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1、第九章 2檢驗 (Chi Square Test ),重點掌握: 1、2檢驗的基本思想 2、完全隨機(jī)設(shè)計和配對設(shè)計四格表資料2檢驗的步驟及應(yīng)用條件。 3、行列表資料的2檢驗及應(yīng)用中應(yīng)注意的問題。,2檢驗用途: 用于計數(shù)資料。 1、檢驗兩樣本率之間有無差異; 2、多個樣本率(或多組構(gòu)成比)之間比較; 3、配對設(shè)計兩樣本率之間比較;,3,2檢驗(Chi-square test),是現(xiàn)代統(tǒng)計學(xué)的創(chuàng)始人之一,英國統(tǒng)計學(xué)家K.Pearson于1900年提出的一種具有廣泛用途的假設(shè)檢驗方法。常用于分類變量資料的統(tǒng)計推斷。,(一)2 檢驗基本思想,例 某神經(jīng)內(nèi)科醫(yī)師欲比較A、B兩種藥物治療腦血栓病人的療效,
2、將病情輕重、病程相近且滿足實驗入選標(biāo)準(zhǔn)的156例腦血管栓塞患者隨機(jī)分為兩組,結(jié)果見表7-1,問兩藥治療近期有效率是否有差別?,兩樣本率比較資料,經(jīng)整理有四個基本數(shù)據(jù),四格表資料的基本形式,a b c,請判斷下列a、b、c誰屬四格表:兩組大白鼠在不同致癌劑作用下的發(fā)癌率如下表,問兩組發(fā)癌率有無差別?,2檢驗遵循假設(shè)檢驗的基本思想,是指在建立無效假設(shè)的基礎(chǔ)上,利用a、b、c、d四個格子的數(shù),計算統(tǒng)計量2值,統(tǒng)計量2值 檢驗水準(zhǔn)下2界值,相比較,P值 檢驗水準(zhǔn)a值,相比較,10,2界值表,A:實際頻數(shù)(actual frequency) T:理論頻數(shù)(theoretical frequency) 對
3、資料要求:n 40,且T5,統(tǒng)計量2值通用公式,T 怎么求 ? T:理論頻數(shù)(theoretical frequency) TRC :第R 行C 列的理論頻數(shù) nR :相應(yīng)的行合計,nC :相應(yīng)的列合計,nR,nC,其他格子的理論頻數(shù)均可由這個格子的理論頻數(shù)計算而得, 即 T11=65.7,那么 T12=82-65.7=16.3, T21=125-65.7=59.3, T22=31-16.3 =14.7。見表7-1括號內(nèi)數(shù)字。,如果Pa,則可認(rèn)為A與T的差別已超出了抽樣誤差可以解釋的范圍,即有理由拒絕H0,接受H1,即12。 如果Pa,則尚無充分理由拒絕H0。,可見,2值的大小反映了實際頻數(shù)A
4、與H0成立條件下的理論頻數(shù)T之間的偏差,即實際頻數(shù)與理論頻數(shù)的吻合程度。 卡方值越大,說明實際頻數(shù)與理論頻數(shù)的差別越明顯,兩組有效率不同的可能性越大。,2檢驗的基本思想: 首先建立檢驗假設(shè),在此基礎(chǔ)上計算理論頻數(shù),將樣本率的比較演繹為實際頻數(shù)與理論頻數(shù)間是否吻合的比較,借助統(tǒng)計量2值和自由度,根據(jù)該統(tǒng)計量在其特定分布中的位置確定概率,做出統(tǒng)計推斷結(jié)論。,(一)用途: 檢驗兩樣本率之間差異有無統(tǒng)計學(xué)意義。,第一節(jié) 獨立樣本四格表資料的2檢驗,(二)公式 基本公式:n40,且T5(所有格子),19,四格表專用公式:,式中, a,c 為陽性絕對數(shù);b,d 為陰性絕對數(shù);n 為總例數(shù),20,例9-1
