1、醫(yī)學(xué)信息檢索,PubMed主要內(nèi)容,PubMed概況 PubMed數(shù)據(jù)來源 PubMed檢索機(jī)制 PubMed檢索運(yùn)算符 PubMed檢索方法 結(jié)果的顯示、保存 其他輔助功能,PubMed概況,創(chuàng)建機(jī)構(gòu)：美國國家醫(yī)學(xué)圖書館下設(shè)的美國生物技術(shù)信息中心(NCBI) 1997年6月開始向全球開放 特色：具有收錄范圍廣、內(nèi)容全、檢索途徑多、檢索體系完備等特點，部分文獻(xiàn)還可在網(wǎng)上直接免費獲得全文。 與Medline光盤數(shù)據(jù)庫的區(qū)別：檢索機(jī)制、檢索界面、檢索方法以及收錄文獻(xiàn)數(shù)量不同。,PubMed數(shù)據(jù)來源,MEDLINE： pubmed-indexed for medline In Process Cit

2、ations：每天收錄，尚未經(jīng)規(guī)范處理的數(shù)據(jù)。pubmed-in process Publisher-Supplied Citations：由出版商提供的電子文獻(xiàn)，每條記錄標(biāo)有PubMed-as supplied by Publisher。,自動轉(zhuǎn)換匹配功能(Automatic Term Mapping) 對于輸入的檢索詞，PubMed先按一定的詞表順序進(jìn)行對照匹配和轉(zhuǎn)換，再進(jìn)行檢索。詞表匹配轉(zhuǎn)換順序是：MeSH表(MeSH Translation Table)、期刊刊名表(Journal Translation Table)、短語表(Phrase list)、作者索引(Author Inde

3、x)。如果在以上4個表中都找不到相匹配的詞，PubMed將把短語分開，以單詞為單位，分別重復(fù)以上的過程，檢索時各個詞之間是AND邏輯關(guān)系。如果仍找不到相匹配的詞，則用單個詞在所有字段查找，各個詞之間也是AND邏輯關(guān)系。,PubMed檢索機(jī)制,短語檢索(Phrase Searching) 也可稱為強(qiáng)迫詞組檢索，即，如果要將短語作為一個詞組進(jìn)行檢索，可用雙引號“ ”將其引起來。如：“drug therapy”作為詞組進(jìn)行檢索的詞，系統(tǒng)不進(jìn)行自動轉(zhuǎn)換匹配，也不進(jìn)行MeSH詞的擴(kuò)檢。,PubMed檢索機(jī)制,PubMed檢索運(yùn)算符,邏輯運(yùn)算符： 邏輯與：AND，邏輯或：OR，邏輯非：NOT。 當(dāng)一個檢索

4、表達(dá)式中同時含有三個運(yùn)算符時，運(yùn)算順序從左至右，括號可以改變運(yùn)算順序。 截詞符：*，一個詞或字拼寫出部分字母后面加上一個截詞符，chem*表示用詞根進(jìn)行檢索。 雙引號：“ ”，表示對引號中的短語進(jìn)行檢索。 檢索字段標(biāo)識符：tag，tag為字段名稱。 ti，au，ta， la，pt。,常用字段組成,標(biāo)識符 字段名稱 中文釋義 TI Title 題目 AU Author 作者 AD Affiliation 作者單位 AB Abstract 文摘 DP Publication Date 出版日期 TA Journal Title Abbreviation 刊名縮寫 MH MeSH Terms 主題詞

5、 PT Publication Type 出版類型,/pubmed/,PubMed 網(wǎng)址,高級檢索,主題檢索,期刊檢索,文獻(xiàn)匹配,臨床咨詢,特定主題咨詢,PubMed檢索方法,基本檢索 高級檢索 主題檢索 輔助檢索,基本檢索,默認(rèn)檢索字段為主題、作者、期刊,關(guān)鍵詞、詞(詞組)或短語： 輸入任意關(guān)鍵詞：liver cancer、Lung cancer； 帶有雙引號” ”作為短語檢索：”cancer therapy”； 帶有連接號”-”作為一個詞組檢索：interleukin-6。 限制檢索字段：如liver cancerti 作者：Smith

