1、RNA互作，靶基因預(yù)測(cè)，定位以及疾病分析數(shù)據(jù)庫(kù),RNA互作、定位、疾病數(shù)據(jù)庫(kù),互作,定位,疾病,*RAID2.0中有這兩個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)的部分?jǐn)?shù)據(jù)整合在其中，同時(shí)也在更新計(jì)劃中，有需要可以關(guān)注。,Refernce,RAID v2.0：RNA-RNA、RNA-Protein互作模式，/raid/ RNALocate ：RNA的亞細(xì)胞定位數(shù)據(jù)庫(kù)，/rnalocate/ MNDR v2.0：非編碼RNA與疾病的數(shù)據(jù)庫(kù)，/mndr/ Reference RAID

2、 v2.0: an updated resource of RNA-associated interactions across organisms. Nucleic Acids Research. 2017; 45(D1): D115-D118. RNALocate: a resource for RNA subcellular localizations. Nucleic Acids Research. 2017; 45(D1): D135-D138. MNDR v2.0: an updated resource of ncRNA-disease associations in mamma

3、ls. Nucleic Acids Research. 2018; 46(D1): D371-D374.,RAID v2.0RNA-RNA、RNA-Protein互作/raid/,RAID v2.0數(shù)據(jù)展示,RAID v2.0: an updated resource of RNA-associated interactions across organisms. Nucleic Acids Research. 2017; 45(D1): D115-D118.,RAID v2.0共包含mRNA、miRNA、lncRNA、circRNA、tRNA

4、等10余種類型，超過527萬條數(shù)據(jù)。 可通過主頁(yè)上的“Statistics”點(diǎn)擊進(jìn)入查看數(shù)據(jù)分布情況。,850倍RNA相關(guān)互作；與實(shí)驗(yàn)或計(jì)算預(yù)測(cè)證據(jù)相結(jié)合；基于綜合置信度評(píng)分進(jìn)行可靠性評(píng)估；物種覆蓋率提高到60。,RAID v2.0頁(yè)面展示,搜索與瀏覽，側(cè)重點(diǎn)各有不同，我們分別展示。,可根據(jù)note選擇搜索關(guān)鍵詞,在Download的數(shù)據(jù)表中會(huì)看到簡(jiǎn)寫為S/W/P。,以hsa-miR-34a-5p為例搜索,精確匹配選項(xiàng),來看看hsa-miR-34a-5p的朋友圈,再看個(gè)與蛋白質(zhì)互作的！,搜索框內(nèi)輸入MALAT1，將打分限定為0.9-1.0后進(jìn)行搜索。然后“more”一下。,可查看與蛋白質(zhì)結(jié)合的

5、序列,可根據(jù)互作類型、檢測(cè)方法或物種進(jìn)行瀏覽，這里以RNA-Protein互作為例。,您能瀏覽到的,艾瑪，請(qǐng)寬恕我越來越小的截屏字體，相信總有一款適合您 。,關(guān)于下載，不贅述，后面還有！,分體與合體的區(qū)別,RNALocateRNA的亞細(xì)胞定位數(shù)據(jù)庫(kù)/rnalocate/,RNALocate是如何構(gòu)成的？,RNALocate: a resource for RNA subcellular localizations. Nucleic Acids Research. 2017; 45(D1): D135-D138.,可搜索可瀏覽，內(nèi)容豐富，展示直觀

6、,可根據(jù)定位、組織和RNA類型瀏覽,以定位瀏覽為例，左右均可以點(diǎn)選,直達(dá)NCBI鏈接,搜索功能都能獲得什么？,序列展示與瀏覽功能類似,同源展示，可進(jìn)一步追蹤,一步鄰居？?jī)刹洁従?？?qǐng)選擇您的網(wǎng)絡(luò)展示形式,看不清？任性調(diào)！,本站數(shù)據(jù)有三種基礎(chǔ)下載形式可選,怕不怕？,MNDR v2.0非編碼RNA與疾病的數(shù)據(jù)庫(kù)/mndr/,MNDR v2.0看得到的有什么？,如果您有目標(biāo)RNA，想知道它和什么疾病相關(guān),如果您研究某種疾病，想知道有哪些RNA與之有關(guān),MNDR v2.0看不到的有什么？,MNDR v2.0: an updated resource of

7、 ncRNA-disease associations in mammals. Nucleic Acids Research. 2018; 46(D1): D371-D374.,MNDR v2.0中您更關(guān)心什么？,MNDR v2.0: an updated resource of ncRNA-disease associations in mammals. Nucleic Acids Research. 2018; 46(D1): D371-D374.,如何使用MNDR v2.0搜索？,1,2,3,4,5,6,7,8,搜索結(jié)果展示,搜索結(jié)果“more”細(xì)節(jié)展示,如何使用MNDR v2.0瀏覽？,查詢非編碼RNA和疾病的關(guān)系，可根據(jù)疾病、非編碼RNA和物種瀏覽,點(diǎn)擊想要瀏覽的疾病，可以直接看到相關(guān)的非編碼RNA,也可下載后查看,關(guān)于Download,下載后的文件以“.TXT” 記事本形式存在，直接查看不方便，可以轉(zhuǎn)到excel表格中。,上一頁(yè)瀏覽到的43條信息，均在下載的數(shù)據(jù)表中。,S:強(qiáng)驗(yàn)證；W:弱驗(yàn)證；,當(dāng)然還有整體的Download,關(guān)于Statistics,哈哈哈哈哈?。?請(qǐng)?jiān)徫业牟怀墒?，這