5、為了解吲達(dá)帕胺治療原發(fā)性高血壓的療效,將70名高血壓患者隨機(jī)分為兩組,實驗組用吲達(dá)帕胺加輔助治療,對照組用安慰劑加輔助治療,結(jié)果如下表,試分析吲達(dá)帕胺治療原發(fā)性高血壓的有效性。,22,建立檢驗假設(shè)并確定檢驗水準(zhǔn) H0:1=2,即試驗組與對照組總體有效率相等 H1:12,即試驗組與對照組總體有效率不等 =0.05 2. 計算檢驗統(tǒng)計量: 計算四格表中每一格的理論數(shù),,假設(shè)檢驗步驟,23,T11=(4144)/70=25.77,那么 T12=44-25.77=18.23, T21=41-25.77=15.23, T22=26-15.23 =10.77。見表9-1括號內(nèi)數(shù)字。,24,自由度為:=(行
6、數(shù)-1)(列數(shù)-1)=(2-1)(2-1)=1,3. 確定P 值 查附表7(P225),4. 結(jié)論:按=0.05水準(zhǔn),拒絕H0,接受H1,差異有統(tǒng)計學(xué)意義??烧J(rèn)為兩組治療原發(fā)性高血壓的總體有效率不等。,= + + =8.40,(20-25.77)2,25.77,(24-18.23)2,18.23,25,四格表專用公式:,26,四格表專用公式:(n 40,且T5),= =8.40,44264129,(205-2421)270,四格表資料卡方檢驗的校正,2、基本公式,專用公式,1、校正條件: n40,且 1T5(一個及以上格子),28,例9-2 某醫(yī)師欲比較胞磷膽堿與神經(jīng)節(jié)苷脂治療腦血管疾病的療效
7、,將58例腦血管疾病患者隨機(jī)分為兩組,結(jié)果如下表。問兩種藥物治療腦血管疾病的有效率是否不同?,表9-2 兩種藥物治療腦血管疾病有效率的比較,29,建立檢驗假設(shè)并確定檢驗水準(zhǔn) H0:1=2 ,兩藥物治療腦血管疾病有效率相等 H1:12 ,兩藥物治療腦血管疾病有效率不等 =0.05 2. 計算檢驗統(tǒng)計量: 計算H0成立時各格子的理論頻數(shù),由此得到四格表中有兩個格子理論頻數(shù),1T5,n 40, 需采用校正公式,30,= =0.376,(256-324 -58/2)258,4992830,31,3. 確定P值 查附表7,4. 結(jié)論:按=0.05水準(zhǔn),不拒絕H0,差別無統(tǒng)計學(xué)意義。尚不能認(rèn)為兩種藥物治療
8、腦血管疾病有效率不等。,當(dāng)n40,或T1時,校正公式也不恰當(dāng), 這時須用四格表的Fisher確切概率法。,查X2界值表 X20.05,1=3.84 X20.3763.84,故P0.05,,(一)用途: 檢驗配對設(shè)計計數(shù)資料(率)有無差異。 如研究中對同一觀察單位分別采用兩種 方法進(jìn)行檢測,比較兩種檢測方法的檢測情況(計數(shù)資料)有無差別。 這種資料分析時要整理為配對設(shè)計的四格表形式。,第二節(jié) 配對四格表資料 2 檢驗,(二)配對資料 McNemar X2檢驗 1、檢驗的基本思想 例 某研究組采用病理檢查法和超聲檢查法,檢查確診乳腺癌患者257例,結(jié)果見表7-4,問兩種方法檢出率有無差別?,表7-
