙蒸水0.9mL,pH6.81.0mol/L的Tris-HCl

0.375mL,Acr/Bis

0.2mL,10%SDS

15μL混勻,臨灌膠前再加入TEMED

2.5μL和10%AP

15μL后混勻;

10×SDSRunning

buffer:稱取30.0g

Tris

base,144.0g

Glycine,10g

SDS,用ddH2O補(bǔ)足至1L;

10×Transfer

buffer:稱取30.0g

Tris

base,144.0g

Glycine,用ddH2O補(bǔ)足至1L;1×Transfer

buffer:50mL

10×Transfer

buffer,100mL甲醇,用ddH2O補(bǔ)足至500mL

考馬斯亮藍(lán)染色液:0.25g考馬斯亮藍(lán)R250,10mL冰醋酸,45mL甲醇,用ddH2O定容至100mL;

脫色液:100mL冰醋酸,450mL甲醇,使用ddH2O定容至1000mL。GST裂解緩沖液:配方為150mMNaCl,20mM、pH8.8的Tris-HCl,5mMMgCl2,1%Triton-X-100,1mMDTT,1mMPMSF和Inhibitorcocktail。其中DTT和蛋白酶抑制劑現(xiàn)用現(xiàn)加,其余的組分配置好后之后存于4℃冰箱保存。His裂解緩沖液:稱取13.609gKH2PO4和22.818gK2HPO4分別溶于100mLddH2O以配成1M的KH2PO4和1M的K2HPO4溶液。然后取0.3mL所配的KH2PO4溶液、4.7mL所配的K2HPO4溶液、2.3gNaCl、0.75gKCl、10mLglycerol、0.5mLTriton-X-100和68mgimidazole溶于90mLddH2O以配成100mL體系,調(diào)節(jié)pH至7.8。1.1.3主要設(shè)備及儀器超凈工作臺;立式高壓滅菌鍋;恒溫培養(yǎng)箱;恒溫?fù)u床;電子天平;小型高速離心機(jī);凝膠成像儀;PCR儀;通風(fēng)櫥;超聲破碎儀;pH計;超純水系統(tǒng);移液器(Eppendorf);電泳儀(BIO-RAD電泳系統(tǒng));核酸濃度檢測儀(NanoDrop);冷凍冰箱,超低溫冰箱等。1.1.4培養(yǎng)基制備LB液體培養(yǎng)基:稱取胰蛋白胨10.0g、NaCl10.0g、酵母提取物5.0g,加入適量超純水用玻璃棒攪拌至全部溶化,補(bǔ)加超純水至1000mL,高壓蒸汽滅菌20min。LB固體培養(yǎng)基:在LB液體培養(yǎng)基中加入瓊脂粉至終濃度為1.5%,高壓滅菌20min。2YT培養(yǎng)基:稱取胰蛋白胨10.0g、NaCl5.0g、酵母提取物5.0g,加入800mL去離子水用玻璃棒攪拌至全部溶化,補(bǔ)加去離子水至1000mL,高壓蒸汽滅菌20min。1.2方法1.2.1引物設(shè)計根據(jù)蒺藜苜蓿基因組的信息,設(shè)計TML2基因的引物,并送公司合成。本實驗利用無縫克隆技術(shù)構(gòu)建載體,設(shè)計的引物如下:NameOligo(5'-3')ProteinsizeTML2-pGEX-6P-FGGGATCCCCGGAATTCATGAGTTATAGTGTGTCTAGTAAAAGATC~72kD(GST-tag)TML2-pGEX-6P-RGTCGACCCGGGAATTCTCAAGCCAACATCACAGCACAATTGTGAATTML2-pCold-T-FCTCGGTACCCTCGAGATGAGTTATAGTGTGTCTA~95kD(His-tag)TML2-pCold-TF-RTTCGGATCCCTCGAGTCAAGCCAACATCACAGCACAAT1.2.2獲取目的基因用HiFiScript快速去基因組cDNA第一鏈合成試劑盒提取蒺藜苜蓿野生型A17RNA,反轉(zhuǎn)錄成cDNA備用。