6、J 、 Smithau 2002年以后的文獻(xiàn)如果作者有全稱，可用全稱,基本檢索,期刊刊名： 可用期刊全稱：GENE THERAPYTA； 可用期刊簡稱：JAMATA；(The Journal of the American Medical Association) 刊名中含有特殊字符，如、&等，要去掉： 如J HAND SURGAM 輸入時要寫成J HAND SURG AM 截詞：chemo* 復(fù)雜表達(dá)式：liver cancer AND therapy 帶有摘要文獻(xiàn)的檢索 ：liver cancer AND hasabstract,基本檢索,分析該檢索課題，包含兩個方面： 肝癌：liver

7、cancer； 治療：therapy 兩個主題之間的邏輯關(guān)系是AND，即 liver cancer AND therapy,基本檢索舉例1：肝癌的治療,分析該檢索課題，包含兩個方面： 作者為：馬大龍（ma dl）； 作者單位為： 北京大學(xué)（peking universityad）。,基本檢索舉例2：北京大學(xué)醫(yī)學(xué)部馬大龍教授發(fā)表的文獻(xiàn),得到了兩個檢索結(jié)果： 作者為：馬大龍（ma dl）的檢索結(jié)果 作者單位為：北京大學(xué)（peking universityad）的檢索結(jié)果 利用檢索史把這兩個檢索結(jié)果用AND組合起來,基本檢索舉例2：北京大學(xué)醫(yī)學(xué)部馬大龍教授發(fā)表的文獻(xiàn),高級檢索,限制檢索或條件檢索：L

8、imit (1) 全文、摘要 (2)動物、人類 (3)文獻(xiàn)類型 (4)語種 (5)數(shù)據(jù)庫子集的限定 (6)年齡組,分析該課題： 主題為肝癌治療，即liver cancer and therapy 限制條件有兩個： 語種為英文（English）； 文獻(xiàn)類型為綜述（Review）,高級檢索舉例：原文為英文的肝癌治療方面的綜述文獻(xiàn),主題檢索,medline數(shù)據(jù)主題標(biāo)引規(guī)范，用主題詞檢索，可以提高查全率、查準(zhǔn)率,點擊MeSH Database打開主題檢索界面,主題檢索,主題檢索舉例：長春新堿（Vincristine ）治療白血病（leukemia）的文獻(xiàn),該檢索課題有兩個概念：長春新堿（Vincris

9、tine ） 、白血?。╨eukemia） 長春新堿治療疾病，組配副主題詞治療應(yīng)用（therapeutic use） 白血病藥物治療，組配副主題詞藥物療法（drug therapy） 這兩個概念之間是AND的關(guān)系,主題檢索舉例：長春新堿（Vincristine ）治療白血病（leukemia）的文獻(xiàn),第1步：檢索長春新堿/治療應(yīng)用,主題檢索舉例：長春新堿（Vincristine ）治療白血?。╨eukemia）的文獻(xiàn),第1步：檢索長春新堿/治療應(yīng)用,主題檢索舉例：長春新堿（Vincristine ）治療白血?。╨eukemia）的文獻(xiàn),第1步：檢索長春新堿/治療應(yīng)用,副主題詞,主題檢索舉例：長

10、春新堿（Vincristine ）治療白血病（leukemia）的文獻(xiàn),第1步：檢索長春新堿/治療應(yīng)用,主題檢索舉例：長春新堿（Vincristine ）治療白血?。╨eukemia）的文獻(xiàn),第1步：檢索長春新堿/治療應(yīng)用,主題檢索舉例：長春新堿（Vincristine ）治療白血病（leukemia）的文獻(xiàn),第1步：檢索長春新堿/治療應(yīng)用,主題檢索舉例：長春新堿（Vincristine ）治療白血?。╨eukemia）的文獻(xiàn),第2步：檢索白血病/藥物療法,主題檢索舉例：長春新堿（Vincristine ）治療白血病（leukemia）的文獻(xiàn),第2步：檢索白血病/藥物療法,主題檢索舉例：長春新

11、堿（Vincristine ）治療白血病（leukemia）的文獻(xiàn),第2步：檢索白血病/藥物療法,主題檢索舉例：長春新堿（Vincristine ）治療白血?。╨eukemia）的文獻(xiàn),第2步：檢索白血病/藥物療法,主題檢索舉例：長春新堿（Vincristine ）治療白血病（leukemia）的文獻(xiàn),第2步：檢索白血病/藥物療法,主題檢索舉例：長春新堿（Vincristine ）治療白血?。╨eukemia）的文獻(xiàn),第2步：檢索白血病/藥物療法,通過兩個主題檢索得到： “長春新堿/治療應(yīng)用” 的檢索結(jié)果 “白血病/藥物療法” 的檢索結(jié)果 兩個檢索結(jié)果用AND組合起來，需要用到檢索史,主題檢索