9、4 病理法和超聲法檢查乳腺癌患者的檢查結(jié)果,上述配對設(shè)計實驗中,就每個對子而言,兩種處理的結(jié)果不外乎有四種可能:,病理法和超聲法兩種檢測方法皆為陽性數(shù)(a); 病理法和超聲法兩種檢測方法皆為陰性數(shù) (d); 病理法為陽性、超聲法為陰性數(shù) (b); 病理法為陰性、超聲法為陽性數(shù) (c)。,其中,a, d 為兩法觀察結(jié)果一致的兩種情況 b, c為兩法觀察結(jié)果不一致的兩種情況。,因此,我們只對檢查結(jié)果不一致的格子(b、c)進(jìn)行檢驗。 檢驗的方法就是配對資料McNemarX2檢驗,但其適用條件是b+c40。,2、檢驗公式:檢驗統(tǒng)計量(McNemar test),38,例9-4 現(xiàn)有198份痰標(biāo)本,每份
10、標(biāo)本分別用A、B兩種培養(yǎng)基培養(yǎng)結(jié)核菌,結(jié)果如下表,問A、B兩種培養(yǎng)基的陽性培養(yǎng)率是否不等?,39,建立檢驗假設(shè)并確定檢驗水準(zhǔn) H0:B=C, 兩種培養(yǎng)基的陽性培養(yǎng)率相等 H1:BC,兩種培養(yǎng)基的陽性培養(yǎng)率不相等 =0.05 2.計算檢驗統(tǒng)計量:若H0成立時,檢出結(jié)果不一致的兩個格子理論頻數(shù)都應(yīng)該是(b+c)/2,40,3. 確定P值,作出推斷結(jié)論 (查附表7,=1),=(24-20)2/(24+20)=0.36,查X2界值表 X20.05,1=3.84 X20.363.84,故P0.05,按0.05水準(zhǔn),不拒絕H0,差別無統(tǒng)計學(xué)意義。故尚不能認(rèn)為兩種培養(yǎng)基的陽性培養(yǎng)率不同。,(三)當(dāng)bc40時
11、,配對設(shè)計四格表資料的X2統(tǒng)計量需校正。 (|bc|1)2 2 v=1 bc 注:當(dāng)b+c40時,對于配對四格表資料,采用確切概率法進(jìn)行檢驗要優(yōu)于使用連續(xù)性校正公式檢驗。,兩個率的比較也屬于行列表資料的2檢驗,是最簡單一種行列表(22表)。 如果兩個以上的率或構(gòu)成比的比較,由于行或列都大于2,所以不能再用四格表資料2檢驗。 只能用行列表資料的2檢驗。,第三節(jié) 行列表資料的2檢驗,行列 表資料分類,1、 雙向無序資料 例:雙向無序資料之多個樣本率比較 有 R 行 2 列,稱為 R 2表;,2、 雙向無序資料 例:雙向無序資料之多個樣本構(gòu)成比比較 有 R 行 C 列,稱為 R C表;,3、單向有序
12、多分類(多組)資料 例:多個樣本率(構(gòu)成比)比較 有 R 行 C 列,稱為 R C表;,4、雙向有序資料 例:雙向有序的兩個變量分析 有 R 行 C 列,稱為 R C列聯(lián)表;,一、行列表資料2檢驗的用途 1、檢驗兩個及以上樣本構(gòu)成比有無差異; 2、檢驗多個樣本率間有無差異;,二、計算公式 檢驗統(tǒng)計量,(通用),(專用),2檢驗的應(yīng)用條件: (1)1T5的格子數(shù)不超過總格子數(shù)的1/5。,(2)不能有任意一個格子理論頻數(shù)小于1。,50,例9-5 某醫(yī)院用三種方案治療急性無黃疸型病毒肝炎254例,結(jié)果如表9-6所示,問三種方案治療急性肝炎的有效率是否不同?,1、多個樣本率的比較,51,三個樣本率的比
13、較,32表資料,1. 建立檢驗假設(shè) ,確定檢驗水準(zhǔn) 0:三種治療方案有效率相同,即123 1:三種治療方案有效率不全相同。 0.05 2.計算檢驗統(tǒng)計量,RC列聯(lián)表2檢驗步驟(同四格表),=254 = 22.81,512,( + +. -1 ),492,100145,100109,53,3、確定P值,作出推斷,自由度v(行數(shù)-1)(列數(shù)-1)(3-1)(2-1)2 查X2界值表 X20.05,2=5.99 X222.815.99,故 P0.05,按0.05水準(zhǔn),拒絕H0,接受H1,差別有統(tǒng)計學(xué)意義??烧J(rèn)為三種治療的有效率有差別。,2、多組樣本構(gòu)成比(比重或分布)的比較,例9-6 某研究人員收集