反應(yīng)體系如表1、表2所示:表1去除基因組DNA反應(yīng)體系成分體積(μL)10×gDNAEraserBuffer1ulgDNAEraser0.5ulRNATemplate10pg-1ugRNase-FreeWater總體系Upto10ul10表2逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng)體系成分體積(μL)表一反應(yīng)液10HiFiScript,200U/uL1PrimerMix1)45×ScriptRTBuffer4RNase-FreeWater總體系4201.2.3表達(dá)載體的構(gòu)建目的基因克隆以cDNA作為模板以擴(kuò)增目的基因。反應(yīng)體系如表3,PCR反應(yīng)程序如表4。表3PCR反應(yīng)體系成分體積(μL)2×PhantaMasBuffer25dNTPs1模板DNA1ForwardPrimer(10μM)2ReversePrimer(10μM)2PhantaMaxSuper-FidelityDNAPolymerase(1U/μL)1.5ddH2O17.5總體系50表4PCR反應(yīng)程序預(yù)變性變性退火延伸1-4徹底延伸保溫94℃5min95℃30sec55℃30sec72℃30sec/Kb30cycles72℃10min16℃forever將PCR產(chǎn)物利用瓊脂糖凝膠電泳進(jìn)行鑒定,并在切膠儀上盡可能少地切下凝膠上的PCR產(chǎn)物,放置于2mL離心管中用以后續(xù)回收純化。線性化載體制備選擇pCold-TF(圖2)和pGEX-6P-1質(zhì)粒(圖3)作為載體質(zhì)粒,分別利用XhoⅠ和E.coRⅠ37℃酶切30min,將載體質(zhì)粒線性化。酶切體系如表5、表6。表5pGEX-6P-1酶切反應(yīng)體系成分體積(μL)質(zhì)粒3E.coRⅠ110×FastDigestGreenBuffer5ddH2O41總體系50表6pCold-TF酶切反應(yīng)體系成分體積(μL)質(zhì)粒3XhoⅠ110×NEBuffer3.15ddH2O41總體系50圖2pCold-TF圖3pGEX-6P-PCR產(chǎn)物回收與純化將以cDNA為模板克隆目的片段得到的PCR產(chǎn)物和酶切反應(yīng)后的載體質(zhì)粒經(jīng)1%的瓊脂糖凝膠電泳后,按照Tiangen公司生產(chǎn)的瓊脂糖凝膠DNA回收試劑盒的說明書操作:(1)在紫外燈下用手術(shù)刀切下對應(yīng)大小的單一目的條帶,要求盡量快速準(zhǔn)確,把切下來的膠塊放入到1.5mL的EP管中;(2)稱量切下膠塊的重量,加入等體積的溶膠液PN(1g對應(yīng)1mL);55℃金屬浴加熱至膠塊融化;(3)向吸附柱中加入500μL的平衡液BL,12000rpm,離心1min,棄去收集管中的液體,平衡吸附柱;(4)向平衡過的吸附柱中加入已溶解并冷卻的膠塊混合液,靜置2min;(5)12000rpm離心30s,棄去收集管中的液體;(6)加入漂洗液PW600μL,靜置2-5min,12000rpm離心1min,棄去收集管中的液體;(7)重復(fù)上一步驟一次;(8)空吸附柱12000rpm離心2min,離心后,將吸附柱放入新的1.5mLEP管中,置于55℃金屬浴上數(shù)分鐘,至沒有乙醇?xì)馕?;?)吸附柱中加入50μLddH2O室溫放置2min后,12000rpm離心2min,將收集的液體放在-20℃保存。目的基因與載體的連接利用重組酶將線性化的pCpld-TF和pGEX-6P-1載體與目的基因連接,采用無縫克隆技術(shù),按照表7所示體系加入試劑,37℃水浴30min,構(gòu)建完整的表達(dá)載體。表7目的基因與線性化載體的連接體系成分體積(μL)線性化載體pGEX-6P-1/pCold-TF3ExnaseⅡ15×CEⅡBuffer2目的基因4總體系101.2.4表達(dá)載體轉(zhuǎn)化受體細(xì)胞Rosetta感受態(tài)細(xì)胞制備(1)取-80℃凍存的菌株,用接種環(huán)劃線接種于固體平板上,做好標(biāo)記,倒置于37℃培養(yǎng)箱培養(yǎng)過夜;(2)第二天,從平板上挑取單個菌落,接種至4mLLB培養(yǎng)液的試管中,37℃,200rpm,震蕩培養(yǎng)過夜。次日取菌液100uL接種至含有10mLLB液體培養(yǎng)基的錐形瓶中,37℃,200rpm振蕩培養(yǎng)約2-3小時至對數(shù)生長期;(3)當(dāng)菌液OD600值達(dá)到0.3-0.5時,將錐形瓶取出放置于冰上10-15min。