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文檔簡介
1、,Beilstein 使用培訓(xùn)(一) -化學(xué)合成反應(yīng)的檢索,藥明康德新藥開發(fā)有限公司,藥明康德版權(quán)所有,1,Part I: 基本檢索方法介紹,2,選擇數(shù)據(jù)庫,3,4,選擇繪圖工具,使用較為方面,一般是默認(rèn)設(shè)置,5,編輯狀態(tài),選擇結(jié)構(gòu)或基團(tuán),橡皮,旋轉(zhuǎn),放大,縮小,畫線,Clossfire 點(diǎn)擊后進(jìn)入檢索頁面,6,7,8,最后的字母改為,代表該結(jié)構(gòu)和氫都可以。以下幾個也是常用的:任意原子;:除C,H的原子:金屬原子:鹵素原子AH, QH, MH, XH則代表這類分子或氫原子,9,10,11,12,快捷方式打開后某類模板后則成默認(rèn)方式,要打開其他模板從File工具欄打開,13,14,結(jié)構(gòu)定義狀態(tài),
2、畫線將反應(yīng)物和產(chǎn)物的共同原子連起,15,在定義狀態(tài)下,單擊反應(yīng)連線的一端,跳出如右對話框,可設(shè)定反應(yīng)中心(反應(yīng)中心or非反應(yīng)中心)及手性翻轉(zhuǎn)情況(構(gòu)象翻轉(zhuǎn)or保持),16,17,使用方法: 從ChemDraw中復(fù)制結(jié)構(gòu)后,在檢索主頁面使用Ctrl+v 或右鍵單擊后左鍵點(diǎn)Paste。,Note:1. 此法進(jìn)入編輯器后無效;但可以在主頁面復(fù)制后再進(jìn)入編輯器 2. 結(jié)構(gòu)中不能含有ChemDraw自帶的模板,不能有任何縮寫(無法識別)。,18,雜原子任意取代 原子任意取代 作為結(jié)構(gòu)檢索 作為反應(yīng)物檢索 作為產(chǎn)物檢索,19,19,選擇檢索反應(yīng),點(diǎn)擊Start Search后開始檢索,20,Part II
3、: 檢索技巧介紹,21,結(jié)構(gòu)與官能團(tuán)分開畫,并且都free site可以表示官能團(tuán)的任意位置取代,代表分子結(jié)構(gòu)中含有吡啶環(huán)及硝基,自然就包含了鄰、對、間位的硝基吡啶。但有時范圍可能過大,包含許多非期望的結(jié)構(gòu)信息,可以通過其他方法加以限定,22,在產(chǎn)物中帶有敏感官能團(tuán)的情況下選擇性的反應(yīng)檢索示例,23,24,25,改變鍵的性質(zhì),選擇或點(diǎn)擊相應(yīng)的鍵修改,包含所有的芳環(huán)結(jié)構(gòu),再文字定義,包含所有的芳環(huán)結(jié)構(gòu),再文字定義,28,29,30,39,Part III: 利用Beilstein 確定合成路線,40,41,設(shè)計(jì)合成路線(一),42,盡量注意分子具有類似性,這樣將其反應(yīng)條件應(yīng)用 到我們所要合成的分
4、子中將更可靠. 變換官能團(tuán)的取代位置,擴(kuò)展檢索范圍 非反應(yīng)的基團(tuán)相同位置設(shè)為Free site 將分子中無關(guān)重要的非反應(yīng)中心為部位變?yōu)镕ree site,設(shè)計(jì)合成路線(一),43,點(diǎn)擊反應(yīng)物,追溯文獻(xiàn)合成路線,設(shè)計(jì)合成路線(一),44,設(shè)計(jì)合成路線(一),45,設(shè)計(jì)合成路線(二),46,文獻(xiàn)中找不到類似結(jié)構(gòu)的合成方法; 相關(guān)類似物的合成方法很少,找不到較為合適路線,設(shè)計(jì)合成路線(二),47,設(shè)計(jì)合成路線(二),48,設(shè)計(jì)合成路線(二),49,設(shè)計(jì)合成路線(二),50,設(shè)計(jì)合成路線(二),51,設(shè)計(jì)合成路線(二),52,設(shè)計(jì)合成路線(二),53,設(shè)計(jì)合成路線(二),56,設(shè)計(jì)合成路線(三),57,Part IV: 其他功能介紹,58,將Chemdraw不帶縮寫的結(jié)構(gòu)復(fù)制到CrossFire 檢索主頁面,點(diǎn)擊Autonom鍵,59,輸入化學(xué)結(jié)構(gòu)后點(diǎn)擊“Genernate Name” ,可得到相應(yīng)的化學(xué)結(jié)構(gòu),其對復(fù)雜結(jié)構(gòu)特別帶順反式及多個手性中心的,命名特別方便其還會標(biāo)出各種環(huán)的各原子的序號,選擇命名的參考,60,61,Beilstein 帶有將檢索結(jié)果導(dǎo)入到Word的功能,但內(nèi)
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