代謝工程技術(shù)合同合同編號：MET-2025-XXXX簽訂地點：中華人民共和國XX市甲方（委托方）：名稱：XX生物科技有限公司地址：XX省XX市XX區(qū)XX路XX號法定代表人：XXX聯(lián)絡方式：XXX-XXXXXXXX乙方（開發(fā)方）：名稱：XX大學代謝工程研究所地址：XX省XX市XX區(qū)XX路XX號法定代表人：XXX聯(lián)絡方式：XXX-XXXXXXXX第一條總則1.1本合同依據(jù)《中華人民共和國民法典》及相關法律法規(guī)，就甲方委托乙方進行重組大腸桿菌生產(chǎn)L-纈氨酸的代謝工程改造項目（以下簡稱“項目”）達成協(xié)議，雙方應嚴格履行各自權(quán)利與義務，確保項目目標實現(xiàn)。第二條項目內(nèi)容與技術(shù)目標2.1技術(shù)開發(fā)內(nèi)容乙方需通過以下步驟完成代謝途徑重構(gòu)：代謝網(wǎng)絡分析：基于KEGG數(shù)據(jù)庫構(gòu)建L-纈氨酸合成途徑的代謝網(wǎng)絡模型，識別關鍵節(jié)點（如丙酮酸節(jié)點、α-酮異戊酸節(jié)點）及通量控制系數(shù)（FCC）大于0.3的限速酶（如乙酰羥酸合成酶、二羥酸脫水酶）?；蚓庉嫞翰捎肅RISPR-Cas9技術(shù)敲除大腸桿菌MG1655的ilvE基因（分支酸變位酶），阻斷L-苯丙氨酸競爭途徑；過表達ilvGMEDA操縱子（編碼纈氨酸合成酶系）及反饋抑制解除突變型ilvA基因（編碼蘇氨酸脫氨酶）。發(fā)酵優(yōu)化：開發(fā)5L發(fā)酵罐的流加培養(yǎng)工藝，建立基于在線HPLC的代謝流實時監(jiān)測系統(tǒng)，優(yōu)化碳氮比（葡萄糖:硫酸銨=5:1）及溶氧濃度（30%±5%飽和度）。2.2技術(shù)目標產(chǎn)量指標：L-纈氨酸發(fā)酵產(chǎn)量≥50g/L，得率≥0.35g/g葡萄糖，生產(chǎn)強度≥2.0g/(L·h)。菌株穩(wěn)定性：連續(xù)傳代10次后，重組菌株的質(zhì)粒丟失率≤5%，產(chǎn)物合成能力保持初始水平的90%以上。代謝流分布：通過13C同位素標記實驗驗證，目標途徑通量占中心代謝通量比例≥60%，副產(chǎn)物（如L-亮氨酸、乙酸）生成量≤2g/L。第三條交付成果與履行期限3.1交付成果清單菌株材料：重組大腸桿菌工程菌株（編號MET-2025-VAL）的甘油管保藏物3份，含完整基因型鑒定報告（含測序峰圖及突變位點驗證）。技術(shù)文檔：代謝網(wǎng)絡模型（SBML格式）及通量平衡分析（FBA）計算代碼（MATLAB腳本）；基因編輯實驗手冊（含sgRNA序列、同源臂設計及篩選方法）；5L發(fā)酵罐標準操作規(guī)程（SOP）及代謝流分析報告（含13C-MFA數(shù)據(jù)）；中試放大可行性評估報告（含氧傳遞系數(shù)kLa、比生長速率μ等工程參數(shù)）。3.2項目進度第一階段（0-3個月）：完成代謝網(wǎng)絡建模與靶點驗證，提交《代謝途徑設計方案》，甲方支付首期費用后啟動實驗；第二階段（4-8個月）：完成基因編輯與菌株篩選，交付3株候選工程菌及《搖瓶發(fā)酵數(shù)據(jù)報告》；第三階段（9-12個月）：完成發(fā)酵工藝優(yōu)化與代謝流驗證，提交全套技術(shù)文檔及最終菌株。第四條費用及支付方式4.1合同總金額：人民幣280萬元（含稅），包括：菌株構(gòu)建費：120萬元（含基因合成、測序及篩選成本）；代謝分析費：80萬元（含13C同位素標記及質(zhì)譜檢測）；技術(shù)服務費：60萬元（含模型構(gòu)建、工藝開發(fā)及人員成本）；不可預見費：20萬元（用于應對實驗重復或耗材漲價）。4.2支付進度首期款（30%）：84萬元，于合同簽訂后10個工作日內(nèi)支付，用于啟動代謝網(wǎng)絡建模及基因編輯實驗；中期款（40%）：112萬元，乙方交付候選工程菌及搖瓶數(shù)據(jù)后15個工作日內(nèi)支付；尾款（30%）：84萬元，項目驗收通過后30個工作日內(nèi)支付，乙方需提供全額增值稅專用發(fā)票。