在無菌條件下把菌液倒入10mL的預(yù)冷的離心管中,離心4℃,5000rpm離心10min;(4)棄去上清,加入約1mL的預(yù)冷的CaCl2溶液,吹打混勻,懸浮菌體,放入冰浴30min;(5)離心4℃,5000rpm離心10min,棄去上清,加入約200μL預(yù)冷的CaCl2溶液,重新懸浮菌體;(6)將用CaCl2溶液處理后的菌體分裝于1.5mL的EP管中,每管50μL,保存于-80℃的超低溫冰箱中備用。質(zhì)粒載體轉(zhuǎn)化感受態(tài)細(xì)胞(1)取1管50μL的感受態(tài)細(xì)胞,用Marker筆標(biāo)記載體名稱。加入10ng的載體質(zhì)粒DNA,輕輕彈動管壁以混合內(nèi)容物,冰上放置30min;(2)將離心管放到42℃水浴鍋中熱激90s,期間不要搖動。然后在冰浴中迅速冷卻2min;(3)離心管中加入400μLLB液體培養(yǎng)基,37℃恒溫震蕩培養(yǎng)箱中復(fù)蘇1h;將離心管用離心機(jī)在9000rpm下離心4min,吸去上清300μL,剩余的100μL菌液重懸后,滴加在含有羧芐青霉素的選擇平板上,用涂布棒將菌液涂勻,待菌液晾干后,貼封口膜,將平板倒置培養(yǎng)在37℃恒溫培養(yǎng)箱過夜;(4)第二天早晨觀察轉(zhuǎn)化子出現(xiàn)的情況,挑取單菌落進(jìn)行PCR鑒定。轉(zhuǎn)化子的PCR鑒定挑取單菌落混入表8中所示體系,進(jìn)行PCR;制備含有熒光染料的1%的瓊脂糖凝膠電泳15-20min,用化學(xué)發(fā)光儀進(jìn)行觀察,用biovision軟件進(jìn)行拍照,確定陽性克隆菌落。表8轉(zhuǎn)化子PCR檢測體系成分體積(μL)10×Taqbuffer2.5dNTPs1ForwardPrimer1ReversePrimer1TaqEnzyme0.5ddH2O19總體系質(zhì)粒提取與測序檢測利用質(zhì)粒小提中量取試劑盒提取上述陽性克隆菌落質(zhì)粒,測定質(zhì)粒濃度及純度后,將質(zhì)粒送往西安擎科生物公司測序,檢測是否進(jìn)一步篩選陽性克隆菌落。1.2.5TML2蛋白的誘導(dǎo)表達(dá)(1)從新鮮的劃線平板中挑取單克隆到5mL含50mg/L羧芐青霉素的2YT液體培養(yǎng)基中,37℃搖瓶培養(yǎng)過夜;(2)取出1mL菌液加入50mL含50mg/L羧芐青霉素的2YT液體培養(yǎng)基中,含有pGEX-6P-1-tml2的菌和含有pCold-TF-TML2的菌在37℃搖瓶培養(yǎng)至OD600為0.6,取出1ml菌液作為誘導(dǎo)前的對照,保存在-20℃冰箱中備用;(3)培養(yǎng)基中加入1MIPTG至終濃度為1mM,含有pGEX-6P-1-TML2的菌和含有pCold-TF-TML2的菌分別在37℃、15℃誘導(dǎo)6h、24h;(4)取出1mL菌液,和誘導(dǎo)前的菌液一起離心(4℃,5,000rpm,10min),棄掉上清,沉淀用100μL2×SDSBuffer重懸;(5)樣品95℃煮5min,進(jìn)行SDS分析。1.2.6確定TML2蛋白表達(dá)部位從表達(dá)目的蛋白的陽性克隆中選取一個菌株,分析目標(biāo)蛋白的溶解性,確定蛋白是否形成包涵體。(1)含有pGEX-6P-1-TML2的菌和含有pCold-TF-TML2的菌分別在37℃和15℃下加入IPTG分別誘導(dǎo)6h、24h之后,離心(4℃,4000rpm,20min),棄上清,沉淀分別用10mLGST裂解液、His裂解液重懸,立即放到冰上;(2)重懸液中加入溶菌酶(終濃度為1mg/mL),4℃冰箱過夜;(3)超聲波破碎細(xì)胞,超聲6×9s,10s間隔一次,總時間15-90min,功率:200w-350w,樣品始終都要保持在冰上;(4)4℃,4000rpm,離心30min,收集上清,記做A(可溶部分),保存在冰上備用;(5)沉淀分別用10mLGST裂解液、His裂解液重懸記做B(不溶部分),保存在冰上備用;(6)取A和B各50μL,加入等體積的2×SDSBuffer,95℃煮5min,進(jìn)行SDS分析目標(biāo)蛋白的表達(dá)部位。