14、了亞洲、歐洲和北美洲人的A、B、AB、O血型資料,結(jié)果如下表,問不同地區(qū)人群的血型分布是否不同?,三個樣本構(gòu)成比的比較,34表資料,1. 建立檢驗假設(shè) ,確定檢驗水準(zhǔn) H0:不同地區(qū)人群血型分布總體構(gòu)成比相同 H1:不同地區(qū)人群血型分布總體構(gòu)成比不全相同 =0.05 2.計算檢驗統(tǒng)計量,= 297.38,3、確定P值,作出推斷,自由度v(行數(shù)-1)(列數(shù)-1)(3-1)(4-1)6 查X2界值表 X20.05,6=12.59 X2297.3812.59,故 P0.05,按0.05水準(zhǔn),拒絕H0,接受H1,差別有統(tǒng)計學(xué)意義。 可認(rèn)為不同地區(qū)的人群血型分布不全相同 。,例:9-5,多樣本率間多重比
15、較,按照比較目的將RC列聯(lián)表分解為多個四格表,并對每個四格表進(jìn)行檢驗。 檢驗水準(zhǔn)a進(jìn)行調(diào)整:Bonferroni調(diào)整法 a=2a/k(k-1),行列表X2檢驗應(yīng)用注意事項,(1)不宜有1/5以上格子理論頻數(shù)大于1小于5、或有一個格子理論頻數(shù)小于1。 理論頻數(shù)太小的處理方法: A、增加樣本含量-最好方法 B、刪除頻數(shù)太小的行和列 C、合理合并頻數(shù)太小的行或列 (合并時要根據(jù)專業(yè)知識,將性質(zhì)相近而且是相鄰行或列進(jìn)行合并,不能亂合并)第(2)和第(3)處理方法會損失信息。 D、采用RC的Fisher確切概率法。,(2)當(dāng)三個及以上率(或構(gòu)成比)比較,結(jié)論拒絕H0時,只能說總的有差別,但不能說明它們彼
16、此間都有差別,或某兩者間有差別。 解決此問題方法:率的多重比較。 (3)RC表的X2檢驗與分類結(jié)果的排序無關(guān)。 而對于單向有序資料,如果是比較兩組的療效(治愈、顯效、好轉(zhuǎn)、無效)是否有差別,則需要用非參數(shù)檢驗(秩和檢驗)。,單向有序多分類(多組)資料,四格表資料的Fisher確切概率法 Fisher確切概率法可分三種: 1、完全隨機(jī)設(shè)計四格表資料的確切概率法 應(yīng)用條件:當(dāng)n40或T1時,或其他檢驗方法所得的概率接近檢驗水準(zhǔn);,2、配對設(shè)計四格表資料確切概率法 應(yīng)用條件:當(dāng)b+c25時,應(yīng)改用確切概率法。當(dāng)b+c40時采用確切概率法進(jìn)行檢驗要優(yōu)于使用連續(xù)性校正公式檢驗。 3、行列表資料確切概率法 應(yīng)用條件:行列表資料,當(dāng)出現(xiàn)1/5以上格子理論頻數(shù)大于1小于5,或有一個格子理論頻數(shù)小于1時。,小 結(jié),1、2檢驗的基本思想,(1)n40,且T5時,2檢驗基本公式和專用公式,(2)n 40,且1T5時,用2檢驗校正公式,(3)n40,或T1時,改用四格表確切概率法,2、四格表資料2檢驗:,3、配對四格表資料2檢驗:,b+c40 b+c40時,小 結(jié),4、RC表(行列表) 有R個各分為C類的率/構(gòu)成比,其基本數(shù)據(jù)有R行C 列,則稱為RC表(包括四格表)
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