第五條保密條款5.1保密范圍：雙方應對項目涉及的代謝網(wǎng)絡模型參數(shù)（如反應可逆性、底物抑制常數(shù)）、基因編輯策略（如sgRNA序列、篩選標記）、發(fā)酵工藝數(shù)據(jù)（如補料速率、pH控制曲線）及對方商業(yè)秘密（如成本結(jié)構(gòu)、客戶信息）承擔保密義務。5.2保密期限：本條款自合同簽訂之日起生效，至項目完成后10年終止。未經(jīng)對方書面許可，任何一方不得向第三方披露保密信息，即使披露為履行合同所需（如委托第三方測序），也需提前簽訂次級保密協(xié)議。第六條知識產(chǎn)權(quán)6.1成果歸屬：菌株所有權(quán)：重組大腸桿菌工程菌株（MET-2025-VAL）的全部知識產(chǎn)權(quán)歸甲方所有，乙方僅保留學術(shù)發(fā)表權(quán)（需經(jīng)甲方書面同意，且發(fā)表前60日提交文稿供甲方審核）；技術(shù)文檔：代謝網(wǎng)絡模型、發(fā)酵SOP等文檔的著作權(quán)歸甲方所有，乙方可將方法論部分用于非商業(yè)化教學或研究。6.2專利申請：雙方共同以甲方為第一申請人，就“一種基于代謝流調(diào)控的L-纈氨酸高產(chǎn)菌株構(gòu)建方法”申請發(fā)明專利，申請費用由甲方承擔，乙方需提供必要的實驗數(shù)據(jù)及發(fā)明人身份證明。第七條驗收標準與程序7.1驗收指標：產(chǎn)量驗證：乙方在甲方實驗室3次重復5L發(fā)酵實驗，L-纈氨酸平均產(chǎn)量≥50g/L，且單次實驗標準差≤5%；穩(wěn)定性測試：連續(xù)傳代10次后，菌株發(fā)酵產(chǎn)量下降幅度≤10%；文檔完整性：交付的技術(shù)文檔需包含原始實驗記錄（如電泳圖、色譜圖）及可重復的數(shù)據(jù)分析流程。7.2驗收流程：乙方提交驗收申請后，甲方應在15個工作日內(nèi)組織專家評審（3名行業(yè)專家+2名甲方技術(shù)人員）；若驗收不通過，乙方需在30日內(nèi)完成整改（如重新優(yōu)化發(fā)酵參數(shù)），并承擔相關費用。第八條違約責任8.1甲方違約：逾期支付費用的，每逾期一日按逾期金額的0.05%支付違約金，逾期超過30日的，乙方有權(quán)暫停項目并順延交付時間；提供虛假實驗數(shù)據(jù)導致乙方研發(fā)方向錯誤的，需賠償乙方已發(fā)生成本的120%。8.2乙方違約：未按期交付成果的，每逾期一日按合同總金額的0.1%支付違約金，逾期超過60日的，甲方有權(quán)解除合同并要求返還已付款項；菌株性能未達標的（如產(chǎn)量<45g/L），需退還合同金額的50%并免費提供技術(shù)改進方案；違反保密義務的，需支付違約金50萬元，并賠償甲方因此遭受的直接損失（包括但不限于市場份額損失、訴訟費用）。第九條知識產(chǎn)權(quán)與權(quán)利歸屬9.1甲方權(quán)利：在全球范圍內(nèi)永久享有工程菌株的所有權(quán)、使用權(quán)及再開發(fā)權(quán)，可將其用于商業(yè)生產(chǎn)或轉(zhuǎn)讓第三方；9.2乙方權(quán)利：保留在學術(shù)論文中引用項目數(shù)據(jù)的權(quán)利，但需注明甲方為合作單位，且發(fā)表前需經(jīng)甲方書面審核；9.3爭議處理：因知識產(chǎn)權(quán)歸屬產(chǎn)生的爭議，雙方應優(yōu)先協(xié)商解決，協(xié)商不成的，提交合同簽訂地有管轄權(quán)的人民法院訴訟解決。第十條其他條款10.1不可抗力：因地震、疫情等不可抗力導致項目停滯的，雙方應在事件發(fā)生后15日內(nèi)協(xié)商延期或解除合同，互不承擔責任；10.2合同變更：任何條款修改需經(jīng)雙方簽字蓋章的書面補充協(xié)議確認，補充協(xié)議與本合同具有同等法律效力；10.3合同份數(shù)：本合同一式6份