1.2.7表達(dá)產(chǎn)物的WesternBlot分析利用WesternBlot分析進(jìn)一步檢測表達(dá)產(chǎn)物表達(dá)情況。由于原核表達(dá)載體pGEX-6P-1載體本身含有GST標(biāo)簽,所以本試驗選用小鼠抗GST-Tag單克隆抗體作為第一抗體分析表達(dá)產(chǎn)物是否為帶有GST的融合蛋白。(1)將表達(dá)目的蛋白的陽性克隆進(jìn)行誘導(dǎo)表達(dá),并且進(jìn)行SDS電泳分離;(2)SDS電泳結(jié)束后,取下凝膠,轉(zhuǎn)移到CN膜上(濕轉(zhuǎn));(3)從轉(zhuǎn)移裝置中取出硝酸纖維素膜,將膜放入封閉液中,室溫下封閉1.5h;(4)膜放入15mL含一抗(用封閉液1:3000稀釋)的溶液中,室溫下反應(yīng)1.5h;(5)用TBST洗膜4次,每次20min;(6)膜放入10mL含兔抗鼠IgG二抗(HRP標(biāo)記)(用封閉液1:8000稀釋)的溶液中,室溫下反應(yīng)1.5h;(7)用TBST洗膜三次,每次15min;(8)在膜上加入HRP顯色底物,放入化學(xué)發(fā)光儀中曝光顯色拍照。1.2.8IPTG濃度和誘導(dǎo)時間對蛋白表達(dá)的影響探究(1)從含有pGEX-6P-1-TML2的菌的新鮮的劃線平板中挑取單克隆到5mL含50mg/L羧芐青霉素的2YT液體培養(yǎng)基中,37℃搖瓶培養(yǎng)過夜;(2)取出1mL菌液分別加入50mL含50mg/L羧芐青霉素的2YT液體培養(yǎng)基中,37℃搖瓶培養(yǎng)至OD600為0.6,取出1mL菌液作為誘導(dǎo)前的對照,保存在-20℃冰箱中備用;(3)向培養(yǎng)基中分別加入1MIPTG至終濃度為1mM,分別取0h、1h、2h、3h、4h、5h、6h時的菌液1mL,-20℃冰箱保存;(4)將每組所取1mL菌液,和誘導(dǎo)前的菌液一起離心(4℃,5000rpm,10min),棄掉上清,沉淀用100μL2×SDSBuffer重懸;(5)樣品95℃煮5min,進(jìn)行SDS分析。(6)另取7ml菌液分別加入7瓶20ml含50mg/L羧芐青霉素的2YT液體培養(yǎng)基中,37℃搖瓶培養(yǎng)至OD600為0.6,取出1ml菌液作為誘導(dǎo)前的對照,保存在-20℃冰箱中備用;(7)向七組培養(yǎng)基中分別加入1MIPTG至終濃度為0.1mM、0.2mM、0.4mM、0.6mM、0.8mM、1.0mM、1.2mM,37℃搖床6h;(8)每組取出1mL菌液,和誘導(dǎo)前的菌液一起離心(4℃,5000rpm,10min),棄掉上清,沉淀用100μL2×SDSBuffer重懸;(9)樣品95℃煮5min,進(jìn)行SDS分析。2實驗結(jié)果及結(jié)論2.1重組質(zhì)粒的構(gòu)建與轉(zhuǎn)化2.1.1目的基因的克隆用TransZolUpPlusRNAKit提取蒺藜苜蓿野生型A17RNA,反轉(zhuǎn)錄成cDNA后進(jìn)行PCR擴(kuò)增,將所得到PCR產(chǎn)物進(jìn)行瓊脂糖凝膠電泳,電泳結(jié)果顯示(圖5),1218bp處有明顯的亮帶,確認(rèn)得到目的基因。cspApromoterTriggerFactorTML2GeneAMP+HiscspApromoterTriggerFactorTML2GeneAMP+HisTacpromoterGSTTagTML2GeneAMP+pColdTacpromoterGSTTagTML2GeneAMP+圖4重組載體構(gòu)建示意圖1kb1kb1218bp圖5PCR擴(kuò)增目的基因2.1.2轉(zhuǎn)化子PCR鑒定對經(jīng)過感受態(tài)細(xì)胞法轉(zhuǎn)化后的Rosetta菌體進(jìn)行轉(zhuǎn)化子PCR鑒定,瓊脂糖凝膠電泳所得結(jié)果顯示(圖6),具有明顯的帶,說明轉(zhuǎn)化成功。pCold-TFpCold-TF-TML2inRosettapGEX-6P-1-TML2inRosetta圖6轉(zhuǎn)化子的PCR鑒定。M為DNAmarker,1~5為5個單克隆。