12、舉例：長春新堿（Vincristine ）治療白血病（leukemia）的文獻(xiàn),文獻(xiàn)匹配器 臨床咨詢和系統(tǒng)評價,輔助檢索,文獻(xiàn)匹配器,系統(tǒng)提供有兩種用來查找特定文獻(xiàn)的方式：單篇文獻(xiàn)匹配器（Single Citation Matcher）和多篇文獻(xiàn)匹配器（Batch Citation Matcher）。 如果要查找某一篇文獻(xiàn)，點擊單篇引文匹配器，輸入刊名、日期、卷、期、頁碼、作者、題目中的一項或多項內(nèi)容進(jìn)行檢索，系統(tǒng)返回文獻(xiàn)記錄結(jié)果。如果要同時查找多篇文獻(xiàn)，則點擊多篇引文匹配器，然后在輸入框內(nèi)分行輸入每篇文獻(xiàn)的查詢項目。其中刊名為必需項，其他項目沒有時可省略。,單篇文獻(xiàn)匹配器（Single Ci

13、tation Matcher）,多篇文獻(xiàn)匹配器（Batch Citation Matcher）,輸入格式,臨床咨詢和系統(tǒng)評價,用戶方便快捷地檢索到有關(guān)臨床方面的文獻(xiàn)，如臨床疾病的診斷、治療、病因和預(yù)后等； 檢索臨床實踐過程中的問題，如系統(tǒng)綜述、多元分析、臨床試驗、循證醫(yī)學(xué)、實踐指導(dǎo)、遺傳學(xué)方面。,臨床咨詢和系統(tǒng)評價,臨床咨詢,臨床咨詢和系統(tǒng)評價,系統(tǒng)評價,PubMed Clinical Queries臨床咨詢,Directory of Topic-Specific PubMed Queries PUBMED學(xué)科、專題數(shù)據(jù)庫/bsd/special_qu

14、eries.html,Clinical Queries using Research Methodology Filters 臨床研究方法,Clinical Queries using Research Methodology Filters臨床研究方法的檢索/entrez/query/static/clinicaltable.html,Summary of Enhancements for Clinical Queries for MEDLINE for Studies MEDLINE數(shù)據(jù)庫如何強(qiáng)化臨床信息檢索功能？http:/www.nl

15、/pubs/techbull/jf04/cq_info.html,NLM Resources for Informing Comparative Effectiveness醫(yī)學(xué)科研信息檢索/nichsr/cer/cerqueries.html#pubmed,/sites/myncbi/recentactivity/PUBMED上檢索當(dāng)天全球醫(yī)學(xué)科研活動,科學(xué)網(wǎng)許培揚(yáng)博客,PUBMED數(shù)據(jù)庫高效科研信息的檢索方法 ,醫(yī)學(xué)語義智能檢索平臺/v2

16、/search?s=r&query=Genome-sequencing&so_a=&so_j=,全球語言翻譯支持,全文鏈接 BioMed Central PubMed Pubget,結(jié)果的顯示、保存,顯示 保存,結(jié)果的顯示,顯示格式：系統(tǒng)提供的顯示格式很多，一般較常用的有以下3種： （1）Summary：為默認(rèn)顯示格式。顯示的信息包括文獻(xiàn)的標(biāo)題、著者、出處、PMID、綜述出版類型、非英文文獻(xiàn)的原文語種等。 （2）Abstract：顯示信息除了文獻(xiàn)標(biāo)題、著者、出處等基本信息外，還包括摘要信息，以便用戶了解文獻(xiàn)詳細(xì)內(nèi)容。,（3）MEDLINE：以MEDLINE數(shù)據(jù)庫的記錄格式來顯示檢索結(jié)果。字段內(nèi)容主要包括PMID、題目、摘要、作者、作者地址、語種、出版類型、出處、MeSH、文獻(xiàn)ID、出版狀態(tài)等。,結(jié)果的顯示,結(jié)果的顯示,保存記錄