2.1.3質(zhì)粒提取與測序檢測提取陽性克隆轉(zhuǎn)化子中質(zhì)粒,送往測序公司進(jìn)行測序,所得結(jié)果顯示(圖7、圖8),部分陽性克隆轉(zhuǎn)化子中確實含有表達(dá)載體,轉(zhuǎn)化成功。圖7pGEX-6P-1-TML2表達(dá)載體測序結(jié)果圖8pCold-TF-TML2表達(dá)載體測序結(jié)果2.2重組質(zhì)粒表達(dá)的表達(dá)和純化2.2.1目的蛋白的表達(dá)情況裂解菌體的SDS結(jié)果(圖9)顯示,IPTG6h誘導(dǎo)條件下,pGEX-6P-1-TML2載體表達(dá)出72kD大小的蛋白,pCold-TF-TML2載體表達(dá)出95kD大小的蛋白,說明轉(zhuǎn)化菌體中目的蛋白得到成功表達(dá);不同濃度IPTG誘導(dǎo)結(jié)果(圖10)顯示,未添加IPTG與添加IPTG情況下表達(dá)量差異明顯,而添加不同濃度的IPTG誘導(dǎo)表達(dá)量沒有明顯差別;不同IPTG誘導(dǎo)時間結(jié)果(圖10)顯示,誘導(dǎo)0h組沒有蛋白表達(dá),誘導(dǎo)時間為1h、2h、3h的3組之間,隨著誘導(dǎo)時間增加,蛋白表達(dá)量逐漸增加,誘導(dǎo)時間為4h、5h、6h的三組之間,誘導(dǎo)時間增加,表達(dá)量沒有明顯變化。pGEX-6pGEX-6P-1-TML2pCold-TF-TML2圖9菌株蛋白SDS分析。M為ProteinMarker;1為0h時未添加IPTG誘導(dǎo)時菌體的蛋白表達(dá)情況;左圖2為37oC下,1mMIPTG誘導(dǎo)6h時菌體的蛋白表達(dá)情況,右圖2為15oC下1mMIPTG誘導(dǎo)24h時菌體的蛋白表達(dá)情況。M1234567M1234567M1234567M123456775kD75kD圖10不同誘導(dǎo)條件下含pGEX-6P-1-TML2表達(dá)載體的菌體蛋白表達(dá)的SDS分析。左圖為1mMIPTG誘導(dǎo)下,不同誘導(dǎo)時間下蛋白表達(dá)情況,其中M為ProteinMarker,1~7分別對應(yīng)0、1、2、3、4、5、6h的誘導(dǎo)時間;右圖為不同濃度IPTG誘導(dǎo)下蛋白表達(dá)情況,1~7分別對應(yīng)0.1、0.2、0.4、0.6、0.8、1.0、1.2mM的IPTG濃度。2.2.2目的蛋白表達(dá)部位的確定pCold-TF-TML2pGEX-6P-1-TML2將超聲波破碎后菌體離心所得的上清和沉淀進(jìn)行SDS分析,所得結(jié)果(圖11)顯示,IPTG6h誘導(dǎo)條件下,pGEX-6P-1-TML2載體轉(zhuǎn)化菌的上清中沒有72kD大小的蛋白表達(dá),而沉淀中含有72kD大小的蛋白;IPTG24h誘導(dǎo)條件下,pCpCold-TF-TML2pGEX-6P-1-TML295kD75kD95kD75kD圖11經(jīng)超聲波破碎后的SDS分析。左圖為含pGEX-6P-1-TML2的菌株在37oC、1mMIPTG誘導(dǎo)條件下,經(jīng)超聲波破碎后的蛋白情況,其中M為ProteinMarker,1、2分別為0h誘導(dǎo)時間下,經(jīng)超聲波破碎后的上清部分和沉淀部分。3、4為6h誘導(dǎo)時間下,經(jīng)超聲波破碎后的上清部分和沉淀部分;右圖為含pCold-TF-TML2的菌株在15oC、1mMIPTG誘導(dǎo)條件下,經(jīng)超聲波破碎后的蛋白情況,其中M為ProteinMarker,1、2分別為0h誘導(dǎo)時間下,經(jīng)超聲波破碎后的上清部分和沉淀部分。3、4為24h誘導(dǎo)時間下,經(jīng)超聲波破碎后的上清部分和沉淀部分。2.2.3表達(dá)產(chǎn)物的WesternBlot分析對SDS所得條帶進(jìn)行Western-Blot分析,結(jié)果(圖11)顯示,沉淀中有大量蛋白。75kD75kD圖11含pGEX-6P-1-TML2表達(dá)載體的菌株蛋白表達(dá)情況的WesternBlot分析。其中M為ProteinMarker;1為未經(jīng)IPTG誘導(dǎo)的菌株;2為經(jīng)IPTG誘導(dǎo)的菌株,超聲波破碎后的沉淀;3為經(jīng)IPTG誘導(dǎo)的菌株,超聲波破碎后的上清液。2.3總結(jié)本項目通過RNA提取和反轉(zhuǎn)錄的方法成功獲得了野生型蒺藜苜蓿A17的cDNA;通過PCR技術(shù)成功從中克隆得到TML2基因;利用無縫克隆技術(shù)完成了pGEX-6P-1-TML2和pCold-TF-TML2原核表達(dá)載體的構(gòu)建;成功將表達(dá)載體轉(zhuǎn)入表達(dá)菌株Rosetta并完成表達(dá);確定了TML2蛋白的表達(dá)部位少量位于上清,大量位于沉淀中,形成包涵體。所得結(jié)果和經(jīng)驗為下一步繼續(xù)分離和純化TML2蛋白奠定了基礎(chǔ)。致謝感謝蘭州大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院給予我們這次科研訓(xùn)練的機(jī)會。感謝我們的導(dǎo)師陳玉輝老師,不論是在完成實驗項目過程中遇到的問題,還是對于日后的人生道路選擇,陳老師都極其耐心解答我們的困惑,并主動分享寶貴的人生經(jīng)驗,我們受益匪淺。感謝李宇赫師兄、裴悅師姐在日常的實驗中給予我們的悉心指導(dǎo)與耐心講解。感謝在項目進(jìn)行過程中團(tuán)隊成員:周千行、白婉欣、陳龍文、劉琳、李堃宇五名同學(xué)之間的合作互助。也感謝同實驗室其他師兄師姐指導(dǎo)與幫助。參考文獻(xiàn)[1]FuguiZhuetal.ACEPPeptideReceptor-LikeKinaseRegulatesAuxinBiosynthesisandEthyleneSignalingtoCoordinateRootGrowthandSymbioticNodulationinMedicagotruncatula.PlantCell.2020Sep;32(9):2855-2877.[2]GautratP,LaffontC,FrugierF.CompactRootArchitecture2PromotesRootCompetenceforNodulationthroughthemiR2111SystemicEffector.CurrBiol.2020Apr6;30(7):1339-1345.e3.doi:10.1016/j.cub.2020.01.084.Epub2020Feb27.PMID:32109394.[3]Masahiro,Takahara,Shimpei,Magori,Takashi,Soyano,Satoru,Okamoto,Chie,Yoshida,Koji,Yano,Shusei,Sato,Satoshi,Tabata,Katsushi,Yamaguchi,Shuji,Shigenobu,Naoya,Take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22.4(2010):259-68.[5]陳愛民,連瑞麗,孫杰,等.豆科模式植物——蒺藜苜蓿.植物生理學(xué)報,2006,42(5):997-1003.作者簡介:白婉欣,女,1998年9月出生于陜西省神木縣,2017年從西安市鐵一中學(xué)考入蘭州大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院。在校期間積極參加各種活動,刻苦學(xué)習(xí)。大學(xué)四年期間參與多項創(chuàng)新創(chuàng)業(yè)項目,均順利結(jié)項,有較為豐富的科研經(jīng)歷。曾在校學(xué)生會秘書處、院學(xué)生會媒體中心任職,工作認(rèn)真,責(zé)任心較強(qiáng),有一定領(lǐng)導(dǎo)能力。李堃宇,男,2000年3月出生于山西省呂梁市離石區(qū),2018年從呂梁市高級中學(xué)考入蘭州大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院,在校期間被評為“蘭州大學(xué)優(yōu)秀共青團(tuán)員”、“優(yōu)秀學(xué)生

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